Doublet Group distance statistics: 52677

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C2	A	max_d=0.055 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N3	A	max_d=0.056 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N1	A	max_d=0.070 avg_d=0.042 std_dev=0.015
C5	A	max_d=0.082 avg_d=0.057 std_dev=0.016
C4	A	max_d=0.071 avg_d=0.039 std_dev=0.016
C1'	A	max_d=0.084 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N2	A	max_d=0.115 avg_d=0.069 std_dev=0.025
N9	A	max_d=0.116 avg_d=0.068 std_dev=0.026
O6	A	max_d=0.151 avg_d=0.070 std_dev=0.028
N7	A	max_d=0.205 avg_d=0.142 std_dev=0.039
C8	A	max_d=0.215 avg_d=0.145 std_dev=0.043
N1	B	max_d=0.611 avg_d=0.348 std_dev=0.139
C2'	A	max_d=0.652 avg_d=0.214 std_dev=0.144
O4'	A	max_d=0.549 avg_d=0.159 std_dev=0.145
C2	B	max_d=0.859 avg_d=0.433 std_dev=0.189
O2'	A	max_d=0.956 avg_d=0.355 std_dev=0.202
C5'	B	max_d=0.827 avg_d=0.457 std_dev=0.225
N3	B	max_d=1.138 avg_d=0.665 std_dev=0.225
C4'	A	max_d=0.841 avg_d=0.395 std_dev=0.226
C3'	A	max_d=1.012 avg_d=0.435 std_dev=0.234
O4'	B	max_d=1.137 avg_d=0.547 std_dev=0.242
C6	B	max_d=0.937 avg_d=0.509 std_dev=0.246
C1'	B	max_d=1.173 avg_d=0.561 std_dev=0.252
C4	B	max_d=1.180 avg_d=0.797 std_dev=0.260
O2	B	max_d=1.083 avg_d=0.431 std_dev=0.262
C4'	B	max_d=1.256 avg_d=0.560 std_dev=0.264
C5	B	max_d=1.331 avg_d=0.778 std_dev=0.311
C3'	B	max_d=1.606 avg_d=0.734 std_dev=0.333
O3'	A	max_d=1.526 avg_d=0.691 std_dev=0.342
N4	B	max_d=1.574 avg_d=0.941 std_dev=0.355
O5'	B	max_d=1.926 avg_d=0.589 std_dev=0.369
C2'	B	max_d=1.679 avg_d=0.789 std_dev=0.375
C5'	A	max_d=1.330 avg_d=0.627 std_dev=0.412
O2'	B	max_d=2.248 avg_d=1.034 std_dev=0.500
O3'	B	max_d=2.478 avg_d=1.196 std_dev=0.582
P	B	max_d=3.477 avg_d=0.937 std_dev=0.682
O5'	A	max_d=3.304 avg_d=1.802 std_dev=0.880
OP1	B	max_d=4.078 avg_d=1.156 std_dev=0.911
OP2	B	max_d=4.757 avg_d=1.537 std_dev=1.031
OP2	A	max_d=5.400 avg_d=2.407 std_dev=1.193
P	A	max_d=5.375 avg_d=2.417 std_dev=1.206
OP1	A	max_d=6.898 avg_d=3.139 std_dev=1.647

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.06	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.22	0.03	0.29	0.47	0.21
C2	0.04	0.00	0.14	0.17	0.01	0.08	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.22	0.03	0.45	0.03	0.72	0.63	0.46
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.03	0.07	0.07	0.11	0.17	0.14	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.26	0.07	0.36	0.37	0.21
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.11	0.01	0.11	0.03	0.13	0.13	0.15	0.21	0.16	0.13	0.07	0.02	0.01	0.02	0.34	0.13	0.48	0.30	0.28
C4	0.03	0.01	0.07	0.11	0.00	0.07	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.02	0.46	0.01	0.67	0.57	0.43
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.14	0.09	0.09	0.07	0.15	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.13	0.18	0.41	0.10
C5	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.11	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.57	0.01	0.85	0.64	0.55
C5'	0.06	0.20	0.03	0.03	0.20	0.01	0.29	0.00	0.30	0.29	0.26	0.17	0.16	0.33	0.18	0.05	0.06	0.02	0.01	0.34	0.33	0.40	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.11	0.01	0.30	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.03	0.59	0.01	0.93	0.71	0.61
C8	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.14	0.01	0.29	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.05	0.56	0.02	0.71	0.52	0.47
N1	0.03	0.01	0.11	0.15	0.01	0.09	0.01	0.26	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.15	0.19	0.03	0.54	0.02	0.86	0.69	0.55
N2	0.05	0.01	0.17	0.21	0.01	0.09	0.01	0.17	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.22	0.28	0.05	0.41	0.04	0.68	0.63	0.43
N3	0.04	0.01	0.14	0.16	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.19	0.03	0.40	0.02	0.61	0.57	0.38
N7	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.15	0.01	0.33	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.05	0.62	0.02	0.89	0.62	0.58
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.42	0.02	0.55	0.50	0.35
O2'	0.02	0.18	0.01	0.02	0.10	0.05	0.08	0.05	0.11	0.04	0.15	0.22	0.17	0.05	0.04	0.00	0.03	0.05	0.09	0.11	0.20	0.39	0.14
O3'	0.01	0.22	0.02	0.01	0.11	0.02	0.12	0.06	0.14	0.14	0.19	0.28	0.19	0.14	0.06	0.03	0.00	0.01	0.31	0.15	0.58	0.29	0.32
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.00	0.19	0.04	0.24	0.56	0.27
O5'	0.22	0.45	0.26	0.34	0.46	0.02	0.57	0.01	0.59	0.56	0.54	0.41	0.40	0.62	0.42	0.09	0.31	0.19	0.00	0.64	0.02	0.03	0.01
O6	0.03	0.03	0.07	0.13	0.01	0.13	0.01	0.34	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.11	0.15	0.04	0.64	0.00	1.04	0.76	0.67
OP1	0.29	0.72	0.36	0.48	0.67	0.18	0.85	0.33	0.93	0.71	0.86	0.68	0.61	0.89	0.55	0.20	0.58	0.24	0.02	1.04	0.00	0.01	0.01
OP2	0.47	0.63	0.37	0.30	0.57	0.41	0.64	0.40	0.71	0.52	0.69	0.63	0.57	0.62	0.50	0.39	0.29	0.56	0.03	0.76	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.46	0.21	0.28	0.43	0.10	0.55	0.01	0.61	0.47	0.55	0.43	0.38	0.58	0.35	0.14	0.32	0.27	0.01	0.67	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.10	0.23	0.22	0.14	0.18	0.14	0.17	0.11	0.10	0.12	0.22	0.18	0.29	0.29	0.14	0.30	0.52	0.86	0.41
C2	0.15	0.09	0.22	0.21	0.17	0.16	0.14	0.15	0.11	0.10	0.13	0.24	0.16	0.25	0.26	0.13	0.26	0.49	0.77	0.35
C2'	0.26	0.18	0.31	0.31	0.14	0.27	0.13	0.25	0.15	0.19	0.14	0.20	0.25	0.37	0.37	0.25	0.31	0.56	0.83	0.40
C3'	0.29	0.21	0.32	0.30	0.18	0.29	0.18	0.25	0.19	0.22	0.17	0.24	0.28	0.38	0.36	0.27	0.31	0.55	0.86	0.41
C4	0.15	0.10	0.21	0.20	0.15	0.15	0.14	0.14	0.11	0.10	0.11	0.23	0.17	0.26	0.25	0.12	0.28	0.52	0.88	0.40
C4'	0.20	0.12	0.25	0.23	0.17	0.20	0.18	0.17	0.15	0.14	0.12	0.26	0.19	0.31	0.30	0.18	0.29	0.51	0.88	0.40
C5	0.15	0.12	0.20	0.19	0.14	0.14	0.15	0.13	0.12	0.11	0.11	0.21	0.19	0.24	0.24	0.11	0.28	0.55	0.95	0.43
C5'	0.27	0.23	0.28	0.27	0.34	0.26	0.36	0.24	0.31	0.26	0.26	0.42	0.23	0.33	0.30	0.27	0.37	0.55	0.95	0.48
C6	0.15	0.14	0.20	0.18	0.14	0.13	0.15	0.13	0.12	0.12	0.12	0.22	0.21	0.22	0.22	0.11	0.27	0.55	0.96	0.42
C8	0.15	0.11	0.21	0.19	0.14	0.14	0.15	0.13	0.12	0.11	0.10	0.21	0.18	0.25	0.25	0.12	0.29	0.55	0.97	0.45
N1	0.15	0.12	0.20	0.19	0.16	0.14	0.15	0.14	0.11	0.11	0.11	0.23	0.20	0.23	0.23	0.12	0.26	0.52	0.86	0.37
N2	0.16	0.09	0.24	0.24	0.18	0.18	0.15	0.17	0.12	0.10	0.16	0.24	0.14	0.27	0.30	0.15	0.25	0.48	0.67	0.30
N3	0.15	0.08	0.22	0.21	0.16	0.17	0.14	0.16	0.11	0.10	0.12	0.24	0.15	0.26	0.27	0.13	0.27	0.49	0.80	0.37
N7	0.15	0.13	0.20	0.19	0.14	0.14	0.15	0.13	0.12	0.11	0.11	0.20	0.20	0.24	0.24	0.11	0.29	0.57	1.01	0.46
N9	0.15	0.10	0.21	0.20	0.15	0.16	0.15	0.15	0.12	0.10	0.11	0.22	0.17	0.26	0.26	0.13	0.29	0.52	0.90	0.42
O2'	0.31	0.23	0.37	0.37	0.18	0.33	0.17	0.32	0.20	0.23	0.20	0.22	0.30	0.42	0.44	0.30	0.35	0.61	0.80	0.43
O3'	0.37	0.28	0.40	0.38	0.20	0.37	0.20	0.34	0.24	0.29	0.22	0.23	0.35	0.47	0.43	0.36	0.36	0.59	0.85	0.42
O4'	0.16	0.09	0.22	0.22	0.16	0.17	0.17	0.17	0.13	0.10	0.11	0.24	0.16	0.28	0.28	0.13	0.32	0.51	0.90	0.44
O5'	0.52	0.54	0.52	0.53	0.63	0.53	0.63	0.54	0.58	0.55	0.58	0.68	0.50	0.51	0.54	0.53	0.63	0.84	0.99	0.68
O6	0.15	0.17	0.19	0.18	0.14	0.13	0.16	0.14	0.13	0.14	0.15	0.20	0.23	0.21	0.22	0.13	0.28	0.59	1.03	0.46
OP1	0.87	0.90	0.82	0.83	1.02	0.87	1.02	0.89	0.97	0.91	0.96	1.09	0.84	0.79	0.81	0.91	0.85	0.99	1.06	0.83
OP2	0.72	0.71	0.71	0.72	0.78	0.73	0.80	0.73	0.77	0.73	0.73	0.82	0.67	0.71	0.73	0.74	0.72	0.93	1.04	0.76
P	0.55	0.56	0.53	0.54	0.67	0.55	0.67	0.56	0.63	0.58	0.61	0.73	0.51	0.52	0.54	0.57	0.58	0.78	0.97	0.63

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.09	0.34	0.37	0.13
C2	0.02	0.00	0.10	0.09	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.12	0.04	0.20	0.47	0.70	0.30
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.08	0.06	0.17	0.01	0.02	0.02	0.14	0.31	0.41	0.19
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.12	0.05	0.09	0.09	0.15	0.02	0.02	0.02	0.20	0.32	0.40	0.23
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.02	0.27	0.65	0.96	0.47
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.25	0.19	0.10
C5	0.01	0.02	0.07	0.11	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.15	0.04	0.28	0.67	0.96	0.50
C5'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.08	0.01	0.10	0.00	0.09	0.06	0.07	0.09	0.08	0.05	0.03	0.01	0.01	0.11	0.25	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.15	0.05	0.25	0.55	0.77	0.40
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.19	0.44	0.62	0.27
N3	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.24	0.57	0.86	0.39
N4	0.02	0.02	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.14	0.03	0.28	0.72	1.06	0.53
O2	0.04	0.01	0.17	0.15	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.15	0.20	0.07	0.18	0.43	0.62	0.24
O2'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.02	0.07	0.05	0.15	0.00	0.05	0.04	0.07	0.41	0.33	0.17
O3'	0.02	0.12	0.02	0.02	0.11	0.02	0.15	0.03	0.15	0.05	0.12	0.14	0.20	0.05	0.00	0.02	0.20	0.48	0.46	0.27
O4'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.07	0.04	0.02	0.00	0.08	0.33	0.20	0.12
O5'	0.09	0.20	0.14	0.20	0.27	0.02	0.28	0.01	0.25	0.19	0.24	0.28	0.18	0.07	0.20	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.34	0.47	0.31	0.32	0.65	0.25	0.67	0.11	0.55	0.44	0.57	0.72	0.43	0.41	0.48	0.33	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.37	0.70	0.41	0.40	0.96	0.19	0.96	0.25	0.77	0.62	0.86	1.06	0.62	0.33	0.46	0.20	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.30	0.19	0.23	0.47	0.10	0.50	0.02	0.40	0.27	0.39	0.53	0.24	0.17	0.27	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00