Doublet Group distance statistics: 52699

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N2	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.000, 0.025, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.000, 0.025, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C5	B	0, 0.000, 0.117, 0.235, 0.235 max_d=0.235 avg_d=0.117 std_dev=0.117
N4	B	0, 0.000, 0.121, 0.243, 0.243 max_d=0.243 avg_d=0.121 std_dev=0.121
C4	B	0, 0.000, 0.142, 0.285, 0.285 max_d=0.285 avg_d=0.142 std_dev=0.142
C6	B	0, 0.000, 0.143, 0.286, 0.286 max_d=0.286 avg_d=0.143 std_dev=0.143
C1'	B	0, 0.000, 0.189, 0.379, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.189 std_dev=0.189
N1	B	0, 0.000, 0.193, 0.386, 0.386 max_d=0.386 avg_d=0.193 std_dev=0.193
N3	B	0, 0.000, 0.227, 0.454, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.227 std_dev=0.227
C2	B	0, 0.000, 0.255, 0.510, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.255 std_dev=0.255
O2	B	0, 0.000, 0.346, 0.692, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.346 std_dev=0.346
O4'	B	0, 0.000, 0.349, 0.698, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.349 std_dev=0.349
C2'	B	0, 0.000, 0.472, 0.945, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.472 std_dev=0.472
C3'	B	0, 0.000, 0.477, 0.953, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.477 std_dev=0.477
C4'	B	0, 0.000, 0.486, 0.973, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.486 std_dev=0.486
O5'	B	0, 0.000, 0.603, 1.206, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.603 std_dev=0.603
C5'	B	0, 0.000, 0.644, 1.288, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.644 std_dev=0.644
O2'	B	0, 0.000, 0.674, 1.347, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.674 std_dev=0.674
P	B	0, 0.000, 0.679, 1.358, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.679 std_dev=0.679
O3'	B	0, 0.000, 0.734, 1.468, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.734 std_dev=0.734
OP1	B	0, 0.000, 0.772, 1.545, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.772 std_dev=0.772
OP2	B	0, 0.000, 0.908, 1.817, 1.817 max_d=1.817 avg_d=0.908 std_dev=0.908
O4'	A	0, 0.000, 1.116, 2.231, 2.231 max_d=2.231 avg_d=1.116 std_dev=1.116
C2'	A	0, 0.000, 1.143, 2.285, 2.285 max_d=2.285 avg_d=1.143 std_dev=1.143
O2'	A	0, 0.000, 1.262, 2.525, 2.525 max_d=2.525 avg_d=1.262 std_dev=1.262
C4'	A	0, 0.000, 1.675, 3.350, 3.350 max_d=3.350 avg_d=1.675 std_dev=1.675
C3'	A	0, 0.000, 1.820, 3.640, 3.640 max_d=3.640 avg_d=1.820 std_dev=1.820
O3'	A	0, 0.000, 2.636, 5.272, 5.272 max_d=5.272 avg_d=2.636 std_dev=2.636
C5'	A	0, 0.000, 2.775, 5.549, 5.549 max_d=5.549 avg_d=2.775 std_dev=2.775
O5'	A	0, 0.000, 3.387, 6.774, 6.774 max_d=6.774 avg_d=3.387 std_dev=3.387
OP2	A	0, 0.000, 4.041, 8.081, 8.081 max_d=8.081 avg_d=4.041 std_dev=4.041
P	A	0, 0.000, 4.050, 8.100, 8.100 max_d=8.100 avg_d=4.050 std_dev=4.050
OP1	A	0, 0.000, 5.180, 10.359, 10.359 max_d=10.359 avg_d=5.180 std_dev=5.180

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.03	0.20	0.21	0.25
C2	0.03	0.00	0.49	0.32	0.01	0.14	0.01	0.43	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.50	0.50	0.37	0.37	0.01	0.65	0.07	0.41
C2'	0.00	0.49	0.00	0.00	0.25	0.00	0.11	0.06	0.20	0.25	0.37	0.60	0.48	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.13	0.21	0.05	0.15
C3'	0.01	0.32	0.00	0.00	0.12	0.00	0.01	0.05	0.09	0.28	0.23	0.42	0.29	0.19	0.06	0.00	0.00	0.01	0.13	0.03	0.23	0.26	0.05
C4	0.01	0.01	0.25	0.12	0.00	0.12	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.23	0.19	0.20	0.08	0.02	0.19	0.19	0.04
C4'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.12	0.00	0.12	0.01	0.14	0.07	0.15	0.14	0.13	0.09	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.14	0.18	0.23	0.05
C5	0.01	0.01	0.11	0.01	0.00	0.12	0.00	0.35	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.05	0.10	0.05	0.02	0.06	0.39	0.08
C5'	0.08	0.43	0.06	0.05	0.34	0.01	0.35	0.00	0.41	0.18	0.44	0.44	0.38	0.26	0.22	0.01	0.03	0.01	0.01	0.40	0.30	0.36	0.02
C6	0.02	0.00	0.20	0.09	0.01	0.14	0.01	0.41	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.16	0.18	0.07	0.01	0.27	0.30	0.09
C8	0.00	0.01	0.25	0.28	0.00	0.07	0.00	0.18	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.33	0.18	0.42	0.02	0.47	0.68	0.54
N1	0.03	0.00	0.37	0.23	0.01	0.15	0.01	0.44	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.38	0.37	0.30	0.26	0.01	0.55	0.08	0.32
N2	0.02	0.00	0.60	0.42	0.00	0.14	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.63	0.66	0.43	0.50	0.00	0.87	0.22	0.57
N3	0.02	0.00	0.48	0.29	0.00	0.13	0.00	0.38	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.47	0.44	0.37	0.31	0.01	0.50	0.04	0.30
N7	0.00	0.01	0.13	0.19	0.00	0.09	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.23	0.08	0.32	0.02	0.31	0.68	0.40
N9	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.08	0.00	0.22	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02	0.15	0.02	0.15	0.34	0.24
O2'	0.01	0.50	0.01	0.00	0.23	0.00	0.12	0.01	0.21	0.19	0.38	0.63	0.47	0.09	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.15	0.15	0.17	0.09
O3'	0.00	0.50	0.02	0.00	0.19	0.01	0.05	0.03	0.16	0.33	0.37	0.66	0.44	0.23	0.05	0.03	0.00	0.01	0.03	0.09	0.16	0.57	0.10
O4'	0.00	0.37	0.01	0.01	0.20	0.00	0.10	0.01	0.18	0.18	0.30	0.43	0.37	0.08	0.02	0.05	0.01	0.00	0.08	0.13	0.21	0.20	0.27
O5'	0.12	0.37	0.13	0.13	0.08	0.02	0.05	0.01	0.07	0.42	0.26	0.50	0.31	0.32	0.15	0.01	0.03	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00
O6	0.03	0.01	0.13	0.03	0.02	0.14	0.02	0.40	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.09	0.13	0.00	0.00	0.20	0.41	0.03
OP1	0.20	0.65	0.21	0.23	0.19	0.18	0.06	0.30	0.27	0.47	0.55	0.87	0.50	0.31	0.15	0.15	0.16	0.21	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00
OP2	0.21	0.07	0.05	0.26	0.19	0.23	0.39	0.36	0.30	0.68	0.08	0.22	0.04	0.68	0.34	0.17	0.57	0.20	0.01	0.41	0.00	0.00	0.00
P	0.25	0.41	0.15	0.05	0.04	0.05	0.08	0.02	0.09	0.54	0.32	0.57	0.30	0.40	0.24	0.09	0.10	0.27	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.03	0.00	0.15	0.10	0.03	0.03	0.02	0.14	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.08	0.13	0.04	0.30	0.37	0.31	0.26
C2	0.00	0.04	0.09	0.05	0.05	0.02	0.03	0.18	0.02	0.02	0.07	0.07	0.04	0.02	0.18	0.07	0.33	0.38	0.29	0.26
C2'	0.53	0.51	0.36	0.44	0.42	0.57	0.44	0.71	0.48	0.51	0.47	0.36	0.54	0.40	0.68	0.64	0.81	0.84	0.70	0.71
C3'	0.29	0.29	0.04	0.12	0.30	0.34	0.32	0.52	0.33	0.31	0.28	0.28	0.26	0.04	0.32	0.45	0.61	0.63	0.51	0.54
C4	0.01	0.01	0.11	0.09	0.04	0.00	0.03	0.18	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.00	0.12	0.05	0.33	0.39	0.33	0.28
C4'	0.31	0.25	0.55	0.49	0.11	0.30	0.11	0.09	0.17	0.24	0.18	0.03	0.32	0.56	0.32	0.16	0.05	0.11	0.08	0.04
C5	0.02	0.01	0.08	0.11	0.04	0.01	0.03	0.19	0.02	0.00	0.02	0.06	0.03	0.06	0.08	0.03	0.34	0.39	0.34	0.31
C5'	0.75	0.66	1.05	1.00	0.44	0.74	0.44	0.50	0.54	0.65	0.55	0.32	0.77	1.08	0.88	0.57	0.37	0.32	0.32	0.36
C6	0.00	0.01	0.04	0.09	0.05	0.01	0.05	0.22	0.03	0.01	0.03	0.07	0.02	0.12	0.08	0.04	0.36	0.40	0.35	0.32
C8	0.02	0.01	0.11	0.12	0.03	0.02	0.03	0.18	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.03	0.07	0.03	0.34	0.40	0.35	0.31
N1	0.01	0.03	0.05	0.07	0.05	0.02	0.04	0.21	0.03	0.02	0.06	0.07	0.02	0.07	0.13	0.05	0.35	0.39	0.32	0.29
N2	0.00	0.06	0.10	0.03	0.05	0.02	0.02	0.15	0.01	0.03	0.08	0.06	0.09	0.08	0.23	0.08	0.30	0.35	0.25	0.22
N3	0.00	0.03	0.11	0.06	0.05	0.01	0.03	0.16	0.02	0.02	0.06	0.07	0.03	0.05	0.17	0.07	0.32	0.38	0.31	0.26
N7	0.02	0.02	0.08	0.13	0.03	0.01	0.03	0.20	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.08	0.04	0.02	0.34	0.40	0.36	0.32
N9	0.02	0.00	0.12	0.11	0.03	0.01	0.03	0.17	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.02	0.11	0.04	0.32	0.39	0.33	0.29
O2'	0.63	0.59	0.48	0.58	0.46	0.67	0.47	0.78	0.53	0.59	0.52	0.37	0.65	0.52	0.87	0.73	0.88	0.94	0.77	0.78
O3'	0.56	0.51	0.27	0.38	0.47	0.63	0.52	0.80	0.55	0.55	0.47	0.41	0.51	0.24	0.59	0.75	0.85	0.86	0.69	0.76
O4'	0.51	0.43	0.68	0.63	0.24	0.51	0.26	0.30	0.35	0.43	0.32	0.13	0.52	0.66	0.46	0.41	0.11	0.03	0.02	0.11
O5'	0.83	0.66	1.16	1.12	0.25	0.85	0.27	0.56	0.46	0.65	0.45	0.02	0.86	1.24	1.08	0.66	0.37	0.30	0.20	0.30
O6	0.00	0.01	0.00	0.10	0.04	0.02	0.05	0.24	0.04	0.01	0.01	0.07	0.03	0.19	0.05	0.02	0.38	0.41	0.36	0.35
OP1	1.52	1.23	1.93	1.92	0.68	1.61	0.75	1.30	1.02	1.25	0.92	0.37	1.47	2.06	1.97	1.34	1.08	1.01	0.80	0.95
OP2	0.55	0.36	0.88	0.89	0.12	0.60	0.10	0.27	0.12	0.34	0.12	0.37	0.60	0.95	0.92	0.39	0.05	0.04	0.20	0.07
P	1.07	0.85	1.42	1.42	0.39	1.13	0.43	0.83	0.65	0.85	0.61	0.13	1.06	1.49	1.42	0.90	0.62	0.54	0.39	0.52

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.00	0.21	0.36	0.18	0.18
C2	0.00	0.00	0.07	0.10	0.00	0.00	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.04	0.29	0.35	0.23	0.23
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.12	0.19	0.13	0.02	0.03	0.06	0.17	0.00	0.02	0.01	0.39	0.69	0.56	0.52
C3'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.11	0.00	0.09	0.02	0.07	0.07	0.12	0.12	0.09	0.02	0.00	0.02	0.03	0.47	0.16	0.21
C4	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.01	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.01	0.02	0.33	0.31	0.21	0.25
C4'	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.13	0.03	0.00	0.00	0.24	0.00	0.04
C5	0.01	0.00	0.12	0.09	0.00	0.02	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.25	0.01	0.06	0.34	0.27	0.15	0.23
C5'	0.10	0.17	0.19	0.02	0.23	0.00	0.24	0.00	0.23	0.17	0.20	0.24	0.13	0.05	0.18	0.01	0.01	0.08	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.13	0.07	0.00	0.02	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.02	0.06	0.34	0.29	0.14	0.21
N1	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.01	0.01	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.08	0.00	0.29	0.34	0.19	0.21
N3	0.01	0.00	0.03	0.12	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.04	0.02	0.31	0.34	0.24	0.25
N4	0.00	0.00	0.06	0.12	0.00	0.02	0.01	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.01	0.02	0.34	0.29	0.21	0.25
O2	0.00	0.00	0.17	0.09	0.00	0.00	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.13	0.08	0.26	0.37	0.24	0.23
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.21	0.13	0.25	0.05	0.21	0.11	0.12	0.25	0.12	0.00	0.03	0.07	0.35	0.73	0.73	0.56
O3'	0.17	0.08	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.18	0.02	0.08	0.04	0.01	0.13	0.03	0.00	0.12	0.17	0.24	0.02	0.02
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.01	0.06	0.00	0.02	0.02	0.08	0.07	0.12	0.00	0.01	0.11	0.13	0.08
O5'	0.21	0.29	0.39	0.03	0.33	0.00	0.34	0.01	0.34	0.29	0.31	0.34	0.26	0.35	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.36	0.35	0.69	0.47	0.31	0.24	0.27	0.08	0.29	0.34	0.34	0.29	0.37	0.73	0.24	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.23	0.56	0.16	0.21	0.00	0.15	0.03	0.14	0.19	0.24	0.21	0.24	0.73	0.02	0.13	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.18	0.23	0.52	0.21	0.25	0.04	0.23	0.01	0.21	0.21	0.25	0.25	0.23	0.56	0.02	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00