Doublet Group distance statistics: 52652

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.019 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.006, 0.025, 0.045, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.025 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.005, 0.025, 0.045, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.027 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.002, 0.022, 0.043, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.022 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.005, 0.026, 0.047, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.026 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.032 std_dev=0.023
N3	A	0, -0.001, 0.030, 0.061, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.030 std_dev=0.031
C1'	A	0, 0.002, 0.035, 0.069, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.035 std_dev=0.033
C2	A	0, -0.006, 0.028, 0.062, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.028 std_dev=0.034
N2	A	0, -0.011, 0.062, 0.134, 0.230 max_d=0.230 avg_d=0.062 std_dev=0.073
C4	B	0, 0.243, 0.522, 0.801, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.522 std_dev=0.279
C6	B	0, 0.296, 0.614, 0.932, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.614 std_dev=0.318
N1	B	0, 0.374, 0.709, 1.045, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.709 std_dev=0.336
C5	B	0, 0.330, 0.674, 1.018, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.674 std_dev=0.344
N9	B	0, 0.304, 0.678, 1.052, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.678 std_dev=0.374
C1'	B	0, 0.309, 0.703, 1.096, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.703 std_dev=0.393
N3	B	0, 0.309, 0.716, 1.124, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.716 std_dev=0.407
O4'	A	0, 0.515, 0.927, 1.339, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.927 std_dev=0.412
C2'	A	0, 0.533, 0.973, 1.414, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.973 std_dev=0.440
N6	B	0, 0.391, 0.843, 1.294, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.843 std_dev=0.452
C2	B	0, 0.406, 0.865, 1.323, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.865 std_dev=0.459
C2'	B	0, 0.375, 0.904, 1.432, 1.598 max_d=1.598 avg_d=0.904 std_dev=0.528
O2'	A	0, 0.598, 1.134, 1.671, 1.814 max_d=1.814 avg_d=1.134 std_dev=0.536
N7	B	0, 0.507, 1.085, 1.664, 1.877 max_d=1.877 avg_d=1.085 std_dev=0.578
O4'	B	0, 0.308, 0.893, 1.477, 1.909 max_d=1.909 avg_d=0.893 std_dev=0.585
O2'	B	0, 0.340, 0.926, 1.513, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.926 std_dev=0.587
C8	B	0, 0.452, 1.045, 1.639, 1.792 max_d=1.792 avg_d=1.045 std_dev=0.593
C4'	A	0, 0.770, 1.388, 2.005, 2.163 max_d=2.163 avg_d=1.388 std_dev=0.618
C3'	B	0, 0.519, 1.202, 1.884, 2.030 max_d=2.030 avg_d=1.202 std_dev=0.682
C3'	A	0, 0.840, 1.526, 2.212, 2.392 max_d=2.392 avg_d=1.526 std_dev=0.686
C4'	B	0, 0.512, 1.201, 1.890, 2.236 max_d=2.236 avg_d=1.201 std_dev=0.689
O3'	B	0, 0.624, 1.482, 2.340, 2.628 max_d=2.628 avg_d=1.482 std_dev=0.858
C5'	B	0, 0.694, 1.568, 2.441, 2.852 max_d=2.852 avg_d=1.568 std_dev=0.874
O5'	B	0, 0.997, 1.925, 2.853, 2.937 max_d=2.937 avg_d=1.925 std_dev=0.928
O3'	A	0, 1.248, 2.246, 3.245, 3.444 max_d=3.444 avg_d=2.246 std_dev=0.998
C5'	A	0, 1.281, 2.326, 3.371, 3.650 max_d=3.650 avg_d=2.326 std_dev=1.045
O5'	A	0, 1.416, 2.609, 3.802, 4.168 max_d=4.168 avg_d=2.609 std_dev=1.193
P	B	0, 1.276, 2.548, 3.820, 3.883 max_d=3.883 avg_d=2.548 std_dev=1.272
OP1	B	0, 1.476, 2.913, 4.349, 4.280 max_d=4.280 avg_d=2.913 std_dev=1.436
OP2	B	0, 1.158, 2.909, 4.660, 6.003 max_d=6.003 avg_d=2.909 std_dev=1.751
P	A	0, 2.222, 4.078, 5.934, 6.344 max_d=6.344 avg_d=4.078 std_dev=1.856
OP2	A	0, 2.487, 4.570, 6.653, 6.657 max_d=6.657 avg_d=4.570 std_dev=2.083
OP1	A	0, 2.485, 4.593, 6.700, 7.394 max_d=7.394 avg_d=4.593 std_dev=2.107

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.06	0.12	0.09	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01	0.08	0.02	0.20	0.19	0.11
C2	0.09	0.00	0.21	0.21	0.01	0.12	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.26	0.26	0.08	0.24	0.02	0.35	0.37	0.28
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.02	0.10	0.07	0.17	0.26	0.20	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.08	0.35	0.20	0.12
C3'	0.02	0.21	0.00	0.00	0.11	0.01	0.09	0.03	0.12	0.14	0.17	0.27	0.19	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.07	0.10	0.40	0.28	0.20
C4	0.04	0.01	0.11	0.11	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.12	0.04	0.19	0.01	0.26	0.32	0.23
C4'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.08	0.09	0.10	0.16	0.12	0.09	0.04	0.05	0.05	0.01	0.02	0.08	0.26	0.12	0.08
C5	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.13	0.05	0.21	0.01	0.27	0.37	0.26
C5'	0.02	0.15	0.02	0.03	0.12	0.01	0.15	0.00	0.16	0.15	0.16	0.17	0.14	0.17	0.09	0.05	0.04	0.01	0.00	0.18	0.14	0.06	0.04
C6	0.03	0.01	0.10	0.12	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.16	0.05	0.24	0.01	0.32	0.40	0.29
C8	0.03	0.02	0.07	0.14	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.18	0.08	0.19	0.03	0.23	0.35	0.23
N1	0.06	0.00	0.17	0.17	0.02	0.10	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.21	0.22	0.06	0.25	0.01	0.35	0.40	0.30
N2	0.12	0.01	0.26	0.27	0.02	0.16	0.01	0.17	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.32	0.34	0.12	0.26	0.03	0.39	0.38	0.30
N3	0.09	0.01	0.20	0.19	0.01	0.12	0.00	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.24	0.23	0.09	0.21	0.01	0.31	0.33	0.25
N7	0.02	0.01	0.04	0.11	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.18	0.07	0.21	0.03	0.26	0.39	0.26
N9	0.01	0.03	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.08	0.06	0.03	0.15	0.02	0.20	0.28	0.18
O2'	0.07	0.26	0.00	0.02	0.14	0.05	0.10	0.05	0.14	0.06	0.21	0.32	0.24	0.05	0.08	0.00	0.04	0.05	0.03	0.12	0.43	0.23	0.15
O3'	0.02	0.26	0.03	0.01	0.12	0.05	0.13	0.04	0.16	0.18	0.22	0.34	0.23	0.18	0.06	0.04	0.00	0.04	0.10	0.16	0.62	0.51	0.39
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.08	0.06	0.12	0.09	0.07	0.03	0.05	0.04	0.00	0.10	0.06	0.14	0.23	0.17
O5'	0.08	0.24	0.06	0.07	0.19	0.02	0.21	0.00	0.24	0.19	0.25	0.26	0.21	0.21	0.15	0.03	0.10	0.10	0.00	0.25	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.08	0.10	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.12	0.16	0.06	0.25	0.00	0.33	0.42	0.31
OP1	0.20	0.35	0.35	0.40	0.26	0.26	0.27	0.14	0.32	0.23	0.35	0.39	0.31	0.26	0.20	0.43	0.62	0.14	0.02	0.33	0.00	0.02	0.01
OP2	0.19	0.37	0.20	0.28	0.32	0.12	0.37	0.06	0.40	0.35	0.40	0.38	0.33	0.39	0.28	0.23	0.51	0.23	0.02	0.42	0.02	0.00	0.00
P	0.11	0.28	0.12	0.20	0.23	0.08	0.26	0.04	0.29	0.23	0.30	0.30	0.25	0.26	0.18	0.15	0.39	0.17	0.01	0.31	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.39	0.34	0.44	0.38	0.32	0.36	0.25	0.27	0.22	0.27	0.27	0.36	0.15	0.23	0.33	0.57	0.43	0.36	0.61	0.53	1.00	0.52
C2	0.35	0.31	0.42	0.39	0.28	0.35	0.23	0.33	0.18	0.28	0.21	0.32	0.16	0.25	0.31	0.50	0.43	0.32	0.57	0.61	0.90	0.50
C2'	0.41	0.31	0.45	0.39	0.31	0.39	0.25	0.30	0.20	0.28	0.23	0.35	0.15	0.24	0.34	0.59	0.44	0.39	0.56	0.45	0.88	0.43
C3'	0.41	0.31	0.44	0.38	0.31	0.39	0.25	0.30	0.22	0.29	0.25	0.34	0.17	0.24	0.34	0.58	0.42	0.40	0.53	0.35	0.92	0.41
C4	0.36	0.34	0.41	0.36	0.31	0.33	0.25	0.27	0.21	0.26	0.27	0.35	0.13	0.22	0.31	0.51	0.39	0.32	0.60	0.54	1.01	0.54
C4'	0.37	0.30	0.42	0.35	0.29	0.34	0.23	0.25	0.21	0.25	0.25	0.33	0.17	0.21	0.30	0.55	0.40	0.34	0.51	0.38	0.96	0.43
C5	0.34	0.34	0.38	0.32	0.31	0.29	0.25	0.23	0.24	0.25	0.30	0.34	0.16	0.22	0.30	0.48	0.34	0.31	0.61	0.53	1.11	0.60
C5'	0.35	0.30	0.39	0.34	0.28	0.31	0.25	0.26	0.24	0.26	0.27	0.31	0.23	0.24	0.29	0.51	0.38	0.31	0.43	0.29	0.99	0.41
C6	0.33	0.35	0.36	0.31	0.30	0.28	0.25	0.23	0.24	0.25	0.31	0.34	0.14	0.22	0.30	0.45	0.33	0.29	0.62	0.55	1.13	0.61
C8	0.36	0.35	0.39	0.32	0.31	0.30	0.26	0.23	0.25	0.26	0.30	0.35	0.19	0.23	0.31	0.50	0.35	0.32	0.61	0.52	1.12	0.60
N1	0.33	0.34	0.38	0.34	0.29	0.31	0.23	0.29	0.19	0.26	0.26	0.33	0.15	0.23	0.29	0.47	0.37	0.30	0.59	0.56	1.00	0.54
N2	0.36	0.26	0.45	0.45	0.28	0.40	0.26	0.40	0.19	0.34	0.16	0.29	0.23	0.31	0.33	0.52	0.50	0.34	0.55	0.71	0.77	0.48
N3	0.36	0.31	0.43	0.39	0.30	0.35	0.24	0.32	0.19	0.27	0.23	0.33	0.14	0.24	0.31	0.52	0.44	0.33	0.58	0.60	0.91	0.50
N7	0.34	0.35	0.37	0.30	0.31	0.28	0.27	0.21	0.26	0.26	0.32	0.34	0.21	0.23	0.31	0.47	0.32	0.31	0.62	0.54	1.17	0.63
N9	0.37	0.34	0.41	0.35	0.31	0.33	0.25	0.26	0.23	0.27	0.28	0.36	0.15	0.23	0.32	0.53	0.39	0.34	0.60	0.53	1.03	0.54
O2'	0.44	0.33	0.49	0.43	0.34	0.44	0.26	0.34	0.22	0.30	0.25	0.37	0.17	0.25	0.36	0.64	0.49	0.42	0.57	0.49	0.83	0.41
O3'	0.48	0.33	0.49	0.43	0.35	0.47	0.29	0.37	0.24	0.35	0.26	0.37	0.20	0.29	0.39	0.64	0.48	0.47	0.57	0.34	0.89	0.41
O4'	0.37	0.33	0.42	0.37	0.31	0.34	0.25	0.26	0.23	0.27	0.27	0.35	0.17	0.23	0.32	0.55	0.42	0.33	0.57	0.49	1.02	0.51
O5'	0.38	0.35	0.41	0.36	0.33	0.34	0.30	0.32	0.29	0.31	0.32	0.35	0.28	0.29	0.34	0.51	0.39	0.35	0.40	0.27	1.03	0.44
O6	0.32	0.34	0.34	0.28	0.31	0.25	0.27	0.19	0.28	0.25	0.34	0.34	0.19	0.23	0.30	0.42	0.29	0.28	0.64	0.58	1.24	0.69
OP1	0.47	0.43	0.48	0.45	0.41	0.45	0.39	0.45	0.37	0.43	0.39	0.43	0.38	0.41	0.43	0.55	0.46	0.47	0.49	0.38	1.16	0.59
OP2	0.39	0.31	0.38	0.40	0.35	0.40	0.40	0.46	0.38	0.44	0.32	0.31	0.46	0.46	0.39	0.38	0.39	0.41	0.51	0.51	1.22	0.68
P	0.35	0.31	0.36	0.35	0.31	0.34	0.32	0.37	0.31	0.35	0.30	0.31	0.35	0.35	0.33	0.42	0.35	0.35	0.43	0.40	1.15	0.57

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.24	0.54	0.20	0.24
C2	0.03	0.00	0.13	0.10	0.00	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.20	0.15	0.03	0.45	0.44	0.71	0.36
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.02	0.05	0.07	0.10	0.14	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.31	0.67	0.20	0.31
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.05	0.12	0.07	0.11	0.07	0.10	0.04	0.02	0.00	0.01	0.38	0.59	0.23	0.27
C4	0.02	0.00	0.07	0.05	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.07	0.02	0.47	0.40	0.73	0.37
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.06	0.11	0.02	0.04	0.10	0.11	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.61	0.25	0.35
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.06	0.04	0.55	0.46	1.04	0.57
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.10	0.01	0.17	0.00	0.17	0.19	0.12	0.05	0.23	0.22	0.10	0.03	0.03	0.01	0.01	0.22	0.33	0.02
C6	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.04	0.56	0.50	1.10	0.59
C8	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.11	0.01	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.13	0.04	0.57	0.44	0.99	0.58
N1	0.02	0.00	0.10	0.07	0.00	0.02	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.11	0.03	0.52	0.45	0.94	0.48
N3	0.04	0.00	0.14	0.11	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.15	0.02	0.41	0.45	0.57	0.30
N6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.10	0.02	0.23	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.08	0.08	0.06	0.58	0.59	1.27	0.71
N7	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.11	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.12	0.04	0.61	0.56	1.23	0.72
N9	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.45	0.37	0.64	0.32
O2'	0.02	0.20	0.00	0.02	0.10	0.03	0.06	0.03	0.10	0.04	0.16	0.19	0.08	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.09	0.96	0.29	0.55
O3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.06	0.13	0.11	0.15	0.08	0.12	0.04	0.02	0.00	0.01	0.26	0.75	0.14	0.34
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.03	0.02	0.06	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.10	0.49	0.15	0.27
O5'	0.24	0.45	0.31	0.38	0.47	0.01	0.55	0.01	0.56	0.57	0.52	0.41	0.58	0.61	0.45	0.09	0.26	0.10	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.54	0.44	0.67	0.59	0.40	0.61	0.46	0.22	0.50	0.44	0.45	0.45	0.59	0.56	0.37	0.96	0.75	0.49	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.71	0.20	0.23	0.73	0.25	1.04	0.33	1.10	0.99	0.94	0.57	1.27	1.23	0.64	0.29	0.14	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.36	0.31	0.27	0.37	0.35	0.57	0.02	0.59	0.58	0.48	0.30	0.71	0.72	0.32	0.55	0.34	0.27	0.00	0.00	0.01	0.00