Doublet Group distance statistics: 52691

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.010
O6	A	max_d=0.033 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N7	A	max_d=0.036 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C4	A	max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C8	A	max_d=0.044 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N9	A	max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.018
N1	A	max_d=0.057 avg_d=0.018 std_dev=0.021
N3	A	max_d=0.059 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C2	A	max_d=0.066 avg_d=0.018 std_dev=0.024
C1'	A	max_d=0.090 avg_d=0.025 std_dev=0.033
N2	A	max_d=0.100 avg_d=0.028 std_dev=0.036
C5	B	max_d=0.587 avg_d=0.325 std_dev=0.205
C6	B	max_d=0.647 avg_d=0.348 std_dev=0.220
O4'	A	max_d=0.623 avg_d=0.353 std_dev=0.236
C2'	A	max_d=0.703 avg_d=0.347 std_dev=0.248
C4	B	max_d=0.720 avg_d=0.436 std_dev=0.268
N4	B	max_d=0.720 avg_d=0.432 std_dev=0.271
O2'	A	max_d=0.860 avg_d=0.390 std_dev=0.288
N1	B	max_d=0.809 avg_d=0.482 std_dev=0.288
C1'	B	max_d=0.855 avg_d=0.517 std_dev=0.294
O2'	B	max_d=0.893 avg_d=0.604 std_dev=0.325
C2'	B	max_d=1.012 avg_d=0.664 std_dev=0.378
OP2	A	max_d=1.062 avg_d=0.564 std_dev=0.379
C4'	A	max_d=1.014 avg_d=0.549 std_dev=0.381
O4'	B	max_d=1.187 avg_d=0.741 std_dev=0.403
N3	B	max_d=1.047 avg_d=0.598 std_dev=0.403
O5'	B	max_d=1.156 avg_d=0.698 std_dev=0.405
C2	B	max_d=1.057 avg_d=0.628 std_dev=0.408
C3'	A	max_d=1.104 avg_d=0.572 std_dev=0.417
C4'	B	max_d=1.392 avg_d=1.001 std_dev=0.518
C3'	B	max_d=1.393 avg_d=0.975 std_dev=0.526
O2	B	max_d=1.439 avg_d=0.800 std_dev=0.553
P	B	max_d=1.618 avg_d=0.837 std_dev=0.560
O3'	B	max_d=1.595 avg_d=1.076 std_dev=0.570
O3'	A	max_d=1.587 avg_d=0.747 std_dev=0.575
C5'	A	max_d=1.768 avg_d=1.004 std_dev=0.644
OP2	B	max_d=1.846 avg_d=0.972 std_dev=0.670
OP1	B	max_d=2.022 avg_d=1.026 std_dev=0.709
O5'	A	max_d=1.909 avg_d=1.333 std_dev=0.717
C5'	B	max_d=2.096 avg_d=1.523 std_dev=0.788
P	A	max_d=2.531 avg_d=1.631 std_dev=0.861
OP1	A	max_d=4.689 avg_d=3.352 std_dev=1.720

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.06	0.07	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.23	0.03	0.13	0.32	0.20
C2	0.06	0.00	0.14	0.21	0.01	0.07	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.25	0.06	0.40	0.02	0.39	0.35	0.25
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.02	0.02	0.02	0.04	0.09	0.09	0.18	0.15	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.29	0.02	0.34	0.20	0.10
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.14	0.00	0.13	0.01	0.15	0.19	0.18	0.26	0.20	0.17	0.09	0.00	0.00	0.01	0.33	0.16	0.56	0.28	0.25
C4	0.03	0.01	0.07	0.14	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.13	0.03	0.42	0.01	0.36	0.33	0.25
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.11	0.08	0.07	0.05	0.12	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.12	0.22	0.31	0.14
C5	0.02	0.01	0.02	0.13	0.00	0.10	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.14	0.02	0.50	0.00	0.46	0.37	0.33
C5'	0.03	0.19	0.02	0.01	0.18	0.01	0.24	0.00	0.27	0.21	0.24	0.18	0.15	0.26	0.14	0.06	0.02	0.01	0.00	0.30	0.38	0.34	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.15	0.01	0.10	0.00	0.27	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.10	0.16	0.02	0.51	0.00	0.52	0.40	0.36
C8	0.01	0.01	0.09	0.19	0.00	0.11	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.20	0.04	0.53	0.01	0.37	0.32	0.29
N1	0.06	0.00	0.09	0.18	0.02	0.08	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.20	0.05	0.46	0.01	0.47	0.38	0.31
N2	0.07	0.00	0.18	0.26	0.01	0.07	0.01	0.18	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.31	0.08	0.36	0.02	0.37	0.34	0.23
N3	0.06	0.00	0.15	0.20	0.00	0.05	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.22	0.07	0.36	0.01	0.32	0.32	0.21
N7	0.01	0.01	0.07	0.17	0.00	0.12	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.19	0.03	0.56	0.01	0.48	0.37	0.36
N9	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.41	0.01	0.28	0.31	0.21
O2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.06	0.07	0.06	0.10	0.06	0.14	0.19	0.15	0.06	0.03	0.00	0.02	0.06	0.12	0.10	0.26	0.26	0.14
O3'	0.01	0.25	0.02	0.00	0.13	0.02	0.14	0.02	0.16	0.20	0.20	0.31	0.22	0.19	0.09	0.02	0.00	0.01	0.23	0.17	0.72	0.42	0.34
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.05	0.08	0.07	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.08	0.02	0.14	0.46	0.32
O5'	0.23	0.40	0.29	0.33	0.42	0.02	0.50	0.00	0.51	0.53	0.46	0.36	0.36	0.56	0.41	0.12	0.23	0.08	0.00	0.54	0.02	0.01	0.00
O6	0.03	0.02	0.02	0.16	0.01	0.12	0.00	0.30	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.17	0.02	0.54	0.00	0.58	0.42	0.40
OP1	0.13	0.39	0.34	0.56	0.36	0.22	0.46	0.38	0.52	0.37	0.47	0.37	0.32	0.48	0.28	0.26	0.72	0.14	0.02	0.58	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	0.35	0.20	0.28	0.33	0.31	0.37	0.34	0.40	0.32	0.38	0.34	0.32	0.37	0.31	0.26	0.42	0.46	0.01	0.42	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.25	0.10	0.25	0.25	0.14	0.33	0.01	0.36	0.29	0.31	0.23	0.21	0.36	0.21	0.14	0.34	0.32	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.25	0.32	0.33	0.16	0.30	0.18	0.31	0.22	0.25	0.19	0.16	0.32	0.34	0.36	0.28	0.26	0.29	0.32	0.26
C2	0.23	0.19	0.28	0.29	0.14	0.25	0.11	0.25	0.15	0.18	0.18	0.20	0.29	0.29	0.32	0.22	0.20	0.23	0.25	0.20
C2'	0.21	0.16	0.27	0.29	0.09	0.23	0.08	0.24	0.12	0.16	0.11	0.13	0.24	0.26	0.32	0.19	0.15	0.17	0.22	0.14
C3'	0.24	0.22	0.29	0.31	0.19	0.25	0.18	0.25	0.18	0.21	0.20	0.23	0.28	0.28	0.34	0.21	0.16	0.15	0.16	0.10
C4	0.26	0.23	0.28	0.29	0.14	0.26	0.15	0.27	0.19	0.22	0.18	0.15	0.31	0.29	0.31	0.24	0.23	0.26	0.29	0.23
C4'	0.18	0.18	0.24	0.26	0.15	0.20	0.12	0.21	0.11	0.15	0.16	0.20	0.25	0.24	0.30	0.15	0.14	0.17	0.22	0.13
C5	0.26	0.25	0.27	0.28	0.15	0.25	0.16	0.26	0.20	0.23	0.20	0.14	0.33	0.28	0.30	0.24	0.23	0.26	0.30	0.24
C5'	0.20	0.25	0.22	0.25	0.29	0.22	0.26	0.23	0.22	0.21	0.28	0.35	0.28	0.22	0.27	0.20	0.17	0.16	0.18	0.16
C6	0.26	0.26	0.27	0.28	0.15	0.25	0.15	0.26	0.20	0.24	0.21	0.15	0.33	0.27	0.30	0.24	0.23	0.26	0.29	0.23
C8	0.26	0.25	0.27	0.28	0.16	0.25	0.16	0.26	0.20	0.23	0.20	0.14	0.33	0.28	0.30	0.24	0.23	0.27	0.30	0.24
N1	0.25	0.23	0.27	0.28	0.13	0.25	0.12	0.25	0.17	0.21	0.18	0.19	0.31	0.28	0.30	0.23	0.21	0.24	0.26	0.21
N2	0.20	0.18	0.27	0.29	0.17	0.24	0.11	0.24	0.12	0.15	0.22	0.24	0.28	0.29	0.32	0.19	0.19	0.22	0.24	0.19
N3	0.23	0.20	0.28	0.29	0.13	0.25	0.12	0.26	0.16	0.19	0.17	0.18	0.28	0.29	0.32	0.22	0.21	0.24	0.27	0.21
N7	0.26	0.26	0.26	0.27	0.17	0.25	0.17	0.26	0.20	0.24	0.22	0.14	0.34	0.27	0.29	0.25	0.23	0.27	0.31	0.24
N9	0.26	0.24	0.28	0.29	0.15	0.26	0.16	0.27	0.20	0.23	0.19	0.15	0.31	0.30	0.32	0.25	0.23	0.27	0.30	0.24
O2'	0.28	0.19	0.29	0.30	0.14	0.28	0.17	0.30	0.21	0.23	0.13	0.15	0.25	0.28	0.31	0.29	0.23	0.26	0.31	0.25
O3'	0.28	0.25	0.34	0.35	0.21	0.30	0.20	0.29	0.21	0.24	0.21	0.23	0.30	0.33	0.37	0.26	0.19	0.17	0.13	0.12
O4'	0.28	0.24	0.32	0.33	0.17	0.29	0.18	0.30	0.21	0.24	0.20	0.16	0.32	0.35	0.37	0.26	0.27	0.31	0.34	0.27
O5'	0.67	0.68	0.69	0.71	0.66	0.68	0.65	0.70	0.66	0.67	0.67	0.64	0.72	0.68	0.72	0.66	0.67	0.73	0.78	0.69
O6	0.27	0.29	0.26	0.28	0.18	0.25	0.17	0.27	0.22	0.25	0.26	0.14	0.34	0.26	0.30	0.25	0.24	0.28	0.31	0.25
OP1	0.68	0.68	0.65	0.67	0.68	0.68	0.68	0.72	0.68	0.68	0.67	0.68	0.69	0.65	0.65	0.68	0.59	0.63	0.65	0.61
OP2	0.50	0.50	0.48	0.48	0.47	0.48	0.46	0.46	0.47	0.48	0.49	0.46	0.52	0.50	0.49	0.49	0.43	0.40	0.40	0.39
P	0.49	0.50	0.48	0.50	0.50	0.49	0.48	0.50	0.48	0.49	0.50	0.50	0.53	0.47	0.50	0.49	0.44	0.46	0.49	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.11	0.06
C2	0.02	0.00	0.12	0.10	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.12	0.05	0.09	0.07	0.17	0.11
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.04	0.01	0.11	0.02	0.13	0.01	0.08	0.05	0.23	0.00	0.01	0.00	0.10	0.05	0.08	0.08
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.10	0.00	0.17	0.03	0.18	0.05	0.09	0.11	0.19	0.02	0.00	0.01	0.13	0.07	0.03	0.09
C4	0.03	0.01	0.04	0.10	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.13	0.03	0.14	0.16	0.22	0.16
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.04	0.07	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.05	0.10	0.02
C5	0.02	0.01	0.11	0.17	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.22	0.05	0.16	0.18	0.21	0.15
C5'	0.02	0.08	0.02	0.03	0.13	0.00	0.13	0.00	0.10	0.07	0.11	0.14	0.07	0.05	0.04	0.01	0.01	0.06	0.15	0.01
C6	0.01	0.01	0.13	0.18	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.21	0.07	0.13	0.12	0.15	0.10
N1	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.08	0.06	0.14	0.09
N3	0.02	0.00	0.08	0.09	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.12	0.04	0.11	0.12	0.20	0.14
N4	0.03	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.03	0.16	0.20	0.25	0.18
O2	0.03	0.00	0.23	0.19	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.24	0.24	0.09	0.08	0.06	0.16	0.11
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.04	0.05	0.08	0.05	0.09	0.02	0.10	0.05	0.24	0.00	0.04	0.06	0.04	0.05	0.05	0.04
O3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.13	0.02	0.22	0.04	0.21	0.06	0.12	0.16	0.24	0.04	0.00	0.01	0.11	0.09	0.04	0.08
O4'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.04	0.03	0.09	0.06	0.01	0.00	0.06	0.07	0.13	0.06
O5'	0.05	0.09	0.10	0.13	0.14	0.02	0.16	0.01	0.13	0.08	0.11	0.16	0.08	0.04	0.11	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.07	0.05	0.07	0.16	0.05	0.18	0.06	0.12	0.06	0.12	0.20	0.06	0.05	0.09	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.17	0.08	0.03	0.22	0.10	0.21	0.15	0.15	0.14	0.20	0.25	0.16	0.05	0.04	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.11	0.08	0.09	0.16	0.02	0.15	0.01	0.10	0.09	0.14	0.18	0.11	0.04	0.08	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00