Doublet Group distance statistics: 52678

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C2	A	max_d=0.056 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N1	A	max_d=0.056 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N3	A	max_d=0.055 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C1'	A	max_d=0.069 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C5	A	max_d=0.070 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C4	A	max_d=0.081 avg_d=0.030 std_dev=0.015
N9	A	max_d=0.100 avg_d=0.036 std_dev=0.019
N2	A	max_d=0.109 avg_d=0.029 std_dev=0.022
O6	A	max_d=0.115 avg_d=0.049 std_dev=0.022
N7	A	max_d=0.160 avg_d=0.054 std_dev=0.033
C8	A	max_d=0.188 avg_d=0.062 std_dev=0.038
N3	B	max_d=0.482 avg_d=0.256 std_dev=0.128
C4	B	max_d=0.561 avg_d=0.245 std_dev=0.147
C6	B	max_d=0.693 avg_d=0.332 std_dev=0.154
C5	B	max_d=0.724 avg_d=0.296 std_dev=0.167
C2	B	max_d=0.637 avg_d=0.341 std_dev=0.183
N4	B	max_d=0.860 avg_d=0.302 std_dev=0.192
N1	B	max_d=0.676 avg_d=0.373 std_dev=0.201
O2	B	max_d=0.850 avg_d=0.462 std_dev=0.225
C4'	B	max_d=1.123 avg_d=0.594 std_dev=0.286
C1'	B	max_d=1.108 avg_d=0.573 std_dev=0.297
O4'	B	max_d=1.109 avg_d=0.562 std_dev=0.304
C3'	B	max_d=1.214 avg_d=0.559 std_dev=0.329
C5'	B	max_d=1.472 avg_d=0.659 std_dev=0.360
O5'	B	max_d=1.733 avg_d=0.736 std_dev=0.388
C2'	B	max_d=1.467 avg_d=0.730 std_dev=0.389
C2'	A	max_d=1.845 avg_d=0.450 std_dev=0.509
O4'	A	max_d=1.862 avg_d=0.415 std_dev=0.510
O3'	B	max_d=2.078 avg_d=0.833 std_dev=0.546
O2'	B	max_d=2.764 avg_d=1.130 std_dev=0.643
P	B	max_d=3.021 avg_d=1.526 std_dev=0.685
O2'	A	max_d=2.517 avg_d=0.686 std_dev=0.735
C3'	A	max_d=2.601 avg_d=0.644 std_dev=0.745
O5'	A	max_d=3.520 avg_d=1.719 std_dev=0.781
C4'	A	max_d=2.781 avg_d=0.657 std_dev=0.797
O3'	A	max_d=2.900 avg_d=0.815 std_dev=0.876
OP1	B	max_d=4.225 avg_d=1.921 std_dev=0.909
OP2	B	max_d=5.255 avg_d=2.019 std_dev=1.047
C5'	A	max_d=4.061 avg_d=1.183 std_dev=1.177
P	A	max_d=5.831 avg_d=1.871 std_dev=1.417
OP2	A	max_d=7.150 avg_d=1.930 std_dev=1.795
OP1	A	max_d=7.697 avg_d=2.351 std_dev=1.855

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.00	0.00	0.03	0.22	0.01	0.25	0.01	0.24	0.39	0.22
C2	0.03	0.00	0.33	0.28	0.01	0.11	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.28	0.24	0.38	0.01	0.41	0.79	0.42
C2'	0.00	0.33	0.00	0.01	0.17	0.02	0.09	0.15	0.15	0.16	0.26	0.40	0.32	0.09	0.03	0.00	0.03	0.01	0.24	0.12	0.39	0.36	0.29
C3'	0.02	0.28	0.01	0.00	0.24	0.01	0.29	0.03	0.31	0.23	0.31	0.27	0.24	0.27	0.18	0.03	0.01	0.03	0.09	0.33	0.30	0.14	0.14
C4	0.02	0.01	0.17	0.24	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.19	0.13	0.50	0.01	0.42	0.88	0.53
C4'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.17	0.09	0.15	0.10	0.15	0.07	0.22	0.02	0.01	0.02	0.11	0.27	0.08	0.11
C5	0.01	0.01	0.09	0.29	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.21	0.07	0.68	0.01	0.61	1.20	0.77
C5'	0.07	0.21	0.15	0.03	0.17	0.01	0.22	0.00	0.23	0.24	0.22	0.23	0.19	0.26	0.14	0.11	0.17	0.02	0.01	0.26	0.12	0.08	0.02
C6	0.01	0.01	0.15	0.31	0.00	0.09	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.25	0.12	0.67	0.00	0.63	1.26	0.78
C8	0.01	0.01	0.16	0.23	0.00	0.17	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.16	0.13	0.77	0.01	0.69	1.17	0.84
N1	0.02	0.00	0.26	0.31	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.27	0.19	0.53	0.01	0.50	1.05	0.60
N2	0.04	0.01	0.40	0.27	0.01	0.15	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.38	0.32	0.29	0.28	0.01	0.45	0.65	0.32
N3	0.03	0.00	0.32	0.24	0.00	0.10	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.27	0.26	0.23	0.33	0.01	0.37	0.66	0.34
N7	0.00	0.01	0.09	0.27	0.00	0.15	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.21	0.06	0.83	0.01	0.80	1.40	0.96
N9	0.00	0.01	0.03	0.18	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.13	0.02	0.51	0.01	0.40	0.80	0.52
O2'	0.03	0.29	0.00	0.03	0.16	0.22	0.21	0.11	0.21	0.30	0.23	0.38	0.27	0.30	0.15	0.00	0.05	0.15	0.15	0.24	0.30	0.37	0.22
O3'	0.22	0.28	0.03	0.01	0.19	0.02	0.21	0.17	0.25	0.16	0.27	0.32	0.26	0.21	0.13	0.05	0.00	0.15	0.27	0.27	0.31	0.34	0.27
O4'	0.01	0.24	0.01	0.03	0.13	0.01	0.07	0.02	0.12	0.13	0.19	0.29	0.23	0.06	0.02	0.15	0.15	0.00	0.25	0.10	0.22	0.32	0.20
O5'	0.25	0.38	0.24	0.09	0.50	0.02	0.68	0.01	0.67	0.77	0.53	0.28	0.33	0.83	0.51	0.15	0.27	0.25	0.00	0.76	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.12	0.33	0.01	0.11	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.24	0.27	0.10	0.76	0.00	0.76	1.44	0.91
OP1	0.24	0.41	0.39	0.30	0.42	0.27	0.61	0.12	0.63	0.69	0.50	0.45	0.37	0.80	0.40	0.30	0.31	0.22	0.02	0.76	0.00	0.02	0.00
OP2	0.39	0.79	0.36	0.14	0.88	0.08	1.20	0.08	1.26	1.17	1.05	0.65	0.66	1.40	0.80	0.37	0.34	0.32	0.02	1.44	0.02	0.00	0.01
P	0.22	0.42	0.29	0.14	0.53	0.11	0.77	0.02	0.78	0.84	0.60	0.32	0.34	0.96	0.52	0.22	0.27	0.20	0.01	0.91	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.12	0.21	0.18	0.12	0.16	0.12	0.13	0.12	0.13	0.10	0.15	0.17	0.30	0.22	0.16	0.22	0.22	0.60	0.29
C2	0.14	0.10	0.18	0.15	0.12	0.12	0.11	0.10	0.10	0.10	0.09	0.16	0.15	0.28	0.22	0.13	0.19	0.16	0.56	0.27
C2'	0.38	0.35	0.43	0.41	0.25	0.38	0.25	0.37	0.29	0.33	0.30	0.23	0.41	0.29	0.27	0.37	0.43	0.40	0.77	0.50
C3'	0.27	0.29	0.31	0.29	0.28	0.26	0.25	0.26	0.24	0.25	0.29	0.32	0.33	0.22	0.23	0.26	0.33	0.33	0.72	0.43
C4	0.14	0.11	0.17	0.17	0.11	0.12	0.12	0.11	0.10	0.11	0.09	0.15	0.16	0.30	0.21	0.13	0.21	0.19	0.65	0.30
C4'	0.31	0.20	0.40	0.39	0.16	0.35	0.21	0.31	0.24	0.24	0.14	0.17	0.22	0.56	0.53	0.29	0.33	0.35	0.58	0.35
C5	0.13	0.12	0.16	0.18	0.11	0.12	0.12	0.13	0.11	0.11	0.10	0.15	0.16	0.31	0.20	0.12	0.23	0.21	0.74	0.35
C5'	0.40	0.28	0.51	0.52	0.30	0.46	0.36	0.45	0.37	0.35	0.25	0.30	0.27	0.71	0.68	0.38	0.47	0.52	0.71	0.50
C6	0.13	0.12	0.16	0.19	0.12	0.12	0.12	0.14	0.11	0.11	0.11	0.16	0.16	0.31	0.20	0.12	0.24	0.21	0.77	0.36
C8	0.14	0.12	0.17	0.19	0.11	0.12	0.12	0.13	0.10	0.11	0.10	0.15	0.16	0.32	0.21	0.12	0.23	0.23	0.73	0.34
N1	0.13	0.12	0.16	0.17	0.12	0.12	0.11	0.12	0.10	0.11	0.09	0.16	0.16	0.29	0.21	0.12	0.22	0.17	0.67	0.31
N2	0.14	0.09	0.19	0.15	0.13	0.13	0.12	0.10	0.11	0.10	0.11	0.16	0.14	0.25	0.26	0.14	0.18	0.16	0.46	0.22
N3	0.14	0.10	0.18	0.15	0.12	0.13	0.12	0.10	0.10	0.11	0.09	0.16	0.15	0.28	0.22	0.14	0.20	0.18	0.56	0.27
N7	0.13	0.12	0.16	0.20	0.12	0.12	0.13	0.14	0.11	0.11	0.11	0.15	0.16	0.33	0.21	0.12	0.24	0.24	0.79	0.37
N9	0.14	0.11	0.18	0.18	0.11	0.13	0.12	0.12	0.10	0.11	0.09	0.15	0.16	0.30	0.21	0.13	0.22	0.21	0.66	0.31
O2'	0.46	0.37	0.54	0.48	0.27	0.47	0.28	0.43	0.34	0.38	0.30	0.25	0.44	0.47	0.39	0.44	0.43	0.42	0.63	0.45
O3'	0.39	0.33	0.51	0.47	0.26	0.44	0.25	0.37	0.28	0.33	0.29	0.27	0.40	0.50	0.49	0.37	0.30	0.37	0.51	0.33
O4'	0.41	0.31	0.46	0.43	0.26	0.42	0.30	0.38	0.34	0.35	0.25	0.23	0.33	0.66	0.57	0.40	0.38	0.38	0.56	0.37
O5'	0.23	0.35	0.25	0.29	0.54	0.25	0.50	0.32	0.40	0.32	0.46	0.66	0.29	0.45	0.40	0.25	0.40	0.47	0.87	0.54
O6	0.13	0.13	0.16	0.21	0.13	0.13	0.14	0.17	0.12	0.12	0.12	0.16	0.16	0.32	0.21	0.12	0.26	0.25	0.86	0.41
OP1	0.62	0.49	0.81	0.84	0.55	0.74	0.56	0.72	0.55	0.54	0.50	0.64	0.49	0.98	1.03	0.60	0.69	0.78	1.00	0.75
OP2	0.68	0.87	0.55	0.64	1.16	0.67	1.11	0.80	0.96	0.84	1.04	1.32	0.76	0.47	0.54	0.75	0.93	1.01	1.46	1.11
P	0.36	0.43	0.43	0.47	0.65	0.41	0.61	0.48	0.51	0.42	0.56	0.79	0.36	0.59	0.60	0.38	0.56	0.65	1.03	0.69

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.21	0.00	0.10	0.11	0.25	0.14
C2	0.01	0.00	0.09	0.12	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.19	0.04	0.18	0.11	0.54	0.26
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.12	0.09	0.03	0.07	0.06	0.15	0.00	0.02	0.01	0.26	0.24	0.29	0.26
C3'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.21	0.00	0.25	0.02	0.23	0.13	0.16	0.23	0.11	0.02	0.01	0.02	0.15	0.20	0.11	0.11
C4	0.01	0.01	0.05	0.21	0.00	0.11	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.12	0.03	0.30	0.24	0.86	0.42
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.11	0.00	0.14	0.00	0.13	0.06	0.07	0.12	0.04	0.16	0.02	0.00	0.02	0.09	0.13	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.25	0.00	0.14	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.19	0.03	0.33	0.26	0.88	0.43
C5'	0.05	0.09	0.12	0.02	0.20	0.00	0.23	0.00	0.19	0.10	0.14	0.22	0.05	0.05	0.12	0.01	0.01	0.10	0.19	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.23	0.01	0.13	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.16	0.04	0.27	0.17	0.67	0.34
N1	0.01	0.01	0.03	0.13	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.11	0.01	0.17	0.10	0.48	0.24
N3	0.01	0.00	0.07	0.16	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.14	0.04	0.24	0.18	0.72	0.34
N4	0.02	0.01	0.06	0.23	0.00	0.12	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.14	0.03	0.33	0.30	0.98	0.47
O2	0.02	0.00	0.15	0.11	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.32	0.06	0.13	0.09	0.42	0.20
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.22	0.16	0.21	0.05	0.17	0.13	0.19	0.23	0.15	0.00	0.05	0.11	0.19	0.17	0.33	0.21
O3'	0.21	0.19	0.02	0.01	0.12	0.02	0.19	0.12	0.16	0.11	0.14	0.14	0.32	0.05	0.00	0.14	0.23	0.39	0.30	0.25
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.06	0.11	0.14	0.00	0.11	0.16	0.24	0.15
O5'	0.10	0.18	0.26	0.15	0.30	0.02	0.33	0.01	0.27	0.17	0.24	0.33	0.13	0.19	0.23	0.11	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.11	0.11	0.24	0.20	0.24	0.09	0.26	0.10	0.17	0.10	0.18	0.30	0.09	0.17	0.39	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.25	0.54	0.29	0.11	0.86	0.13	0.88	0.19	0.67	0.48	0.72	0.98	0.42	0.33	0.30	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.26	0.26	0.11	0.42	0.03	0.43	0.02	0.34	0.24	0.34	0.47	0.20	0.21	0.25	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00