Doublet Group distance statistics: 52675

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 4, 3, 7, 4, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.001, 0.015, 0.028, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.015 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.002, 0.018, 0.034, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.012, 0.030, 0.047, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.030 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.017 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.005, 0.026, 0.046, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.026 std_dev=0.021
C4	A	0, -0.002, 0.020, 0.042, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.020 std_dev=0.022
N9	A	0, -0.003, 0.022, 0.048, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.022 std_dev=0.025
N7	A	0, -0.002, 0.029, 0.060, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.029 std_dev=0.031
C8	A	0, -0.005, 0.037, 0.080, 0.204 max_d=0.204 avg_d=0.037 std_dev=0.043
C2	B	0, 0.143, 0.289, 0.435, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.289 std_dev=0.146
N3	B	0, 0.203, 0.362, 0.521, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.362 std_dev=0.159
N1	B	0, 0.118, 0.288, 0.459, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.288 std_dev=0.170
C1'	B	0, 0.121, 0.297, 0.474, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.297 std_dev=0.177
O4'	B	0, 0.163, 0.381, 0.598, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.381 std_dev=0.218
O2	B	0, 0.142, 0.363, 0.584, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.363 std_dev=0.221
C2'	B	0, 0.182, 0.409, 0.637, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.409 std_dev=0.228
C4	B	0, 0.228, 0.465, 0.701, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.465 std_dev=0.237
C4'	B	0, 0.232, 0.482, 0.732, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.482 std_dev=0.250
C6	B	0, 0.188, 0.445, 0.703, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.445 std_dev=0.258
C3'	B	0, 0.241, 0.503, 0.765, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.503 std_dev=0.262
C5	B	0, 0.253, 0.543, 0.833, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.543 std_dev=0.290
N4	B	0, 0.310, 0.601, 0.891, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.601 std_dev=0.290
O2'	B	0, 0.231, 0.539, 0.847, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.539 std_dev=0.308
C5'	B	0, 0.329, 0.698, 1.066, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.698 std_dev=0.369
O3'	B	0, 0.262, 0.646, 1.030, 1.860 max_d=1.860 avg_d=0.646 std_dev=0.384
O5'	B	0, 0.342, 0.817, 1.291, 2.106 max_d=2.106 avg_d=0.817 std_dev=0.474
C2'	A	0, -0.209, 0.281, 0.770, 2.409 max_d=2.409 avg_d=0.281 std_dev=0.490
O4'	A	0, -0.244, 0.255, 0.754, 2.352 max_d=2.352 avg_d=0.255 std_dev=0.499
P	B	0, 0.395, 0.985, 1.575, 2.145 max_d=2.145 avg_d=0.985 std_dev=0.590
C3'	A	0, -0.223, 0.423, 1.069, 2.954 max_d=2.954 avg_d=0.423 std_dev=0.646
OP1	B	0, 0.410, 1.065, 1.719, 2.471 max_d=2.471 avg_d=1.065 std_dev=0.655
O2'	A	0, -0.269, 0.403, 1.076, 3.495 max_d=3.495 avg_d=0.403 std_dev=0.673
C4'	A	0, -0.248, 0.427, 1.101, 3.140 max_d=3.140 avg_d=0.427 std_dev=0.675
O3'	A	0, -0.106, 0.575, 1.256, 2.670 max_d=2.670 avg_d=0.575 std_dev=0.681
OP2	B	0, 0.428, 1.168, 1.908, 2.951 max_d=2.951 avg_d=1.168 std_dev=0.740
C5'	A	0, -0.358, 0.740, 1.837, 5.150 max_d=5.150 avg_d=0.740 std_dev=1.098
O5'	A	0, -0.571, 0.905, 2.381, 6.390 max_d=6.390 avg_d=0.905 std_dev=1.476
P	A	0, -0.487, 1.304, 3.096, 7.154 max_d=7.154 avg_d=1.304 std_dev=1.791
OP2	A	0, -0.377, 1.474, 3.325, 8.138 max_d=8.138 avg_d=1.474 std_dev=1.851
OP1	A	0, -0.638, 1.496, 3.630, 8.618 max_d=8.618 avg_d=1.496 std_dev=2.134

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.16	0.01	0.14	0.01	0.17	0.27	0.12
C2	0.02	0.00	0.28	0.22	0.01	0.18	0.00	0.32	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.22	0.30	0.18	0.01	0.28	0.34	0.25
C2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.16	0.01	0.11	0.12	0.16	0.12	0.24	0.33	0.27	0.07	0.04	0.00	0.03	0.01	0.14	0.14	0.22	0.55	0.27
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.19	0.01	0.23	0.03	0.26	0.19	0.25	0.22	0.18	0.23	0.14	0.02	0.01	0.02	0.22	0.28	0.21	0.45	0.24
C4	0.01	0.01	0.16	0.19	0.00	0.07	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.15	0.15	0.25	0.01	0.24	0.39	0.25
C4'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.07	0.19	0.12	0.25	0.18	0.16	0.06	0.14	0.02	0.01	0.02	0.09	0.18	0.22	0.08
C5	0.01	0.00	0.11	0.23	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.18	0.06	0.42	0.01	0.41	0.59	0.43
C5'	0.07	0.32	0.12	0.03	0.19	0.01	0.17	0.00	0.19	0.23	0.26	0.40	0.31	0.23	0.12	0.06	0.12	0.02	0.01	0.19	0.17	0.16	0.02
C6	0.01	0.01	0.16	0.26	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.23	0.11	0.39	0.01	0.41	0.62	0.43
C8	0.01	0.01	0.12	0.19	0.01	0.19	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.28	0.14	0.16	0.58	0.01	0.52	0.63	0.55
N1	0.02	0.00	0.24	0.25	0.01	0.12	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.23	0.22	0.26	0.01	0.30	0.47	0.30
N2	0.03	0.00	0.33	0.22	0.01	0.25	0.01	0.40	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.39	0.25	0.36	0.21	0.02	0.37	0.32	0.31
N3	0.02	0.01	0.27	0.18	0.00	0.18	0.00	0.31	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.28	0.19	0.30	0.15	0.01	0.26	0.30	0.22
N7	0.01	0.01	0.07	0.23	0.00	0.16	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.18	0.09	0.60	0.01	0.60	0.77	0.63
N9	0.00	0.01	0.04	0.14	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.10	0.01	0.32	0.01	0.25	0.37	0.26
O2'	0.02	0.28	0.00	0.02	0.09	0.14	0.09	0.06	0.08	0.28	0.18	0.39	0.28	0.24	0.09	0.00	0.06	0.10	0.09	0.10	0.28	0.58	0.25
O3'	0.16	0.22	0.03	0.01	0.15	0.02	0.18	0.12	0.23	0.14	0.23	0.25	0.19	0.18	0.10	0.06	0.00	0.12	0.27	0.25	0.34	0.43	0.27
O4'	0.01	0.30	0.01	0.02	0.15	0.01	0.06	0.02	0.11	0.16	0.22	0.36	0.30	0.09	0.01	0.10	0.12	0.00	0.20	0.07	0.26	0.20	0.22
O5'	0.14	0.18	0.14	0.22	0.25	0.02	0.42	0.01	0.39	0.58	0.26	0.21	0.15	0.60	0.32	0.09	0.27	0.20	0.00	0.48	0.03	0.03	0.01
O6	0.01	0.01	0.14	0.28	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.25	0.07	0.48	0.00	0.53	0.76	0.54
OP1	0.17	0.28	0.22	0.21	0.24	0.18	0.41	0.17	0.41	0.52	0.30	0.37	0.26	0.60	0.25	0.28	0.34	0.26	0.03	0.53	0.00	0.02	0.01
OP2	0.27	0.34	0.55	0.45	0.39	0.22	0.59	0.16	0.62	0.63	0.47	0.32	0.30	0.77	0.37	0.58	0.43	0.20	0.03	0.76	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.25	0.27	0.24	0.25	0.08	0.43	0.02	0.43	0.55	0.30	0.31	0.22	0.63	0.26	0.25	0.27	0.22	0.01	0.54	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.08	0.18	0.23	0.16	0.13	0.17	0.17	0.13	0.09	0.11	0.22	0.12	0.21	0.28	0.09	0.32	0.40	0.46	0.37
C2	0.09	0.07	0.15	0.18	0.16	0.11	0.15	0.14	0.12	0.08	0.11	0.21	0.13	0.17	0.21	0.08	0.30	0.36	0.41	0.33
C2'	0.37	0.34	0.40	0.39	0.32	0.36	0.32	0.33	0.33	0.34	0.32	0.33	0.38	0.46	0.44	0.36	0.36	0.40	0.42	0.36
C3'	0.26	0.27	0.28	0.29	0.34	0.25	0.34	0.25	0.30	0.28	0.30	0.39	0.26	0.31	0.34	0.27	0.34	0.41	0.45	0.35
C4	0.09	0.08	0.14	0.18	0.15	0.11	0.16	0.16	0.12	0.09	0.10	0.21	0.13	0.17	0.21	0.09	0.33	0.42	0.47	0.38
C4'	0.26	0.21	0.35	0.39	0.23	0.30	0.24	0.32	0.23	0.22	0.20	0.27	0.23	0.36	0.46	0.24	0.44	0.52	0.55	0.47
C5	0.09	0.09	0.11	0.15	0.15	0.11	0.17	0.18	0.13	0.09	0.09	0.21	0.14	0.15	0.16	0.09	0.36	0.46	0.51	0.41
C5'	0.44	0.38	0.56	0.60	0.37	0.51	0.40	0.52	0.41	0.41	0.36	0.38	0.39	0.56	0.68	0.43	0.62	0.72	0.72	0.65
C6	0.09	0.09	0.10	0.13	0.14	0.11	0.16	0.17	0.13	0.09	0.09	0.21	0.14	0.12	0.13	0.10	0.36	0.47	0.51	0.41
C8	0.09	0.08	0.13	0.17	0.15	0.12	0.17	0.18	0.13	0.09	0.10	0.21	0.13	0.16	0.20	0.09	0.36	0.48	0.52	0.43
N1	0.09	0.08	0.11	0.13	0.15	0.10	0.15	0.15	0.12	0.08	0.09	0.21	0.14	0.13	0.15	0.09	0.32	0.41	0.45	0.36
N2	0.10	0.08	0.18	0.20	0.15	0.12	0.14	0.13	0.11	0.09	0.13	0.19	0.12	0.20	0.25	0.10	0.26	0.31	0.35	0.29
N3	0.09	0.07	0.16	0.20	0.16	0.11	0.15	0.15	0.12	0.08	0.11	0.21	0.12	0.19	0.25	0.09	0.30	0.37	0.42	0.34
N7	0.09	0.09	0.11	0.15	0.15	0.12	0.17	0.19	0.13	0.09	0.09	0.20	0.14	0.14	0.16	0.10	0.38	0.50	0.54	0.44
N9	0.09	0.08	0.15	0.19	0.16	0.12	0.17	0.17	0.13	0.09	0.10	0.22	0.13	0.18	0.23	0.09	0.34	0.43	0.48	0.39
O2'	0.45	0.37	0.53	0.51	0.27	0.46	0.28	0.41	0.33	0.38	0.30	0.27	0.44	0.62	0.59	0.43	0.39	0.40	0.41	0.37
O3'	0.29	0.29	0.33	0.34	0.36	0.29	0.36	0.28	0.32	0.29	0.32	0.41	0.28	0.36	0.40	0.29	0.35	0.40	0.46	0.36
O4'	0.35	0.31	0.39	0.42	0.28	0.37	0.29	0.39	0.30	0.32	0.28	0.28	0.35	0.40	0.46	0.34	0.50	0.56	0.61	0.54
O5'	0.27	0.23	0.38	0.40	0.32	0.31	0.33	0.31	0.28	0.24	0.26	0.42	0.23	0.43	0.50	0.26	0.42	0.54	0.52	0.45
O6	0.10	0.11	0.09	0.12	0.13	0.12	0.16	0.19	0.13	0.10	0.10	0.19	0.15	0.11	0.13	0.12	0.38	0.52	0.55	0.44
OP1	0.46	0.36	0.59	0.59	0.39	0.51	0.40	0.47	0.38	0.39	0.34	0.48	0.42	0.69	0.72	0.43	0.53	0.64	0.60	0.54
OP2	0.37	0.40	0.39	0.40	0.58	0.38	0.58	0.41	0.50	0.42	0.48	0.70	0.35	0.45	0.47	0.40	0.54	0.68	0.67	0.59
P	0.39	0.32	0.50	0.51	0.39	0.43	0.40	0.41	0.36	0.34	0.32	0.48	0.35	0.58	0.62	0.37	0.51	0.64	0.61	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.11	0.15	0.12	0.10
C2	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.08	0.03	0.24	0.29	0.32	0.25
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.07	0.03	0.06	0.05	0.11	0.00	0.02	0.01	0.16	0.24	0.16	0.17
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.02	0.11	0.05	0.08	0.09	0.10	0.02	0.01	0.01	0.23	0.31	0.21	0.23
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.10	0.03	0.35	0.45	0.51	0.39
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.06	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.13	0.18	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.13	0.04	0.37	0.45	0.50	0.40
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.07	0.10	0.13	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.12	0.27	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.13	0.04	0.32	0.35	0.35	0.31
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.23	0.26	0.26	0.22
N3	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.30	0.37	0.43	0.32
N4	0.01	0.02	0.05	0.09	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.12	0.04	0.38	0.51	0.58	0.43
O2	0.02	0.01	0.11	0.10	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.12	0.13	0.04	0.19	0.23	0.27	0.19
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.06	0.05	0.12	0.00	0.04	0.04	0.07	0.21	0.17	0.10
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.10	0.02	0.13	0.03	0.13	0.05	0.09	0.12	0.13	0.04	0.00	0.02	0.21	0.39	0.33	0.25
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.09	0.11	0.15	0.09
O5'	0.11	0.24	0.16	0.23	0.35	0.02	0.37	0.01	0.32	0.23	0.30	0.38	0.19	0.07	0.21	0.09	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.15	0.29	0.24	0.31	0.45	0.13	0.45	0.12	0.35	0.26	0.37	0.51	0.23	0.21	0.39	0.11	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.12	0.32	0.16	0.21	0.51	0.18	0.50	0.27	0.35	0.26	0.43	0.58	0.27	0.17	0.33	0.15	0.03	0.03	0.00	0.01
P	0.10	0.25	0.17	0.23	0.39	0.04	0.40	0.01	0.31	0.22	0.32	0.43	0.19	0.10	0.25	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00