Doublet Group distance statistics: 52672

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 13, 9, 8, 11, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.015, 0.029, 0.043, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.029 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.011, 0.026, 0.042, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.016, 0.032, 0.048, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.032 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.016, 0.035, 0.053, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.035 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.017, 0.040, 0.062, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.040 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.022, 0.053, 0.084, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.053 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.034, 0.065, 0.097, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.065 std_dev=0.032
N2	A	0, 0.001, 0.037, 0.072, 0.232 max_d=0.232 avg_d=0.037 std_dev=0.036
C8	A	0, 0.038, 0.075, 0.113, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.075 std_dev=0.037
N3	B	0, 0.198, 0.352, 0.506, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.352 std_dev=0.154
C2	B	0, 0.204, 0.365, 0.527, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.365 std_dev=0.161
N1	B	0, 0.215, 0.384, 0.554, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.384 std_dev=0.169
C4	B	0, 0.199, 0.371, 0.542, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.371 std_dev=0.171
C1'	B	0, 0.242, 0.441, 0.640, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.441 std_dev=0.199
O4'	A	0, 0.057, 0.261, 0.466, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.261 std_dev=0.205
N4	B	0, 0.203, 0.411, 0.618, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.411 std_dev=0.208
C2'	B	0, 0.300, 0.513, 0.725, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.513 std_dev=0.213
C6	B	0, 0.204, 0.418, 0.632, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.418 std_dev=0.214
C2'	A	0, 0.103, 0.318, 0.533, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.318 std_dev=0.215
O2	B	0, 0.211, 0.426, 0.642, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.426 std_dev=0.216
C5	B	0, 0.186, 0.417, 0.647, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.417 std_dev=0.231
O2'	B	0, 0.367, 0.609, 0.850, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.609 std_dev=0.242
O4'	B	0, 0.263, 0.522, 0.781, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.522 std_dev=0.259
C3'	B	0, 0.290, 0.582, 0.874, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.582 std_dev=0.292
C4'	B	0, 0.273, 0.603, 0.933, 1.970 max_d=1.970 avg_d=0.603 std_dev=0.330
C4'	A	0, 0.075, 0.421, 0.767, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.421 std_dev=0.346
O3'	B	0, 0.396, 0.759, 1.121, 1.887 max_d=1.887 avg_d=0.759 std_dev=0.362
C3'	A	0, 0.125, 0.507, 0.888, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.507 std_dev=0.381
O2'	A	0, 0.089, 0.473, 0.858, 1.878 max_d=1.878 avg_d=0.473 std_dev=0.384
C5'	B	0, 0.242, 0.701, 1.160, 3.036 max_d=3.036 avg_d=0.701 std_dev=0.459
C5'	A	0, 0.239, 0.705, 1.171, 2.065 max_d=2.065 avg_d=0.705 std_dev=0.466
O5'	A	0, 0.303, 0.850, 1.397, 2.788 max_d=2.788 avg_d=0.850 std_dev=0.547
O3'	A	0, 0.172, 0.793, 1.414, 2.903 max_d=2.903 avg_d=0.793 std_dev=0.621
O5'	B	0, 0.053, 0.788, 1.523, 5.420 max_d=5.420 avg_d=0.788 std_dev=0.735
P	A	0, 0.304, 1.152, 2.000, 4.362 max_d=4.362 avg_d=1.152 std_dev=0.848
P	B	0, -0.014, 0.947, 1.908, 6.981 max_d=6.981 avg_d=0.947 std_dev=0.961
OP1	A	0, 0.306, 1.322, 2.338, 4.392 max_d=4.392 avg_d=1.322 std_dev=1.016
OP2	A	0, 0.227, 1.266, 2.305, 6.110 max_d=6.110 avg_d=1.266 std_dev=1.039
OP1	B	0, -0.104, 1.005, 2.113, 8.049 max_d=8.049 avg_d=1.005 std_dev=1.108
OP2	B	0, -0.138, 1.150, 2.438, 9.306 max_d=9.306 avg_d=1.150 std_dev=1.288

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.16	0.01	0.20	0.02	0.24	0.19	0.17
C2	0.04	0.00	0.21	0.20	0.01	0.06	0.02	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.19	0.20	0.10	0.34	0.03	0.50	0.43	0.36
C2'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.11	0.02	0.06	0.11	0.09	0.11	0.16	0.25	0.21	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.28	0.08	0.38	0.37	0.31
C3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.18	0.01	0.23	0.02	0.24	0.23	0.22	0.21	0.17	0.25	0.15	0.03	0.01	0.02	0.16	0.26	0.30	0.16	0.15
C4	0.02	0.01	0.11	0.18	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.12	0.05	0.37	0.01	0.49	0.43	0.38
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.09	0.14	0.07	0.09	0.06	0.15	0.07	0.19	0.03	0.01	0.02	0.12	0.12	0.18	0.06
C5	0.02	0.02	0.06	0.23	0.01	0.10	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.20	0.15	0.03	0.47	0.02	0.64	0.60	0.52
C5'	0.04	0.09	0.11	0.02	0.09	0.01	0.16	0.00	0.16	0.19	0.12	0.09	0.08	0.21	0.09	0.10	0.12	0.02	0.01	0.20	0.21	0.23	0.02
C6	0.02	0.02	0.09	0.24	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.22	0.17	0.04	0.49	0.01	0.69	0.66	0.55
C8	0.01	0.01	0.11	0.23	0.01	0.14	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.22	0.19	0.08	0.49	0.03	0.57	0.54	0.50
N1	0.04	0.01	0.16	0.22	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.20	0.17	0.07	0.42	0.02	0.61	0.56	0.47
N2	0.05	0.01	0.25	0.21	0.01	0.09	0.02	0.09	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.24	0.27	0.12	0.30	0.05	0.46	0.39	0.31
N3	0.04	0.01	0.21	0.17	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.18	0.20	0.10	0.30	0.02	0.42	0.35	0.30
N7	0.01	0.02	0.08	0.25	0.01	0.15	0.01	0.21	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.25	0.21	0.06	0.54	0.03	0.70	0.69	0.60
N9	0.01	0.02	0.02	0.15	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.08	0.02	0.35	0.02	0.41	0.36	0.33
O2'	0.02	0.19	0.00	0.03	0.14	0.19	0.20	0.10	0.22	0.22	0.20	0.24	0.18	0.25	0.13	0.00	0.06	0.13	0.18	0.25	0.31	0.42	0.26
O3'	0.16	0.20	0.02	0.01	0.12	0.03	0.15	0.12	0.17	0.19	0.17	0.27	0.20	0.21	0.08	0.06	0.00	0.11	0.21	0.21	0.33	0.35	0.24
O4'	0.01	0.10	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.02	0.04	0.08	0.07	0.12	0.10	0.06	0.02	0.13	0.11	0.00	0.14	0.05	0.14	0.15	0.13
O5'	0.20	0.34	0.28	0.16	0.37	0.02	0.47	0.01	0.49	0.49	0.42	0.30	0.30	0.54	0.35	0.18	0.21	0.14	0.00	0.54	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.03	0.08	0.26	0.01	0.12	0.02	0.20	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.25	0.21	0.05	0.54	0.00	0.78	0.77	0.64
OP1	0.24	0.50	0.38	0.30	0.49	0.12	0.64	0.21	0.69	0.57	0.61	0.46	0.42	0.70	0.41	0.31	0.33	0.14	0.03	0.78	0.00	0.02	0.01
OP2	0.19	0.43	0.37	0.16	0.43	0.18	0.60	0.23	0.66	0.54	0.56	0.39	0.35	0.69	0.36	0.42	0.35	0.15	0.02	0.77	0.02	0.00	0.01
P	0.17	0.36	0.31	0.15	0.38	0.06	0.52	0.02	0.55	0.50	0.47	0.31	0.30	0.60	0.33	0.26	0.24	0.13	0.01	0.64	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.11	0.22	0.24	0.12	0.15	0.11	0.15	0.09	0.10	0.10	0.17	0.15	0.26	0.31	0.13	0.25	0.26	0.43	0.27
C2	0.14	0.10	0.21	0.22	0.13	0.15	0.11	0.15	0.09	0.10	0.10	0.18	0.15	0.24	0.27	0.13	0.26	0.26	0.43	0.28
C2'	0.26	0.24	0.34	0.33	0.21	0.27	0.22	0.25	0.22	0.24	0.21	0.23	0.28	0.38	0.40	0.25	0.27	0.31	0.40	0.28
C3'	0.27	0.27	0.33	0.32	0.29	0.27	0.30	0.25	0.29	0.27	0.27	0.31	0.29	0.35	0.37	0.26	0.30	0.32	0.45	0.31
C4	0.14	0.11	0.21	0.21	0.12	0.14	0.11	0.14	0.09	0.11	0.10	0.17	0.16	0.24	0.27	0.12	0.27	0.27	0.48	0.30
C4'	0.15	0.13	0.25	0.26	0.14	0.17	0.15	0.15	0.13	0.13	0.12	0.19	0.17	0.29	0.33	0.14	0.25	0.27	0.43	0.27
C5	0.14	0.13	0.19	0.20	0.12	0.13	0.12	0.14	0.11	0.12	0.11	0.17	0.17	0.22	0.24	0.12	0.30	0.29	0.57	0.35
C5'	0.16	0.15	0.23	0.24	0.19	0.17	0.20	0.15	0.17	0.15	0.16	0.24	0.17	0.28	0.31	0.16	0.26	0.27	0.47	0.28
C6	0.14	0.13	0.18	0.19	0.12	0.13	0.12	0.15	0.11	0.12	0.12	0.17	0.18	0.20	0.23	0.12	0.32	0.30	0.60	0.37
C8	0.14	0.12	0.20	0.21	0.12	0.13	0.13	0.14	0.11	0.11	0.11	0.17	0.17	0.23	0.26	0.13	0.29	0.29	0.55	0.34
N1	0.13	0.12	0.19	0.20	0.12	0.13	0.11	0.14	0.10	0.11	0.10	0.17	0.17	0.21	0.23	0.12	0.29	0.28	0.52	0.33
N2	0.15	0.11	0.23	0.23	0.15	0.17	0.12	0.17	0.11	0.11	0.14	0.19	0.14	0.25	0.28	0.15	0.25	0.26	0.36	0.25
N3	0.14	0.10	0.22	0.23	0.12	0.16	0.11	0.15	0.09	0.10	0.10	0.17	0.15	0.26	0.28	0.14	0.25	0.26	0.42	0.27
N7	0.14	0.13	0.19	0.20	0.13	0.13	0.13	0.15	0.12	0.12	0.12	0.17	0.18	0.22	0.24	0.13	0.31	0.30	0.60	0.37
N9	0.14	0.11	0.21	0.22	0.12	0.14	0.11	0.14	0.10	0.11	0.10	0.17	0.16	0.25	0.28	0.13	0.26	0.27	0.48	0.30
O2'	0.20	0.22	0.29	0.30	0.27	0.22	0.25	0.22	0.23	0.21	0.24	0.31	0.23	0.32	0.37	0.21	0.26	0.30	0.40	0.29
O3'	0.27	0.26	0.37	0.36	0.25	0.28	0.26	0.25	0.26	0.26	0.24	0.27	0.29	0.42	0.44	0.24	0.28	0.33	0.42	0.28
O4'	0.17	0.13	0.25	0.27	0.13	0.19	0.13	0.19	0.12	0.13	0.11	0.17	0.17	0.29	0.34	0.16	0.29	0.31	0.48	0.32
O5'	0.37	0.38	0.36	0.37	0.47	0.37	0.48	0.37	0.44	0.40	0.42	0.52	0.35	0.38	0.39	0.39	0.43	0.43	0.62	0.47
O6	0.15	0.16	0.17	0.19	0.14	0.15	0.14	0.17	0.13	0.14	0.15	0.17	0.19	0.18	0.22	0.14	0.36	0.34	0.68	0.43
OP1	0.61	0.62	0.54	0.56	0.75	0.61	0.76	0.65	0.71	0.65	0.67	0.81	0.56	0.53	0.54	0.66	0.70	0.70	0.88	0.76
OP2	0.53	0.55	0.49	0.50	0.69	0.53	0.71	0.56	0.65	0.57	0.60	0.76	0.47	0.48	0.49	0.57	0.62	0.63	0.84	0.68
P	0.42	0.44	0.39	0.40	0.57	0.42	0.58	0.45	0.53	0.46	0.50	0.63	0.39	0.39	0.40	0.46	0.51	0.51	0.73	0.57

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.06	0.02	0.02	0.01	0.10	0.12	0.22	0.11
C2	0.04	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.09	0.04	0.20	0.19	0.39	0.22
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.06	0.02	0.08	0.02	0.09	0.03	0.07	0.07	0.14	0.01	0.02	0.01	0.13	0.17	0.15	0.10
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.11	0.01	0.15	0.02	0.15	0.06	0.09	0.12	0.13	0.02	0.01	0.01	0.18	0.24	0.15	0.15
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.13	0.04	0.36	0.34	0.66	0.42
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.10	0.04	0.04	0.08	0.07	0.06	0.03	0.00	0.02	0.10	0.12	0.02
C5	0.02	0.02	0.08	0.15	0.00	0.11	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.18	0.07	0.42	0.39	0.71	0.48
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.14	0.01	0.18	0.00	0.16	0.08	0.10	0.16	0.08	0.06	0.04	0.02	0.01	0.11	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.10	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.16	0.07	0.37	0.32	0.56	0.38
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.02	0.22	0.19	0.37	0.22
N3	0.03	0.01	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.10	0.03	0.28	0.25	0.52	0.32
N4	0.03	0.02	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.08	0.15	0.04	0.39	0.38	0.75	0.48
O2	0.06	0.01	0.14	0.13	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.15	0.16	0.09	0.13	0.16	0.28	0.14
O2'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.07	0.06	0.06	0.06	0.06	0.03	0.09	0.08	0.15	0.00	0.04	0.05	0.07	0.15	0.13	0.06
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.13	0.03	0.18	0.04	0.16	0.06	0.10	0.15	0.16	0.04	0.00	0.02	0.18	0.35	0.20	0.18
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.02	0.07	0.02	0.03	0.04	0.09	0.05	0.02	0.00	0.08	0.13	0.22	0.12
O5'	0.10	0.20	0.13	0.18	0.36	0.02	0.42	0.01	0.37	0.22	0.28	0.39	0.13	0.07	0.18	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.19	0.17	0.24	0.34	0.10	0.39	0.11	0.32	0.19	0.25	0.38	0.16	0.15	0.35	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.22	0.39	0.15	0.15	0.66	0.12	0.71	0.12	0.56	0.37	0.52	0.75	0.28	0.13	0.20	0.22	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.22	0.10	0.15	0.42	0.02	0.48	0.02	0.38	0.22	0.32	0.48	0.14	0.06	0.18	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00