Doublet Group distance statistics: 52698

back

Distances from reference structure (by RMSD)

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C6	A	max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C4	A	max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.005
O6	A	max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N3	A	max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C8	A	max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N7	A	max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N9	A	max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C2	A	max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C1'	A	max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N2	A	max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
O2'	A	max_d=0.217 avg_d=0.109 std_dev=0.109
O4'	A	max_d=0.280 avg_d=0.140 std_dev=0.140
C2'	A	max_d=0.285 avg_d=0.142 std_dev=0.142
N3	B	max_d=0.462 avg_d=0.231 std_dev=0.231
C2	B	max_d=0.495 avg_d=0.247 std_dev=0.247
C4	B	max_d=0.503 avg_d=0.251 std_dev=0.251
C3'	A	max_d=0.555 avg_d=0.277 std_dev=0.277
C4'	A	max_d=0.557 avg_d=0.278 std_dev=0.278
N1	B	max_d=0.573 avg_d=0.286 std_dev=0.286
N4	B	max_d=0.609 avg_d=0.304 std_dev=0.304
C5	B	max_d=0.609 avg_d=0.305 std_dev=0.305
O2	B	max_d=0.616 avg_d=0.308 std_dev=0.308
C6	B	max_d=0.633 avg_d=0.317 std_dev=0.317
C2'	B	max_d=0.635 avg_d=0.317 std_dev=0.317
O2'	B	max_d=0.671 avg_d=0.335 std_dev=0.335
O3'	A	max_d=0.702 avg_d=0.351 std_dev=0.351
C1'	B	max_d=0.758 avg_d=0.379 std_dev=0.379
C5'	A	max_d=1.075 avg_d=0.537 std_dev=0.537
C3'	B	max_d=1.079 avg_d=0.539 std_dev=0.539
O4'	B	max_d=1.190 avg_d=0.595 std_dev=0.595
O5'	A	max_d=1.200 avg_d=0.600 std_dev=0.600
O3'	B	max_d=1.352 avg_d=0.676 std_dev=0.676
C4'	B	max_d=1.402 avg_d=0.701 std_dev=0.701
O5'	B	max_d=1.917 avg_d=0.959 std_dev=0.959
C5'	B	max_d=1.920 avg_d=0.960 std_dev=0.960
OP2	B	max_d=2.030 avg_d=1.015 std_dev=1.015
P	B	max_d=2.080 avg_d=1.040 std_dev=1.040
P	A	max_d=2.612 avg_d=1.306 std_dev=1.306
OP1	B	max_d=2.937 avg_d=1.468 std_dev=1.468
OP2	A	max_d=2.993 avg_d=1.497 std_dev=1.497
OP1	A	max_d=3.725 avg_d=1.862 std_dev=1.862

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.02	0.34	0.34	0.22
C2	0.02	0.00	0.08	0.15	0.01	0.08	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.16	0.02	0.33	0.00	0.73	0.78	0.54
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.07	0.10	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.45	0.33	0.25
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.03	0.13	0.03	0.15	0.16	0.13	0.06	0.06	0.01	0.00	0.00	0.02	0.12	0.46	0.25	0.24
C4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.11	0.01	0.31	0.01	0.61	0.67	0.46
C4'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.04	0.08	0.08	0.06	0.06	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.09	0.21	0.12	0.09
C5	0.01	0.00	0.02	0.10	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.11	0.01	0.35	0.01	0.64	0.74	0.51
C5'	0.04	0.17	0.03	0.03	0.15	0.01	0.18	0.00	0.20	0.15	0.19	0.16	0.14	0.18	0.12	0.03	0.01	0.02	0.00	0.21	0.04	0.02	0.00
C6	0.02	0.00	0.04	0.13	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.14	0.02	0.37	0.00	0.72	0.83	0.57
C8	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.30	0.01	0.44	0.51	0.36
N1	0.02	0.00	0.07	0.15	0.01	0.08	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.16	0.02	0.36	0.00	0.76	0.84	0.58
N2	0.03	0.00	0.10	0.16	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.18	0.02	0.32	0.00	0.76	0.79	0.55
N3	0.02	0.00	0.08	0.13	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.14	0.01	0.29	0.00	0.65	0.69	0.48
N7	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.34	0.01	0.54	0.66	0.45
N9	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.27	0.01	0.48	0.52	0.36
O2'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.06	0.03	0.41	0.29	0.22
O3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.11	0.01	0.11	0.01	0.14	0.03	0.16	0.18	0.14	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.48	0.19	0.22
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.11	0.02	0.17	0.18	0.09
O5'	0.15	0.33	0.07	0.02	0.31	0.02	0.35	0.00	0.37	0.30	0.36	0.32	0.29	0.34	0.27	0.06	0.05	0.11	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00
O6	0.02	0.00	0.03	0.12	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.14	0.02	0.38	0.00	0.73	0.85	0.60
OP1	0.34	0.73	0.45	0.46	0.61	0.21	0.64	0.04	0.72	0.44	0.76	0.76	0.65	0.54	0.48	0.41	0.48	0.17	0.00	0.73	0.00	0.00	0.00
OP2	0.34	0.78	0.33	0.25	0.67	0.12	0.74	0.02	0.83	0.51	0.84	0.79	0.69	0.66	0.52	0.29	0.19	0.18	0.00	0.85	0.00	0.00	0.00
P	0.22	0.54	0.25	0.24	0.46	0.09	0.51	0.00	0.57	0.36	0.58	0.55	0.48	0.45	0.36	0.22	0.22	0.09	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.09	0.11	0.08	0.05	0.20	0.01	0.16	0.06	0.12	0.00	0.13	0.16	0.17	0.05	0.25	0.02	0.01	0.29	0.11
C2	0.18	0.05	0.10	0.08	0.09	0.18	0.03	0.14	0.04	0.09	0.06	0.16	0.13	0.16	0.06	0.21	0.01	0.03	0.25	0.10
C2'	0.29	0.15	0.20	0.19	0.00	0.32	0.06	0.30	0.14	0.19	0.05	0.09	0.22	0.27	0.17	0.35	0.15	0.16	0.18	0.02
C3'	0.38	0.26	0.28	0.27	0.11	0.41	0.16	0.39	0.24	0.29	0.16	0.02	0.32	0.33	0.24	0.46	0.25	0.23	0.11	0.11
C4	0.18	0.09	0.10	0.06	0.06	0.17	0.03	0.12	0.05	0.11	0.01	0.15	0.17	0.15	0.04	0.22	0.01	0.04	0.31	0.14
C4'	0.28	0.18	0.16	0.14	0.04	0.29	0.07	0.26	0.15	0.20	0.09	0.04	0.24	0.22	0.10	0.35	0.11	0.09	0.22	0.02
C5	0.18	0.11	0.09	0.05	0.05	0.14	0.02	0.08	0.05	0.11	0.02	0.14	0.19	0.14	0.02	0.20	0.05	0.11	0.37	0.19
C5'	0.39	0.31	0.25	0.23	0.18	0.38	0.20	0.36	0.27	0.32	0.23	0.10	0.36	0.29	0.17	0.46	0.22	0.17	0.13	0.07
C6	0.17	0.12	0.09	0.05	0.06	0.13	0.03	0.07	0.04	0.11	0.02	0.15	0.20	0.14	0.02	0.18	0.06	0.13	0.37	0.20
C8	0.18	0.11	0.09	0.05	0.04	0.15	0.02	0.09	0.05	0.11	0.03	0.13	0.19	0.15	0.01	0.21	0.05	0.12	0.38	0.20
N1	0.17	0.09	0.10	0.07	0.08	0.15	0.03	0.10	0.04	0.10	0.03	0.16	0.18	0.15	0.05	0.19	0.02	0.05	0.30	0.15
N2	0.17	0.01	0.10	0.09	0.10	0.19	0.04	0.16	0.03	0.07	0.10	0.16	0.06	0.16	0.09	0.21	0.04	0.10	0.18	0.04
N3	0.18	0.06	0.10	0.07	0.08	0.18	0.03	0.15	0.04	0.10	0.04	0.16	0.13	0.15	0.06	0.22	0.01	0.03	0.26	0.10
N7	0.17	0.12	0.09	0.04	0.04	0.13	0.02	0.07	0.05	0.11	0.04	0.12	0.20	0.14	0.00	0.19	0.06	0.16	0.41	0.22
N9	0.19	0.10	0.10	0.06	0.05	0.18	0.02	0.13	0.05	0.11	0.01	0.14	0.18	0.16	0.03	0.23	0.01	0.04	0.32	0.15
O2'	0.18	0.03	0.10	0.09	0.09	0.22	0.04	0.21	0.04	0.08	0.06	0.17	0.08	0.16	0.08	0.25	0.06	0.11	0.23	0.05
O3'	0.42	0.28	0.31	0.32	0.15	0.48	0.20	0.47	0.28	0.33	0.18	0.05	0.33	0.37	0.29	0.51	0.32	0.33	0.04	0.19
O4'	0.19	0.10	0.08	0.05	0.05	0.18	0.02	0.14	0.05	0.11	0.01	0.13	0.17	0.14	0.00	0.24	0.01	0.04	0.33	0.14
O5'	0.56	0.49	0.45	0.42	0.37	0.56	0.39	0.53	0.45	0.50	0.42	0.29	0.55	0.48	0.37	0.62	0.39	0.32	0.02	0.23
O6	0.15	0.13	0.08	0.04	0.04	0.10	0.03	0.03	0.04	0.11	0.06	0.14	0.21	0.12	0.01	0.15	0.09	0.20	0.42	0.25
OP1	1.10	0.99	0.92	0.91	0.84	1.13	0.88	1.12	0.97	1.02	0.90	0.73	1.04	0.96	0.83	1.22	0.96	0.88	0.53	0.80
OP2	1.14	1.07	0.99	0.99	0.94	1.14	0.96	1.12	1.03	1.08	1.00	0.84	1.11	1.02	0.92	1.22	0.98	0.85	0.55	0.80
P	0.86	0.78	0.70	0.69	0.65	0.86	0.67	0.84	0.75	0.80	0.71	0.55	0.83	0.73	0.61	0.95	0.70	0.59	0.29	0.53

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.12	0.09
C2	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.02	0.09	0.10	0.27	0.19
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.04	0.05	0.00	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.01
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.01	0.00	0.00	0.03	0.13	0.10	0.04
C4	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.14	0.25	0.39	0.27
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.00	0.00	0.12	0.03	0.01
C5	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.14	0.26	0.37	0.27
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.08	0.00	0.10	0.00	0.08	0.05	0.06	0.09	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.09	0.01	0.00
C6	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.12	0.16	0.27	0.22
N1	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.09	0.08	0.22	0.17
N3	0.00	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.12	0.18	0.34	0.24
N4	0.00	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.15	0.30	0.43	0.30
O2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.03	0.07	0.05	0.24	0.16
O2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.19	0.05	0.04
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.02	0.04	0.00	0.01	0.02	0.07	0.08	0.05	0.03	0.00	0.01	0.02	0.22	0.21	0.12
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.08
O5'	0.04	0.09	0.04	0.03	0.14	0.00	0.14	0.00	0.12	0.09	0.12	0.15	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.03	0.10	0.10	0.13	0.25	0.12	0.26	0.09	0.16	0.08	0.18	0.30	0.05	0.19	0.22	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.12	0.27	0.01	0.10	0.39	0.03	0.37	0.01	0.27	0.22	0.34	0.43	0.24	0.05	0.21	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.19	0.01	0.04	0.27	0.01	0.27	0.00	0.22	0.17	0.24	0.30	0.16	0.04	0.12	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00