Doublet Group distance statistics: 52685

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C6	A	max_d=0.042 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C1'	A	max_d=0.056 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N2	A	max_d=0.086 avg_d=0.035 std_dev=0.022
C5	A	max_d=0.070 avg_d=0.030 std_dev=0.022
N1	A	max_d=0.082 avg_d=0.035 std_dev=0.023
N3	A	max_d=0.085 avg_d=0.032 std_dev=0.023
N9	A	max_d=0.102 avg_d=0.042 std_dev=0.032
C4	A	max_d=0.109 avg_d=0.041 std_dev=0.032
O6	A	max_d=0.117 avg_d=0.045 std_dev=0.036
N7	A	max_d=0.125 avg_d=0.062 std_dev=0.044
C8	A	max_d=0.160 avg_d=0.072 std_dev=0.056
N1	B	max_d=0.541 avg_d=0.250 std_dev=0.143
C2	B	max_d=0.652 avg_d=0.264 std_dev=0.165
N3	B	max_d=0.520 avg_d=0.319 std_dev=0.169
C6	B	max_d=0.770 avg_d=0.364 std_dev=0.196
C1'	B	max_d=0.823 avg_d=0.435 std_dev=0.263
C4	B	max_d=0.925 avg_d=0.486 std_dev=0.299
O2	B	max_d=0.914 avg_d=0.430 std_dev=0.305
C5	B	max_d=1.070 avg_d=0.529 std_dev=0.334
O4'	B	max_d=1.350 avg_d=0.478 std_dev=0.392
N4	B	max_d=1.492 avg_d=0.684 std_dev=0.468
C4'	B	max_d=1.831 avg_d=0.715 std_dev=0.506
C2'	A	max_d=1.508 avg_d=0.655 std_dev=0.507
C2'	B	max_d=1.718 avg_d=0.834 std_dev=0.514
C3'	B	max_d=1.664 avg_d=0.915 std_dev=0.515
O4'	A	max_d=1.555 avg_d=0.628 std_dev=0.517
O3'	B	max_d=2.355 avg_d=1.230 std_dev=0.688
C5'	B	max_d=2.678 avg_d=0.894 std_dev=0.750
C4'	A	max_d=2.382 avg_d=1.075 std_dev=0.816
C3'	A	max_d=2.455 avg_d=1.109 std_dev=0.819
O2'	B	max_d=2.682 avg_d=1.182 std_dev=0.829
O2'	A	max_d=2.317 avg_d=1.076 std_dev=0.850
O5'	B	max_d=3.324 avg_d=1.281 std_dev=0.986
O3'	A	max_d=3.458 avg_d=1.694 std_dev=1.219
C5'	A	max_d=3.962 avg_d=1.564 std_dev=1.235
P	B	max_d=4.695 avg_d=1.603 std_dev=1.265
OP2	B	max_d=5.735 avg_d=2.081 std_dev=1.595
OP1	B	max_d=6.335 avg_d=1.922 std_dev=1.700
O5'	A	max_d=4.953 avg_d=2.044 std_dev=1.803
P	A	max_d=7.659 avg_d=2.869 std_dev=2.718
OP1	A	max_d=8.762 avg_d=3.357 std_dev=3.220
OP2	A	max_d=9.630 avg_d=3.397 std_dev=3.373

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.32	0.01	0.38	0.02	0.25	0.46	0.24
C2	0.03	0.00	0.35	0.24	0.01	0.17	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.39	0.46	0.31	0.43	0.01	0.49	0.83	0.30
C2'	0.01	0.35	0.00	0.01	0.19	0.02	0.11	0.19	0.18	0.16	0.28	0.42	0.34	0.08	0.03	0.00	0.03	0.02	0.41	0.15	0.46	0.48	0.36
C3'	0.02	0.24	0.01	0.00	0.25	0.01	0.35	0.02	0.36	0.38	0.30	0.23	0.20	0.41	0.24	0.02	0.01	0.02	0.26	0.40	0.49	0.22	0.26
C4	0.02	0.01	0.19	0.25	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.24	0.16	0.61	0.01	0.25	1.02	0.54
C4'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.14	0.26	0.14	0.23	0.16	0.24	0.11	0.29	0.02	0.01	0.01	0.17	0.43	0.16	0.15
C5	0.01	0.01	0.11	0.35	0.00	0.14	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.38	0.14	0.07	0.85	0.01	0.45	1.49	0.89
C5'	0.06	0.29	0.19	0.02	0.15	0.01	0.19	0.00	0.21	0.29	0.25	0.36	0.26	0.28	0.10	0.11	0.22	0.01	0.01	0.25	0.26	0.20	0.02
C6	0.02	0.01	0.18	0.36	0.01	0.14	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.41	0.20	0.13	0.83	0.00	0.44	1.54	0.87
C8	0.01	0.01	0.16	0.38	0.01	0.26	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.40	0.21	0.19	1.03	0.02	0.70	1.56	1.10
N1	0.03	0.00	0.28	0.30	0.01	0.14	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.40	0.33	0.24	0.62	0.00	0.35	1.20	0.57
N2	0.04	0.01	0.42	0.23	0.01	0.23	0.02	0.36	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.46	0.59	0.38	0.29	0.02	0.72	0.62	0.18
N3	0.02	0.00	0.34	0.20	0.01	0.16	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.35	0.46	0.30	0.37	0.00	0.49	0.68	0.22
N7	0.01	0.01	0.08	0.41	0.01	0.24	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.44	0.21	0.11	1.07	0.01	0.79	1.83	1.22
N9	0.01	0.01	0.03	0.24	0.01	0.11	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.23	0.11	0.02	0.67	0.02	0.24	0.99	0.61
O2'	0.02	0.39	0.00	0.02	0.28	0.29	0.38	0.11	0.41	0.40	0.40	0.46	0.35	0.44	0.23	0.00	0.06	0.21	0.36	0.46	0.63	0.48	0.36
O3'	0.32	0.46	0.03	0.01	0.24	0.02	0.14	0.22	0.20	0.21	0.33	0.59	0.46	0.21	0.11	0.06	0.00	0.20	0.39	0.20	0.70	0.62	0.51
O4'	0.01	0.31	0.02	0.02	0.16	0.01	0.07	0.01	0.13	0.19	0.24	0.38	0.30	0.11	0.02	0.21	0.20	0.00	0.32	0.09	0.33	0.33	0.18
O5'	0.38	0.43	0.41	0.26	0.61	0.01	0.85	0.01	0.83	1.03	0.62	0.29	0.37	1.07	0.67	0.36	0.39	0.32	0.00	0.95	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.15	0.40	0.01	0.17	0.01	0.25	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.46	0.20	0.09	0.95	0.00	0.61	1.81	1.07
OP1	0.25	0.49	0.46	0.49	0.25	0.43	0.45	0.26	0.44	0.70	0.35	0.72	0.49	0.79	0.24	0.63	0.70	0.33	0.02	0.61	0.00	0.01	0.00
OP2	0.46	0.83	0.48	0.22	1.02	0.16	1.49	0.20	1.54	1.56	1.20	0.62	0.68	1.83	0.99	0.48	0.62	0.33	0.02	1.81	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.30	0.36	0.26	0.54	0.15	0.89	0.02	0.87	1.10	0.57	0.18	0.22	1.22	0.61	0.36	0.51	0.18	0.00	1.07	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.12	0.43	0.38	0.11	0.21	0.12	0.21	0.09	0.11	0.08	0.18	0.18	0.38	0.48	0.24	0.50	0.64	0.93	0.57
C2	0.10	0.09	0.38	0.37	0.14	0.15	0.13	0.17	0.10	0.09	0.10	0.18	0.11	0.25	0.39	0.16	0.52	0.64	0.92	0.59
C2'	0.47	0.44	0.71	0.64	0.40	0.50	0.43	0.45	0.44	0.44	0.40	0.40	0.47	0.74	0.76	0.46	0.42	0.63	0.96	0.52
C3'	0.37	0.39	0.56	0.52	0.49	0.42	0.50	0.41	0.46	0.40	0.42	0.55	0.35	0.51	0.63	0.42	0.35	0.66	0.92	0.47
C4	0.12	0.10	0.36	0.35	0.11	0.14	0.11	0.15	0.08	0.09	0.07	0.17	0.15	0.26	0.36	0.16	0.54	0.67	1.01	0.63
C4'	0.22	0.19	0.45	0.40	0.21	0.27	0.21	0.28	0.18	0.18	0.17	0.28	0.25	0.36	0.48	0.29	0.53	0.71	0.94	0.59
C5	0.09	0.08	0.28	0.33	0.09	0.10	0.10	0.12	0.06	0.06	0.05	0.16	0.13	0.18	0.26	0.12	0.59	0.73	1.13	0.70
C5'	0.35	0.31	0.59	0.57	0.29	0.40	0.30	0.41	0.30	0.31	0.28	0.33	0.37	0.50	0.59	0.34	0.66	0.85	1.12	0.76
C6	0.06	0.06	0.23	0.32	0.08	0.10	0.09	0.13	0.05	0.04	0.04	0.15	0.11	0.14	0.22	0.09	0.61	0.76	1.16	0.73
C8	0.12	0.10	0.32	0.33	0.09	0.11	0.10	0.12	0.06	0.08	0.06	0.16	0.16	0.23	0.30	0.15	0.57	0.71	1.12	0.68
N1	0.06	0.06	0.28	0.33	0.12	0.10	0.11	0.14	0.07	0.05	0.07	0.17	0.09	0.15	0.27	0.11	0.57	0.71	1.05	0.67
N2	0.10	0.10	0.45	0.41	0.16	0.18	0.15	0.20	0.13	0.11	0.14	0.19	0.08	0.31	0.48	0.18	0.48	0.61	0.81	0.53
N3	0.13	0.10	0.42	0.38	0.13	0.17	0.12	0.18	0.10	0.10	0.09	0.18	0.14	0.32	0.44	0.19	0.50	0.63	0.91	0.57
N7	0.09	0.08	0.27	0.32	0.08	0.09	0.10	0.12	0.06	0.06	0.05	0.15	0.14	0.18	0.24	0.11	0.61	0.75	1.19	0.73
N9	0.13	0.10	0.38	0.35	0.10	0.15	0.11	0.15	0.08	0.09	0.07	0.17	0.17	0.29	0.38	0.18	0.53	0.67	1.02	0.62
O2'	0.47	0.44	0.60	0.56	0.50	0.58	0.53	0.58	0.50	0.46	0.44	0.56	0.46	0.70	0.82	0.62	0.63	0.65	0.95	0.64
O3'	0.52	0.46	0.40	0.46	0.44	0.64	0.47	0.63	0.47	0.47	0.42	0.47	0.51	0.43	0.74	0.71	0.49	0.76	0.61	0.43
O4'	0.37	0.31	0.51	0.47	0.18	0.37	0.19	0.38	0.25	0.31	0.22	0.17	0.38	0.44	0.49	0.41	0.69	0.79	1.02	0.73
O5'	0.51	0.60	0.70	0.70	0.86	0.51	0.86	0.57	0.75	0.62	0.72	0.99	0.46	0.51	0.61	0.46	0.70	0.97	1.39	0.93
O6	0.06	0.07	0.16	0.32	0.07	0.12	0.09	0.15	0.06	0.05	0.06	0.12	0.11	0.18	0.19	0.06	0.67	0.83	1.27	0.81
OP1	0.66	0.52	0.87	0.82	0.52	0.70	0.55	0.64	0.51	0.54	0.44	0.67	0.66	0.94	0.91	0.61	0.64	0.92	0.93	0.67
OP2	1.02	1.15	1.07	1.14	1.63	1.03	1.65	1.16	1.45	1.21	1.37	1.86	0.90	0.77	0.91	1.03	1.20	1.50	1.95	1.51
P	0.42	0.52	0.59	0.62	0.89	0.44	0.90	0.54	0.73	0.55	0.69	1.09	0.36	0.41	0.55	0.41	0.61	0.96	1.33	0.87

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.20	0.01	0.27	0.41	0.35	0.28
C2	0.02	0.00	0.16	0.20	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.13	0.13	0.07	0.49	0.59	0.75	0.52
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.04	0.01	0.10	0.14	0.13	0.02	0.13	0.05	0.29	0.01	0.02	0.01	0.48	0.65	0.59	0.54
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.27	0.01	0.28	0.02	0.26	0.16	0.24	0.29	0.20	0.02	0.01	0.01	0.38	0.57	0.29	0.36
C4	0.02	0.02	0.04	0.27	0.00	0.12	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.25	0.12	0.03	0.69	0.88	1.18	0.80
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.12	0.00	0.16	0.01	0.15	0.07	0.07	0.13	0.07	0.20	0.03	0.00	0.02	0.22	0.22	0.05
C5	0.01	0.01	0.10	0.28	0.01	0.16	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.29	0.20	0.07	0.73	0.95	1.19	0.85
C5'	0.05	0.07	0.14	0.02	0.15	0.01	0.19	0.00	0.16	0.08	0.10	0.17	0.08	0.06	0.14	0.02	0.01	0.28	0.33	0.01
C6	0.01	0.01	0.13	0.26	0.01	0.15	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.25	0.19	0.09	0.65	0.80	0.89	0.69
N1	0.01	0.01	0.02	0.16	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.14	0.06	0.01	0.48	0.59	0.65	0.50
N3	0.02	0.01	0.13	0.24	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.19	0.11	0.06	0.60	0.72	0.99	0.67
N4	0.03	0.02	0.05	0.29	0.01	0.13	0.01	0.17	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.28	0.16	0.04	0.73	0.97	1.34	0.89
O2	0.04	0.01	0.29	0.20	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.18	0.27	0.12	0.39	0.50	0.60	0.41
O2'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.25	0.20	0.29	0.06	0.25	0.14	0.19	0.28	0.18	0.00	0.04	0.15	0.25	0.52	0.62	0.43
O3'	0.20	0.13	0.02	0.01	0.12	0.03	0.20	0.14	0.19	0.06	0.11	0.16	0.27	0.04	0.00	0.14	0.26	0.44	0.36	0.23
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.07	0.02	0.09	0.01	0.06	0.04	0.12	0.15	0.14	0.00	0.08	0.32	0.30	0.18
O5'	0.27	0.49	0.48	0.38	0.69	0.02	0.73	0.01	0.65	0.48	0.60	0.73	0.39	0.25	0.26	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.41	0.59	0.65	0.57	0.88	0.22	0.95	0.28	0.80	0.59	0.72	0.97	0.50	0.52	0.44	0.32	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	0.75	0.59	0.29	1.18	0.22	1.19	0.33	0.89	0.65	0.99	1.34	0.60	0.62	0.36	0.30	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.28	0.52	0.54	0.36	0.80	0.05	0.85	0.01	0.69	0.50	0.67	0.89	0.41	0.43	0.23	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00