Doublet Group distance statistics: 52697

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C4	A	max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N1	A	max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C2	A	max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C6	A	max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N3	A	max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N9	A	max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C5	A	max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C8	A	max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N7	A	max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
O6	A	max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.027
O4'	A	max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N2	A	max_d=0.083 avg_d=0.041 std_dev=0.041
C2'	A	max_d=0.092 avg_d=0.046 std_dev=0.046
C2'	B	max_d=0.198 avg_d=0.099 std_dev=0.099
C4'	A	max_d=0.279 avg_d=0.139 std_dev=0.139
O2'	A	max_d=0.291 avg_d=0.145 std_dev=0.145
O2	B	max_d=0.296 avg_d=0.148 std_dev=0.148
C3'	A	max_d=0.307 avg_d=0.154 std_dev=0.154
C2	B	max_d=0.309 avg_d=0.155 std_dev=0.155
C3'	B	max_d=0.326 avg_d=0.163 std_dev=0.163
O2'	B	max_d=0.357 avg_d=0.179 std_dev=0.179
N3	B	max_d=0.391 avg_d=0.195 std_dev=0.195
C4'	B	max_d=0.438 avg_d=0.219 std_dev=0.219
C1'	B	max_d=0.513 avg_d=0.256 std_dev=0.256
O3'	A	max_d=0.538 avg_d=0.269 std_dev=0.269
C5'	A	max_d=0.551 avg_d=0.276 std_dev=0.276
N1	B	max_d=0.573 avg_d=0.287 std_dev=0.287
C5'	B	max_d=0.650 avg_d=0.325 std_dev=0.325
O4'	B	max_d=0.721 avg_d=0.360 std_dev=0.360
O3'	B	max_d=0.764 avg_d=0.382 std_dev=0.382
C4	B	max_d=0.796 avg_d=0.398 std_dev=0.398
N4	B	max_d=0.933 avg_d=0.467 std_dev=0.467
C6	B	max_d=0.950 avg_d=0.475 std_dev=0.475
C5	B	max_d=1.094 avg_d=0.547 std_dev=0.547
O5'	B	max_d=1.344 avg_d=0.672 std_dev=0.672
O5'	A	max_d=1.941 avg_d=0.971 std_dev=0.971
P	B	max_d=2.158 avg_d=1.079 std_dev=1.079
OP1	B	max_d=2.289 avg_d=1.144 std_dev=1.144
OP2	B	max_d=2.567 avg_d=1.284 std_dev=1.284
OP2	A	max_d=3.048 avg_d=1.524 std_dev=1.524
P	A	max_d=3.220 avg_d=1.610 std_dev=1.610
OP1	A	max_d=4.091 avg_d=2.046 std_dev=2.046

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.08	0.02
C2	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.02	0.01	0.18	0.02	0.46	0.34	0.29
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.00	0.20	0.20	0.18
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.06	0.05	0.02	0.03	0.07	0.04	0.01	0.00	0.01	0.27	0.08	0.27	0.23	0.28
C4	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01	0.15	0.00	0.35	0.29	0.23
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.05	0.04	0.02	0.02	0.05	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.17	0.02	0.04
C5	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.18	0.01	0.45	0.38	0.31
C5'	0.03	0.09	0.02	0.01	0.10	0.00	0.13	0.00	0.14	0.14	0.12	0.08	0.08	0.15	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01	0.16	0.19	0.05	0.01
C6	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.20	0.00	0.53	0.42	0.36
C8	0.02	0.00	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.03	0.10	0.02	0.24	0.25	0.19
N1	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.20	0.01	0.53	0.40	0.34
N2	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.18	0.04	0.47	0.34	0.28
N3	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.00	0.15	0.02	0.36	0.28	0.22
N7	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.03	0.16	0.03	0.39	0.37	0.30
N9	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.21	0.20	0.15
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.00	0.06	0.06	0.05	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.03	0.03	0.02	0.04	0.01
O3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.07	0.06	0.05	0.00	0.01	0.08	0.03	0.04	0.00	0.01	0.27	0.09	0.26	0.21	0.29
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.13	0.01	0.20	0.06	0.15
O5'	0.02	0.18	0.17	0.27	0.15	0.01	0.18	0.01	0.20	0.10	0.20	0.18	0.15	0.16	0.09	0.03	0.27	0.13	0.00	0.19	0.01	0.02	0.00
O6	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.00	0.03	0.09	0.01	0.19	0.00	0.57	0.46	0.38
OP1	0.03	0.46	0.20	0.27	0.35	0.17	0.45	0.19	0.53	0.24	0.53	0.47	0.36	0.39	0.21	0.02	0.26	0.20	0.01	0.57	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.34	0.20	0.23	0.29	0.02	0.38	0.05	0.42	0.25	0.40	0.34	0.28	0.37	0.20	0.04	0.21	0.06	0.02	0.46	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.29	0.18	0.28	0.23	0.04	0.31	0.01	0.36	0.19	0.34	0.28	0.22	0.30	0.15	0.01	0.29	0.15	0.00	0.38	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.02	0.05	0.09	0.03	0.06	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.11	0.05	0.05	0.02	0.01	0.06
C2	0.06	0.04	0.05	0.10	0.08	0.07	0.09	0.07	0.08	0.06	0.06	0.08	0.00	0.08	0.11	0.05	0.09	0.04	0.08	0.11
C2'	0.09	0.06	0.08	0.12	0.08	0.10	0.11	0.10	0.10	0.08	0.06	0.07	0.02	0.05	0.11	0.09	0.11	0.07	0.10	0.14
C3'	0.03	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.10	0.07	0.02	0.06	0.03	0.06	0.09
C4	0.03	0.01	0.04	0.10	0.03	0.05	0.04	0.04	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.08	0.13	0.02	0.05	0.00	0.03	0.06
C4'	0.03	0.01	0.03	0.08	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.08	0.10	0.02	0.03	0.02	0.00	0.04
C5	0.00	0.02	0.03	0.09	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.14	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04
C5'	0.07	0.11	0.05	0.01	0.12	0.06	0.10	0.08	0.09	0.09	0.12	0.14	0.12	0.16	0.03	0.08	0.07	0.11	0.10	0.06
C6	0.01	0.01	0.03	0.11	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.08	0.16	0.02	0.05	0.02	0.05	0.07
C8	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.15	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03
N1	0.02	0.02	0.04	0.11	0.07	0.04	0.07	0.05	0.05	0.03	0.05	0.08	0.04	0.09	0.14	0.01	0.07	0.04	0.08	0.10
N2	0.10	0.09	0.07	0.11	0.12	0.10	0.14	0.10	0.13	0.11	0.10	0.11	0.04	0.08	0.08	0.11	0.12	0.07	0.12	0.15
N3	0.07	0.04	0.06	0.10	0.07	0.07	0.08	0.07	0.07	0.06	0.05	0.06	0.01	0.07	0.11	0.06	0.08	0.02	0.06	0.09
N7	0.02	0.03	0.02	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.05	0.09	0.15	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02
N9	0.04	0.01	0.05	0.10	0.02	0.05	0.04	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.13	0.03	0.04	0.01	0.01	0.05
O2'	0.17	0.12	0.15	0.17	0.12	0.17	0.15	0.17	0.16	0.14	0.11	0.10	0.09	0.02	0.16	0.17	0.17	0.11	0.14	0.19
O3'	0.06	0.01	0.05	0.09	0.03	0.06	0.06	0.06	0.06	0.04	0.00	0.01	0.03	0.07	0.08	0.05	0.09	0.07	0.10	0.14
O4'	0.05	0.02	0.06	0.10	0.02	0.06	0.03	0.05	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.13	0.04	0.04	0.03	0.01	0.04
O5'	0.24	0.19	0.19	0.23	0.21	0.23	0.25	0.22	0.24	0.22	0.19	0.19	0.15	0.07	0.23	0.24	0.23	0.18	0.20	0.25
O6	0.02	0.02	0.04	0.13	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.05	0.07	0.20	0.04	0.05	0.04	0.07	0.07
OP1	0.65	0.59	0.55	0.61	0.67	0.65	0.74	0.68	0.73	0.66	0.59	0.65	0.50	0.41	0.57	0.69	0.72	0.70	0.74	0.78
OP2	0.44	0.40	0.37	0.44	0.45	0.44	0.49	0.44	0.48	0.44	0.41	0.45	0.34	0.25	0.44	0.45	0.46	0.42	0.45	0.49
P	0.39	0.34	0.31	0.36	0.40	0.38	0.45	0.39	0.44	0.39	0.35	0.39	0.28	0.18	0.35	0.41	0.41	0.37	0.40	0.45

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05
C2	0.01	0.00	0.04	0.11	0.00	0.04	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.00	0.05	0.01	0.03	0.06
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.08	0.00	0.00	0.02	0.03	0.10	0.06	0.03
C3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.10	0.00	0.07	0.00	0.04	0.07	0.11	0.11	0.12	0.03	0.00	0.02	0.04	0.14	0.05	0.06
C4	0.00	0.00	0.02	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.16	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04
C4'	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.06	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01
C5	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.11	0.02	0.03	0.03	0.05	0.05
C5'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00
C6	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.02	0.04	0.04	0.07	0.07
N1	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.05	0.02	0.05	0.07
N3	0.00	0.00	0.04	0.11	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.16	0.02	0.03	0.00	0.02	0.04
N4	0.00	0.00	0.03	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.18	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04
O2	0.03	0.00	0.08	0.12	0.00	0.06	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.14	0.02	0.06	0.01	0.03	0.06
O2'	0.01	0.04	0.00	0.03	0.03	0.11	0.02	0.11	0.01	0.02	0.04	0.03	0.03	0.00	0.01	0.08	0.06	0.01	0.02	0.06
O3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.16	0.01	0.11	0.01	0.07	0.08	0.16	0.18	0.14	0.01	0.00	0.00	0.04	0.18	0.05	0.08
O4'	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.08	0.00	0.00	0.07	0.06	0.08	0.10
O5'	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.03	0.06	0.06	0.04	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.00	0.01	0.10	0.14	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.18	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.03	0.03	0.06	0.05	0.03	0.01	0.05	0.02	0.07	0.05	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.06	0.03	0.06	0.04	0.01	0.05	0.00	0.07	0.07	0.04	0.04	0.06	0.06	0.08	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00