Doublet Group distance statistics: 52673

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 1, 6, 7, 8, 10, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.021 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.016, 0.030, 0.045, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.030 std_dev=0.014
N2	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.026 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.015, 0.030, 0.046, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.030 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.017, 0.036, 0.055, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.036 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.023, 0.046, 0.068, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.046 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.021, 0.046, 0.072, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.046 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.038, 0.072, 0.107, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.072 std_dev=0.034
C8	A	0, 0.046, 0.087, 0.128, 0.174 max_d=0.174 avg_d=0.087 std_dev=0.041
C4	B	0, 0.380, 0.568, 0.756, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.568 std_dev=0.188
C5	B	0, 0.390, 0.581, 0.772, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.581 std_dev=0.191
N1	B	0, 0.374, 0.571, 0.768, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.571 std_dev=0.197
N4	B	0, 0.423, 0.622, 0.821, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.622 std_dev=0.199
C6	B	0, 0.367, 0.567, 0.767, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.567 std_dev=0.200
C2'	B	0, 0.464, 0.669, 0.874, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.669 std_dev=0.205
C1'	B	0, 0.452, 0.658, 0.864, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.658 std_dev=0.206
C2	B	0, 0.370, 0.576, 0.783, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.576 std_dev=0.207
N3	B	0, 0.362, 0.571, 0.780, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.571 std_dev=0.209
C3'	B	0, 0.482, 0.728, 0.973, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.728 std_dev=0.246
O4'	B	0, 0.486, 0.732, 0.977, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.732 std_dev=0.246
O2	B	0, 0.371, 0.617, 0.864, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.617 std_dev=0.246
C2'	A	0, 0.056, 0.316, 0.575, 1.652 max_d=1.652 avg_d=0.316 std_dev=0.259
O4'	A	0, 0.023, 0.292, 0.562, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.292 std_dev=0.270
O2'	B	0, 0.525, 0.820, 1.114, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.820 std_dev=0.295
O2'	A	0, 0.132, 0.430, 0.728, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.430 std_dev=0.298
C4'	B	0, 0.451, 0.749, 1.047, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.749 std_dev=0.298
O3'	B	0, 0.518, 0.864, 1.209, 1.752 max_d=1.752 avg_d=0.864 std_dev=0.345
C5'	B	0, 0.493, 0.856, 1.220, 1.897 max_d=1.897 avg_d=0.856 std_dev=0.363
C4'	A	0, 0.083, 0.493, 0.904, 2.492 max_d=2.492 avg_d=0.493 std_dev=0.410
C3'	A	0, 0.066, 0.525, 0.983, 2.669 max_d=2.669 avg_d=0.525 std_dev=0.459
O5'	B	0, 0.507, 1.050, 1.594, 3.176 max_d=3.176 avg_d=1.050 std_dev=0.544
C5'	A	0, 0.085, 0.741, 1.397, 4.089 max_d=4.089 avg_d=0.741 std_dev=0.656
O3'	A	0, 0.116, 0.839, 1.562, 3.892 max_d=3.892 avg_d=0.839 std_dev=0.723
P	B	0, 0.515, 1.271, 2.027, 3.682 max_d=3.682 avg_d=1.271 std_dev=0.756
OP2	B	0, 0.623, 1.445, 2.268, 3.717 max_d=3.717 avg_d=1.445 std_dev=0.823
OP1	B	0, 0.571, 1.509, 2.446, 4.358 max_d=4.358 avg_d=1.509 std_dev=0.938
O5'	A	0, -0.152, 0.795, 1.742, 5.765 max_d=5.765 avg_d=0.795 std_dev=0.947
P	A	0, -0.270, 0.946, 2.163, 7.705 max_d=7.705 avg_d=0.946 std_dev=1.217
OP2	A	0, -0.324, 1.012, 2.349, 8.421 max_d=8.421 avg_d=1.012 std_dev=1.336
OP1	A	0, -0.307, 1.147, 2.601, 9.235 max_d=9.235 avg_d=1.147 std_dev=1.454

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.11	0.00	0.14	0.02	0.21	0.20	0.11
C2	0.02	0.00	0.19	0.19	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.26	0.11	0.31	0.01	0.42	0.36	0.29
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.10	0.02	0.07	0.08	0.11	0.08	0.16	0.23	0.18	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.20	0.10	0.26	0.20	0.16
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.14	0.00	0.17	0.03	0.19	0.17	0.20	0.21	0.17	0.18	0.11	0.02	0.01	0.02	0.29	0.20	0.34	0.17	0.24
C4	0.01	0.01	0.10	0.14	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.15	0.06	0.31	0.01	0.31	0.38	0.28
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.10	0.07	0.08	0.06	0.10	0.05	0.12	0.02	0.00	0.03	0.09	0.16	0.26	0.08
C5	0.01	0.01	0.07	0.17	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.16	0.03	0.40	0.01	0.37	0.55	0.41
C5'	0.05	0.13	0.08	0.03	0.12	0.01	0.16	0.00	0.17	0.17	0.15	0.14	0.11	0.19	0.11	0.06	0.07	0.02	0.01	0.19	0.16	0.31	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.19	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.21	0.05	0.41	0.00	0.40	0.59	0.42
C8	0.01	0.01	0.08	0.17	0.00	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.14	0.07	0.46	0.02	0.38	0.55	0.46
N1	0.02	0.00	0.16	0.20	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.24	0.08	0.36	0.01	0.40	0.48	0.34
N2	0.03	0.00	0.23	0.21	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.32	0.13	0.30	0.02	0.50	0.32	0.30
N3	0.02	0.00	0.18	0.17	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.23	0.10	0.26	0.01	0.39	0.30	0.24
N7	0.01	0.01	0.06	0.18	0.00	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.16	0.04	0.49	0.02	0.45	0.68	0.53
N9	0.00	0.01	0.03	0.11	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.07	0.01	0.30	0.02	0.25	0.34	0.26
O2'	0.02	0.24	0.00	0.02	0.15	0.12	0.14	0.06	0.18	0.09	0.22	0.27	0.22	0.11	0.08	0.00	0.05	0.09	0.12	0.17	0.29	0.23	0.12
O3'	0.11	0.26	0.02	0.01	0.15	0.02	0.16	0.07	0.21	0.14	0.24	0.32	0.23	0.16	0.07	0.05	0.00	0.08	0.26	0.22	0.44	0.31	0.29
O4'	0.00	0.11	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.07	0.08	0.13	0.10	0.04	0.01	0.09	0.08	0.00	0.09	0.04	0.21	0.26	0.15
O5'	0.14	0.31	0.20	0.29	0.31	0.03	0.40	0.01	0.41	0.46	0.36	0.30	0.26	0.49	0.30	0.12	0.26	0.09	0.00	0.45	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.10	0.20	0.01	0.09	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.17	0.22	0.04	0.45	0.00	0.46	0.70	0.49
OP1	0.21	0.42	0.26	0.34	0.31	0.16	0.37	0.16	0.40	0.38	0.40	0.50	0.39	0.45	0.25	0.29	0.44	0.21	0.02	0.46	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.36	0.20	0.17	0.38	0.26	0.55	0.31	0.59	0.55	0.48	0.32	0.30	0.68	0.34	0.23	0.31	0.26	0.02	0.70	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.29	0.16	0.24	0.28	0.08	0.41	0.02	0.42	0.46	0.34	0.30	0.24	0.53	0.26	0.12	0.29	0.15	0.01	0.49	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.11	0.20	0.24	0.17	0.16	0.16	0.20	0.11	0.11	0.13	0.25	0.15	0.22	0.29	0.14	0.36	0.42	0.61	0.37
C2	0.15	0.11	0.19	0.22	0.19	0.15	0.16	0.20	0.12	0.11	0.15	0.27	0.16	0.20	0.25	0.14	0.35	0.38	0.56	0.34
C2'	0.25	0.22	0.30	0.33	0.24	0.26	0.24	0.28	0.22	0.22	0.22	0.29	0.24	0.30	0.37	0.25	0.45	0.48	0.64	0.44
C3'	0.27	0.25	0.31	0.32	0.27	0.27	0.26	0.29	0.25	0.25	0.25	0.32	0.27	0.31	0.36	0.27	0.47	0.49	0.67	0.46
C4	0.15	0.12	0.19	0.22	0.17	0.15	0.16	0.21	0.12	0.11	0.13	0.25	0.17	0.21	0.27	0.14	0.39	0.44	0.63	0.39
C4'	0.18	0.13	0.24	0.27	0.17	0.19	0.16	0.21	0.13	0.13	0.14	0.24	0.17	0.27	0.33	0.16	0.37	0.41	0.61	0.37
C5	0.16	0.14	0.19	0.22	0.16	0.16	0.15	0.22	0.12	0.12	0.12	0.23	0.19	0.20	0.26	0.14	0.43	0.49	0.67	0.43
C5'	0.23	0.20	0.31	0.33	0.23	0.25	0.23	0.26	0.20	0.20	0.20	0.29	0.23	0.33	0.40	0.21	0.40	0.41	0.63	0.39
C6	0.16	0.16	0.19	0.22	0.15	0.17	0.15	0.23	0.13	0.13	0.13	0.22	0.21	0.20	0.26	0.14	0.44	0.50	0.67	0.44
C8	0.15	0.13	0.19	0.23	0.16	0.16	0.16	0.22	0.12	0.12	0.12	0.22	0.18	0.20	0.27	0.14	0.42	0.50	0.69	0.44
N1	0.16	0.13	0.19	0.21	0.17	0.16	0.15	0.21	0.11	0.12	0.12	0.26	0.20	0.20	0.25	0.14	0.40	0.44	0.61	0.39
N2	0.15	0.12	0.19	0.22	0.22	0.15	0.18	0.19	0.13	0.11	0.20	0.28	0.14	0.21	0.25	0.14	0.30	0.33	0.51	0.30
N3	0.15	0.11	0.19	0.23	0.19	0.15	0.16	0.20	0.12	0.11	0.14	0.27	0.15	0.21	0.27	0.14	0.35	0.39	0.58	0.35
N7	0.16	0.14	0.19	0.23	0.15	0.16	0.16	0.23	0.13	0.13	0.13	0.21	0.19	0.20	0.27	0.14	0.45	0.53	0.71	0.46
N9	0.15	0.12	0.19	0.23	0.17	0.15	0.16	0.21	0.12	0.11	0.13	0.24	0.16	0.21	0.27	0.14	0.39	0.45	0.64	0.40
O2'	0.30	0.29	0.35	0.38	0.31	0.31	0.30	0.32	0.29	0.29	0.29	0.34	0.30	0.34	0.42	0.30	0.46	0.49	0.62	0.44
O3'	0.38	0.35	0.42	0.43	0.33	0.38	0.33	0.38	0.33	0.35	0.33	0.36	0.38	0.44	0.47	0.38	0.54	0.55	0.70	0.52
O4'	0.22	0.17	0.27	0.29	0.18	0.23	0.17	0.25	0.16	0.17	0.16	0.24	0.21	0.31	0.35	0.20	0.36	0.41	0.60	0.36
O5'	0.40	0.38	0.43	0.45	0.43	0.41	0.43	0.43	0.40	0.39	0.40	0.48	0.38	0.46	0.51	0.41	0.51	0.52	0.74	0.51
O6	0.18	0.19	0.20	0.24	0.15	0.19	0.16	0.26	0.14	0.16	0.17	0.19	0.23	0.20	0.27	0.16	0.47	0.56	0.71	0.48
OP1	0.62	0.53	0.72	0.73	0.49	0.68	0.51	0.64	0.53	0.55	0.48	0.51	0.58	0.80	0.84	0.61	0.65	0.63	0.79	0.61
OP2	0.44	0.47	0.43	0.45	0.62	0.44	0.61	0.49	0.54	0.47	0.53	0.71	0.43	0.45	0.49	0.46	0.68	0.71	0.99	0.72
P	0.41	0.38	0.47	0.48	0.44	0.44	0.44	0.43	0.40	0.39	0.39	0.51	0.39	0.53	0.57	0.41	0.54	0.55	0.78	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.16	0.17	0.31	0.16
C2	0.02	0.00	0.09	0.10	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.04	0.31	0.34	0.45	0.29
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.02	0.06	0.02	0.08	0.02	0.07	0.04	0.15	0.00	0.02	0.01	0.18	0.21	0.23	0.13
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.11	0.01	0.14	0.03	0.14	0.07	0.10	0.12	0.14	0.02	0.01	0.02	0.22	0.27	0.20	0.17
C4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.03	0.45	0.54	0.61	0.44
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.11	0.06	0.06	0.10	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.15	0.24	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.16	0.04	0.47	0.55	0.60	0.46
C5'	0.04	0.14	0.02	0.03	0.21	0.01	0.23	0.00	0.21	0.14	0.17	0.23	0.11	0.06	0.06	0.02	0.01	0.22	0.27	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.11	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.05	0.41	0.43	0.48	0.36
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.30	0.31	0.40	0.26
N3	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.12	0.04	0.39	0.45	0.54	0.37
N4	0.02	0.01	0.04	0.12	0.00	0.10	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.14	0.03	0.48	0.61	0.67	0.50
O2	0.04	0.01	0.15	0.14	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.17	0.07	0.24	0.27	0.40	0.23
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.06	0.06	0.04	0.06	0.05	0.03	0.10	0.06	0.17	0.00	0.06	0.06	0.07	0.18	0.22	0.07
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.13	0.02	0.16	0.06	0.15	0.06	0.12	0.14	0.17	0.06	0.00	0.02	0.19	0.36	0.28	0.21
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.04	0.03	0.07	0.06	0.02	0.00	0.15	0.17	0.35	0.20
O5'	0.16	0.31	0.18	0.22	0.45	0.02	0.47	0.01	0.41	0.30	0.39	0.48	0.24	0.07	0.19	0.15	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.17	0.34	0.21	0.27	0.54	0.15	0.55	0.22	0.43	0.31	0.45	0.61	0.27	0.18	0.36	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.45	0.23	0.20	0.61	0.24	0.60	0.27	0.48	0.40	0.54	0.67	0.40	0.22	0.28	0.35	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.29	0.13	0.17	0.44	0.05	0.46	0.02	0.36	0.26	0.37	0.50	0.23	0.07	0.21	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00