Doublet Group distance statistics: 52683

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 2, 3, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.009, 0.021, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.027 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.020, 0.035, 0.050, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.035 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.021, 0.037, 0.052, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.037 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.012, 0.029, 0.045, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.029 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.020, 0.036, 0.053, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.036 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.017, 0.035, 0.053, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.035 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.013, 0.031, 0.050, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.031 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.016, 0.037, 0.058, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.037 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.017, 0.042, 0.067, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.042 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.037, 0.065, 0.092, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.065 std_dev=0.028
N3	B	0, 0.158, 0.304, 0.450, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.304 std_dev=0.146
C4	B	0, 0.171, 0.318, 0.465, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.318 std_dev=0.147
C2	B	0, 0.171, 0.340, 0.508, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.340 std_dev=0.168
N4	B	0, 0.199, 0.376, 0.553, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.376 std_dev=0.177
C5	B	0, 0.177, 0.382, 0.587, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.382 std_dev=0.205
N1	B	0, 0.154, 0.361, 0.569, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.361 std_dev=0.208
O2	B	0, 0.180, 0.419, 0.658, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.419 std_dev=0.239
C6	B	0, 0.138, 0.378, 0.619, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.378 std_dev=0.241
O4'	A	0, 0.270, 0.518, 0.766, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.518 std_dev=0.248
C2'	A	0, 0.321, 0.591, 0.861, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.591 std_dev=0.270
C1'	B	0, 0.229, 0.500, 0.772, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.500 std_dev=0.271
C2'	B	0, 0.240, 0.541, 0.842, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.541 std_dev=0.301
O2'	B	0, 0.295, 0.650, 1.004, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.650 std_dev=0.354
O4'	B	0, 0.286, 0.656, 1.026, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.656 std_dev=0.370
C4'	A	0, 0.375, 0.768, 1.161, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.768 std_dev=0.393
C3'	B	0, 0.304, 0.716, 1.129, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.716 std_dev=0.413
O2'	A	0, 0.386, 0.826, 1.265, 1.931 max_d=1.931 avg_d=0.826 std_dev=0.439
C3'	A	0, 0.430, 0.870, 1.310, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.870 std_dev=0.440
C4'	B	0, 0.351, 0.806, 1.261, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.806 std_dev=0.455
O5'	B	0, 0.374, 0.843, 1.311, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.843 std_dev=0.468
OP2	B	0, 0.342, 0.823, 1.304, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.823 std_dev=0.481
P	B	0, 0.384, 0.887, 1.391, 1.726 max_d=1.726 avg_d=0.887 std_dev=0.503
O3'	B	0, 0.350, 0.862, 1.374, 2.035 max_d=2.035 avg_d=0.862 std_dev=0.512
C5'	B	0, 0.394, 0.951, 1.508, 2.052 max_d=2.052 avg_d=0.951 std_dev=0.557
OP1	B	0, 0.382, 1.035, 1.688, 2.109 max_d=2.109 avg_d=1.035 std_dev=0.653
C5'	A	0, 0.798, 1.461, 2.124, 2.397 max_d=2.397 avg_d=1.461 std_dev=0.663
O3'	A	0, 0.544, 1.214, 1.883, 2.426 max_d=2.426 avg_d=1.214 std_dev=0.669
OP2	A	0, 1.146, 1.997, 2.848, 2.907 max_d=2.907 avg_d=1.997 std_dev=0.851
O5'	A	0, 1.024, 1.975, 2.926, 3.494 max_d=3.494 avg_d=1.975 std_dev=0.951
P	A	0, 1.842, 3.129, 4.417, 4.401 max_d=4.401 avg_d=3.129 std_dev=1.287
OP1	A	0, 3.096, 4.740, 6.384, 6.418 max_d=6.418 avg_d=4.740 std_dev=1.644

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.19	0.01	0.08	0.02	0.09	0.17	0.09
C2	0.04	0.00	0.14	0.19	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.28	0.23	0.05	0.27	0.01	0.35	0.35	0.30
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.02	0.04	0.15	0.07	0.08	0.11	0.18	0.15	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.09	0.06	0.11	0.24	0.10
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.16	0.00	0.21	0.02	0.21	0.23	0.20	0.21	0.17	0.24	0.14	0.02	0.01	0.02	0.24	0.23	0.21	0.13	0.20
C4	0.02	0.01	0.07	0.16	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.21	0.10	0.03	0.24	0.01	0.28	0.28	0.25
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.09	0.08	0.09	0.08	0.09	0.05	0.19	0.01	0.00	0.02	0.09	0.08	0.14	0.03
C5	0.02	0.01	0.04	0.21	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.22	0.09	0.03	0.28	0.01	0.35	0.33	0.30
C5'	0.07	0.14	0.15	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.16	0.14	0.15	0.14	0.13	0.16	0.11	0.06	0.14	0.02	0.01	0.16	0.10	0.22	0.02
C6	0.02	0.00	0.07	0.21	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.26	0.11	0.03	0.31	0.00	0.40	0.39	0.34
C8	0.01	0.02	0.08	0.23	0.00	0.09	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.17	0.03	0.24	0.01	0.25	0.22	0.22
N1	0.03	0.01	0.11	0.20	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.28	0.16	0.04	0.30	0.01	0.40	0.39	0.34
N2	0.04	0.01	0.18	0.21	0.02	0.09	0.02	0.14	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.29	0.31	0.05	0.28	0.01	0.35	0.37	0.31
N3	0.04	0.01	0.15	0.17	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.23	0.05	0.24	0.01	0.28	0.30	0.25
N7	0.01	0.01	0.06	0.24	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.18	0.17	0.03	0.28	0.01	0.33	0.31	0.29
N9	0.00	0.02	0.02	0.14	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.06	0.02	0.18	0.01	0.20	0.20	0.18
O2'	0.02	0.28	0.00	0.02	0.21	0.19	0.22	0.06	0.26	0.13	0.28	0.29	0.25	0.18	0.12	0.00	0.05	0.13	0.17	0.26	0.18	0.18	0.10
O3'	0.19	0.23	0.02	0.01	0.10	0.01	0.09	0.14	0.11	0.17	0.16	0.31	0.23	0.17	0.06	0.05	0.00	0.13	0.29	0.14	0.42	0.27	0.33
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.05	0.05	0.03	0.02	0.13	0.13	0.00	0.09	0.03	0.09	0.18	0.11
O5'	0.08	0.27	0.09	0.24	0.24	0.02	0.28	0.01	0.31	0.24	0.30	0.28	0.24	0.28	0.18	0.17	0.29	0.09	0.00	0.32	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.23	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.14	0.03	0.32	0.00	0.44	0.42	0.37
OP1	0.09	0.35	0.11	0.21	0.28	0.08	0.35	0.10	0.40	0.25	0.40	0.35	0.28	0.33	0.20	0.18	0.42	0.09	0.02	0.44	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.35	0.24	0.13	0.28	0.14	0.33	0.22	0.39	0.22	0.39	0.37	0.30	0.31	0.20	0.18	0.27	0.18	0.01	0.42	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.30	0.10	0.20	0.25	0.03	0.30	0.02	0.34	0.22	0.34	0.31	0.25	0.29	0.18	0.10	0.33	0.11	0.01	0.37	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.17	0.21	0.19	0.18	0.19	0.17	0.19	0.17	0.17	0.17	0.21	0.18	0.29	0.21	0.21	0.41	0.45	0.41	0.41
C2	0.18	0.16	0.18	0.17	0.19	0.17	0.18	0.17	0.17	0.16	0.18	0.22	0.14	0.24	0.17	0.18	0.38	0.41	0.36	0.37
C2'	0.21	0.18	0.18	0.16	0.19	0.19	0.18	0.17	0.18	0.18	0.19	0.21	0.19	0.26	0.17	0.22	0.39	0.41	0.38	0.38
C3'	0.24	0.24	0.19	0.17	0.27	0.22	0.27	0.21	0.25	0.24	0.26	0.30	0.23	0.25	0.17	0.26	0.41	0.42	0.40	0.41
C4	0.17	0.15	0.18	0.17	0.17	0.16	0.16	0.17	0.15	0.15	0.15	0.21	0.15	0.24	0.18	0.17	0.40	0.43	0.40	0.39
C4'	0.19	0.16	0.18	0.15	0.16	0.16	0.15	0.15	0.15	0.16	0.16	0.19	0.17	0.25	0.18	0.19	0.39	0.43	0.39	0.38
C5	0.15	0.13	0.16	0.15	0.16	0.14	0.15	0.16	0.14	0.13	0.14	0.20	0.15	0.21	0.17	0.15	0.40	0.43	0.40	0.40
C5'	0.21	0.16	0.19	0.17	0.16	0.19	0.16	0.18	0.16	0.17	0.15	0.18	0.17	0.26	0.19	0.23	0.40	0.44	0.39	0.39
C6	0.14	0.13	0.15	0.14	0.16	0.13	0.15	0.15	0.13	0.13	0.13	0.20	0.15	0.19	0.16	0.14	0.39	0.42	0.39	0.39
C8	0.16	0.14	0.17	0.17	0.16	0.15	0.15	0.16	0.14	0.13	0.14	0.19	0.15	0.23	0.19	0.15	0.40	0.44	0.41	0.40
N1	0.15	0.13	0.16	0.14	0.18	0.14	0.17	0.15	0.15	0.14	0.16	0.21	0.14	0.20	0.15	0.15	0.39	0.41	0.37	0.38
N2	0.20	0.18	0.19	0.18	0.21	0.19	0.20	0.19	0.19	0.18	0.21	0.22	0.15	0.25	0.17	0.20	0.36	0.40	0.34	0.35
N3	0.19	0.16	0.19	0.18	0.19	0.17	0.18	0.17	0.17	0.16	0.17	0.22	0.15	0.25	0.19	0.19	0.38	0.42	0.38	0.37
N7	0.15	0.13	0.16	0.16	0.15	0.14	0.15	0.16	0.13	0.13	0.13	0.19	0.15	0.21	0.18	0.14	0.40	0.43	0.41	0.40
N9	0.18	0.15	0.19	0.17	0.17	0.16	0.16	0.17	0.15	0.15	0.15	0.20	0.15	0.25	0.19	0.18	0.40	0.44	0.40	0.39
O2'	0.33	0.31	0.30	0.27	0.31	0.31	0.30	0.30	0.31	0.31	0.31	0.32	0.31	0.36	0.27	0.34	0.48	0.53	0.47	0.47
O3'	0.25	0.21	0.27	0.25	0.20	0.26	0.20	0.22	0.20	0.21	0.20	0.23	0.22	0.33	0.31	0.27	0.40	0.44	0.36	0.38
O4'	0.21	0.16	0.23	0.22	0.18	0.20	0.17	0.20	0.17	0.17	0.16	0.21	0.17	0.30	0.25	0.21	0.42	0.47	0.43	0.41
O5'	0.35	0.32	0.28	0.26	0.32	0.33	0.33	0.33	0.33	0.33	0.31	0.32	0.31	0.31	0.25	0.38	0.44	0.43	0.40	0.43
O6	0.14	0.14	0.15	0.14	0.14	0.13	0.14	0.15	0.12	0.13	0.13	0.18	0.17	0.18	0.15	0.14	0.41	0.42	0.40	0.40
OP1	0.49	0.45	0.41	0.40	0.45	0.48	0.48	0.50	0.48	0.47	0.43	0.45	0.43	0.43	0.37	0.54	0.57	0.54	0.51	0.55
OP2	0.45	0.39	0.37	0.38	0.41	0.44	0.45	0.46	0.45	0.43	0.38	0.42	0.36	0.37	0.35	0.49	0.51	0.48	0.43	0.49
P	0.40	0.35	0.31	0.30	0.36	0.38	0.38	0.39	0.39	0.38	0.34	0.36	0.34	0.33	0.28	0.44	0.47	0.45	0.41	0.45

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.13	0.16	0.08	0.11
C2	0.03	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.08	0.04	0.28	0.29	0.24	0.26
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.04	0.04	0.09	0.00	0.02	0.01	0.17	0.25	0.11	0.16
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.07	0.06	0.10	0.02	0.01	0.01	0.23	0.32	0.12	0.21
C4	0.03	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.04	0.39	0.40	0.37	0.38
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.05	0.06	0.05	0.05	0.01	0.00	0.01	0.11	0.16	0.01
C5	0.02	0.02	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.09	0.04	0.39	0.40	0.36	0.38
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.11	0.08	0.10	0.12	0.07	0.05	0.02	0.01	0.01	0.15	0.26	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.09	0.04	0.35	0.33	0.25	0.31
N1	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.27	0.27	0.19	0.23
N3	0.03	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.04	0.34	0.35	0.32	0.32
N4	0.03	0.02	0.04	0.06	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.08	0.04	0.41	0.43	0.42	0.42
O2	0.04	0.00	0.09	0.10	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.12	0.06	0.23	0.25	0.20	0.21
O2'	0.02	0.04	0.00	0.02	0.03	0.05	0.04	0.05	0.05	0.02	0.04	0.04	0.06	0.00	0.04	0.04	0.04	0.14	0.10	0.05
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.07	0.01	0.09	0.02	0.09	0.05	0.09	0.08	0.12	0.04	0.00	0.01	0.18	0.35	0.18	0.21
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.04	0.06	0.04	0.01	0.00	0.04	0.09	0.13	0.08
O5'	0.13	0.28	0.17	0.23	0.39	0.01	0.39	0.01	0.35	0.27	0.34	0.41	0.23	0.04	0.18	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.16	0.29	0.25	0.32	0.40	0.11	0.40	0.15	0.33	0.27	0.35	0.43	0.25	0.14	0.35	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.24	0.11	0.12	0.37	0.16	0.36	0.26	0.25	0.19	0.32	0.42	0.20	0.10	0.18	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.26	0.16	0.21	0.38	0.01	0.38	0.01	0.31	0.23	0.32	0.42	0.21	0.05	0.21	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00