Doublet Group distance statistics: 52681

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 2, 3, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.014, 0.026, 0.038, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.017, 0.030, 0.042, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.030 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.004, 0.019, 0.033, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.021 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.029 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.021, 0.044, 0.067, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.044 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.008, 0.034, 0.060, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.034 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.001, 0.034, 0.067, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.034 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.001, 0.040, 0.079, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.040 std_dev=0.039
C1'	B	0, 0.291, 0.485, 0.679, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.485 std_dev=0.194
N1	B	0, 0.206, 0.413, 0.621, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.413 std_dev=0.207
O4'	B	0, 0.339, 0.550, 0.761, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.550 std_dev=0.211
C2	B	0, 0.151, 0.374, 0.596, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.374 std_dev=0.222
C2'	B	0, 0.293, 0.527, 0.761, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.527 std_dev=0.234
N3	B	0, 0.132, 0.370, 0.608, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.370 std_dev=0.238
C4	B	0, 0.239, 0.484, 0.729, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.484 std_dev=0.245
C4'	B	0, 0.361, 0.608, 0.854, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.608 std_dev=0.247
O2'	B	0, 0.421, 0.672, 0.924, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.672 std_dev=0.252
C6	B	0, 0.255, 0.516, 0.778, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.516 std_dev=0.261
O2	B	0, 0.202, 0.464, 0.726, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.464 std_dev=0.262
C5	B	0, 0.318, 0.590, 0.863, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.590 std_dev=0.272
C3'	B	0, 0.363, 0.635, 0.908, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.635 std_dev=0.273
N4	B	0, 0.288, 0.585, 0.882, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.585 std_dev=0.297
C5'	B	0, 0.413, 0.732, 1.052, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.732 std_dev=0.319
O4'	A	0, 0.001, 0.331, 0.662, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.331 std_dev=0.330
O3'	B	0, 0.430, 0.803, 1.177, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.803 std_dev=0.373
C2'	A	0, -0.008, 0.376, 0.761, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.376 std_dev=0.385
O5'	B	0, 0.350, 0.813, 1.276, 1.831 max_d=1.831 avg_d=0.813 std_dev=0.463
O5'	A	0, 0.747, 1.239, 1.731, 2.072 max_d=2.072 avg_d=1.239 std_dev=0.492
C4'	A	0, 0.123, 0.653, 1.183, 2.168 max_d=2.168 avg_d=0.653 std_dev=0.530
C3'	A	0, 0.062, 0.594, 1.126, 1.944 max_d=1.944 avg_d=0.594 std_dev=0.532
O2'	A	0, -0.039, 0.537, 1.113, 2.355 max_d=2.355 avg_d=0.537 std_dev=0.576
P	B	0, 0.628, 1.237, 1.846, 2.388 max_d=2.388 avg_d=1.237 std_dev=0.609
OP1	B	0, 0.291, 0.974, 1.658, 2.470 max_d=2.470 avg_d=0.974 std_dev=0.684
O3'	A	0, 0.080, 0.772, 1.464, 2.303 max_d=2.303 avg_d=0.772 std_dev=0.692
C5'	A	0, 0.467, 1.244, 2.021, 3.253 max_d=3.253 avg_d=1.244 std_dev=0.777
P	A	0, 0.639, 1.469, 2.299, 3.046 max_d=3.046 avg_d=1.469 std_dev=0.830
OP2	B	0, 1.878, 2.840, 3.802, 4.417 max_d=4.417 avg_d=2.840 std_dev=0.962
OP2	A	0, 0.738, 1.701, 2.663, 3.646 max_d=3.646 avg_d=1.701 std_dev=0.962
OP1	A	0, 0.954, 1.996, 3.039, 4.315 max_d=4.315 avg_d=1.996 std_dev=1.043

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.16	0.00	0.09	0.02	0.12	0.18	0.14
C2	0.04	0.00	0.25	0.26	0.02	0.08	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.23	0.09	0.22	0.02	0.28	0.36	0.28
C2'	0.01	0.25	0.00	0.01	0.12	0.03	0.05	0.09	0.09	0.14	0.18	0.32	0.25	0.10	0.02	0.00	0.02	0.02	0.24	0.07	0.31	0.33	0.26
C3'	0.02	0.26	0.01	0.00	0.21	0.00	0.24	0.02	0.26	0.22	0.26	0.28	0.23	0.25	0.15	0.02	0.01	0.02	0.10	0.27	0.24	0.18	0.11
C4	0.02	0.02	0.12	0.21	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.13	0.05	0.19	0.01	0.24	0.32	0.26
C4'	0.01	0.08	0.03	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.13	0.08	0.10	0.08	0.14	0.06	0.20	0.02	0.00	0.02	0.11	0.10	0.09	0.05
C5	0.02	0.02	0.05	0.24	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.21	0.15	0.03	0.24	0.01	0.31	0.41	0.33
C5'	0.04	0.11	0.09	0.02	0.10	0.01	0.15	0.00	0.16	0.16	0.13	0.12	0.10	0.19	0.09	0.12	0.12	0.02	0.02	0.18	0.11	0.10	0.02
C6	0.02	0.02	0.09	0.26	0.01	0.10	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.22	0.18	0.04	0.27	0.00	0.35	0.47	0.37
C8	0.02	0.02	0.14	0.22	0.01	0.13	0.00	0.16	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.24	0.19	0.07	0.20	0.02	0.25	0.36	0.28
N1	0.03	0.01	0.18	0.26	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.18	0.20	0.07	0.25	0.02	0.32	0.43	0.34
N2	0.05	0.01	0.32	0.28	0.02	0.10	0.03	0.12	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.23	0.30	0.10	0.22	0.04	0.28	0.36	0.28
N3	0.04	0.01	0.25	0.23	0.01	0.08	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.22	0.09	0.19	0.02	0.23	0.30	0.24
N7	0.03	0.02	0.10	0.25	0.01	0.14	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.27	0.21	0.06	0.25	0.02	0.34	0.45	0.36
N9	0.01	0.02	0.02	0.15	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.14	0.08	0.02	0.14	0.01	0.18	0.26	0.21
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.14	0.20	0.21	0.12	0.22	0.24	0.18	0.23	0.16	0.27	0.14	0.00	0.05	0.13	0.15	0.26	0.23	0.32	0.19
O3'	0.16	0.23	0.02	0.01	0.13	0.02	0.15	0.12	0.18	0.19	0.20	0.30	0.22	0.21	0.08	0.05	0.00	0.10	0.16	0.20	0.32	0.35	0.21
O4'	0.00	0.09	0.02	0.02	0.05	0.00	0.03	0.02	0.04	0.07	0.07	0.10	0.09	0.06	0.02	0.13	0.10	0.00	0.08	0.04	0.14	0.21	0.17
O5'	0.09	0.22	0.24	0.10	0.19	0.02	0.24	0.02	0.27	0.20	0.25	0.22	0.19	0.25	0.14	0.15	0.16	0.08	0.00	0.29	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.27	0.01	0.11	0.01	0.18	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.26	0.20	0.04	0.29	0.00	0.41	0.53	0.42
OP1	0.12	0.28	0.31	0.24	0.24	0.10	0.31	0.11	0.35	0.25	0.32	0.28	0.23	0.34	0.18	0.23	0.32	0.14	0.02	0.41	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.36	0.33	0.18	0.32	0.09	0.41	0.10	0.47	0.36	0.43	0.36	0.30	0.45	0.26	0.32	0.35	0.21	0.02	0.53	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.28	0.26	0.11	0.26	0.05	0.33	0.02	0.37	0.28	0.34	0.28	0.24	0.36	0.21	0.19	0.21	0.17	0.01	0.42	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.14	0.26	0.28	0.15	0.17	0.14	0.18	0.13	0.13	0.14	0.18	0.15	0.31	0.35	0.14	0.36	0.43	0.44	0.36
C2	0.15	0.13	0.26	0.27	0.12	0.17	0.11	0.18	0.11	0.12	0.12	0.14	0.16	0.29	0.33	0.14	0.37	0.42	0.40	0.35
C2'	0.30	0.26	0.41	0.40	0.23	0.32	0.22	0.30	0.23	0.26	0.24	0.24	0.30	0.47	0.47	0.28	0.31	0.36	0.35	0.28
C3'	0.34	0.32	0.39	0.39	0.33	0.35	0.33	0.34	0.32	0.32	0.32	0.35	0.33	0.43	0.44	0.34	0.37	0.40	0.39	0.33
C4	0.15	0.14	0.25	0.26	0.14	0.17	0.13	0.18	0.12	0.13	0.13	0.16	0.16	0.29	0.33	0.14	0.41	0.46	0.46	0.40
C4'	0.18	0.16	0.27	0.28	0.17	0.19	0.16	0.19	0.15	0.16	0.16	0.21	0.18	0.32	0.35	0.17	0.34	0.40	0.41	0.33
C5	0.15	0.15	0.25	0.26	0.15	0.17	0.14	0.18	0.13	0.14	0.15	0.17	0.17	0.28	0.32	0.14	0.47	0.52	0.52	0.46
C5'	0.20	0.18	0.25	0.24	0.18	0.20	0.18	0.19	0.17	0.18	0.18	0.21	0.21	0.31	0.31	0.23	0.38	0.43	0.43	0.36
C6	0.16	0.16	0.25	0.27	0.14	0.18	0.13	0.19	0.13	0.15	0.15	0.16	0.18	0.27	0.32	0.15	0.49	0.53	0.52	0.47
C8	0.15	0.15	0.25	0.26	0.15	0.17	0.14	0.17	0.13	0.14	0.15	0.18	0.17	0.29	0.32	0.14	0.46	0.52	0.53	0.46
N1	0.15	0.14	0.25	0.27	0.12	0.18	0.11	0.19	0.11	0.13	0.12	0.14	0.17	0.28	0.32	0.14	0.43	0.48	0.45	0.41
N2	0.15	0.12	0.26	0.28	0.13	0.18	0.12	0.19	0.11	0.12	0.13	0.15	0.15	0.30	0.34	0.14	0.30	0.35	0.33	0.29
N3	0.15	0.13	0.26	0.27	0.12	0.17	0.11	0.18	0.11	0.12	0.12	0.15	0.15	0.30	0.34	0.14	0.36	0.41	0.40	0.35
N7	0.16	0.16	0.24	0.26	0.16	0.17	0.15	0.18	0.14	0.14	0.16	0.19	0.18	0.27	0.32	0.14	0.49	0.55	0.56	0.49
N9	0.15	0.14	0.25	0.27	0.14	0.17	0.13	0.18	0.13	0.14	0.14	0.17	0.16	0.30	0.33	0.14	0.40	0.47	0.47	0.40
O2'	0.24	0.24	0.35	0.35	0.30	0.26	0.28	0.26	0.25	0.23	0.27	0.35	0.24	0.43	0.44	0.24	0.35	0.40	0.46	0.38
O3'	0.31	0.30	0.39	0.38	0.29	0.32	0.27	0.31	0.26	0.28	0.29	0.33	0.34	0.44	0.43	0.31	0.33	0.35	0.38	0.30
O4'	0.18	0.16	0.28	0.29	0.15	0.20	0.14	0.20	0.14	0.16	0.15	0.17	0.19	0.33	0.36	0.17	0.40	0.47	0.48	0.41
O5'	0.32	0.30	0.30	0.29	0.30	0.32	0.31	0.30	0.30	0.31	0.29	0.32	0.32	0.34	0.31	0.36	0.46	0.48	0.46	0.42
O6	0.17	0.17	0.25	0.27	0.16	0.19	0.15	0.20	0.15	0.16	0.17	0.18	0.19	0.26	0.32	0.16	0.54	0.58	0.57	0.52
OP1	0.41	0.37	0.33	0.32	0.37	0.41	0.39	0.41	0.39	0.39	0.36	0.39	0.38	0.38	0.32	0.48	0.54	0.54	0.52	0.50
OP2	0.49	0.45	0.39	0.40	0.43	0.49	0.45	0.49	0.47	0.47	0.42	0.42	0.46	0.42	0.38	0.56	0.66	0.67	0.66	0.63
P	0.41	0.38	0.33	0.33	0.39	0.40	0.40	0.39	0.40	0.40	0.38	0.40	0.39	0.37	0.33	0.47	0.57	0.59	0.56	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.20	0.23	0.12	0.13
C2	0.02	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.02	0.37	0.37	0.31	0.32
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.08	0.05	0.14	0.00	0.02	0.01	0.18	0.31	0.15	0.16
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.02	0.11	0.05	0.10	0.10	0.14	0.02	0.01	0.01	0.19	0.36	0.19	0.19
C4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.02	0.51	0.52	0.49	0.48
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.06	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.17	0.19	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.13	0.03	0.52	0.51	0.48	0.49
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.08	0.11	0.14	0.09	0.06	0.03	0.02	0.01	0.21	0.28	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.13	0.03	0.47	0.42	0.33	0.39
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.36	0.35	0.25	0.29
N3	0.02	0.00	0.08	0.10	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.12	0.02	0.45	0.46	0.42	0.41
N4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.03	0.53	0.57	0.57	0.54
O2	0.04	0.01	0.14	0.14	0.01	0.06	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.15	0.16	0.04	0.30	0.32	0.26	0.26
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.05	0.06	0.03	0.06	0.04	0.03	0.09	0.06	0.15	0.00	0.05	0.05	0.07	0.24	0.14	0.08
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.11	0.02	0.13	0.03	0.13	0.06	0.12	0.13	0.16	0.05	0.00	0.01	0.12	0.40	0.27	0.21
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.05	0.01	0.00	0.12	0.14	0.17	0.09
O5'	0.20	0.37	0.18	0.19	0.51	0.02	0.52	0.01	0.47	0.36	0.45	0.53	0.30	0.07	0.12	0.12	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.23	0.37	0.31	0.36	0.52	0.17	0.51	0.21	0.42	0.35	0.46	0.57	0.32	0.24	0.40	0.14	0.03	0.00	0.03	0.01
OP2	0.12	0.31	0.15	0.19	0.49	0.19	0.48	0.28	0.33	0.25	0.42	0.57	0.26	0.14	0.27	0.17	0.03	0.03	0.00	0.02
P	0.13	0.32	0.16	0.19	0.48	0.04	0.49	0.02	0.39	0.29	0.41	0.54	0.26	0.08	0.21	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00