Doublet Group distance statistics: 52679

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	max_d=0.047 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N1	A	max_d=0.039 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C5	A	max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C4	A	max_d=0.050 avg_d=0.030 std_dev=0.016
N3	A	max_d=0.067 avg_d=0.027 std_dev=0.016
C2	A	max_d=0.067 avg_d=0.019 std_dev=0.017
N9	A	max_d=0.059 avg_d=0.033 std_dev=0.017
C1'	A	max_d=0.065 avg_d=0.026 std_dev=0.018
N7	A	max_d=0.087 avg_d=0.045 std_dev=0.025
N2	A	max_d=0.130 avg_d=0.042 std_dev=0.029
O6	A	max_d=0.143 avg_d=0.044 std_dev=0.030
C8	A	max_d=0.105 avg_d=0.053 std_dev=0.031
C2'	A	max_d=0.500 avg_d=0.227 std_dev=0.125
O2'	A	max_d=0.598 avg_d=0.305 std_dev=0.143
O4'	A	max_d=0.683 avg_d=0.369 std_dev=0.146
N1	B	max_d=0.802 avg_d=0.416 std_dev=0.182
C4	B	max_d=0.768 avg_d=0.417 std_dev=0.197
N3	B	max_d=0.836 avg_d=0.464 std_dev=0.197
C6	B	max_d=0.879 avg_d=0.484 std_dev=0.198
C5	B	max_d=0.921 avg_d=0.519 std_dev=0.216
C2	B	max_d=0.919 avg_d=0.486 std_dev=0.233
C1'	B	max_d=1.022 avg_d=0.546 std_dev=0.252
C3'	A	max_d=0.968 avg_d=0.531 std_dev=0.257
C4'	A	max_d=1.099 avg_d=0.615 std_dev=0.286
N4	B	max_d=1.284 avg_d=0.525 std_dev=0.292
O2	B	max_d=1.278 avg_d=0.725 std_dev=0.342
O3'	A	max_d=1.378 avg_d=0.707 std_dev=0.348
O4'	B	max_d=1.758 avg_d=0.627 std_dev=0.377
P	A	max_d=1.675 avg_d=1.072 std_dev=0.404
OP2	A	max_d=1.637 avg_d=0.959 std_dev=0.426
O5'	A	max_d=1.487 avg_d=1.092 std_dev=0.431
C5'	A	max_d=1.738 avg_d=0.977 std_dev=0.441
C4'	B	max_d=1.922 avg_d=1.207 std_dev=0.458
OP1	A	max_d=2.191 avg_d=1.374 std_dev=0.527
C2'	B	max_d=2.401 avg_d=1.176 std_dev=0.551
C3'	B	max_d=2.681 avg_d=1.487 std_dev=0.606
O2'	B	max_d=3.724 avg_d=1.684 std_dev=0.802
O3'	B	max_d=3.692 avg_d=2.103 std_dev=0.824
C5'	B	max_d=4.501 avg_d=1.778 std_dev=0.852
O5'	B	max_d=6.411 avg_d=1.708 std_dev=1.228
P	B	max_d=9.204 avg_d=2.217 std_dev=1.775
OP1	B	max_d=9.412 avg_d=2.561 std_dev=1.794
OP2	B	max_d=11.157 avg_d=2.338 std_dev=2.211

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.21	0.03	0.21	0.19	0.15
C2	0.05	0.00	0.14	0.23	0.01	0.10	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.27	0.05	0.41	0.01	0.37	0.36	0.35
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.09	0.07	0.12	0.17	0.14	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.27	0.09	0.33	0.17	0.21
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.16	0.00	0.16	0.02	0.20	0.14	0.22	0.25	0.20	0.15	0.09	0.02	0.01	0.02	0.36	0.21	0.44	0.17	0.29
C4	0.02	0.01	0.08	0.16	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.16	0.02	0.43	0.01	0.37	0.34	0.35
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.14	0.12	0.12	0.11	0.09	0.13	0.07	0.05	0.02	0.00	0.01	0.16	0.17	0.27	0.06
C5	0.02	0.01	0.07	0.16	0.00	0.12	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.18	0.02	0.52	0.02	0.45	0.45	0.45
C5'	0.03	0.19	0.02	0.02	0.17	0.01	0.23	0.00	0.26	0.20	0.23	0.18	0.15	0.25	0.13	0.05	0.04	0.01	0.01	0.29	0.21	0.37	0.01
C6	0.02	0.00	0.09	0.20	0.01	0.14	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.23	0.03	0.53	0.00	0.48	0.49	0.48
C8	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.12	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.15	0.04	0.52	0.03	0.42	0.37	0.41
N1	0.04	0.00	0.12	0.22	0.01	0.12	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.26	0.03	0.48	0.01	0.43	0.44	0.42
N2	0.06	0.01	0.17	0.25	0.01	0.11	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.32	0.07	0.38	0.01	0.35	0.34	0.32
N3	0.05	0.00	0.14	0.20	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.13	0.23	0.05	0.37	0.01	0.33	0.30	0.30
N7	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.13	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.17	0.04	0.57	0.03	0.50	0.49	0.50
N9	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.40	0.02	0.33	0.28	0.30
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.08	0.05	0.12	0.17	0.13	0.05	0.03	0.00	0.04	0.06	0.08	0.08	0.18	0.20	0.10
O3'	0.02	0.27	0.02	0.01	0.16	0.02	0.18	0.04	0.23	0.15	0.26	0.32	0.23	0.17	0.08	0.04	0.00	0.02	0.30	0.25	0.48	0.21	0.29
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.07	0.05	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.12	0.04	0.16	0.29	0.16
O5'	0.21	0.41	0.27	0.36	0.43	0.01	0.52	0.01	0.53	0.52	0.48	0.38	0.37	0.57	0.40	0.08	0.30	0.12	0.00	0.56	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.09	0.21	0.01	0.16	0.02	0.29	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.08	0.25	0.04	0.56	0.00	0.53	0.56	0.53
OP1	0.21	0.37	0.33	0.44	0.37	0.17	0.45	0.21	0.48	0.42	0.43	0.35	0.33	0.50	0.33	0.18	0.48	0.16	0.02	0.53	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.36	0.17	0.17	0.34	0.27	0.45	0.37	0.49	0.37	0.44	0.34	0.30	0.49	0.28	0.20	0.21	0.29	0.02	0.56	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.35	0.21	0.29	0.35	0.06	0.45	0.01	0.48	0.41	0.42	0.32	0.30	0.50	0.30	0.10	0.29	0.16	0.01	0.53	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.19	0.28	0.27	0.15	0.41	0.15	0.85	0.17	0.20	0.16	0.19	0.25	0.39	0.35	0.35	0.64	1.16	0.69	0.93
C2	0.23	0.18	0.24	0.24	0.13	0.35	0.13	0.74	0.15	0.18	0.13	0.17	0.24	0.32	0.29	0.31	0.50	0.89	0.52	0.69
C2'	0.27	0.19	0.31	0.33	0.13	0.46	0.15	0.93	0.18	0.21	0.13	0.15	0.24	0.40	0.39	0.35	0.76	1.27	0.83	1.07
C3'	0.31	0.25	0.31	0.32	0.21	0.44	0.22	0.88	0.24	0.26	0.21	0.22	0.29	0.39	0.38	0.35	0.70	1.19	0.76	0.99
C4	0.23	0.19	0.24	0.23	0.13	0.32	0.13	0.70	0.16	0.19	0.15	0.18	0.24	0.32	0.29	0.29	0.44	0.87	0.49	0.65
C4'	0.25	0.18	0.26	0.26	0.14	0.40	0.15	0.85	0.16	0.19	0.14	0.18	0.24	0.37	0.35	0.32	0.66	1.18	0.72	0.95
C5	0.22	0.19	0.22	0.21	0.14	0.25	0.14	0.54	0.16	0.18	0.16	0.17	0.25	0.26	0.26	0.24	0.27	0.62	0.47	0.42
C5'	0.29	0.25	0.26	0.24	0.25	0.38	0.26	0.79	0.25	0.26	0.24	0.29	0.28	0.36	0.31	0.34	0.57	1.06	0.61	0.83
C6	0.21	0.20	0.20	0.21	0.13	0.21	0.14	0.44	0.15	0.18	0.17	0.16	0.24	0.23	0.24	0.22	0.21	0.46	0.55	0.32
C8	0.22	0.19	0.23	0.22	0.14	0.28	0.14	0.61	0.15	0.18	0.16	0.17	0.25	0.30	0.29	0.26	0.34	0.75	0.46	0.52
N1	0.22	0.20	0.21	0.21	0.13	0.26	0.13	0.54	0.16	0.19	0.15	0.17	0.25	0.25	0.24	0.25	0.28	0.59	0.45	0.41
N2	0.24	0.15	0.27	0.28	0.12	0.42	0.12	0.86	0.15	0.18	0.12	0.17	0.21	0.37	0.31	0.35	0.66	1.05	0.66	0.87
N3	0.24	0.17	0.25	0.25	0.13	0.38	0.13	0.80	0.15	0.18	0.14	0.18	0.23	0.35	0.31	0.32	0.58	1.03	0.61	0.82
N7	0.21	0.19	0.22	0.21	0.14	0.22	0.14	0.50	0.15	0.18	0.17	0.17	0.25	0.26	0.27	0.23	0.23	0.57	0.51	0.37
N9	0.23	0.19	0.25	0.23	0.14	0.34	0.14	0.73	0.16	0.19	0.15	0.18	0.25	0.33	0.31	0.30	0.48	0.94	0.52	0.70
O2'	0.32	0.23	0.39	0.43	0.18	0.56	0.20	1.06	0.24	0.26	0.18	0.20	0.27	0.49	0.49	0.43	0.95	1.52	1.09	1.31
O3'	0.36	0.31	0.38	0.41	0.26	0.51	0.27	0.95	0.29	0.32	0.26	0.27	0.35	0.45	0.45	0.40	0.82	1.31	0.93	1.13
O4'	0.25	0.20	0.28	0.27	0.16	0.39	0.16	0.83	0.18	0.21	0.17	0.20	0.26	0.39	0.36	0.34	0.61	1.13	0.66	0.89
O5'	0.51	0.52	0.48	0.49	0.58	0.61	0.58	0.93	0.56	0.53	0.54	0.61	0.50	0.48	0.48	0.59	0.73	1.10	0.71	0.89
O6	0.20	0.20	0.18	0.22	0.14	0.16	0.14	0.29	0.16	0.18	0.18	0.15	0.23	0.22	0.22	0.19	0.27	0.31	0.77	0.36
OP1	0.46	0.47	0.42	0.42	0.54	0.56	0.54	0.88	0.51	0.48	0.49	0.59	0.46	0.45	0.40	0.54	0.68	1.02	0.66	0.83
OP2	0.44	0.46	0.37	0.38	0.57	0.51	0.58	0.77	0.53	0.47	0.50	0.63	0.42	0.36	0.34	0.52	0.59	0.84	0.68	0.68
P	0.44	0.45	0.37	0.38	0.53	0.51	0.54	0.82	0.50	0.46	0.48	0.59	0.43	0.38	0.35	0.52	0.62	0.95	0.63	0.75

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.19	0.00	0.17	0.08	0.31	0.19
C2	0.02	0.00	0.10	0.10	0.01	0.17	0.01	0.36	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.14	0.17	0.10	0.27	0.40	0.18
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.08	0.12	0.10	0.02	0.08	0.05	0.18	0.01	0.03	0.01	0.11	0.13	0.19	0.11
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.21	0.01	0.31	0.02	0.31	0.13	0.11	0.22	0.24	0.01	0.01	0.01	0.17	0.20	0.20	0.17
C4	0.01	0.01	0.04	0.21	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.13	0.03	0.51	0.37	1.05	0.62
C4'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.08	0.00	0.24	0.01	0.27	0.05	0.12	0.09	0.38	0.16	0.02	0.00	0.02	0.13	0.05	0.04
C5	0.01	0.01	0.08	0.31	0.00	0.24	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.17	0.13	0.84	0.70	1.38	0.99
C5'	0.05	0.36	0.12	0.02	0.12	0.01	0.35	0.00	0.38	0.06	0.29	0.13	0.70	0.06	0.12	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.31	0.01	0.27	0.00	0.38	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.15	0.17	0.81	0.64	1.19	0.90
N1	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.09	0.01	0.35	0.18	0.63	0.39
N3	0.01	0.00	0.08	0.11	0.00	0.12	0.00	0.29	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.13	0.13	0.19	0.22	0.61	0.26
N4	0.01	0.01	0.05	0.22	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.15	0.03	0.54	0.43	1.16	0.68
O2	0.03	0.00	0.18	0.24	0.01	0.38	0.01	0.70	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.24	0.30	0.43	0.66	0.35	0.50
O2'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.19	0.16	0.23	0.06	0.21	0.11	0.14	0.20	0.15	0.00	0.05	0.12	0.05	0.14	0.12	0.05
O3'	0.19	0.14	0.03	0.01	0.13	0.02	0.17	0.12	0.15	0.09	0.13	0.15	0.24	0.05	0.00	0.13	0.21	0.33	0.25	0.24
O4'	0.00	0.17	0.01	0.01	0.03	0.00	0.13	0.01	0.17	0.01	0.13	0.03	0.30	0.12	0.13	0.00	0.21	0.16	0.28	0.22
O5'	0.17	0.10	0.11	0.17	0.51	0.02	0.84	0.01	0.81	0.35	0.19	0.54	0.43	0.05	0.21	0.21	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.08	0.27	0.13	0.20	0.37	0.13	0.70	0.07	0.64	0.18	0.22	0.43	0.66	0.14	0.33	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.40	0.19	0.20	1.05	0.05	1.38	0.08	1.19	0.63	0.61	1.16	0.35	0.12	0.25	0.28	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.18	0.11	0.17	0.62	0.04	0.99	0.01	0.90	0.39	0.26	0.68	0.50	0.05	0.24	0.22	0.00	0.01	0.01	0.00