Doublet Group distance statistics: 52677

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 2, 4, 7, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.008, 0.020, 0.033, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.027, 0.042, 0.056, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.042 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.042, 0.057, 0.073, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.057 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.023, 0.039, 0.055, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.039 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.011, 0.027, 0.043, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.044, 0.069, 0.094, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.069 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.042, 0.068, 0.095, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.068 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.042, 0.070, 0.098, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.070 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.103, 0.142, 0.181, 0.205 max_d=0.205 avg_d=0.142 std_dev=0.039
C8	A	0, 0.103, 0.145, 0.188, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.145 std_dev=0.043
N1	B	0, 0.209, 0.348, 0.486, 0.611 max_d=0.611 avg_d=0.348 std_dev=0.139
C2'	A	0, 0.070, 0.214, 0.358, 0.652 max_d=0.652 avg_d=0.214 std_dev=0.144
O4'	A	0, 0.015, 0.159, 0.304, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.159 std_dev=0.145
C2	B	0, 0.244, 0.433, 0.622, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.433 std_dev=0.189
O2'	A	0, 0.154, 0.355, 0.557, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.355 std_dev=0.202
C5'	B	0, 0.232, 0.457, 0.682, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.457 std_dev=0.225
N3	B	0, 0.440, 0.665, 0.890, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.665 std_dev=0.225
C4'	A	0, 0.169, 0.395, 0.621, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.395 std_dev=0.226
C3'	A	0, 0.201, 0.435, 0.669, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.435 std_dev=0.234
O4'	B	0, 0.305, 0.547, 0.789, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.547 std_dev=0.242
C6	B	0, 0.263, 0.509, 0.754, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.509 std_dev=0.246
C1'	B	0, 0.309, 0.561, 0.813, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.561 std_dev=0.252
C4	B	0, 0.537, 0.797, 1.057, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.797 std_dev=0.260
O2	B	0, 0.169, 0.431, 0.694, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.431 std_dev=0.262
C4'	B	0, 0.296, 0.560, 0.823, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.560 std_dev=0.264
C5	B	0, 0.467, 0.778, 1.089, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.778 std_dev=0.311
C3'	B	0, 0.400, 0.734, 1.067, 1.606 max_d=1.606 avg_d=0.734 std_dev=0.333
O3'	A	0, 0.349, 0.691, 1.033, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.691 std_dev=0.342
N4	B	0, 0.586, 0.941, 1.296, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.941 std_dev=0.355
O5'	B	0, 0.219, 0.589, 0.958, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.589 std_dev=0.369
C2'	B	0, 0.414, 0.789, 1.164, 1.679 max_d=1.679 avg_d=0.789 std_dev=0.375
C5'	A	0, 0.216, 0.627, 1.039, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.627 std_dev=0.412
O2'	B	0, 0.534, 1.034, 1.534, 2.248 max_d=2.248 avg_d=1.034 std_dev=0.500
O3'	B	0, 0.614, 1.196, 1.779, 2.478 max_d=2.478 avg_d=1.196 std_dev=0.582
P	B	0, 0.255, 0.937, 1.618, 3.477 max_d=3.477 avg_d=0.937 std_dev=0.682
O5'	A	0, 0.922, 1.802, 2.683, 3.304 max_d=3.304 avg_d=1.802 std_dev=0.880
OP1	B	0, 0.245, 1.156, 2.066, 4.078 max_d=4.078 avg_d=1.156 std_dev=0.911
OP2	B	0, 0.506, 1.537, 2.569, 4.757 max_d=4.757 avg_d=1.537 std_dev=1.031
OP2	A	0, 1.214, 2.407, 3.600, 5.400 max_d=5.400 avg_d=2.407 std_dev=1.193
P	A	0, 1.211, 2.417, 3.622, 5.375 max_d=5.375 avg_d=2.417 std_dev=1.206
OP1	A	0, 1.492, 3.139, 4.786, 6.898 max_d=6.898 avg_d=3.139 std_dev=1.647

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.06	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.22	0.03	0.29	0.47	0.21
C2	0.04	0.00	0.14	0.17	0.01	0.08	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.22	0.03	0.45	0.03	0.72	0.63	0.46
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.03	0.07	0.07	0.11	0.17	0.14	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.26	0.07	0.36	0.37	0.21
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.11	0.01	0.11	0.03	0.13	0.13	0.15	0.21	0.16	0.13	0.07	0.02	0.01	0.02	0.34	0.13	0.48	0.30	0.28
C4	0.03	0.01	0.07	0.11	0.00	0.07	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.02	0.46	0.01	0.67	0.57	0.43
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.14	0.09	0.09	0.07	0.15	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.13	0.18	0.41	0.10
C5	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.11	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.57	0.01	0.85	0.64	0.55
C5'	0.06	0.20	0.03	0.03	0.20	0.01	0.29	0.00	0.30	0.29	0.26	0.17	0.16	0.33	0.18	0.05	0.06	0.02	0.01	0.34	0.33	0.40	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.11	0.01	0.30	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.03	0.59	0.01	0.93	0.71	0.61
C8	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.14	0.01	0.29	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.05	0.56	0.02	0.71	0.52	0.47
N1	0.03	0.01	0.11	0.15	0.01	0.09	0.01	0.26	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.15	0.19	0.03	0.54	0.02	0.86	0.69	0.55
N2	0.05	0.01	0.17	0.21	0.01	0.09	0.01	0.17	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.22	0.28	0.05	0.41	0.04	0.68	0.63	0.43
N3	0.04	0.01	0.14	0.16	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.19	0.03	0.40	0.02	0.61	0.57	0.38
N7	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.15	0.01	0.33	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.05	0.62	0.02	0.89	0.62	0.58
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.42	0.02	0.55	0.50	0.35
O2'	0.02	0.18	0.01	0.02	0.10	0.05	0.08	0.05	0.11	0.04	0.15	0.22	0.17	0.05	0.04	0.00	0.03	0.05	0.09	0.11	0.20	0.39	0.14
O3'	0.01	0.22	0.02	0.01	0.11	0.02	0.12	0.06	0.14	0.14	0.19	0.28	0.19	0.14	0.06	0.03	0.00	0.01	0.31	0.15	0.58	0.29	0.32
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.00	0.19	0.04	0.24	0.56	0.27
O5'	0.22	0.45	0.26	0.34	0.46	0.02	0.57	0.01	0.59	0.56	0.54	0.41	0.40	0.62	0.42	0.09	0.31	0.19	0.00	0.64	0.02	0.03	0.01
O6	0.03	0.03	0.07	0.13	0.01	0.13	0.01	0.34	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.11	0.15	0.04	0.64	0.00	1.04	0.76	0.67
OP1	0.29	0.72	0.36	0.48	0.67	0.18	0.85	0.33	0.93	0.71	0.86	0.68	0.61	0.89	0.55	0.20	0.58	0.24	0.02	1.04	0.00	0.01	0.01
OP2	0.47	0.63	0.37	0.30	0.57	0.41	0.64	0.40	0.71	0.52	0.69	0.63	0.57	0.62	0.50	0.39	0.29	0.56	0.03	0.76	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.46	0.21	0.28	0.43	0.10	0.55	0.01	0.61	0.47	0.55	0.43	0.38	0.58	0.35	0.14	0.32	0.27	0.01	0.67	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.10	0.23	0.22	0.14	0.18	0.14	0.17	0.11	0.10	0.12	0.22	0.18	0.29	0.29	0.14	0.30	0.52	0.86	0.41
C2	0.15	0.09	0.22	0.21	0.17	0.16	0.14	0.15	0.11	0.10	0.13	0.24	0.16	0.25	0.26	0.13	0.26	0.49	0.77	0.35
C2'	0.26	0.18	0.31	0.31	0.14	0.27	0.13	0.25	0.15	0.19	0.14	0.20	0.25	0.37	0.37	0.25	0.31	0.56	0.83	0.40
C3'	0.29	0.21	0.32	0.30	0.18	0.29	0.18	0.25	0.19	0.22	0.17	0.24	0.28	0.38	0.36	0.27	0.31	0.55	0.86	0.41
C4	0.15	0.10	0.21	0.20	0.15	0.15	0.14	0.14	0.11	0.10	0.11	0.23	0.17	0.26	0.25	0.12	0.28	0.52	0.88	0.40
C4'	0.20	0.12	0.25	0.23	0.17	0.20	0.18	0.17	0.15	0.14	0.12	0.26	0.19	0.31	0.30	0.18	0.29	0.51	0.88	0.40
C5	0.15	0.12	0.20	0.19	0.14	0.14	0.15	0.13	0.12	0.11	0.11	0.21	0.19	0.24	0.24	0.11	0.28	0.55	0.95	0.43
C5'	0.27	0.23	0.28	0.27	0.34	0.26	0.36	0.24	0.31	0.26	0.26	0.42	0.23	0.33	0.30	0.27	0.37	0.55	0.95	0.48
C6	0.15	0.14	0.20	0.18	0.14	0.13	0.15	0.13	0.12	0.12	0.12	0.22	0.21	0.22	0.22	0.11	0.27	0.55	0.96	0.42
C8	0.15	0.11	0.21	0.19	0.14	0.14	0.15	0.13	0.12	0.11	0.10	0.21	0.18	0.25	0.25	0.12	0.29	0.55	0.97	0.45
N1	0.15	0.12	0.20	0.19	0.16	0.14	0.15	0.14	0.11	0.11	0.11	0.23	0.20	0.23	0.23	0.12	0.26	0.52	0.86	0.37
N2	0.16	0.09	0.24	0.24	0.18	0.18	0.15	0.17	0.12	0.10	0.16	0.24	0.14	0.27	0.30	0.15	0.25	0.48	0.67	0.30
N3	0.15	0.08	0.22	0.21	0.16	0.17	0.14	0.16	0.11	0.10	0.12	0.24	0.15	0.26	0.27	0.13	0.27	0.49	0.80	0.37
N7	0.15	0.13	0.20	0.19	0.14	0.14	0.15	0.13	0.12	0.11	0.11	0.20	0.20	0.24	0.24	0.11	0.29	0.57	1.01	0.46
N9	0.15	0.10	0.21	0.20	0.15	0.16	0.15	0.15	0.12	0.10	0.11	0.22	0.17	0.26	0.26	0.13	0.29	0.52	0.90	0.42
O2'	0.31	0.23	0.37	0.37	0.18	0.33	0.17	0.32	0.20	0.23	0.20	0.22	0.30	0.42	0.44	0.30	0.35	0.61	0.80	0.43
O3'	0.37	0.28	0.40	0.38	0.20	0.37	0.20	0.34	0.24	0.29	0.22	0.23	0.35	0.47	0.43	0.36	0.36	0.59	0.85	0.42
O4'	0.16	0.09	0.22	0.22	0.16	0.17	0.17	0.17	0.13	0.10	0.11	0.24	0.16	0.28	0.28	0.13	0.32	0.51	0.90	0.44
O5'	0.52	0.54	0.52	0.53	0.63	0.53	0.63	0.54	0.58	0.55	0.58	0.68	0.50	0.51	0.54	0.53	0.63	0.84	0.99	0.68
O6	0.15	0.17	0.19	0.18	0.14	0.13	0.16	0.14	0.13	0.14	0.15	0.20	0.23	0.21	0.22	0.13	0.28	0.59	1.03	0.46
OP1	0.87	0.90	0.82	0.83	1.02	0.87	1.02	0.89	0.97	0.91	0.96	1.09	0.84	0.79	0.81	0.91	0.85	0.99	1.06	0.83
OP2	0.72	0.71	0.71	0.72	0.78	0.73	0.80	0.73	0.77	0.73	0.73	0.82	0.67	0.71	0.73	0.74	0.72	0.93	1.04	0.76
P	0.55	0.56	0.53	0.54	0.67	0.55	0.67	0.56	0.63	0.58	0.61	0.73	0.51	0.52	0.54	0.57	0.58	0.78	0.97	0.63

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.09	0.34	0.37	0.13
C2	0.02	0.00	0.10	0.09	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.12	0.04	0.20	0.47	0.70	0.30
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.08	0.06	0.17	0.01	0.02	0.02	0.14	0.31	0.41	0.19
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.12	0.05	0.09	0.09	0.15	0.02	0.02	0.02	0.20	0.32	0.40	0.23
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.02	0.27	0.65	0.96	0.47
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.25	0.19	0.10
C5	0.01	0.02	0.07	0.11	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.15	0.04	0.28	0.67	0.96	0.50
C5'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.08	0.01	0.10	0.00	0.09	0.06	0.07	0.09	0.08	0.05	0.03	0.01	0.01	0.11	0.25	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.15	0.05	0.25	0.55	0.77	0.40
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.19	0.44	0.62	0.27
N3	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.24	0.57	0.86	0.39
N4	0.02	0.02	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.14	0.03	0.28	0.72	1.06	0.53
O2	0.04	0.01	0.17	0.15	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.15	0.20	0.07	0.18	0.43	0.62	0.24
O2'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.02	0.07	0.05	0.15	0.00	0.05	0.04	0.07	0.41	0.33	0.17
O3'	0.02	0.12	0.02	0.02	0.11	0.02	0.15	0.03	0.15	0.05	0.12	0.14	0.20	0.05	0.00	0.02	0.20	0.48	0.46	0.27
O4'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.07	0.04	0.02	0.00	0.08	0.33	0.20	0.12
O5'	0.09	0.20	0.14	0.20	0.27	0.02	0.28	0.01	0.25	0.19	0.24	0.28	0.18	0.07	0.20	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.34	0.47	0.31	0.32	0.65	0.25	0.67	0.11	0.55	0.44	0.57	0.72	0.43	0.41	0.48	0.33	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.37	0.70	0.41	0.40	0.96	0.19	0.96	0.25	0.77	0.62	0.86	1.06	0.62	0.33	0.46	0.20	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.30	0.19	0.23	0.47	0.10	0.50	0.02	0.40	0.27	0.39	0.53	0.24	0.17	0.27	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00