Doublet Group distance statistics: 52650

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N9	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.004, 0.021, 0.038, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.017
C4	A	0, -0.002, 0.016, 0.033, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.016 std_dev=0.017
N1	A	0, -0.001, 0.017, 0.036, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.017 std_dev=0.019
C6	A	0, -0.009, 0.013, 0.035, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.013 std_dev=0.022
C1'	A	0, -0.004, 0.025, 0.054, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.025 std_dev=0.029
C2	A	0, -0.010, 0.026, 0.061, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.026 std_dev=0.036
N3	A	0, -0.011, 0.025, 0.061, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.025 std_dev=0.036
N2	A	0, -0.011, 0.036, 0.082, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.036 std_dev=0.046
O6	A	0, -0.046, 0.049, 0.144, 0.298 max_d=0.298 avg_d=0.049 std_dev=0.095
C5	B	0, 0.163, 0.391, 0.619, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.391 std_dev=0.228
C6	B	0, 0.093, 0.327, 0.561, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.327 std_dev=0.234
N1	B	0, 0.094, 0.331, 0.568, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.331 std_dev=0.237
C4	B	0, 0.195, 0.433, 0.672, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.433 std_dev=0.238
C2	B	0, 0.151, 0.400, 0.650, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.400 std_dev=0.250
N3	B	0, 0.191, 0.457, 0.723, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.457 std_dev=0.266
N6	B	0, 0.087, 0.374, 0.660, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.374 std_dev=0.286
N7	B	0, 0.199, 0.487, 0.776, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.487 std_dev=0.288
N9	B	0, 0.229, 0.526, 0.823, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.526 std_dev=0.297
C8	B	0, 0.248, 0.554, 0.861, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.554 std_dev=0.307
C1'	B	0, 0.245, 0.627, 1.009, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.627 std_dev=0.382
O4'	A	0, -0.123, 0.324, 0.770, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.324 std_dev=0.447
C2'	B	0, 0.208, 0.659, 1.109, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.659 std_dev=0.450
O4'	B	0, 0.266, 0.718, 1.169, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.718 std_dev=0.451
C2'	A	0, -0.125, 0.330, 0.785, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.330 std_dev=0.455
O2'	A	0, -0.115, 0.373, 0.861, 1.503 max_d=1.503 avg_d=0.373 std_dev=0.488
C3'	B	0, 0.299, 0.793, 1.288, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.793 std_dev=0.494
O2'	B	0, 0.297, 0.808, 1.318, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.808 std_dev=0.510
C4'	B	0, 0.347, 0.872, 1.397, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.872 std_dev=0.525
O3'	B	0, 0.333, 0.958, 1.584, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.958 std_dev=0.625
C5'	B	0, 0.345, 1.007, 1.669, 2.078 max_d=2.078 avg_d=1.007 std_dev=0.662
C3'	A	0, -0.180, 0.505, 1.191, 2.188 max_d=2.188 avg_d=0.505 std_dev=0.686
C4'	A	0, -0.235, 0.502, 1.238, 2.372 max_d=2.372 avg_d=0.502 std_dev=0.736
O5'	B	0, 0.355, 1.134, 1.913, 2.503 max_d=2.503 avg_d=1.134 std_dev=0.779
O3'	A	0, -0.172, 0.694, 1.560, 2.746 max_d=2.746 avg_d=0.694 std_dev=0.866
P	B	0, 0.215, 1.149, 2.083, 3.245 max_d=3.245 avg_d=1.149 std_dev=0.934
OP1	B	0, 0.390, 1.419, 2.447, 3.378 max_d=3.378 avg_d=1.419 std_dev=1.029
OP2	B	0, 0.007, 1.130, 2.252, 3.828 max_d=3.828 avg_d=1.130 std_dev=1.123
C5'	A	0, -0.368, 0.847, 2.062, 3.901 max_d=3.901 avg_d=0.847 std_dev=1.215
O5'	A	0, -0.339, 1.107, 2.552, 4.639 max_d=4.639 avg_d=1.107 std_dev=1.445
P	A	0, -0.783, 1.295, 3.373, 6.635 max_d=6.635 avg_d=1.295 std_dev=2.078
OP2	A	0, -0.818, 1.347, 3.511, 6.924 max_d=6.924 avg_d=1.347 std_dev=2.165
OP1	A	0, -0.991, 1.588, 4.167, 8.304 max_d=8.304 avg_d=1.588 std_dev=2.579

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.07	0.06	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01	0.16	0.05	0.29	0.29	0.30
C2	0.06	0.00	0.27	0.37	0.02	0.08	0.03	0.14	0.02	0.04	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.06	0.42	0.08	0.21	0.02	0.29	0.20	0.15
C2'	0.00	0.27	0.00	0.01	0.16	0.02	0.09	0.04	0.16	0.11	0.22	0.32	0.27	0.05	0.02	0.03	0.07	0.02	0.11	0.16	0.28	0.18	0.19
C3'	0.01	0.37	0.01	0.00	0.28	0.01	0.27	0.02	0.35	0.12	0.37	0.40	0.33	0.18	0.14	0.06	0.04	0.01	0.08	0.38	0.33	0.19	0.14
C4	0.02	0.02	0.16	0.28	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.09	0.29	0.04	0.16	0.04	0.26	0.21	0.21
C4'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.13	0.09	0.10	0.08	0.07	0.11	0.05	0.04	0.05	0.01	0.02	0.18	0.17	0.06	0.10
C5	0.01	0.03	0.09	0.27	0.00	0.11	0.00	0.16	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.30	0.02	0.22	0.05	0.27	0.25	0.22
C5'	0.04	0.14	0.04	0.02	0.11	0.01	0.16	0.00	0.20	0.16	0.17	0.14	0.11	0.17	0.09	0.02	0.07	0.06	0.01	0.26	0.12	0.01	0.02
C6	0.02	0.02	0.16	0.35	0.01	0.13	0.02	0.20	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.10	0.39	0.02	0.25	0.01	0.27	0.22	0.17
C8	0.01	0.04	0.11	0.12	0.03	0.09	0.00	0.16	0.02	0.00	0.02	0.04	0.04	0.00	0.00	0.16	0.15	0.02	0.32	0.08	0.41	0.49	0.41
N1	0.04	0.01	0.22	0.37	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.42	0.06	0.24	0.02	0.29	0.22	0.16
N2	0.07	0.00	0.32	0.40	0.02	0.08	0.02	0.14	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.46	0.09	0.24	0.04	0.33	0.23	0.16
N3	0.06	0.00	0.27	0.33	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.05	0.35	0.08	0.16	0.02	0.26	0.17	0.17
N7	0.01	0.03	0.05	0.18	0.02	0.11	0.00	0.17	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.16	0.22	0.02	0.28	0.09	0.35	0.41	0.34
N9	0.01	0.04	0.02	0.14	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.13	0.15	0.02	0.18	0.06	0.30	0.30	0.29
O2'	0.09	0.06	0.03	0.06	0.09	0.04	0.12	0.02	0.10	0.16	0.09	0.03	0.05	0.16	0.13	0.00	0.03	0.03	0.08	0.09	0.27	0.18	0.17
O3'	0.02	0.42	0.07	0.04	0.29	0.05	0.30	0.07	0.39	0.15	0.42	0.46	0.35	0.22	0.15	0.03	0.00	0.04	0.24	0.43	0.54	0.41	0.33
O4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.06	0.02	0.02	0.06	0.09	0.08	0.02	0.02	0.03	0.04	0.00	0.25	0.03	0.36	0.40	0.41
O5'	0.16	0.21	0.11	0.08	0.16	0.02	0.22	0.01	0.25	0.32	0.24	0.24	0.16	0.28	0.18	0.08	0.24	0.25	0.00	0.31	0.05	0.02	0.01
O6	0.05	0.02	0.16	0.38	0.04	0.18	0.05	0.26	0.01	0.08	0.02	0.04	0.02	0.09	0.06	0.09	0.43	0.03	0.31	0.00	0.29	0.25	0.19
OP1	0.29	0.29	0.28	0.33	0.26	0.17	0.27	0.12	0.27	0.41	0.29	0.33	0.26	0.35	0.30	0.27	0.54	0.36	0.05	0.29	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.20	0.18	0.19	0.21	0.06	0.25	0.01	0.22	0.49	0.22	0.23	0.17	0.41	0.30	0.18	0.41	0.40	0.02	0.25	0.01	0.00	0.01
P	0.30	0.15	0.19	0.14	0.21	0.10	0.22	0.02	0.17	0.41	0.16	0.16	0.17	0.34	0.29	0.17	0.33	0.41	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.19	0.12	0.13	0.17	0.14	0.17	0.21	0.17	0.17	0.17	0.19	0.19	0.18	0.16	0.18	0.11	0.17	0.46	0.42	0.53	0.43
C2	0.14	0.16	0.12	0.13	0.15	0.13	0.15	0.18	0.17	0.15	0.16	0.16	0.19	0.16	0.14	0.19	0.12	0.15	0.41	0.37	0.49	0.37
C2'	0.27	0.22	0.31	0.28	0.22	0.29	0.18	0.31	0.15	0.20	0.16	0.24	0.15	0.17	0.23	0.40	0.31	0.29	0.27	0.18	0.36	0.19
C3'	0.50	0.41	0.50	0.47	0.44	0.52	0.39	0.53	0.36	0.42	0.36	0.44	0.33	0.39	0.46	0.59	0.46	0.53	0.33	0.23	0.34	0.22
C4	0.13	0.16	0.10	0.11	0.14	0.11	0.15	0.20	0.16	0.15	0.15	0.16	0.18	0.16	0.14	0.16	0.10	0.15	0.45	0.41	0.53	0.43
C4'	0.21	0.15	0.18	0.16	0.16	0.21	0.15	0.26	0.13	0.17	0.11	0.17	0.15	0.16	0.18	0.27	0.14	0.25	0.30	0.21	0.38	0.21
C5	0.12	0.16	0.07	0.09	0.14	0.10	0.15	0.21	0.15	0.15	0.14	0.15	0.17	0.16	0.13	0.13	0.08	0.14	0.48	0.44	0.56	0.47
C5'	0.33	0.25	0.29	0.24	0.28	0.34	0.25	0.37	0.22	0.29	0.20	0.28	0.21	0.26	0.30	0.38	0.22	0.38	0.30	0.15	0.29	0.15
C6	0.12	0.16	0.06	0.09	0.15	0.10	0.16	0.22	0.16	0.16	0.16	0.16	0.19	0.17	0.14	0.12	0.07	0.14	0.49	0.46	0.57	0.48
C8	0.11	0.15	0.07	0.08	0.13	0.10	0.13	0.22	0.13	0.14	0.13	0.15	0.15	0.15	0.12	0.13	0.08	0.13	0.47	0.44	0.56	0.47
N1	0.12	0.16	0.09	0.10	0.14	0.11	0.15	0.19	0.16	0.15	0.16	0.16	0.19	0.16	0.14	0.15	0.09	0.14	0.44	0.40	0.51	0.41
N2	0.16	0.17	0.15	0.16	0.16	0.15	0.16	0.18	0.17	0.16	0.17	0.17	0.19	0.16	0.16	0.22	0.16	0.17	0.38	0.35	0.45	0.33
N3	0.14	0.16	0.13	0.13	0.15	0.13	0.15	0.19	0.16	0.15	0.15	0.16	0.19	0.16	0.14	0.19	0.13	0.15	0.41	0.37	0.50	0.38
N7	0.10	0.14	0.06	0.07	0.12	0.09	0.12	0.23	0.12	0.13	0.12	0.14	0.14	0.15	0.11	0.13	0.07	0.13	0.48	0.45	0.57	0.48
N9	0.13	0.16	0.10	0.10	0.14	0.11	0.14	0.21	0.15	0.15	0.15	0.17	0.17	0.16	0.14	0.16	0.10	0.15	0.45	0.42	0.54	0.44
O2'	0.21	0.23	0.16	0.17	0.22	0.18	0.22	0.22	0.23	0.22	0.23	0.24	0.25	0.23	0.21	0.19	0.16	0.23	0.47	0.43	0.55	0.44
O3'	0.61	0.49	0.59	0.56	0.53	0.63	0.48	0.64	0.44	0.53	0.43	0.53	0.40	0.48	0.56	0.68	0.55	0.65	0.44	0.38	0.43	0.37
O4'	0.12	0.15	0.10	0.13	0.14	0.11	0.15	0.19	0.16	0.15	0.15	0.15	0.20	0.18	0.13	0.15	0.13	0.13	0.47	0.44	0.57	0.45
O5'	0.46	0.35	0.41	0.36	0.38	0.46	0.35	0.47	0.31	0.39	0.29	0.39	0.29	0.37	0.41	0.51	0.33	0.50	0.36	0.18	0.24	0.18
O6	0.17	0.19	0.10	0.13	0.19	0.15	0.20	0.26	0.20	0.21	0.20	0.20	0.21	0.22	0.19	0.11	0.11	0.19	0.57	0.54	0.64	0.57
OP1	0.59	0.43	0.48	0.42	0.48	0.59	0.42	0.57	0.35	0.49	0.34	0.49	0.32	0.44	0.52	0.62	0.38	0.67	0.56	0.35	0.24	0.35
OP2	0.52	0.37	0.43	0.36	0.42	0.52	0.36	0.52	0.29	0.44	0.28	0.42	0.27	0.39	0.46	0.55	0.32	0.59	0.47	0.25	0.22	0.26
P	0.37	0.24	0.28	0.23	0.29	0.37	0.26	0.38	0.21	0.32	0.18	0.29	0.23	0.30	0.33	0.40	0.20	0.44	0.42	0.24	0.28	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.14	0.33	0.11
C2	0.05	0.00	0.11	0.10	0.02	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.13	0.05	0.26	0.22	0.43	0.25
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.02	0.06	0.03	0.08	0.02	0.11	0.10	0.07	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.25	0.28	0.25	0.19
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.04	0.07	0.07	0.09	0.09	0.06	0.06	0.04	0.02	0.01	0.03	0.35	0.37	0.22	0.27
C4	0.03	0.02	0.07	0.06	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.06	0.03	0.28	0.24	0.42	0.26
C4'	0.03	0.08	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.08	0.12	0.08	0.07	0.09	0.13	0.06	0.07	0.03	0.00	0.02	0.14	0.33	0.05
C5	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.09	0.00	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.05	0.04	0.36	0.32	0.49	0.36
C5'	0.05	0.13	0.03	0.04	0.16	0.01	0.25	0.00	0.24	0.29	0.19	0.11	0.29	0.31	0.17	0.07	0.05	0.02	0.02	0.20	0.41	0.04
C6	0.02	0.01	0.08	0.07	0.00	0.08	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.15	0.07	0.04	0.37	0.34	0.52	0.38
C8	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.12	0.01	0.29	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.05	0.37	0.30	0.42	0.34
N1	0.05	0.00	0.11	0.09	0.02	0.08	0.01	0.19	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.19	0.11	0.05	0.31	0.28	0.48	0.32
N3	0.05	0.00	0.10	0.09	0.00	0.07	0.01	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.18	0.11	0.05	0.22	0.19	0.40	0.20
N6	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.09	0.01	0.29	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.14	0.06	0.04	0.42	0.42	0.59	0.46
N7	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.13	0.00	0.31	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.06	0.05	0.40	0.37	0.51	0.42
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.17	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.03	0.03	0.27	0.22	0.37	0.23
O2'	0.01	0.20	0.00	0.02	0.12	0.07	0.11	0.07	0.15	0.02	0.19	0.18	0.14	0.06	0.05	0.00	0.04	0.05	0.11	0.19	0.28	0.11
O3'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.06	0.03	0.05	0.05	0.07	0.07	0.11	0.11	0.06	0.06	0.03	0.04	0.00	0.03	0.31	0.40	0.23	0.27
O4'	0.01	0.05	0.03	0.03	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.05	0.04	0.05	0.03	0.05	0.03	0.00	0.08	0.09	0.39	0.11
O5'	0.13	0.26	0.25	0.35	0.28	0.02	0.36	0.02	0.37	0.37	0.31	0.22	0.42	0.40	0.27	0.11	0.31	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01
OP1	0.14	0.22	0.28	0.37	0.24	0.14	0.32	0.20	0.34	0.30	0.28	0.19	0.42	0.37	0.22	0.19	0.40	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.43	0.25	0.22	0.42	0.33	0.49	0.41	0.52	0.42	0.48	0.40	0.59	0.51	0.37	0.28	0.23	0.39	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.25	0.19	0.27	0.26	0.05	0.36	0.04	0.38	0.34	0.32	0.20	0.46	0.42	0.23	0.11	0.27	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00