Doublet Group distance statistics: 52654

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.001, 0.014, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.014 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.007, 0.021, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.003, 0.019, 0.034, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.003, 0.020, 0.037, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.003, 0.023, 0.043, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C8	A	0, -0.002, 0.032, 0.065, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.032 std_dev=0.033
C6	B	0, 0.153, 0.381, 0.609, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.381 std_dev=0.228
N6	B	0, 0.165, 0.398, 0.631, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.398 std_dev=0.233
C5	B	0, 0.130, 0.374, 0.617, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.374 std_dev=0.244
N1	B	0, 0.156, 0.406, 0.655, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.406 std_dev=0.249
C4	B	0, 0.124, 0.373, 0.623, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.373 std_dev=0.250
C2'	A	0, -0.021, 0.231, 0.483, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.231 std_dev=0.252
N3	B	0, 0.139, 0.410, 0.681, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.410 std_dev=0.271
O4'	A	0, -0.026, 0.247, 0.521, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.247 std_dev=0.273
N9	B	0, 0.094, 0.371, 0.648, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.371 std_dev=0.277
C2	B	0, 0.147, 0.430, 0.713, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.430 std_dev=0.283
N7	B	0, 0.117, 0.403, 0.689, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.403 std_dev=0.286
C1'	B	0, 0.096, 0.384, 0.672, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.384 std_dev=0.288
C8	B	0, 0.091, 0.399, 0.707, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.399 std_dev=0.308
O4'	B	0, 0.136, 0.463, 0.789, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.463 std_dev=0.327
O2'	A	0, -0.059, 0.309, 0.678, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.309 std_dev=0.369
C2'	B	0, 0.130, 0.535, 0.939, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.535 std_dev=0.404
O2'	B	0, 0.160, 0.592, 1.024, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.592 std_dev=0.432
C3'	A	0, -0.052, 0.398, 0.848, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.398 std_dev=0.450
C4'	A	0, -0.068, 0.421, 0.910, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.421 std_dev=0.489
C4'	B	0, 0.109, 0.642, 1.175, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.642 std_dev=0.533
O5'	B	0, 0.125, 0.696, 1.268, 1.538 max_d=1.538 avg_d=0.696 std_dev=0.572
C5'	B	0, 0.121, 0.713, 1.306, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.713 std_dev=0.592
O3'	A	0, -0.047, 0.576, 1.199, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.576 std_dev=0.623
C3'	B	0, 0.024, 0.715, 1.406, 2.053 max_d=2.053 avg_d=0.715 std_dev=0.691
P	B	0, 0.055, 0.863, 1.671, 2.080 max_d=2.080 avg_d=0.863 std_dev=0.808
C5'	A	0, -0.137, 0.674, 1.484, 2.140 max_d=2.140 avg_d=0.674 std_dev=0.811
OP2	B	0, 0.000, 0.853, 1.706, 2.358 max_d=2.358 avg_d=0.853 std_dev=0.853
O5'	A	0, -0.170, 0.688, 1.545, 2.117 max_d=2.117 avg_d=0.688 std_dev=0.857
OP1	B	0, 0.019, 1.039, 2.059, 2.526 max_d=2.526 avg_d=1.039 std_dev=1.020
P	A	0, -0.176, 0.911, 1.999, 2.891 max_d=2.891 avg_d=0.911 std_dev=1.087
O3'	B	0, -0.139, 0.954, 2.047, 3.236 max_d=3.236 avg_d=0.954 std_dev=1.093
OP2	A	0, -0.227, 0.982, 2.191, 3.368 max_d=3.368 avg_d=0.982 std_dev=1.209
OP1	A	0, -0.232, 1.121, 2.475, 3.690 max_d=3.690 avg_d=1.121 std_dev=1.354

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.14	0.02	0.12	0.18	0.15
C2	0.03	0.00	0.21	0.20	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.22	0.16	0.28	0.01	0.29	0.57	0.37
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.12	0.03	0.07	0.01	0.11	0.08	0.17	0.26	0.21	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.09	0.10	0.08	0.05
C3'	0.02	0.20	0.00	0.00	0.17	0.01	0.20	0.02	0.22	0.16	0.21	0.20	0.17	0.19	0.13	0.02	0.00	0.01	0.08	0.23	0.12	0.11	0.09
C4	0.01	0.01	0.12	0.17	0.00	0.02	0.00	0.13	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.17	0.09	0.33	0.01	0.35	0.55	0.41
C4'	0.00	0.07	0.03	0.01	0.02	0.00	0.09	0.00	0.06	0.19	0.03	0.11	0.07	0.17	0.07	0.15	0.02	0.00	0.01	0.10	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.20	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.21	0.06	0.44	0.01	0.53	0.75	0.57
C5'	0.04	0.10	0.01	0.02	0.13	0.00	0.22	0.00	0.21	0.34	0.13	0.12	0.08	0.34	0.17	0.13	0.06	0.03	0.00	0.25	0.05	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.11	0.22	0.01	0.06	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.25	0.09	0.45	0.00	0.55	0.82	0.60
C8	0.01	0.01	0.08	0.16	0.00	0.19	0.01	0.34	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.16	0.09	0.50	0.01	0.57	0.65	0.58
N1	0.03	0.00	0.17	0.21	0.02	0.03	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.25	0.13	0.37	0.00	0.42	0.72	0.50
N2	0.03	0.00	0.26	0.20	0.02	0.11	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.24	0.18	0.23	0.01	0.21	0.52	0.31
N3	0.02	0.01	0.21	0.17	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.18	0.15	0.24	0.01	0.23	0.47	0.31
N7	0.01	0.01	0.03	0.19	0.00	0.17	0.01	0.34	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.20	0.06	0.54	0.01	0.67	0.84	0.68
N9	0.00	0.02	0.02	0.13	0.01	0.07	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.11	0.02	0.32	0.02	0.33	0.45	0.37
O2'	0.04	0.11	0.00	0.02	0.03	0.15	0.08	0.13	0.06	0.14	0.06	0.18	0.12	0.14	0.05	0.00	0.04	0.13	0.04	0.09	0.04	0.07	0.05
O3'	0.02	0.22	0.03	0.00	0.17	0.02	0.21	0.06	0.25	0.16	0.25	0.24	0.18	0.20	0.11	0.04	0.00	0.02	0.17	0.27	0.21	0.23	0.19
O4'	0.00	0.16	0.01	0.01	0.09	0.00	0.06	0.03	0.09	0.09	0.13	0.18	0.15	0.06	0.02	0.13	0.02	0.00	0.10	0.07	0.09	0.15	0.13
O5'	0.14	0.28	0.05	0.08	0.33	0.01	0.44	0.00	0.45	0.50	0.37	0.23	0.24	0.54	0.32	0.04	0.17	0.10	0.00	0.50	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.09	0.23	0.01	0.10	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.27	0.07	0.50	0.00	0.66	0.93	0.69
OP1	0.12	0.29	0.10	0.12	0.35	0.05	0.53	0.05	0.55	0.57	0.42	0.21	0.23	0.67	0.33	0.04	0.21	0.09	0.01	0.66	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.57	0.08	0.11	0.55	0.03	0.75	0.01	0.82	0.65	0.72	0.52	0.47	0.84	0.45	0.07	0.23	0.15	0.01	0.93	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.37	0.05	0.09	0.41	0.02	0.57	0.01	0.60	0.58	0.50	0.31	0.31	0.68	0.37	0.05	0.19	0.13	0.00	0.69	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.13	0.37	0.39	0.12	0.17	0.11	0.19	0.10	0.11	0.10	0.13	0.08	0.11	0.12	0.20	0.29	0.07	0.25	0.21	0.25	0.14
C2	0.11	0.10	0.33	0.37	0.10	0.16	0.08	0.18	0.07	0.10	0.06	0.11	0.07	0.09	0.10	0.21	0.26	0.08	0.22	0.17	0.24	0.11
C2'	0.30	0.33	0.38	0.38	0.30	0.33	0.27	0.31	0.26	0.27	0.30	0.34	0.22	0.25	0.29	0.43	0.57	0.34	0.34	0.14	0.12	0.12
C3'	0.30	0.33	0.31	0.33	0.32	0.34	0.31	0.33	0.31	0.31	0.32	0.33	0.30	0.31	0.31	0.36	0.53	0.39	0.36	0.16	0.10	0.17
C4	0.12	0.14	0.34	0.38	0.12	0.17	0.11	0.18	0.10	0.11	0.12	0.14	0.08	0.10	0.12	0.21	0.27	0.09	0.23	0.18	0.25	0.13
C4'	0.04	0.04	0.32	0.32	0.05	0.08	0.06	0.12	0.07	0.07	0.05	0.04	0.09	0.08	0.05	0.06	0.15	0.08	0.19	0.21	0.28	0.15
C5	0.13	0.16	0.31	0.38	0.14	0.16	0.12	0.18	0.12	0.12	0.15	0.16	0.10	0.11	0.13	0.22	0.26	0.12	0.23	0.18	0.26	0.13
C5'	0.13	0.12	0.40	0.42	0.15	0.17	0.18	0.23	0.19	0.19	0.15	0.12	0.22	0.21	0.15	0.09	0.18	0.08	0.31	0.32	0.31	0.23
C6	0.13	0.16	0.28	0.38	0.14	0.17	0.13	0.18	0.13	0.12	0.16	0.16	0.10	0.11	0.13	0.24	0.25	0.13	0.22	0.18	0.26	0.13
C8	0.13	0.16	0.32	0.38	0.14	0.16	0.13	0.18	0.13	0.12	0.15	0.16	0.11	0.12	0.13	0.22	0.27	0.11	0.23	0.19	0.26	0.13
N1	0.12	0.14	0.30	0.37	0.12	0.16	0.10	0.18	0.09	0.10	0.12	0.14	0.07	0.10	0.12	0.23	0.25	0.11	0.22	0.16	0.25	0.11
N2	0.11	0.07	0.35	0.36	0.09	0.18	0.09	0.19	0.07	0.11	0.04	0.09	0.09	0.11	0.11	0.19	0.26	0.08	0.22	0.19	0.25	0.12
N3	0.11	0.11	0.35	0.37	0.11	0.17	0.09	0.18	0.07	0.10	0.07	0.12	0.07	0.10	0.11	0.20	0.27	0.08	0.23	0.18	0.24	0.12
N7	0.14	0.17	0.30	0.38	0.15	0.17	0.14	0.18	0.14	0.13	0.16	0.16	0.12	0.13	0.14	0.23	0.26	0.13	0.23	0.20	0.26	0.14
N9	0.12	0.14	0.35	0.39	0.13	0.17	0.11	0.19	0.11	0.11	0.12	0.14	0.09	0.11	0.12	0.21	0.28	0.09	0.24	0.19	0.25	0.13
O2'	0.15	0.19	0.36	0.33	0.15	0.18	0.11	0.16	0.10	0.11	0.14	0.19	0.08	0.09	0.14	0.33	0.49	0.16	0.21	0.09	0.25	0.07
O3'	0.36	0.38	0.27	0.32	0.37	0.42	0.36	0.40	0.35	0.36	0.36	0.38	0.33	0.35	0.36	0.37	0.63	0.49	0.40	0.24	0.20	0.27
O4'	0.18	0.16	0.44	0.47	0.15	0.22	0.13	0.25	0.11	0.14	0.14	0.17	0.08	0.12	0.16	0.11	0.21	0.08	0.29	0.35	0.39	0.28
O5'	0.40	0.39	0.56	0.62	0.43	0.45	0.47	0.50	0.48	0.48	0.43	0.39	0.51	0.50	0.44	0.38	0.48	0.39	0.58	0.47	0.39	0.42
O6	0.15	0.18	0.26	0.38	0.16	0.17	0.15	0.18	0.16	0.14	0.18	0.17	0.13	0.13	0.15	0.26	0.24	0.16	0.22	0.21	0.27	0.15
OP1	0.43	0.41	0.56	0.64	0.48	0.48	0.55	0.56	0.56	0.56	0.48	0.40	0.64	0.60	0.49	0.34	0.47	0.44	0.66	0.57	0.51	0.54
OP2	0.84	0.79	0.89	0.98	0.87	0.89	0.93	0.96	0.92	0.94	0.85	0.80	0.98	0.97	0.89	0.79	0.90	0.86	1.04	0.86	0.79	0.87
P	0.55	0.52	0.66	0.75	0.58	0.61	0.64	0.67	0.64	0.65	0.58	0.52	0.70	0.68	0.59	0.49	0.62	0.56	0.76	0.64	0.57	0.62

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.25	0.00	0.14	0.12	0.36	0.20
C2	0.02	0.00	0.23	0.18	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.21	0.11	0.05	0.13	0.37	0.18
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.13	0.00	0.08	0.16	0.12	0.08	0.18	0.22	0.10	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.27	0.28	0.35	0.28
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.20	0.00	0.28	0.01	0.29	0.28	0.24	0.14	0.33	0.32	0.19	0.02	0.00	0.01	0.13	0.19	0.25	0.15
C4	0.01	0.01	0.13	0.20	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.10	0.06	0.04	0.12	0.39	0.19
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.15	0.04	0.03	0.11	0.15	0.07	0.23	0.02	0.00	0.01	0.11	0.17	0.06
C5	0.01	0.01	0.08	0.28	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.22	0.06	0.03	0.08	0.18	0.38	0.19
C5'	0.04	0.02	0.16	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.09	0.14	0.05	0.03	0.13	0.15	0.05	0.06	0.17	0.01	0.01	0.12	0.07	0.01
C6	0.02	0.01	0.12	0.29	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.06	0.05	0.10	0.20	0.37	0.19
C8	0.00	0.01	0.08	0.28	0.00	0.15	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.25	0.13	0.06	0.06	0.17	0.41	0.20
N1	0.02	0.00	0.18	0.24	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.11	0.09	0.07	0.17	0.37	0.18
N3	0.02	0.00	0.22	0.14	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.25	0.11	0.05	0.10	0.38	0.19
N6	0.02	0.01	0.10	0.33	0.01	0.11	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.12	0.04	0.14	0.25	0.36	0.20
N7	0.01	0.01	0.03	0.32	0.00	0.15	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.28	0.16	0.03	0.11	0.22	0.40	0.21
N9	0.00	0.01	0.02	0.19	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.06	0.01	0.04	0.11	0.39	0.19
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.13	0.23	0.22	0.06	0.20	0.25	0.14	0.06	0.25	0.28	0.15	0.00	0.05	0.16	0.18	0.20	0.38	0.21
O3'	0.25	0.21	0.02	0.00	0.10	0.02	0.06	0.17	0.06	0.13	0.11	0.25	0.12	0.16	0.06	0.05	0.00	0.18	0.30	0.53	0.39	0.36
O4'	0.00	0.11	0.02	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.09	0.11	0.04	0.03	0.01	0.16	0.18	0.00	0.09	0.07	0.32	0.18
O5'	0.14	0.05	0.27	0.13	0.04	0.01	0.08	0.01	0.10	0.06	0.07	0.05	0.14	0.11	0.04	0.18	0.30	0.09	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.12	0.13	0.28	0.19	0.12	0.11	0.18	0.12	0.20	0.17	0.17	0.10	0.25	0.22	0.11	0.20	0.53	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.36	0.37	0.35	0.25	0.39	0.17	0.38	0.07	0.37	0.41	0.37	0.38	0.36	0.40	0.39	0.38	0.39	0.32	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.18	0.28	0.15	0.19	0.06	0.19	0.01	0.19	0.20	0.18	0.19	0.20	0.21	0.19	0.21	0.36	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00