Doublet Group distance statistics: 52688

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.010, 0.020, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.020 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.013, 0.025, 0.037, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.025 std_dev=0.012
N2	A	0, 0.014, 0.028, 0.043, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.028 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.013, 0.028, 0.044, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.028 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.008, 0.024, 0.040, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.018, 0.035, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.035 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.007, 0.025, 0.042, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N1	B	0, 0.168, 0.343, 0.518, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.343 std_dev=0.175
N3	B	0, 0.102, 0.288, 0.475, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.288 std_dev=0.187
O4'	A	0, 0.053, 0.260, 0.467, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.260 std_dev=0.207
C2'	A	0, 0.071, 0.285, 0.498, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.285 std_dev=0.214
O2'	A	0, 0.147, 0.375, 0.603, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.375 std_dev=0.228
C2	B	0, 0.130, 0.390, 0.650, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.390 std_dev=0.260
C4'	A	0, 0.160, 0.450, 0.741, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.450 std_dev=0.291
C3'	A	0, 0.153, 0.477, 0.801, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.477 std_dev=0.324
C1'	B	0, 0.193, 0.540, 0.887, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.540 std_dev=0.347
C4	B	0, 0.270, 0.646, 1.021, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.646 std_dev=0.376
C6	B	0, 0.226, 0.615, 1.005, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.615 std_dev=0.389
OP1	A	0, 0.286, 0.691, 1.096, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.691 std_dev=0.405
O3'	A	0, 0.277, 0.737, 1.197, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.737 std_dev=0.460
O4'	B	0, 0.152, 0.636, 1.119, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.636 std_dev=0.483
C5'	A	0, 0.245, 0.731, 1.218, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.731 std_dev=0.486
N4	B	0, 0.398, 0.939, 1.480, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.939 std_dev=0.541
C5	B	0, 0.333, 0.880, 1.427, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.880 std_dev=0.547
O5'	A	0, 0.196, 0.744, 1.293, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.744 std_dev=0.549
O2	B	0, 0.192, 0.783, 1.373, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.783 std_dev=0.591
C4'	B	0, 0.114, 0.761, 1.409, 2.099 max_d=2.099 avg_d=0.761 std_dev=0.647
P	A	0, 0.106, 0.793, 1.481, 2.064 max_d=2.064 avg_d=0.793 std_dev=0.687
O3'	B	0, 0.493, 1.213, 1.933, 2.151 max_d=2.151 avg_d=1.213 std_dev=0.720
C3'	B	0, 0.216, 0.948, 1.681, 2.204 max_d=2.204 avg_d=0.948 std_dev=0.733
C2'	B	0, 0.219, 1.072, 1.926, 2.487 max_d=2.487 avg_d=1.072 std_dev=0.854
O5'	B	0, 0.095, 0.959, 1.823, 2.761 max_d=2.761 avg_d=0.959 std_dev=0.864
P	B	0, -0.055, 0.934, 1.923, 2.979 max_d=2.979 avg_d=0.934 std_dev=0.989
OP2	A	0, -0.061, 1.029, 2.118, 3.239 max_d=3.239 avg_d=1.029 std_dev=1.090
C5'	B	0, 0.297, 1.499, 2.702, 3.918 max_d=3.918 avg_d=1.499 std_dev=1.203
O2'	B	0, 0.421, 1.689, 2.956, 3.892 max_d=3.892 avg_d=1.689 std_dev=1.268
OP1	B	0, -0.004, 1.333, 2.671, 3.995 max_d=3.995 avg_d=1.333 std_dev=1.337
OP2	B	0, -0.127, 1.571, 3.268, 5.149 max_d=5.149 avg_d=1.571 std_dev=1.697

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.07	0.20	0.10
C2	0.02	0.00	0.12	0.17	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.20	0.04	0.14	0.00	0.12	0.32	0.21
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.06	0.09	0.14	0.12	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.05	0.19	0.11	0.06
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.13	0.09	0.16	0.19	0.15	0.09	0.05	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.24	0.09	0.07
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.11	0.02	0.12	0.00	0.09	0.34	0.19
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.06	0.06	0.05	0.07	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.12	0.02	0.16	0.01	0.16	0.45	0.25
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.12	0.11	0.10	0.07	0.06	0.13	0.06	0.05	0.04	0.01	0.01	0.14	0.08	0.05	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.16	0.02	0.18	0.00	0.20	0.47	0.28
C8	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.05	0.16	0.01	0.11	0.47	0.22
N1	0.02	0.00	0.09	0.16	0.00	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.19	0.03	0.17	0.00	0.17	0.40	0.25
N2	0.03	0.00	0.14	0.19	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.24	0.05	0.14	0.01	0.11	0.29	0.20
N3	0.03	0.00	0.12	0.15	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.17	0.04	0.11	0.00	0.08	0.27	0.17
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.04	0.18	0.01	0.19	0.54	0.28
N9	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.09	0.01	0.05	0.32	0.16
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.07	0.11	0.08	0.04	0.02	0.00	0.06	0.04	0.04	0.05	0.18	0.06	0.03
O3'	0.03	0.20	0.02	0.00	0.11	0.01	0.12	0.04	0.16	0.10	0.19	0.24	0.17	0.11	0.05	0.06	0.00	0.02	0.10	0.17	0.31	0.19	0.09
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.05	0.04	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.03	0.10	0.18	0.10
O5'	0.05	0.14	0.04	0.05	0.12	0.01	0.16	0.01	0.18	0.16	0.17	0.14	0.11	0.18	0.09	0.04	0.10	0.05	0.00	0.20	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.00	0.05	0.13	0.00	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.17	0.03	0.20	0.00	0.26	0.53	0.31
OP1	0.07	0.12	0.19	0.24	0.09	0.11	0.16	0.08	0.20	0.11	0.17	0.11	0.08	0.19	0.05	0.18	0.31	0.10	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.32	0.11	0.09	0.34	0.04	0.45	0.05	0.47	0.47	0.40	0.29	0.27	0.54	0.32	0.06	0.19	0.18	0.02	0.53	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.21	0.06	0.07	0.19	0.03	0.25	0.01	0.28	0.22	0.25	0.20	0.17	0.28	0.16	0.03	0.09	0.10	0.00	0.31	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.20	0.54	0.57	0.26	0.27	0.24	0.45	0.20	0.19	0.23	0.34	0.22	0.40	0.49	0.29	0.26	0.51	0.67	0.27
C2	0.15	0.14	0.46	0.56	0.24	0.26	0.22	0.44	0.18	0.16	0.19	0.30	0.13	0.22	0.46	0.23	0.23	0.45	0.72	0.27
C2'	0.15	0.13	0.50	0.42	0.19	0.18	0.17	0.35	0.10	0.09	0.14	0.28	0.21	0.47	0.34	0.31	0.32	0.55	0.44	0.20
C3'	0.14	0.08	0.42	0.34	0.16	0.20	0.17	0.37	0.10	0.06	0.06	0.26	0.20	0.42	0.29	0.37	0.41	0.67	0.35	0.24
C4	0.16	0.16	0.44	0.55	0.25	0.26	0.23	0.45	0.19	0.16	0.20	0.33	0.18	0.23	0.46	0.25	0.24	0.53	0.73	0.27
C4'	0.14	0.13	0.50	0.50	0.18	0.20	0.16	0.39	0.10	0.10	0.13	0.26	0.21	0.42	0.44	0.29	0.30	0.58	0.53	0.21
C5	0.13	0.14	0.33	0.51	0.24	0.27	0.24	0.47	0.19	0.14	0.17	0.33	0.15	0.08	0.44	0.24	0.24	0.60	0.79	0.28
C5'	0.15	0.12	0.46	0.48	0.11	0.19	0.11	0.38	0.05	0.08	0.09	0.20	0.23	0.36	0.43	0.30	0.30	0.62	0.52	0.16
C6	0.11	0.11	0.25	0.49	0.24	0.27	0.24	0.47	0.19	0.13	0.14	0.33	0.11	0.08	0.42	0.22	0.23	0.62	0.84	0.29
C8	0.15	0.16	0.39	0.53	0.24	0.27	0.24	0.46	0.19	0.16	0.19	0.32	0.19	0.17	0.45	0.26	0.25	0.61	0.76	0.28
N1	0.11	0.11	0.31	0.51	0.24	0.27	0.23	0.46	0.18	0.13	0.16	0.32	0.10	0.04	0.43	0.21	0.22	0.53	0.80	0.28
N2	0.18	0.14	0.54	0.58	0.21	0.27	0.21	0.42	0.20	0.17	0.18	0.25	0.12	0.32	0.47	0.23	0.24	0.37	0.68	0.27
N3	0.18	0.17	0.51	0.57	0.24	0.26	0.22	0.43	0.18	0.17	0.21	0.31	0.18	0.32	0.47	0.26	0.24	0.46	0.69	0.26
N7	0.13	0.14	0.31	0.50	0.24	0.27	0.25	0.47	0.20	0.15	0.17	0.32	0.16	0.07	0.43	0.24	0.24	0.65	0.80	0.29
N9	0.17	0.18	0.47	0.55	0.25	0.27	0.23	0.45	0.19	0.17	0.20	0.33	0.20	0.27	0.47	0.27	0.24	0.55	0.71	0.27
O2'	0.23	0.24	0.66	0.54	0.28	0.21	0.25	0.36	0.21	0.21	0.26	0.34	0.28	0.66	0.44	0.27	0.27	0.45	0.51	0.23
O3'	0.17	0.08	0.42	0.27	0.20	0.27	0.24	0.44	0.17	0.10	0.08	0.30	0.20	0.49	0.27	0.44	0.50	0.74	0.25	0.33
O4'	0.19	0.20	0.55	0.61	0.26	0.29	0.24	0.48	0.20	0.19	0.22	0.33	0.23	0.39	0.55	0.28	0.25	0.53	0.71	0.29
O5'	0.18	0.16	0.38	0.43	0.10	0.19	0.13	0.37	0.08	0.12	0.10	0.18	0.27	0.27	0.38	0.32	0.34	0.68	0.49	0.13
O6	0.11	0.09	0.15	0.45	0.22	0.28	0.25	0.49	0.20	0.13	0.12	0.31	0.09	0.22	0.40	0.22	0.24	0.69	0.90	0.32
OP1	0.18	0.19	0.39	0.44	0.13	0.26	0.15	0.45	0.12	0.15	0.16	0.16	0.28	0.26	0.41	0.34	0.37	0.78	0.43	0.19
OP2	0.34	0.39	0.40	0.47	0.29	0.34	0.23	0.46	0.24	0.32	0.38	0.29	0.48	0.32	0.45	0.41	0.49	0.86	0.53	0.31
P	0.25	0.24	0.37	0.41	0.10	0.20	0.10	0.32	0.12	0.19	0.18	0.10	0.34	0.28	0.33	0.33	0.39	0.71	0.51	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.25	0.00	0.21	0.36	0.24	0.20
C2	0.02	0.00	0.23	0.29	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.22	0.14	0.26	0.48	0.41	0.13
C2'	0.00	0.23	0.00	0.01	0.06	0.01	0.15	0.16	0.21	0.03	0.19	0.07	0.39	0.01	0.03	0.01	0.47	0.68	0.30	0.59
C3'	0.01	0.29	0.01	0.00	0.33	0.01	0.28	0.04	0.24	0.18	0.34	0.37	0.29	0.01	0.01	0.01	0.33	0.36	0.14	0.35
C4	0.01	0.01	0.06	0.33	0.00	0.14	0.00	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.26	0.22	0.03	0.27	0.59	0.69	0.15
C4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.14	0.00	0.17	0.01	0.16	0.07	0.11	0.17	0.10	0.22	0.02	0.00	0.02	0.17	0.28	0.06
C5	0.01	0.01	0.15	0.28	0.00	0.17	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.38	0.22	0.09	0.29	0.62	0.72	0.18
C5'	0.06	0.17	0.16	0.04	0.26	0.01	0.26	0.00	0.20	0.13	0.23	0.31	0.16	0.07	0.19	0.01	0.02	0.29	0.41	0.02
C6	0.01	0.01	0.21	0.24	0.01	0.16	0.00	0.20	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.37	0.17	0.13	0.28	0.57	0.54	0.15
N1	0.01	0.01	0.03	0.18	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.10	0.01	0.25	0.47	0.38	0.14
N3	0.02	0.00	0.19	0.34	0.00	0.11	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.24	0.11	0.26	0.53	0.56	0.12
N4	0.02	0.01	0.07	0.37	0.00	0.17	0.01	0.31	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.28	0.29	0.04	0.27	0.61	0.80	0.18
O2	0.03	0.00	0.39	0.29	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.28	0.34	0.22	0.26	0.43	0.32	0.16
O2'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.26	0.22	0.38	0.07	0.37	0.17	0.16	0.28	0.28	0.00	0.05	0.15	0.30	0.59	0.30	0.52
O3'	0.25	0.22	0.03	0.01	0.22	0.02	0.22	0.19	0.17	0.10	0.24	0.29	0.34	0.05	0.00	0.18	0.35	0.56	0.24	0.33
O4'	0.00	0.14	0.01	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.11	0.04	0.22	0.15	0.18	0.00	0.12	0.08	0.36	0.16
O5'	0.21	0.26	0.47	0.33	0.27	0.02	0.29	0.02	0.28	0.25	0.26	0.27	0.26	0.30	0.35	0.12	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.36	0.48	0.68	0.36	0.59	0.17	0.62	0.29	0.57	0.47	0.53	0.61	0.43	0.59	0.56	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.24	0.41	0.30	0.14	0.69	0.28	0.72	0.41	0.54	0.38	0.56	0.80	0.32	0.30	0.24	0.36	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.13	0.59	0.35	0.15	0.06	0.18	0.02	0.15	0.14	0.12	0.18	0.16	0.52	0.33	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00