Doublet Group distance statistics: 52655

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C8	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.010
O6	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C4	A	0, -0.001, 0.012, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.012 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.002, 0.015, 0.029, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.001, 0.015, 0.029, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.015 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.005, 0.021, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.021 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.004, 0.025, 0.045, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.025 std_dev=0.021
C4	B	0, 0.004, 0.214, 0.424, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.214 std_dev=0.210
C2	B	0, 0.049, 0.282, 0.516, 0.611 max_d=0.611 avg_d=0.282 std_dev=0.233
N1	B	0, 0.035, 0.273, 0.510, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.273 std_dev=0.238
N3	B	0, 0.042, 0.295, 0.548, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.295 std_dev=0.253
C5	B	0, 0.068, 0.331, 0.595, 0.611 max_d=0.611 avg_d=0.331 std_dev=0.264
N9	B	0, 0.000, 0.268, 0.536, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.268 std_dev=0.268
C6	B	0, 0.048, 0.355, 0.662, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.355 std_dev=0.307
C1'	B	0, 0.071, 0.400, 0.730, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.400 std_dev=0.330
C8	B	0, 0.053, 0.404, 0.755, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.404 std_dev=0.351
O4'	B	0, -0.012, 0.341, 0.694, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.341 std_dev=0.353
C4'	B	0, 0.072, 0.477, 0.882, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.477 std_dev=0.405
N7	B	0, 0.061, 0.472, 0.882, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.472 std_dev=0.411
C5'	B	0, 0.071, 0.563, 1.056, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.563 std_dev=0.492
C2'	A	0, -0.199, 0.310, 0.819, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.310 std_dev=0.509
N6	B	0, -0.004, 0.513, 1.030, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.513 std_dev=0.517
O4'	A	0, -0.223, 0.296, 0.814, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.296 std_dev=0.518
OP1	B	0, 0.060, 0.635, 1.210, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.635 std_dev=0.575
P	B	0, 0.043, 0.620, 1.196, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.620 std_dev=0.576
C2'	B	0, 0.024, 0.604, 1.183, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.604 std_dev=0.579
O5'	B	0, 0.054, 0.652, 1.251, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.652 std_dev=0.599
OP2	B	0, 0.021, 0.629, 1.236, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.629 std_dev=0.608
C3'	B	0, 0.058, 0.669, 1.281, 1.612 max_d=1.612 avg_d=0.669 std_dev=0.611
C3'	A	0, -0.285, 0.466, 1.217, 1.957 max_d=1.957 avg_d=0.466 std_dev=0.751
O2'	B	0, -0.071, 0.756, 1.583, 2.281 max_d=2.281 avg_d=0.756 std_dev=0.827
C4'	A	0, -0.362, 0.471, 1.304, 2.134 max_d=2.134 avg_d=0.471 std_dev=0.833
O2'	A	0, -0.344, 0.528, 1.400, 2.265 max_d=2.265 avg_d=0.528 std_dev=0.872
O3'	B	0, 0.006, 0.915, 1.824, 2.467 max_d=2.467 avg_d=0.915 std_dev=0.909
O3'	A	0, -0.376, 0.653, 1.682, 2.694 max_d=2.694 avg_d=0.653 std_dev=1.029
C5'	A	0, -0.455, 0.686, 1.827, 2.958 max_d=2.958 avg_d=0.686 std_dev=1.141
O5'	A	0, -0.367, 0.817, 2.002, 3.153 max_d=3.153 avg_d=0.817 std_dev=1.184
P	A	0, -0.527, 1.394, 3.314, 5.087 max_d=5.087 avg_d=1.394 std_dev=1.921
OP2	A	0, -0.537, 1.617, 3.772, 5.629 max_d=5.629 avg_d=1.617 std_dev=2.155
OP1	A	0, -0.626, 1.575, 3.777, 5.835 max_d=5.835 avg_d=1.575 std_dev=2.201

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.31	0.00	0.14	0.01	0.12	0.31	0.22
C2	0.02	0.00	0.33	0.26	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.17	0.17	0.09	0.01	0.12	0.16	0.11
C2'	0.00	0.33	0.00	0.01	0.17	0.01	0.08	0.18	0.15	0.15	0.27	0.39	0.32	0.08	0.01	0.01	0.04	0.02	0.28	0.12	0.21	0.33	0.28
C3'	0.02	0.26	0.01	0.00	0.26	0.00	0.33	0.01	0.36	0.27	0.33	0.22	0.21	0.34	0.21	0.01	0.00	0.01	0.15	0.39	0.34	0.30	0.22
C4	0.02	0.01	0.17	0.26	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.11	0.08	0.07	0.00	0.07	0.20	0.11
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.11	0.20	0.05	0.08	0.04	0.20	0.09	0.26	0.02	0.00	0.01	0.15	0.15	0.05	0.03
C5	0.01	0.00	0.08	0.33	0.00	0.13	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.29	0.05	0.02	0.16	0.01	0.09	0.15	0.07
C5'	0.05	0.04	0.18	0.01	0.07	0.00	0.16	0.00	0.16	0.21	0.10	0.06	0.04	0.24	0.07	0.07	0.18	0.01	0.00	0.21	0.10	0.01	0.00
C6	0.01	0.01	0.15	0.36	0.00	0.11	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.05	0.06	0.19	0.00	0.12	0.10	0.09
C8	0.01	0.00	0.15	0.27	0.00	0.20	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.10	0.14	0.14	0.01	0.10	0.28	0.12
N1	0.01	0.00	0.27	0.33	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.06	0.12	0.15	0.01	0.13	0.11	0.07
N2	0.03	0.00	0.39	0.22	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.25	0.22	0.08	0.01	0.15	0.18	0.14
N3	0.02	0.00	0.32	0.21	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.23	0.17	0.06	0.01	0.11	0.20	0.14
N7	0.01	0.00	0.08	0.34	0.00	0.20	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.41	0.14	0.08	0.21	0.01	0.12	0.21	0.13
N9	0.01	0.01	0.01	0.21	0.00	0.09	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.27	0.15
O2'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.16	0.26	0.29	0.07	0.26	0.39	0.13	0.14	0.07	0.41	0.21	0.00	0.03	0.18	0.16	0.32	0.15	0.32	0.16
O3'	0.31	0.17	0.04	0.00	0.11	0.02	0.05	0.18	0.05	0.10	0.06	0.25	0.23	0.14	0.10	0.03	0.00	0.20	0.34	0.11	0.76	0.56	0.48
O4'	0.00	0.17	0.02	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.06	0.14	0.12	0.22	0.17	0.08	0.01	0.18	0.20	0.00	0.12	0.03	0.10	0.34	0.24
O5'	0.14	0.09	0.28	0.15	0.07	0.01	0.16	0.00	0.19	0.14	0.15	0.08	0.06	0.21	0.05	0.16	0.34	0.12	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.12	0.39	0.00	0.15	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.32	0.11	0.03	0.24	0.00	0.16	0.11	0.14
OP1	0.12	0.12	0.21	0.34	0.07	0.15	0.09	0.10	0.12	0.10	0.13	0.15	0.11	0.12	0.08	0.15	0.76	0.10	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.16	0.33	0.30	0.20	0.05	0.15	0.01	0.10	0.28	0.11	0.18	0.20	0.21	0.27	0.32	0.56	0.34	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.11	0.28	0.22	0.11	0.03	0.07	0.00	0.09	0.12	0.07	0.14	0.14	0.13	0.15	0.16	0.48	0.24	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.11	0.27	0.25	0.11	0.15	0.15	0.08	0.18	0.14	0.14	0.11	0.25	0.18	0.11	0.31	0.36	0.08	0.07	0.13	0.29	0.13
C2	0.12	0.09	0.27	0.26	0.11	0.16	0.16	0.09	0.19	0.14	0.15	0.09	0.26	0.18	0.11	0.30	0.37	0.09	0.07	0.14	0.33	0.17
C2'	0.26	0.25	0.25	0.20	0.22	0.23	0.18	0.28	0.17	0.20	0.15	0.29	0.24	0.20	0.23	0.32	0.24	0.28	0.34	0.29	0.41	0.28
C3'	0.33	0.30	0.24	0.18	0.32	0.29	0.32	0.39	0.30	0.36	0.25	0.34	0.37	0.36	0.34	0.31	0.18	0.40	0.47	0.46	0.54	0.45
C4	0.12	0.11	0.24	0.21	0.10	0.13	0.14	0.05	0.16	0.13	0.12	0.11	0.24	0.17	0.10	0.28	0.30	0.07	0.08	0.14	0.31	0.14
C4'	0.08	0.10	0.26	0.24	0.04	0.09	0.09	0.05	0.12	0.09	0.06	0.12	0.24	0.14	0.04	0.33	0.39	0.05	0.13	0.15	0.29	0.13
C5	0.13	0.15	0.21	0.17	0.10	0.11	0.13	0.04	0.14	0.13	0.12	0.14	0.23	0.16	0.11	0.25	0.24	0.08	0.09	0.14	0.29	0.12
C5'	0.14	0.16	0.23	0.18	0.09	0.08	0.05	0.11	0.06	0.08	0.05	0.18	0.18	0.11	0.10	0.31	0.32	0.15	0.18	0.24	0.35	0.22
C6	0.13	0.16	0.21	0.17	0.11	0.12	0.13	0.05	0.15	0.13	0.13	0.15	0.24	0.16	0.11	0.24	0.23	0.09	0.09	0.14	0.30	0.13
C8	0.13	0.15	0.21	0.17	0.10	0.11	0.12	0.04	0.14	0.12	0.12	0.14	0.21	0.15	0.10	0.25	0.24	0.08	0.11	0.15	0.28	0.11
N1	0.13	0.12	0.24	0.22	0.11	0.14	0.15	0.07	0.18	0.14	0.14	0.12	0.26	0.17	0.12	0.27	0.29	0.09	0.07	0.14	0.32	0.16
N2	0.11	0.10	0.30	0.31	0.11	0.18	0.17	0.12	0.21	0.14	0.19	0.08	0.27	0.18	0.11	0.32	0.43	0.09	0.10	0.15	0.35	0.19
N3	0.12	0.10	0.27	0.26	0.10	0.16	0.15	0.08	0.19	0.14	0.14	0.10	0.26	0.18	0.11	0.31	0.37	0.08	0.07	0.14	0.33	0.16
N7	0.13	0.16	0.19	0.15	0.11	0.10	0.12	0.05	0.13	0.12	0.13	0.15	0.20	0.15	0.11	0.23	0.21	0.08	0.12	0.16	0.28	0.11
N9	0.12	0.12	0.24	0.21	0.10	0.12	0.13	0.05	0.15	0.13	0.12	0.12	0.24	0.16	0.10	0.28	0.29	0.07	0.08	0.14	0.29	0.12
O2'	0.22	0.21	0.35	0.32	0.22	0.23	0.28	0.16	0.32	0.26	0.27	0.21	0.41	0.31	0.22	0.40	0.42	0.18	0.11	0.22	0.35	0.24
O3'	0.11	0.16	0.36	0.31	0.06	0.11	0.15	0.09	0.20	0.15	0.14	0.15	0.35	0.23	0.06	0.47	0.50	0.08	0.19	0.13	0.25	0.12
O4'	0.25	0.23	0.42	0.42	0.23	0.29	0.26	0.21	0.27	0.25	0.25	0.22	0.33	0.28	0.23	0.45	0.54	0.20	0.16	0.18	0.29	0.18
O5'	0.24	0.24	0.20	0.10	0.18	0.17	0.12	0.24	0.08	0.16	0.10	0.27	0.19	0.16	0.19	0.30	0.20	0.27	0.29	0.33	0.40	0.31
O6	0.14	0.20	0.18	0.15	0.13	0.11	0.13	0.06	0.14	0.13	0.16	0.17	0.22	0.16	0.13	0.21	0.19	0.11	0.12	0.15	0.28	0.11
OP1	0.31	0.29	0.26	0.13	0.20	0.21	0.08	0.24	0.07	0.14	0.10	0.34	0.26	0.15	0.22	0.40	0.23	0.34	0.27	0.27	0.29	0.26
OP2	0.29	0.27	0.25	0.16	0.18	0.19	0.09	0.20	0.12	0.13	0.12	0.30	0.32	0.17	0.19	0.37	0.26	0.31	0.24	0.23	0.25	0.22
P	0.24	0.23	0.25	0.18	0.15	0.14	0.08	0.15	0.09	0.11	0.10	0.26	0.26	0.14	0.16	0.34	0.30	0.25	0.21	0.23	0.28	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.30	0.19
C2	0.05	0.00	0.13	0.10	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.15	0.04	0.10	0.15	0.42	0.22
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.04	0.10	0.12	0.07	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.14	0.14	0.07
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.09	0.07	0.10	0.02	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.24	0.13	0.08
C4	0.03	0.00	0.07	0.04	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.11	0.14	0.41	0.22
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.08	0.02	0.06	0.03	0.07	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.14	0.10	0.07
C5	0.02	0.00	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.02	0.16	0.24	0.45	0.25
C5'	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.00	0.11	0.00	0.10	0.14	0.07	0.01	0.13	0.16	0.07	0.03	0.02	0.01	0.00	0.14	0.02	0.00
C6	0.03	0.01	0.07	0.03	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.07	0.02	0.17	0.27	0.47	0.26
C8	0.02	0.00	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.04	0.17	0.19	0.42	0.23
N1	0.03	0.00	0.10	0.07	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.12	0.03	0.15	0.22	0.45	0.24
N3	0.05	0.00	0.12	0.10	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.14	0.04	0.07	0.10	0.39	0.21
N6	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.03	0.20	0.34	0.48	0.28
N7	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.07	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.04	0.20	0.28	0.47	0.27
N9	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.10	0.37	0.21
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.07	0.03	0.06	0.03	0.09	0.03	0.13	0.14	0.09	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.18	0.13	0.08
O3'	0.01	0.15	0.02	0.00	0.07	0.01	0.04	0.02	0.07	0.09	0.12	0.14	0.05	0.07	0.02	0.02	0.00	0.00	0.10	0.40	0.26	0.19
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.14	0.32	0.24
O5'	0.04	0.10	0.06	0.08	0.11	0.01	0.16	0.00	0.17	0.17	0.15	0.07	0.20	0.20	0.10	0.04	0.10	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.15	0.14	0.24	0.14	0.14	0.24	0.14	0.27	0.19	0.22	0.10	0.34	0.28	0.10	0.18	0.40	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.42	0.14	0.13	0.41	0.10	0.45	0.02	0.47	0.42	0.45	0.39	0.48	0.47	0.37	0.13	0.26	0.32	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.22	0.07	0.08	0.22	0.07	0.25	0.00	0.26	0.23	0.24	0.21	0.28	0.27	0.21	0.08	0.19	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00