Doublet Group distance statistics: 52649

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 0, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.006, 0.016, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.005, 0.019, 0.034, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.009, 0.029, 0.050, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.029 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.009, 0.030, 0.051, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.030 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.006, 0.029, 0.052, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.029 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.010, 0.042, 0.075, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.042 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.006, 0.047, 0.088, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.047 std_dev=0.041
C5	B	0, 0.073, 0.223, 0.372, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.223 std_dev=0.150
C2	B	0, 0.079, 0.230, 0.382, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.230 std_dev=0.152
N1	B	0, 0.080, 0.236, 0.392, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.236 std_dev=0.156
C4	B	0, 0.083, 0.245, 0.406, 0.477 max_d=0.477 avg_d=0.245 std_dev=0.161
N3	B	0, 0.107, 0.291, 0.474, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.291 std_dev=0.184
N7	B	0, 0.116, 0.304, 0.493, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.304 std_dev=0.189
C8	B	0, 0.139, 0.334, 0.528, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.334 std_dev=0.195
C6	B	0, 0.046, 0.246, 0.446, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.246 std_dev=0.200
N9	B	0, 0.125, 0.339, 0.553, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.339 std_dev=0.214
N6	B	0, 0.109, 0.404, 0.698, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.404 std_dev=0.294
C1'	B	0, 0.156, 0.484, 0.811, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.484 std_dev=0.327
O4'	B	0, 0.189, 0.522, 0.856, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.522 std_dev=0.334
O4'	A	0, 0.009, 0.399, 0.788, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.399 std_dev=0.389
O5'	B	0, 0.287, 0.706, 1.126, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.706 std_dev=0.420
P	B	0, 0.148, 0.597, 1.045, 1.485 max_d=1.485 avg_d=0.597 std_dev=0.449
C4'	B	0, 0.185, 0.637, 1.088, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.637 std_dev=0.452
C2'	A	0, -0.022, 0.445, 0.913, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.445 std_dev=0.467
C2'	B	0, 0.080, 0.565, 1.051, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.565 std_dev=0.486
C5'	B	0, 0.175, 0.668, 1.161, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.668 std_dev=0.493
C3'	B	0, 0.134, 0.632, 1.131, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.632 std_dev=0.498
OP1	B	0, 0.348, 0.906, 1.464, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.906 std_dev=0.558
O2'	B	0, 0.186, 0.749, 1.312, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.749 std_dev=0.563
OP2	B	0, 0.213, 0.842, 1.471, 1.998 max_d=1.998 avg_d=0.842 std_dev=0.629
C4'	A	0, 0.055, 0.690, 1.325, 1.880 max_d=1.880 avg_d=0.690 std_dev=0.635
O3'	B	0, 0.153, 0.818, 1.483, 1.842 max_d=1.842 avg_d=0.818 std_dev=0.665
C5'	A	0, 0.228, 0.895, 1.561, 2.122 max_d=2.122 avg_d=0.895 std_dev=0.667
O2'	A	0, 0.076, 0.744, 1.412, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.744 std_dev=0.668
C3'	A	0, -0.116, 0.687, 1.489, 2.081 max_d=2.081 avg_d=0.687 std_dev=0.802
O5'	A	0, 0.161, 1.297, 2.432, 3.298 max_d=3.298 avg_d=1.297 std_dev=1.136
OP2	A	0, 0.258, 1.446, 2.633, 3.390 max_d=3.390 avg_d=1.446 std_dev=1.187
O3'	A	0, -0.094, 1.211, 2.516, 3.280 max_d=3.280 avg_d=1.211 std_dev=1.305
P	A	0, 0.180, 1.494, 2.808, 3.578 max_d=3.578 avg_d=1.494 std_dev=1.314
OP1	A	0, 0.345, 1.995, 3.645, 4.554 max_d=4.554 avg_d=1.995 std_dev=1.650

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.36	0.00	0.39	0.02	0.34	0.49	0.28
C2	0.02	0.00	0.32	0.25	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.28	0.17	0.52	0.01	0.43	0.51	0.42
C2'	0.00	0.32	0.00	0.00	0.17	0.02	0.09	0.22	0.15	0.14	0.25	0.38	0.31	0.07	0.02	0.00	0.03	0.02	0.57	0.12	0.58	0.47	0.43
C3'	0.02	0.25	0.00	0.00	0.27	0.01	0.36	0.01	0.37	0.32	0.32	0.22	0.21	0.38	0.23	0.02	0.01	0.02	0.31	0.41	0.42	0.24	0.20
C4	0.01	0.01	0.17	0.27	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.18	0.20	0.10	0.58	0.01	0.45	0.47	0.41
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.10	0.19	0.06	0.09	0.06	0.19	0.09	0.28	0.06	0.00	0.01	0.13	0.17	0.45	0.12
C5	0.01	0.01	0.09	0.36	0.00	0.12	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.27	0.18	0.06	0.69	0.01	0.53	0.50	0.51
C5'	0.07	0.10	0.22	0.01	0.12	0.01	0.19	0.00	0.18	0.25	0.13	0.10	0.09	0.26	0.13	0.11	0.20	0.02	0.01	0.22	0.30	0.42	0.03
C6	0.01	0.01	0.15	0.37	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.25	0.20	0.09	0.69	0.00	0.54	0.53	0.53
C8	0.01	0.01	0.14	0.32	0.00	0.19	0.01	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.34	0.19	0.10	0.75	0.02	0.54	0.44	0.51
N1	0.02	0.00	0.25	0.32	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.21	0.14	0.61	0.01	0.49	0.52	0.48
N2	0.02	0.00	0.38	0.22	0.01	0.09	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.29	0.36	0.20	0.46	0.01	0.40	0.51	0.39
N3	0.02	0.00	0.31	0.21	0.00	0.06	0.01	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.32	0.17	0.49	0.02	0.40	0.49	0.37
N7	0.01	0.01	0.07	0.38	0.01	0.19	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.36	0.23	0.05	0.78	0.02	0.58	0.51	0.58
N9	0.01	0.01	0.02	0.23	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.17	0.02	0.58	0.01	0.44	0.45	0.38
O2'	0.03	0.22	0.00	0.02	0.18	0.28	0.27	0.11	0.25	0.34	0.20	0.29	0.22	0.36	0.20	0.00	0.06	0.19	0.46	0.29	0.50	0.40	0.31
O3'	0.36	0.28	0.03	0.01	0.20	0.06	0.18	0.20	0.20	0.19	0.21	0.36	0.32	0.23	0.17	0.06	0.00	0.28	0.25	0.23	0.45	0.30	0.22
O4'	0.00	0.17	0.02	0.02	0.10	0.00	0.06	0.02	0.09	0.10	0.14	0.20	0.17	0.05	0.02	0.19	0.28	0.00	0.20	0.08	0.24	0.59	0.26
O5'	0.39	0.52	0.57	0.31	0.58	0.01	0.69	0.01	0.69	0.75	0.61	0.46	0.49	0.78	0.58	0.46	0.25	0.20	0.00	0.73	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.12	0.41	0.01	0.13	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.29	0.23	0.08	0.73	0.00	0.58	0.57	0.58
OP1	0.34	0.43	0.58	0.42	0.45	0.17	0.53	0.30	0.54	0.54	0.49	0.40	0.40	0.58	0.44	0.50	0.45	0.24	0.02	0.58	0.00	0.00	0.00
OP2	0.49	0.51	0.47	0.24	0.47	0.45	0.50	0.42	0.53	0.44	0.52	0.51	0.49	0.51	0.45	0.40	0.30	0.59	0.02	0.57	0.00	0.00	0.00
P	0.28	0.42	0.43	0.20	0.41	0.12	0.51	0.03	0.53	0.51	0.48	0.39	0.37	0.58	0.38	0.31	0.22	0.26	0.01	0.58	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.12	0.12	0.08	0.08	0.08	0.06	0.06	0.07	0.05	0.06	0.14	0.14	0.08	0.07	0.23	0.11	0.11	0.36	0.14	0.33	0.17
C2	0.13	0.13	0.12	0.09	0.09	0.09	0.07	0.06	0.09	0.07	0.07	0.14	0.16	0.08	0.09	0.23	0.11	0.12	0.37	0.16	0.36	0.18
C2'	0.46	0.42	0.47	0.39	0.37	0.43	0.27	0.37	0.23	0.30	0.30	0.46	0.18	0.24	0.38	0.63	0.43	0.45	0.48	0.38	0.49	0.39
C3'	0.47	0.40	0.38	0.31	0.41	0.42	0.38	0.39	0.35	0.40	0.36	0.44	0.34	0.38	0.43	0.51	0.29	0.50	0.58	0.47	0.55	0.49
C4	0.11	0.13	0.11	0.08	0.08	0.07	0.07	0.06	0.08	0.06	0.07	0.14	0.16	0.09	0.07	0.21	0.11	0.10	0.37	0.14	0.33	0.17
C4'	0.17	0.15	0.13	0.11	0.13	0.12	0.10	0.07	0.11	0.11	0.10	0.17	0.16	0.12	0.13	0.23	0.14	0.18	0.42	0.17	0.30	0.20
C5	0.09	0.14	0.10	0.09	0.07	0.05	0.07	0.07	0.09	0.06	0.08	0.13	0.18	0.10	0.06	0.18	0.11	0.08	0.36	0.15	0.31	0.17
C5'	0.19	0.18	0.15	0.16	0.18	0.15	0.19	0.14	0.20	0.19	0.17	0.19	0.25	0.22	0.18	0.22	0.19	0.21	0.48	0.17	0.22	0.21
C6	0.09	0.14	0.10	0.10	0.08	0.05	0.07	0.07	0.10	0.06	0.09	0.13	0.20	0.10	0.06	0.17	0.11	0.08	0.36	0.16	0.32	0.17
C8	0.10	0.13	0.10	0.10	0.07	0.05	0.07	0.07	0.09	0.06	0.08	0.13	0.17	0.10	0.06	0.19	0.12	0.08	0.36	0.15	0.29	0.16
N1	0.11	0.14	0.11	0.08	0.08	0.07	0.07	0.05	0.09	0.06	0.08	0.14	0.18	0.09	0.08	0.19	0.10	0.10	0.37	0.15	0.34	0.18
N2	0.14	0.12	0.14	0.11	0.09	0.11	0.07	0.07	0.10	0.07	0.08	0.14	0.15	0.08	0.09	0.24	0.14	0.13	0.36	0.17	0.38	0.18
N3	0.13	0.13	0.12	0.08	0.09	0.09	0.07	0.06	0.09	0.07	0.07	0.14	0.15	0.08	0.09	0.23	0.11	0.12	0.37	0.15	0.35	0.18
N7	0.09	0.14	0.10	0.11	0.07	0.05	0.07	0.09	0.09	0.06	0.09	0.13	0.18	0.11	0.05	0.18	0.13	0.07	0.36	0.16	0.29	0.17
N9	0.11	0.13	0.11	0.09	0.08	0.07	0.06	0.06	0.08	0.06	0.07	0.14	0.16	0.09	0.07	0.21	0.11	0.10	0.37	0.14	0.32	0.17
O2'	0.26	0.23	0.35	0.32	0.20	0.28	0.20	0.27	0.22	0.19	0.19	0.26	0.31	0.22	0.21	0.48	0.38	0.24	0.27	0.30	0.54	0.33
O3'	0.27	0.24	0.26	0.27	0.26	0.27	0.29	0.26	0.31	0.29	0.28	0.25	0.36	0.31	0.27	0.30	0.30	0.31	0.47	0.33	0.39	0.35
O4'	0.16	0.16	0.18	0.25	0.16	0.18	0.18	0.21	0.19	0.18	0.17	0.16	0.24	0.21	0.16	0.15	0.27	0.14	0.44	0.18	0.31	0.21
O5'	0.57	0.55	0.55	0.62	0.60	0.58	0.66	0.61	0.68	0.66	0.61	0.55	0.75	0.71	0.61	0.46	0.60	0.59	0.86	0.61	0.57	0.62
O6	0.08	0.15	0.09	0.11	0.08	0.06	0.09	0.09	0.12	0.07	0.12	0.13	0.24	0.11	0.06	0.15	0.13	0.06	0.36	0.18	0.31	0.18
OP1	0.44	0.43	0.48	0.60	0.48	0.51	0.55	0.59	0.56	0.56	0.49	0.42	0.64	0.61	0.49	0.36	0.61	0.45	0.65	0.57	0.59	0.53
OP2	0.49	0.46	0.54	0.66	0.51	0.57	0.58	0.66	0.58	0.60	0.51	0.46	0.65	0.64	0.53	0.44	0.67	0.50	0.65	0.60	0.62	0.57
P	0.45	0.42	0.49	0.61	0.48	0.52	0.55	0.60	0.56	0.57	0.48	0.42	0.64	0.61	0.50	0.37	0.62	0.46	0.69	0.56	0.57	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.14	0.11	0.45	0.15
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.28	0.15	0.44	0.17
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.22	0.18	0.40	0.09
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.03	0.09	0.09	0.09	0.08	0.11	0.10	0.05	0.03	0.01	0.01	0.28	0.26	0.36	0.12
C4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.01	0.28	0.15	0.45	0.17
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.05	0.04	0.03	0.07	0.05	0.02	0.09	0.02	0.00	0.02	0.14	0.39	0.06
C5	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.10	0.01	0.33	0.17	0.42	0.17
C5'	0.02	0.08	0.02	0.03	0.08	0.01	0.10	0.00	0.11	0.09	0.10	0.07	0.13	0.10	0.06	0.09	0.04	0.02	0.01	0.18	0.37	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.09	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.11	0.02	0.34	0.17	0.39	0.17
C8	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.10	0.02	0.32	0.17	0.45	0.18
N1	0.02	0.00	0.04	0.09	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.32	0.16	0.41	0.17
N3	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.02	0.24	0.14	0.46	0.17
N6	0.03	0.01	0.05	0.11	0.01	0.07	0.02	0.13	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.13	0.03	0.36	0.19	0.33	0.15
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.12	0.02	0.36	0.19	0.40	0.18
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.25	0.14	0.46	0.17
O2'	0.02	0.08	0.00	0.03	0.05	0.09	0.04	0.09	0.05	0.04	0.07	0.08	0.05	0.04	0.03	0.00	0.05	0.06	0.12	0.21	0.38	0.09
O3'	0.02	0.10	0.03	0.01	0.07	0.02	0.10	0.04	0.11	0.10	0.10	0.09	0.13	0.12	0.05	0.05	0.00	0.02	0.23	0.33	0.36	0.16
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.06	0.02	0.00	0.08	0.12	0.45	0.18
O5'	0.14	0.28	0.22	0.28	0.28	0.02	0.33	0.01	0.34	0.32	0.32	0.24	0.36	0.36	0.25	0.12	0.23	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.11	0.15	0.18	0.26	0.15	0.14	0.17	0.18	0.17	0.17	0.16	0.14	0.19	0.19	0.14	0.21	0.33	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.45	0.44	0.40	0.36	0.45	0.39	0.42	0.37	0.39	0.45	0.41	0.46	0.33	0.40	0.46	0.38	0.36	0.45	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.17	0.09	0.12	0.17	0.06	0.17	0.01	0.17	0.18	0.17	0.17	0.15	0.18	0.17	0.09	0.16	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00