Doublet Group distance statistics: 52695

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C4	A	max_d=0.027 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N9	A	max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.012
O6	A	max_d=0.036 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N3	A	max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.016
N7	A	max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.017
C2	A	max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C1'	A	max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.019
C8	A	max_d=0.048 avg_d=0.029 std_dev=0.021
N2	A	max_d=0.110 avg_d=0.043 std_dev=0.048
O4'	A	max_d=0.217 avg_d=0.118 std_dev=0.090
C2'	A	max_d=0.232 avg_d=0.142 std_dev=0.102
C4'	A	max_d=0.302 avg_d=0.183 std_dev=0.131
O4'	B	max_d=0.353 avg_d=0.200 std_dev=0.148
C3'	A	max_d=0.398 avg_d=0.232 std_dev=0.169
O2'	A	max_d=0.540 avg_d=0.274 std_dev=0.221
N1	B	max_d=0.513 avg_d=0.207 std_dev=0.221
C1'	B	max_d=0.551 avg_d=0.297 std_dev=0.227
C4'	B	max_d=0.556 avg_d=0.285 std_dev=0.227
C5'	A	max_d=0.573 avg_d=0.368 std_dev=0.261
O3'	A	max_d=0.624 avg_d=0.350 std_dev=0.261
C5'	B	max_d=0.653 avg_d=0.374 std_dev=0.275
N3	B	max_d=0.629 avg_d=0.402 std_dev=0.285
C4	B	max_d=0.810 avg_d=0.506 std_dev=0.360
C2	B	max_d=0.998 avg_d=0.517 std_dev=0.408
O5'	A	max_d=0.971 avg_d=0.580 std_dev=0.418
O5'	B	max_d=1.031 avg_d=0.562 std_dev=0.426
N4	B	max_d=1.141 avg_d=0.636 std_dev=0.475
C3'	B	max_d=1.128 avg_d=0.453 std_dev=0.486
C2'	B	max_d=1.128 avg_d=0.417 std_dev=0.505
P	A	max_d=1.487 avg_d=0.729 std_dev=0.607
C6	B	max_d=1.415 avg_d=0.855 std_dev=0.614
P	B	max_d=1.547 avg_d=0.849 std_dev=0.641
OP1	B	max_d=1.623 avg_d=0.805 std_dev=0.663
OP1	A	max_d=1.590 avg_d=0.953 std_dev=0.687
OP2	A	max_d=1.704 avg_d=0.922 std_dev=0.702
O3'	B	max_d=1.743 avg_d=0.702 std_dev=0.751
O2'	B	max_d=1.713 avg_d=0.630 std_dev=0.769
C5	B	max_d=1.858 avg_d=1.029 std_dev=0.772
OP2	B	max_d=2.029 avg_d=1.143 std_dev=0.848
O2	B	max_d=2.224 avg_d=1.066 std_dev=0.910

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.07	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.02	0.10	0.36	0.09
C2	0.05	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.03	0.04	0.31	0.00	0.17	0.27	0.14
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.07	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.02	0.17	0.26	0.06
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.02	0.04	0.02	0.06	0.03	0.03	0.00	0.01	0.09	0.05	0.22	0.18	0.06
C4	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.08	0.03	0.01	0.31	0.00	0.14	0.30	0.12
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.03	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.03	0.14	0.29	0.07
C5	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.05	0.00	0.35	0.00	0.14	0.28	0.15
C5'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.03	0.03	0.02	0.08	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.07	0.18	0.21	0.01
C6	0.02	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.05	0.00	0.36	0.00	0.16	0.27	0.16
C8	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.36	0.01	0.11	0.32	0.12
N1	0.04	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.03	0.02	0.34	0.00	0.16	0.27	0.16
N2	0.07	0.00	0.07	0.04	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.20	0.06	0.06	0.30	0.01	0.19	0.27	0.14
N3	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.14	0.03	0.04	0.28	0.00	0.16	0.28	0.12
N7	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.37	0.01	0.14	0.28	0.15
N9	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.30	0.00	0.12	0.32	0.10
O2'	0.00	0.16	0.00	0.03	0.08	0.06	0.07	0.05	0.10	0.01	0.14	0.20	0.14	0.04	0.03	0.00	0.02	0.04	0.05	0.09	0.11	0.33	0.12
O3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.06	0.03	0.06	0.03	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.06	0.25	0.13	0.03
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.13	0.01	0.07	0.41	0.12
O5'	0.17	0.31	0.12	0.09	0.31	0.01	0.35	0.01	0.36	0.36	0.34	0.30	0.28	0.37	0.30	0.05	0.03	0.13	0.00	0.37	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.06	0.01	0.37	0.00	0.17	0.25	0.17
OP1	0.10	0.17	0.17	0.22	0.14	0.14	0.14	0.18	0.16	0.11	0.16	0.19	0.16	0.14	0.12	0.11	0.25	0.07	0.01	0.17	0.00	0.00	0.00
OP2	0.36	0.27	0.26	0.18	0.30	0.29	0.28	0.21	0.27	0.32	0.27	0.27	0.28	0.28	0.32	0.33	0.13	0.41	0.01	0.25	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.14	0.06	0.06	0.12	0.07	0.15	0.01	0.16	0.12	0.16	0.14	0.12	0.15	0.10	0.12	0.03	0.12	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.07	0.11	0.16	0.18	0.09	0.22	0.10	0.18	0.11	0.11	0.21	0.04	0.03	0.19	0.06	0.12	0.14	0.17	0.13
C2	0.12	0.12	0.19	0.24	0.23	0.16	0.25	0.17	0.22	0.16	0.16	0.24	0.08	0.09	0.27	0.11	0.19	0.21	0.25	0.21
C2'	0.10	0.10	0.19	0.22	0.17	0.14	0.22	0.13	0.18	0.12	0.11	0.19	0.16	0.14	0.27	0.08	0.14	0.15	0.18	0.14
C3'	0.16	0.17	0.24	0.25	0.21	0.18	0.26	0.16	0.23	0.17	0.16	0.23	0.24	0.20	0.30	0.14	0.16	0.17	0.20	0.17
C4	0.08	0.08	0.12	0.16	0.20	0.11	0.22	0.11	0.19	0.12	0.13	0.23	0.06	0.04	0.19	0.08	0.13	0.15	0.18	0.14
C4'	0.11	0.12	0.16	0.19	0.20	0.13	0.24	0.12	0.20	0.14	0.14	0.23	0.14	0.10	0.22	0.10	0.13	0.14	0.17	0.14
C5	0.06	0.06	0.07	0.11	0.18	0.07	0.20	0.07	0.16	0.10	0.10	0.22	0.07	0.01	0.12	0.07	0.09	0.10	0.14	0.10
C5'	0.14	0.15	0.17	0.19	0.22	0.15	0.26	0.13	0.22	0.16	0.16	0.25	0.18	0.13	0.22	0.14	0.14	0.15	0.19	0.15
C6	0.05	0.06	0.05	0.09	0.19	0.06	0.20	0.07	0.16	0.09	0.10	0.22	0.08	0.02	0.10	0.07	0.08	0.10	0.15	0.10
C8	0.07	0.07	0.07	0.11	0.17	0.08	0.20	0.07	0.16	0.10	0.10	0.20	0.06	0.01	0.12	0.07	0.08	0.10	0.13	0.10
N1	0.08	0.09	0.12	0.16	0.22	0.11	0.24	0.12	0.20	0.13	0.15	0.23	0.09	0.03	0.18	0.09	0.14	0.16	0.21	0.16
N2	0.16	0.16	0.27	0.33	0.24	0.22	0.28	0.23	0.26	0.20	0.18	0.24	0.09	0.16	0.37	0.14	0.26	0.27	0.31	0.27
N3	0.11	0.11	0.18	0.23	0.22	0.15	0.25	0.16	0.22	0.15	0.15	0.24	0.07	0.09	0.27	0.10	0.18	0.20	0.23	0.19
N7	0.05	0.05	0.04	0.07	0.16	0.05	0.18	0.05	0.14	0.08	0.08	0.20	0.07	0.02	0.09	0.06	0.06	0.08	0.11	0.07
N9	0.08	0.08	0.11	0.15	0.19	0.10	0.22	0.10	0.18	0.11	0.12	0.22	0.06	0.03	0.18	0.08	0.12	0.13	0.17	0.13
O2'	0.05	0.04	0.14	0.17	0.10	0.08	0.15	0.09	0.11	0.01	0.01	0.14	0.15	0.12	0.24	0.05	0.10	0.12	0.13	0.11
O3'	0.19	0.20	0.29	0.30	0.21	0.22	0.28	0.19	0.24	0.19	0.18	0.24	0.30	0.26	0.35	0.16	0.19	0.19	0.22	0.19
O4'	0.07	0.08	0.10	0.14	0.18	0.09	0.21	0.09	0.18	0.11	0.11	0.22	0.05	0.02	0.17	0.07	0.11	0.13	0.16	0.12
O5'	0.24	0.25	0.21	0.19	0.28	0.24	0.29	0.27	0.27	0.24	0.26	0.29	0.27	0.24	0.15	0.25	0.28	0.27	0.25	0.28
O6	0.02	0.02	0.02	0.04	0.15	0.02	0.17	0.02	0.12	0.05	0.05	0.20	0.09	0.06	0.06	0.04	0.03	0.06	0.11	0.06
OP1	0.16	0.18	0.15	0.14	0.09	0.15	0.04	0.16	0.06	0.13	0.16	0.08	0.24	0.14	0.14	0.16	0.17	0.15	0.17	0.17
OP2	0.29	0.30	0.31	0.31	0.19	0.28	0.15	0.27	0.19	0.26	0.27	0.15	0.37	0.29	0.33	0.28	0.26	0.24	0.24	0.25
P	0.14	0.15	0.13	0.12	0.06	0.14	0.03	0.15	0.05	0.11	0.13	0.04	0.21	0.13	0.13	0.14	0.15	0.12	0.12	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.05	0.03
C2	0.01	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.12	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.07	0.02	0.17	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.04	0.04
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.03	0.00	0.13	0.01	0.16	0.03	0.08	0.04	0.18	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.05	0.04
C4	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.02	0.08	0.08	0.11	0.10
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.11	0.03	0.03	0.03	0.07	0.05	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00
C5	0.01	0.00	0.07	0.13	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.16	0.03	0.19	0.21	0.25	0.21
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.15	0.06	0.04	0.07	0.06	0.05	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00
C6	0.01	0.00	0.09	0.16	0.01	0.11	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.18	0.03	0.20	0.20	0.22	0.20
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.06	0.07	0.06
N3	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03
N4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.03	0.08	0.08	0.11	0.10
O2	0.01	0.00	0.17	0.18	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.23	0.03	0.07	0.12	0.08	0.06
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.02	0.05	0.04	0.05	0.06	0.00	0.07	0.03	0.15	0.00	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01
O3'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.07	0.01	0.16	0.03	0.18	0.03	0.11	0.08	0.23	0.03	0.00	0.00	0.02	0.07	0.06	0.04
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.10	0.06
O5'	0.02	0.03	0.03	0.03	0.08	0.00	0.19	0.00	0.20	0.06	0.04	0.08	0.07	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.03	0.05	0.07	0.08	0.08	0.04	0.21	0.03	0.20	0.06	0.03	0.08	0.12	0.04	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.05	0.03	0.04	0.05	0.11	0.02	0.25	0.01	0.22	0.07	0.03	0.11	0.08	0.02	0.06	0.10	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.02	0.04	0.04	0.10	0.00	0.21	0.00	0.20	0.06	0.03	0.10	0.06	0.01	0.04	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00