Doublet Group distance statistics: 52676

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	max_d=0.029 avg_d=0.019 std_dev=0.007
C2	A	max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C1'	A	max_d=0.041 avg_d=0.024 std_dev=0.009
N3	A	max_d=0.054 avg_d=0.035 std_dev=0.012
N1	A	max_d=0.052 avg_d=0.034 std_dev=0.014
C5	A	max_d=0.054 avg_d=0.033 std_dev=0.016
C4	A	max_d=0.071 avg_d=0.044 std_dev=0.018
N9	A	max_d=0.067 avg_d=0.041 std_dev=0.021
N2	A	max_d=0.101 avg_d=0.044 std_dev=0.021
O6	A	max_d=0.159 avg_d=0.063 std_dev=0.033
N7	A	max_d=0.107 avg_d=0.065 std_dev=0.033
C8	A	max_d=0.119 avg_d=0.076 std_dev=0.039
O4'	A	max_d=0.587 avg_d=0.294 std_dev=0.130
C2'	A	max_d=0.621 avg_d=0.289 std_dev=0.134
N1	B	max_d=0.606 avg_d=0.268 std_dev=0.161
C5	B	max_d=0.649 avg_d=0.343 std_dev=0.163
C6	B	max_d=0.866 avg_d=0.345 std_dev=0.174
C4	B	max_d=0.675 avg_d=0.298 std_dev=0.175
C2	B	max_d=0.826 avg_d=0.465 std_dev=0.188
C4'	A	max_d=0.883 avg_d=0.480 std_dev=0.188
C1'	B	max_d=0.790 avg_d=0.354 std_dev=0.193
C2'	B	max_d=0.842 avg_d=0.460 std_dev=0.193
O2'	A	max_d=0.734 avg_d=0.317 std_dev=0.201
C3'	A	max_d=0.999 avg_d=0.483 std_dev=0.222
N3	B	max_d=1.038 avg_d=0.476 std_dev=0.223
N4	B	max_d=0.772 avg_d=0.384 std_dev=0.228
O2'	B	max_d=1.117 avg_d=0.544 std_dev=0.258
O4'	B	max_d=1.140 avg_d=0.401 std_dev=0.273
C5'	A	max_d=1.424 avg_d=0.747 std_dev=0.276
C3'	B	max_d=1.118 avg_d=0.578 std_dev=0.278
O2	B	max_d=1.369 avg_d=0.713 std_dev=0.291
C4'	B	max_d=1.385 avg_d=0.527 std_dev=0.323
O3'	A	max_d=1.525 avg_d=0.762 std_dev=0.340
O5'	B	max_d=1.381 avg_d=0.595 std_dev=0.359
C5'	B	max_d=1.766 avg_d=0.647 std_dev=0.395
O3'	B	max_d=1.831 avg_d=0.844 std_dev=0.426
P	B	max_d=1.772 avg_d=0.770 std_dev=0.439
OP2	B	max_d=2.081 avg_d=1.008 std_dev=0.532
OP1	B	max_d=2.279 avg_d=0.994 std_dev=0.581
O5'	A	max_d=2.195 avg_d=0.840 std_dev=0.595
P	A	max_d=2.869 avg_d=1.308 std_dev=0.620
OP1	A	max_d=4.336 avg_d=3.157 std_dev=0.882
OP2	A	max_d=3.922 avg_d=2.888 std_dev=0.979

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.22	0.02	0.20	0.37	0.23
C2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.14	0.03	0.42	0.01	0.51	0.53	0.40
C2'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.06	0.06	0.08	0.11	0.09	0.05	0.03	0.01	0.02	0.02	0.23	0.05	0.24	0.31	0.16
C3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.08	0.01	0.09	0.03	0.10	0.11	0.11	0.13	0.10	0.11	0.06	0.02	0.01	0.02	0.31	0.11	0.35	0.31	0.23
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.08	0.02	0.44	0.01	0.47	0.53	0.40
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.06	0.06	0.04	0.10	0.05	0.08	0.03	0.00	0.03	0.09	0.19	0.34	0.11
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.10	0.03	0.54	0.01	0.62	0.67	0.52
C5'	0.03	0.10	0.02	0.03	0.12	0.01	0.17	0.00	0.18	0.19	0.14	0.09	0.08	0.21	0.11	0.08	0.04	0.02	0.01	0.21	0.26	0.34	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.03	0.55	0.01	0.69	0.73	0.55
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.10	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.04	0.54	0.03	0.50	0.60	0.48
N1	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.13	0.03	0.50	0.01	0.62	0.64	0.49
N2	0.04	0.00	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.18	0.04	0.39	0.02	0.48	0.49	0.36
N3	0.02	0.01	0.09	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.12	0.03	0.37	0.01	0.42	0.47	0.34
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.10	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.04	0.59	0.03	0.66	0.74	0.58
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.02	0.41	0.02	0.38	0.47	0.35
O2'	0.02	0.17	0.01	0.02	0.10	0.08	0.09	0.08	0.12	0.04	0.15	0.20	0.15	0.06	0.04	0.00	0.05	0.07	0.08	0.11	0.19	0.34	0.15
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.08	0.03	0.10	0.04	0.12	0.13	0.13	0.18	0.12	0.13	0.06	0.05	0.00	0.02	0.32	0.13	0.47	0.35	0.29
O4'	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.07	0.02	0.00	0.21	0.04	0.21	0.45	0.29
O5'	0.22	0.42	0.23	0.31	0.44	0.03	0.54	0.01	0.55	0.54	0.50	0.39	0.37	0.59	0.41	0.08	0.32	0.21	0.00	0.60	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.09	0.01	0.21	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.11	0.13	0.04	0.60	0.00	0.77	0.83	0.63
OP1	0.20	0.51	0.24	0.35	0.47	0.19	0.62	0.26	0.69	0.50	0.62	0.48	0.42	0.66	0.38	0.19	0.47	0.21	0.02	0.77	0.00	0.02	0.01
OP2	0.37	0.53	0.31	0.31	0.53	0.34	0.67	0.34	0.73	0.60	0.64	0.49	0.47	0.74	0.47	0.34	0.35	0.45	0.02	0.83	0.02	0.00	0.01
P	0.23	0.40	0.16	0.23	0.40	0.11	0.52	0.02	0.55	0.48	0.49	0.36	0.34	0.58	0.35	0.15	0.29	0.29	0.01	0.63	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.12	0.16	0.16	0.10	0.13	0.11	0.11	0.10	0.11	0.09	0.16	0.19	0.22	0.23	0.16	0.11	0.13	0.22	0.14
C2	0.15	0.12	0.16	0.15	0.13	0.13	0.12	0.11	0.10	0.11	0.11	0.18	0.20	0.20	0.20	0.16	0.11	0.13	0.21	0.14
C2'	0.22	0.16	0.23	0.21	0.14	0.21	0.14	0.19	0.14	0.16	0.13	0.19	0.22	0.30	0.26	0.23	0.16	0.18	0.22	0.15
C3'	0.26	0.20	0.25	0.22	0.15	0.25	0.16	0.22	0.18	0.21	0.15	0.18	0.26	0.32	0.26	0.28	0.18	0.20	0.25	0.18
C4	0.15	0.13	0.15	0.15	0.10	0.12	0.11	0.10	0.09	0.11	0.09	0.15	0.21	0.20	0.21	0.15	0.11	0.14	0.23	0.15
C4'	0.20	0.15	0.19	0.17	0.11	0.17	0.12	0.14	0.12	0.15	0.11	0.15	0.21	0.26	0.24	0.21	0.13	0.15	0.24	0.15
C5	0.14	0.13	0.14	0.14	0.08	0.11	0.10	0.10	0.08	0.10	0.09	0.14	0.22	0.18	0.20	0.13	0.13	0.16	0.25	0.17
C5'	0.24	0.21	0.20	0.19	0.20	0.20	0.20	0.20	0.20	0.21	0.19	0.23	0.26	0.26	0.23	0.25	0.20	0.24	0.33	0.25
C6	0.13	0.14	0.14	0.14	0.07	0.11	0.09	0.11	0.08	0.10	0.10	0.14	0.22	0.17	0.19	0.13	0.13	0.17	0.26	0.18
C8	0.14	0.13	0.15	0.15	0.08	0.11	0.10	0.10	0.08	0.10	0.09	0.13	0.21	0.19	0.21	0.14	0.13	0.16	0.27	0.18
N1	0.14	0.13	0.14	0.14	0.11	0.11	0.11	0.10	0.09	0.10	0.09	0.18	0.22	0.17	0.18	0.14	0.12	0.14	0.23	0.15
N2	0.17	0.13	0.18	0.17	0.16	0.16	0.15	0.14	0.13	0.13	0.15	0.20	0.19	0.22	0.22	0.17	0.13	0.15	0.21	0.14
N3	0.16	0.12	0.16	0.15	0.12	0.14	0.12	0.12	0.10	0.11	0.10	0.17	0.20	0.21	0.21	0.16	0.11	0.13	0.21	0.14
N7	0.13	0.14	0.14	0.15	0.07	0.10	0.09	0.11	0.08	0.10	0.10	0.12	0.22	0.18	0.21	0.13	0.14	0.18	0.28	0.20
N9	0.15	0.12	0.15	0.15	0.09	0.12	0.11	0.10	0.09	0.10	0.09	0.15	0.20	0.20	0.21	0.15	0.11	0.14	0.24	0.15
O2'	0.25	0.20	0.28	0.26	0.22	0.25	0.22	0.24	0.21	0.21	0.20	0.26	0.23	0.34	0.33	0.26	0.22	0.22	0.25	0.21
O3'	0.31	0.24	0.31	0.27	0.18	0.31	0.19	0.29	0.22	0.25	0.19	0.21	0.29	0.39	0.31	0.33	0.23	0.24	0.25	0.21
O4'	0.16	0.13	0.16	0.16	0.10	0.13	0.11	0.10	0.10	0.11	0.09	0.14	0.20	0.21	0.23	0.16	0.11	0.13	0.23	0.15
O5'	0.51	0.51	0.50	0.52	0.56	0.51	0.57	0.53	0.55	0.52	0.53	0.58	0.49	0.48	0.52	0.53	0.53	0.54	0.57	0.55
O6	0.14	0.16	0.15	0.16	0.07	0.11	0.09	0.13	0.09	0.11	0.14	0.11	0.22	0.17	0.21	0.13	0.16	0.20	0.28	0.21
OP1	0.68	0.68	0.64	0.66	0.77	0.68	0.80	0.70	0.76	0.71	0.71	0.81	0.64	0.61	0.63	0.71	0.71	0.72	0.76	0.73
OP2	0.63	0.65	0.58	0.62	0.78	0.64	0.80	0.70	0.75	0.68	0.70	0.84	0.58	0.54	0.59	0.67	0.74	0.78	0.89	0.83
P	0.49	0.50	0.47	0.49	0.58	0.49	0.60	0.51	0.56	0.52	0.53	0.62	0.46	0.45	0.48	0.51	0.53	0.56	0.63	0.59

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.06	0.09	0.12	0.07
C2	0.02	0.00	0.10	0.10	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.12	0.05	0.10	0.11	0.19	0.12
C2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.09	0.04	0.10	0.09	0.15	0.01	0.02	0.01	0.07	0.17	0.18	0.10
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.11	0.01	0.12	0.03	0.12	0.06	0.11	0.13	0.12	0.02	0.01	0.01	0.08	0.22	0.20	0.15
C4	0.02	0.01	0.08	0.11	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.15	0.03	0.13	0.17	0.26	0.19
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.06	0.05	0.05	0.03	0.00	0.03	0.12	0.08	0.05
C5	0.01	0.02	0.09	0.12	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.16	0.04	0.14	0.18	0.26	0.20
C5'	0.02	0.06	0.02	0.03	0.10	0.01	0.11	0.00	0.10	0.06	0.08	0.11	0.06	0.05	0.04	0.02	0.01	0.09	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.12	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.15	0.04	0.12	0.13	0.20	0.16
N1	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.09	0.09	0.16	0.11
N3	0.02	0.01	0.10	0.11	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.14	0.04	0.12	0.14	0.23	0.16
N4	0.02	0.01	0.09	0.13	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.17	0.04	0.14	0.21	0.29	0.22
O2	0.04	0.01	0.15	0.12	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.15	0.16	0.07	0.09	0.11	0.17	0.10
O2'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.07	0.05	0.07	0.05	0.07	0.04	0.10	0.09	0.15	0.00	0.05	0.04	0.06	0.20	0.16	0.10
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.15	0.03	0.16	0.04	0.15	0.07	0.14	0.17	0.16	0.05	0.00	0.02	0.11	0.32	0.29	0.22
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.07	0.04	0.02	0.00	0.07	0.10	0.11	0.09
O5'	0.06	0.10	0.07	0.08	0.13	0.03	0.14	0.01	0.12	0.09	0.12	0.14	0.09	0.06	0.11	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.11	0.17	0.22	0.17	0.12	0.18	0.09	0.13	0.09	0.14	0.21	0.11	0.20	0.32	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.19	0.18	0.20	0.26	0.08	0.26	0.03	0.20	0.16	0.23	0.29	0.17	0.16	0.29	0.11	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.12	0.10	0.15	0.19	0.05	0.20	0.02	0.16	0.11	0.16	0.22	0.10	0.10	0.22	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00