Doublet Group distance statistics: 52653

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.007, 0.014, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.023 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.012, 0.024, 0.035, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.027 std_dev=0.012
O6	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.027 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.014, 0.035, 0.056, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.035 std_dev=0.021
O2'	A	0, 0.130, 0.301, 0.471, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.301 std_dev=0.171
C2'	A	0, 0.098, 0.315, 0.533, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.315 std_dev=0.217
C6	B	0, 0.169, 0.394, 0.619, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.394 std_dev=0.225
C1'	B	0, 0.204, 0.430, 0.657, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.430 std_dev=0.226
C4	B	0, 0.069, 0.301, 0.532, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.301 std_dev=0.231
N9	B	0, 0.181, 0.429, 0.678, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.429 std_dev=0.249
O4'	A	0, 0.116, 0.371, 0.627, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.371 std_dev=0.255
N3	B	0, 0.163, 0.427, 0.690, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.427 std_dev=0.264
C5	B	0, 0.110, 0.393, 0.675, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.393 std_dev=0.283
N1	B	0, 0.164, 0.459, 0.753, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.459 std_dev=0.294
N6	B	0, 0.129, 0.466, 0.802, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.466 std_dev=0.337
C2	B	0, 0.130, 0.505, 0.880, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.505 std_dev=0.375
C8	B	0, 0.264, 0.663, 1.062, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.663 std_dev=0.399
N7	B	0, 0.243, 0.655, 1.067, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.655 std_dev=0.412
C3'	A	0, 0.170, 0.607, 1.044, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.607 std_dev=0.437
O3'	A	0, 0.283, 0.749, 1.215, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.749 std_dev=0.466
C4'	A	0, 0.180, 0.651, 1.123, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.651 std_dev=0.471
C2'	B	0, 0.139, 0.678, 1.217, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.678 std_dev=0.539
O4'	B	0, 0.231, 0.787, 1.343, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.787 std_dev=0.556
O2'	B	0, 0.212, 0.852, 1.492, 1.832 max_d=1.832 avg_d=0.852 std_dev=0.640
C4'	B	0, 0.412, 1.118, 1.823, 2.154 max_d=2.154 avg_d=1.118 std_dev=0.706
C3'	B	0, 0.407, 1.119, 1.831, 2.363 max_d=2.363 avg_d=1.119 std_dev=0.712
C5'	A	0, 0.399, 1.163, 1.927, 1.980 max_d=1.980 avg_d=1.163 std_dev=0.764
O5'	A	0, 1.094, 2.020, 2.946, 2.660 max_d=2.660 avg_d=2.020 std_dev=0.926
O3'	B	0, 0.672, 1.664, 2.656, 3.084 max_d=3.084 avg_d=1.664 std_dev=0.992
C5'	B	0, 0.410, 1.601, 2.793, 3.655 max_d=3.655 avg_d=1.601 std_dev=1.191
O5'	B	0, -0.180, 1.196, 2.573, 4.190 max_d=4.190 avg_d=1.196 std_dev=1.377
P	A	0, 1.821, 3.335, 4.849, 4.317 max_d=4.317 avg_d=3.335 std_dev=1.514
OP1	A	0, 1.924, 3.516, 5.107, 4.654 max_d=4.654 avg_d=3.516 std_dev=1.592
P	B	0, -0.029, 1.809, 3.646, 5.784 max_d=5.784 avg_d=1.809 std_dev=1.838
OP2	B	0, 0.378, 2.259, 4.140, 6.093 max_d=6.093 avg_d=2.259 std_dev=1.881
OP1	B	0, 0.082, 2.130, 4.177, 6.524 max_d=6.524 avg_d=2.130 std_dev=2.048
OP2	A	0, 2.706, 4.938, 7.170, 6.439 max_d=6.439 avg_d=4.938 std_dev=2.232

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.03	0.18	0.23	0.14
C2	0.03	0.00	0.14	0.28	0.01	0.12	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.33	0.03	0.30	0.02	0.32	0.44	0.31
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.03	0.06	0.02	0.08	0.05	0.11	0.16	0.14	0.04	0.03	0.00	0.01	0.02	0.06	0.07	0.24	0.07	0.03
C3'	0.02	0.28	0.00	0.00	0.22	0.00	0.21	0.01	0.25	0.09	0.28	0.29	0.25	0.15	0.13	0.02	0.00	0.01	0.03	0.23	0.24	0.06	0.07
C4	0.02	0.01	0.08	0.22	0.00	0.11	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.24	0.01	0.30	0.02	0.27	0.45	0.31
C4'	0.02	0.12	0.03	0.00	0.11	0.00	0.13	0.00	0.14	0.10	0.13	0.12	0.10	0.12	0.08	0.11	0.02	0.00	0.01	0.14	0.24	0.05	0.08
C5	0.01	0.01	0.06	0.21	0.00	0.13	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.25	0.01	0.35	0.02	0.32	0.58	0.40
C5'	0.03	0.18	0.02	0.01	0.17	0.00	0.21	0.00	0.22	0.17	0.21	0.17	0.15	0.21	0.13	0.10	0.02	0.02	0.01	0.24	0.13	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.25	0.01	0.14	0.01	0.22	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.31	0.02	0.36	0.01	0.36	0.62	0.42
C8	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.10	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.04	0.33	0.02	0.26	0.56	0.38
N1	0.03	0.01	0.11	0.28	0.01	0.13	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.34	0.02	0.34	0.02	0.34	0.54	0.37
N2	0.03	0.00	0.16	0.29	0.01	0.12	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.36	0.03	0.29	0.02	0.34	0.41	0.29
N3	0.03	0.01	0.14	0.25	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.28	0.03	0.27	0.02	0.29	0.38	0.26
N7	0.01	0.01	0.04	0.15	0.00	0.12	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.19	0.03	0.37	0.02	0.35	0.66	0.45
N9	0.01	0.01	0.03	0.13	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.02	0.26	0.02	0.21	0.40	0.27
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.07	0.11	0.07	0.10	0.10	0.03	0.11	0.12	0.10	0.05	0.04	0.00	0.04	0.09	0.07	0.11	0.43	0.12	0.17
O3'	0.01	0.33	0.01	0.00	0.24	0.02	0.25	0.02	0.31	0.11	0.34	0.36	0.28	0.19	0.13	0.04	0.00	0.01	0.14	0.31	0.39	0.27	0.25
O4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.09	0.01	0.00	0.14	0.02	0.18	0.21	0.14
O5'	0.15	0.30	0.06	0.03	0.30	0.01	0.35	0.01	0.36	0.33	0.34	0.29	0.27	0.37	0.26	0.07	0.14	0.14	0.00	0.38	0.01	0.02	0.00
O6	0.03	0.02	0.07	0.23	0.02	0.14	0.02	0.24	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.11	0.31	0.02	0.38	0.00	0.40	0.69	0.46
OP1	0.18	0.32	0.24	0.24	0.27	0.24	0.32	0.13	0.36	0.26	0.34	0.34	0.29	0.35	0.21	0.43	0.39	0.18	0.01	0.40	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.44	0.07	0.06	0.45	0.05	0.58	0.03	0.62	0.56	0.54	0.41	0.38	0.66	0.40	0.12	0.27	0.21	0.02	0.69	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.31	0.03	0.07	0.31	0.08	0.40	0.02	0.42	0.38	0.37	0.29	0.26	0.45	0.27	0.17	0.25	0.14	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.24	0.42	0.47	0.17	0.21	0.19	0.28	0.16	0.25	0.19	0.20	0.21	0.26	0.20	0.28	0.35	0.23	0.49	0.63	1.14	0.67
C2	0.20	0.22	0.37	0.40	0.17	0.17	0.20	0.21	0.17	0.24	0.18	0.17	0.23	0.26	0.20	0.28	0.29	0.23	0.41	0.47	0.99	0.55
C2'	0.30	0.32	0.35	0.30	0.27	0.22	0.24	0.12	0.24	0.25	0.28	0.31	0.24	0.25	0.27	0.36	0.27	0.38	0.37	0.42	1.00	0.52
C3'	0.43	0.44	0.27	0.19	0.42	0.34	0.41	0.21	0.42	0.41	0.43	0.43	0.43	0.42	0.41	0.44	0.29	0.55	0.42	0.43	1.09	0.61
C4	0.18	0.21	0.35	0.44	0.15	0.18	0.18	0.26	0.16	0.24	0.17	0.17	0.22	0.25	0.19	0.26	0.31	0.21	0.43	0.54	1.06	0.61
C4'	0.26	0.30	0.33	0.37	0.25	0.17	0.27	0.15	0.28	0.30	0.29	0.27	0.32	0.31	0.26	0.31	0.32	0.34	0.45	0.58	1.17	0.67
C5	0.14	0.18	0.27	0.44	0.13	0.16	0.16	0.29	0.14	0.21	0.15	0.14	0.20	0.23	0.16	0.27	0.32	0.17	0.37	0.49	1.02	0.57
C5'	0.29	0.34	0.26	0.33	0.30	0.15	0.33	0.12	0.34	0.35	0.35	0.31	0.40	0.37	0.30	0.32	0.27	0.39	0.44	0.60	1.21	0.70
C6	0.13	0.17	0.22	0.42	0.12	0.14	0.16	0.28	0.14	0.20	0.15	0.12	0.21	0.22	0.14	0.29	0.30	0.16	0.32	0.42	0.96	0.52
C8	0.16	0.19	0.31	0.47	0.14	0.18	0.17	0.31	0.14	0.22	0.16	0.16	0.20	0.24	0.17	0.26	0.34	0.18	0.42	0.57	1.09	0.63
N1	0.16	0.18	0.27	0.38	0.14	0.13	0.18	0.22	0.16	0.22	0.16	0.14	0.23	0.24	0.17	0.27	0.26	0.20	0.34	0.41	0.95	0.51
N2	0.22	0.23	0.43	0.40	0.18	0.21	0.21	0.21	0.18	0.26	0.18	0.19	0.22	0.26	0.22	0.32	0.33	0.26	0.43	0.45	0.96	0.52
N3	0.21	0.22	0.40	0.44	0.17	0.20	0.20	0.24	0.17	0.26	0.18	0.18	0.23	0.26	0.21	0.29	0.33	0.24	0.45	0.53	1.05	0.60
N7	0.13	0.18	0.25	0.46	0.12	0.18	0.15	0.33	0.13	0.20	0.15	0.14	0.18	0.22	0.14	0.27	0.35	0.16	0.37	0.52	1.04	0.59
N9	0.19	0.21	0.36	0.46	0.16	0.19	0.18	0.28	0.16	0.24	0.17	0.18	0.21	0.25	0.19	0.26	0.33	0.21	0.46	0.59	1.10	0.64
O2'	0.25	0.24	0.52	0.47	0.19	0.21	0.14	0.23	0.10	0.19	0.16	0.24	0.10	0.16	0.20	0.37	0.36	0.25	0.42	0.52	0.96	0.52
O3'	0.54	0.52	0.31	0.21	0.52	0.50	0.51	0.39	0.51	0.51	0.51	0.53	0.51	0.51	0.52	0.50	0.40	0.70	0.49	0.43	1.10	0.64
O4'	0.20	0.22	0.45	0.55	0.15	0.26	0.19	0.36	0.15	0.27	0.17	0.18	0.22	0.28	0.20	0.26	0.44	0.22	0.56	0.74	1.22	0.76
O5'	0.38	0.43	0.22	0.28	0.40	0.24	0.42	0.18	0.43	0.41	0.44	0.41	0.47	0.43	0.39	0.42	0.32	0.47	0.35	0.47	1.11	0.61
O6	0.09	0.14	0.15	0.43	0.08	0.17	0.12	0.33	0.10	0.16	0.13	0.10	0.17	0.19	0.11	0.33	0.35	0.12	0.26	0.36	0.91	0.47
OP1	0.45	0.48	0.17	0.18	0.46	0.29	0.48	0.18	0.49	0.49	0.49	0.46	0.53	0.51	0.46	0.45	0.22	0.56	0.42	0.58	1.21	0.73
OP2	0.60	0.57	0.52	0.58	0.61	0.51	0.65	0.50	0.65	0.67	0.61	0.57	0.71	0.70	0.62	0.62	0.58	0.65	0.63	0.78	1.29	0.87
P	0.43	0.46	0.33	0.41	0.45	0.30	0.48	0.28	0.49	0.49	0.48	0.44	0.53	0.51	0.45	0.45	0.38	0.50	0.47	0.63	1.22	0.75

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.25	0.00	0.08	0.33	0.30	0.10
C2	0.02	0.00	0.28	0.27	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.34	0.14	0.05	0.19	0.49	0.09
C2'	0.00	0.28	0.00	0.01	0.16	0.01	0.09	0.14	0.15	0.11	0.23	0.27	0.12	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.43	0.21	0.65	0.37
C3'	0.02	0.27	0.01	0.00	0.26	0.00	0.34	0.02	0.37	0.30	0.33	0.22	0.41	0.36	0.21	0.02	0.01	0.02	0.37	0.17	0.44	0.31
C4	0.01	0.00	0.16	0.26	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.21	0.07	0.07	0.19	0.47	0.09
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.16	0.24	0.10	0.07	0.21	0.25	0.12	0.24	0.02	0.00	0.02	0.36	0.06	0.12
C5	0.01	0.00	0.09	0.34	0.00	0.17	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.19	0.02	0.16	0.17	0.55	0.18
C5'	0.02	0.15	0.14	0.02	0.18	0.01	0.30	0.00	0.31	0.34	0.23	0.11	0.38	0.39	0.18	0.09	0.16	0.01	0.01	0.06	0.17	0.02
C6	0.01	0.00	0.15	0.37	0.00	0.16	0.00	0.31	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.24	0.25	0.05	0.16	0.18	0.58	0.20
C8	0.01	0.00	0.11	0.30	0.00	0.24	0.00	0.34	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.31	0.15	0.11	0.19	0.18	0.48	0.17
N1	0.02	0.00	0.23	0.33	0.00	0.10	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.29	0.11	0.10	0.17	0.55	0.15
N3	0.03	0.00	0.27	0.22	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.34	0.14	0.04	0.22	0.44	0.05
N6	0.00	0.00	0.12	0.41	0.00	0.21	0.01	0.38	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.28	0.27	0.03	0.22	0.22	0.63	0.26
N7	0.00	0.00	0.04	0.36	0.00	0.25	0.00	0.39	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.33	0.21	0.07	0.23	0.21	0.57	0.24
N9	0.00	0.01	0.02	0.21	0.00	0.12	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.11	0.01	0.06	0.21	0.41	0.06
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.17	0.24	0.26	0.09	0.24	0.31	0.17	0.12	0.28	0.33	0.19	0.00	0.03	0.17	0.23	0.40	0.47	0.20
O3'	0.25	0.34	0.02	0.01	0.21	0.02	0.19	0.16	0.25	0.15	0.29	0.34	0.27	0.21	0.11	0.03	0.00	0.15	0.40	0.47	0.48	0.42
O4'	0.00	0.14	0.02	0.02	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.11	0.11	0.14	0.03	0.07	0.01	0.17	0.15	0.00	0.14	0.52	0.09	0.25
O5'	0.08	0.05	0.43	0.37	0.07	0.02	0.16	0.01	0.16	0.19	0.10	0.04	0.22	0.23	0.06	0.23	0.40	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.33	0.19	0.21	0.17	0.19	0.36	0.17	0.06	0.18	0.18	0.17	0.22	0.22	0.21	0.21	0.40	0.47	0.52	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	0.49	0.65	0.44	0.47	0.06	0.55	0.17	0.58	0.48	0.55	0.44	0.63	0.57	0.41	0.47	0.48	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.09	0.37	0.31	0.09	0.12	0.18	0.02	0.20	0.17	0.15	0.05	0.26	0.24	0.06	0.20	0.42	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00