Doublet Group distance statistics: 52671

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 15, 13, 18, 4, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.013, 0.019, 0.025, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.015, 0.027, 0.038, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.027 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.012, 0.025, 0.039, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.008, 0.022, 0.035, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.017, 0.032, 0.047, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.032 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.025, 0.040, 0.055, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.012, 0.028, 0.043, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.028 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.019, 0.039, 0.060, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.039 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.037, 0.058, 0.080, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.058 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.006, 0.032, 0.059, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.032 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.025, 0.057, 0.090, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.057 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.023, 0.061, 0.099, 0.218 max_d=0.218 avg_d=0.061 std_dev=0.038
C2	B	0, 0.115, 0.221, 0.328, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.221 std_dev=0.106
C1'	B	0, 0.153, 0.263, 0.373, 0.551 max_d=0.551 avg_d=0.263 std_dev=0.110
N1	B	0, 0.122, 0.247, 0.372, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.247 std_dev=0.125
N3	B	0, 0.121, 0.251, 0.382, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.251 std_dev=0.131
O4'	B	0, 0.167, 0.353, 0.540, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.353 std_dev=0.187
O2	B	0, 0.156, 0.355, 0.554, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.355 std_dev=0.199
C2'	B	0, 0.270, 0.470, 0.670, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.470 std_dev=0.200
C6	B	0, 0.230, 0.444, 0.658, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.444 std_dev=0.214
C4	B	0, 0.261, 0.480, 0.699, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.480 std_dev=0.219
C4'	B	0, 0.173, 0.403, 0.633, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.403 std_dev=0.230
O4'	A	0, -0.070, 0.167, 0.405, 1.782 max_d=1.782 avg_d=0.167 std_dev=0.237
C2'	A	0, -0.045, 0.211, 0.466, 1.949 max_d=1.949 avg_d=0.211 std_dev=0.256
C5	B	0, 0.283, 0.542, 0.802, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.542 std_dev=0.260
C3'	B	0, 0.268, 0.548, 0.829, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.548 std_dev=0.280
N4	B	0, 0.296, 0.577, 0.858, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.577 std_dev=0.281
O2'	B	0, 0.361, 0.649, 0.937, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.649 std_dev=0.288
O2'	A	0, 0.069, 0.385, 0.701, 2.352 max_d=2.352 avg_d=0.385 std_dev=0.316
C5'	B	0, 0.227, 0.601, 0.976, 2.187 max_d=2.187 avg_d=0.601 std_dev=0.375
C4'	A	0, 0.062, 0.450, 0.839, 2.837 max_d=2.837 avg_d=0.450 std_dev=0.388
C3'	A	0, 0.054, 0.443, 0.832, 2.913 max_d=2.913 avg_d=0.443 std_dev=0.389
O3'	B	0, 0.347, 0.741, 1.136, 2.299 max_d=2.299 avg_d=0.741 std_dev=0.395
O3'	A	0, 0.124, 0.600, 1.077, 3.532 max_d=3.532 avg_d=0.600 std_dev=0.476
O5'	B	0, 0.216, 0.709, 1.202, 2.916 max_d=2.916 avg_d=0.709 std_dev=0.493
O5'	A	0, 1.134, 1.634, 2.134, 3.099 max_d=3.099 avg_d=1.634 std_dev=0.500
C5'	A	0, 0.258, 0.869, 1.480, 4.107 max_d=4.107 avg_d=0.869 std_dev=0.611
P	A	0, 1.502, 2.118, 2.734, 3.809 max_d=3.809 avg_d=2.118 std_dev=0.616
OP2	A	0, 1.755, 2.434, 3.112, 5.771 max_d=5.771 avg_d=2.434 std_dev=0.678
P	B	0, 0.260, 0.989, 1.718, 4.499 max_d=4.499 avg_d=0.989 std_dev=0.729
OP1	A	0, 1.612, 2.428, 3.244, 5.501 max_d=5.501 avg_d=2.428 std_dev=0.816
OP2	B	0, 0.296, 1.149, 2.002, 5.032 max_d=5.032 avg_d=1.149 std_dev=0.853
OP1	B	0, 0.209, 1.230, 2.251, 4.986 max_d=4.986 avg_d=1.230 std_dev=1.021

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.14	0.02	0.15	0.17	0.13
C2	0.04	0.00	0.19	0.19	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.19	0.12	0.32	0.02	0.42	0.33	0.34
C2'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.10	0.01	0.06	0.06	0.10	0.10	0.15	0.23	0.18	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.21	0.08	0.23	0.25	0.20
C3'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.15	0.00	0.16	0.02	0.19	0.11	0.20	0.20	0.17	0.14	0.10	0.02	0.01	0.02	0.21	0.19	0.27	0.18	0.17
C4	0.02	0.01	0.10	0.15	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.13	0.07	0.32	0.01	0.39	0.32	0.33
C4'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.11	0.08	0.09	0.07	0.11	0.05	0.10	0.02	0.01	0.02	0.10	0.11	0.25	0.07
C5	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.15	0.04	0.40	0.01	0.50	0.47	0.44
C5'	0.04	0.16	0.06	0.02	0.15	0.01	0.20	0.00	0.21	0.21	0.19	0.17	0.14	0.23	0.13	0.06	0.07	0.02	0.01	0.24	0.18	0.24	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.19	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.19	0.06	0.42	0.01	0.56	0.52	0.48
C8	0.01	0.01	0.10	0.11	0.01	0.11	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.11	0.08	0.39	0.02	0.42	0.41	0.39
N1	0.03	0.01	0.15	0.20	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.21	0.10	0.38	0.01	0.51	0.44	0.42
N2	0.04	0.01	0.23	0.20	0.01	0.09	0.02	0.17	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.23	0.21	0.15	0.29	0.03	0.40	0.30	0.32
N3	0.04	0.01	0.18	0.17	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.16	0.12	0.28	0.01	0.35	0.27	0.29
N7	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.11	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.14	0.05	0.44	0.02	0.53	0.55	0.49
N9	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.02	0.29	0.02	0.31	0.25	0.27
O2'	0.02	0.18	0.00	0.02	0.08	0.10	0.09	0.06	0.10	0.15	0.14	0.23	0.17	0.14	0.06	0.00	0.06	0.08	0.11	0.11	0.16	0.34	0.15
O3'	0.07	0.19	0.03	0.01	0.13	0.02	0.15	0.07	0.19	0.11	0.21	0.21	0.16	0.14	0.07	0.06	0.00	0.07	0.20	0.21	0.34	0.32	0.21
O4'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.08	0.10	0.15	0.12	0.05	0.02	0.08	0.07	0.00	0.07	0.06	0.09	0.22	0.11
O5'	0.14	0.32	0.21	0.21	0.32	0.02	0.40	0.01	0.42	0.39	0.38	0.29	0.28	0.44	0.29	0.11	0.20	0.07	0.00	0.46	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.08	0.19	0.01	0.10	0.01	0.24	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.11	0.21	0.06	0.46	0.00	0.63	0.62	0.54
OP1	0.15	0.42	0.23	0.27	0.39	0.11	0.50	0.18	0.56	0.42	0.51	0.40	0.35	0.53	0.31	0.16	0.34	0.09	0.02	0.63	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.33	0.25	0.18	0.32	0.25	0.47	0.24	0.52	0.41	0.44	0.30	0.27	0.55	0.25	0.34	0.32	0.22	0.02	0.62	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.34	0.20	0.17	0.33	0.07	0.44	0.02	0.48	0.39	0.42	0.32	0.29	0.49	0.27	0.15	0.21	0.11	0.01	0.54	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.11	0.17	0.18	0.13	0.14	0.12	0.15	0.10	0.10	0.10	0.20	0.16	0.25	0.24	0.14	0.31	0.59	0.53	0.35
C2	0.12	0.09	0.15	0.16	0.14	0.11	0.12	0.13	0.09	0.09	0.11	0.20	0.16	0.21	0.20	0.12	0.28	0.53	0.46	0.30
C2'	0.28	0.22	0.28	0.27	0.18	0.26	0.18	0.25	0.20	0.23	0.18	0.20	0.27	0.35	0.31	0.28	0.41	0.62	0.51	0.40
C3'	0.28	0.25	0.27	0.26	0.23	0.26	0.23	0.26	0.23	0.25	0.22	0.25	0.28	0.33	0.30	0.29	0.40	0.63	0.53	0.40
C4	0.12	0.10	0.15	0.16	0.12	0.11	0.11	0.14	0.08	0.09	0.09	0.19	0.16	0.22	0.20	0.12	0.31	0.59	0.52	0.34
C4'	0.16	0.13	0.22	0.24	0.14	0.18	0.13	0.20	0.11	0.12	0.12	0.19	0.18	0.28	0.30	0.16	0.27	0.58	0.52	0.32
C5	0.11	0.10	0.14	0.14	0.11	0.10	0.11	0.14	0.08	0.09	0.08	0.18	0.16	0.20	0.19	0.11	0.31	0.62	0.55	0.34
C5'	0.23	0.22	0.29	0.33	0.24	0.27	0.23	0.30	0.22	0.22	0.22	0.27	0.25	0.32	0.38	0.24	0.30	0.62	0.57	0.36
C6	0.11	0.11	0.14	0.13	0.11	0.09	0.11	0.13	0.08	0.09	0.09	0.17	0.17	0.19	0.17	0.11	0.31	0.62	0.53	0.33
C8	0.12	0.10	0.15	0.15	0.11	0.10	0.11	0.14	0.08	0.09	0.08	0.17	0.16	0.21	0.20	0.11	0.32	0.64	0.57	0.36
N1	0.12	0.10	0.14	0.14	0.13	0.10	0.11	0.13	0.08	0.09	0.09	0.20	0.17	0.19	0.17	0.11	0.29	0.56	0.49	0.31
N2	0.13	0.10	0.16	0.17	0.16	0.13	0.13	0.14	0.10	0.10	0.15	0.20	0.15	0.22	0.21	0.14	0.27	0.49	0.41	0.28
N3	0.13	0.10	0.16	0.17	0.14	0.12	0.12	0.14	0.09	0.09	0.11	0.20	0.15	0.23	0.21	0.13	0.29	0.55	0.48	0.32
N7	0.11	0.11	0.14	0.15	0.10	0.09	0.11	0.14	0.08	0.09	0.09	0.16	0.16	0.20	0.19	0.11	0.32	0.65	0.58	0.36
N9	0.13	0.10	0.16	0.16	0.12	0.11	0.11	0.14	0.08	0.09	0.09	0.19	0.16	0.22	0.21	0.12	0.31	0.61	0.54	0.35
O2'	0.28	0.21	0.29	0.28	0.18	0.28	0.17	0.26	0.19	0.22	0.18	0.21	0.26	0.38	0.33	0.29	0.39	0.59	0.50	0.39
O3'	0.30	0.26	0.31	0.30	0.25	0.30	0.25	0.29	0.25	0.27	0.24	0.27	0.30	0.37	0.34	0.32	0.39	0.60	0.50	0.38
O4'	0.19	0.16	0.24	0.27	0.17	0.21	0.16	0.24	0.15	0.16	0.15	0.22	0.21	0.30	0.33	0.18	0.27	0.60	0.56	0.34
O5'	0.36	0.39	0.35	0.39	0.46	0.38	0.46	0.43	0.42	0.39	0.42	0.51	0.36	0.35	0.40	0.39	0.46	0.70	0.73	0.52
O6	0.12	0.13	0.14	0.14	0.10	0.10	0.11	0.15	0.10	0.11	0.11	0.15	0.17	0.18	0.17	0.11	0.32	0.66	0.56	0.34
OP1	0.52	0.54	0.50	0.55	0.64	0.55	0.65	0.61	0.60	0.55	0.58	0.69	0.50	0.48	0.56	0.56	0.61	0.83	0.89	0.68
OP2	0.42	0.45	0.39	0.44	0.59	0.44	0.59	0.52	0.53	0.47	0.51	0.67	0.40	0.38	0.43	0.46	0.56	0.81	0.87	0.65
P	0.41	0.44	0.41	0.46	0.54	0.44	0.54	0.51	0.50	0.45	0.48	0.60	0.40	0.39	0.47	0.44	0.51	0.76	0.82	0.59

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.12	0.21	0.17	0.11
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.03	0.24	0.43	0.34	0.23
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.08	0.03	0.07	0.07	0.15	0.00	0.02	0.01	0.14	0.25	0.14	0.13
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.09	0.01	0.12	0.02	0.13	0.05	0.09	0.10	0.15	0.02	0.01	0.02	0.18	0.30	0.16	0.17
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.12	0.04	0.33	0.61	0.50	0.32
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.05	0.07	0.07	0.05	0.02	0.01	0.02	0.15	0.21	0.03
C5	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.15	0.04	0.34	0.61	0.48	0.32
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.14	0.08	0.12	0.16	0.09	0.05	0.04	0.02	0.01	0.21	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.04	0.30	0.48	0.34	0.25
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.02	0.22	0.37	0.27	0.19
N3	0.02	0.00	0.07	0.09	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.29	0.54	0.44	0.28
N4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.14	0.04	0.35	0.67	0.57	0.35
O2	0.04	0.01	0.15	0.15	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.14	0.18	0.05	0.21	0.39	0.31	0.21
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.06	0.05	0.06	0.05	0.05	0.03	0.08	0.07	0.14	0.00	0.04	0.05	0.06	0.21	0.15	0.08
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.12	0.02	0.15	0.04	0.14	0.06	0.12	0.14	0.18	0.04	0.00	0.02	0.17	0.42	0.27	0.22
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.09	0.13	0.23	0.13
O5'	0.12	0.24	0.14	0.18	0.33	0.02	0.34	0.01	0.30	0.22	0.29	0.35	0.21	0.06	0.17	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.21	0.43	0.25	0.30	0.61	0.15	0.61	0.21	0.48	0.37	0.54	0.67	0.39	0.21	0.42	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.34	0.14	0.16	0.50	0.21	0.48	0.30	0.34	0.27	0.44	0.57	0.31	0.15	0.27	0.23	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.23	0.13	0.17	0.32	0.03	0.32	0.02	0.25	0.19	0.28	0.35	0.21	0.08	0.22	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00