Doublet Group distance statistics: 52719

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 7, 0, 2, 4, 7, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.010, 0.025, 0.039, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.011, 0.027, 0.044, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.012, 0.033, 0.054, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.012, 0.038, 0.064, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.038 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.014, 0.042, 0.070, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.042 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.013, 0.049, 0.084, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.049 std_dev=0.035
C8	A	0, 0.018, 0.064, 0.109, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.064 std_dev=0.046
C6	B	0, 0.207, 0.428, 0.650, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.428 std_dev=0.221
C5	B	0, 0.167, 0.389, 0.612, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.389 std_dev=0.222
C4	B	0, 0.186, 0.413, 0.640, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.413 std_dev=0.227
N1	B	0, 0.264, 0.500, 0.737, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.500 std_dev=0.236
N3	B	0, 0.230, 0.474, 0.719, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.474 std_dev=0.244
C2	B	0, 0.257, 0.510, 0.763, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.510 std_dev=0.253
O4'	A	0, 0.050, 0.316, 0.582, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.316 std_dev=0.266
N7	B	0, 0.144, 0.414, 0.684, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.414 std_dev=0.270
N6	B	0, 0.192, 0.464, 0.737, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.464 std_dev=0.273
C2'	A	0, 0.048, 0.335, 0.622, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.335 std_dev=0.287
N9	B	0, 0.135, 0.431, 0.728, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.431 std_dev=0.296
C8	B	0, 0.146, 0.450, 0.754, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.450 std_dev=0.304
O4'	B	0, 0.165, 0.508, 0.850, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.508 std_dev=0.343
C4'	B	0, 0.215, 0.570, 0.926, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.570 std_dev=0.356
P	B	0, 0.292, 0.674, 1.056, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.674 std_dev=0.382
C1'	B	0, 0.106, 0.493, 0.880, 1.727 max_d=1.727 avg_d=0.493 std_dev=0.387
C4'	A	0, 0.041, 0.449, 0.856, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.449 std_dev=0.408
C3'	A	0, 0.019, 0.444, 0.870, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.444 std_dev=0.425
C3'	B	0, 0.228, 0.668, 1.108, 1.925 max_d=1.925 avg_d=0.668 std_dev=0.440
O5'	B	0, 0.225, 0.672, 1.119, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.672 std_dev=0.447
OP1	B	0, 0.341, 0.798, 1.254, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.798 std_dev=0.456
C5'	B	0, 0.227, 0.692, 1.156, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.692 std_dev=0.464
C2'	B	0, 0.150, 0.635, 1.119, 2.270 max_d=2.270 avg_d=0.635 std_dev=0.485
OP2	B	0, 0.340, 0.841, 1.341, 2.038 max_d=2.038 avg_d=0.841 std_dev=0.500
O2'	A	0, 0.067, 0.609, 1.151, 2.168 max_d=2.168 avg_d=0.609 std_dev=0.542
O3'	B	0, 0.279, 0.894, 1.509, 2.665 max_d=2.665 avg_d=0.894 std_dev=0.615
C5'	A	0, 0.168, 0.790, 1.412, 1.977 max_d=1.977 avg_d=0.790 std_dev=0.622
O5'	A	0, 0.247, 0.905, 1.563, 2.110 max_d=2.110 avg_d=0.905 std_dev=0.658
O2'	B	0, 0.122, 0.781, 1.439, 3.038 max_d=3.038 avg_d=0.781 std_dev=0.659
O3'	A	0, -0.217, 0.554, 1.326, 2.684 max_d=2.684 avg_d=0.554 std_dev=0.772
P	A	0, 0.294, 1.123, 1.952, 2.684 max_d=2.684 avg_d=1.123 std_dev=0.829
OP1	A	0, 0.172, 1.010, 1.848, 3.314 max_d=3.314 avg_d=1.010 std_dev=0.838
OP2	A	0, 0.345, 1.434, 2.523, 3.770 max_d=3.770 avg_d=1.434 std_dev=1.089

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.27	0.00	0.13	0.11	0.20	0.18
C2	0.02	0.00	0.23	0.17	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.30	0.36	0.18	0.14	0.12	0.25	0.16
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.12	0.02	0.07	0.16	0.12	0.12	0.19	0.23	0.10	0.07	0.01	0.00	0.06	0.01	0.36	0.30	0.44	0.37
C3'	0.02	0.17	0.00	0.00	0.16	0.01	0.20	0.02	0.21	0.20	0.19	0.14	0.23	0.22	0.13	0.02	0.01	0.02	0.16	0.25	0.16	0.11
C4	0.01	0.01	0.12	0.16	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.24	0.09	0.14	0.13	0.24	0.18
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.12	0.07	0.07	0.08	0.11	0.05	0.21	0.03	0.01	0.02	0.08	0.15	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.20	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.17	0.06	0.18	0.19	0.30	0.21
C5'	0.07	0.12	0.16	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.13	0.17	0.12	0.11	0.15	0.17	0.11	0.11	0.18	0.01	0.01	0.13	0.22	0.03
C6	0.02	0.00	0.12	0.21	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.28	0.21	0.09	0.18	0.20	0.31	0.21
C8	0.01	0.01	0.12	0.20	0.00	0.12	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.26	0.09	0.11	0.17	0.21	0.28	0.24
N1	0.02	0.00	0.19	0.19	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.29	0.30	0.15	0.17	0.16	0.29	0.18
N3	0.02	0.00	0.23	0.14	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.37	0.17	0.13	0.10	0.22	0.15
N6	0.02	0.00	0.10	0.23	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.30	0.18	0.08	0.21	0.24	0.35	0.23
N7	0.01	0.01	0.07	0.22	0.00	0.11	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.28	0.11	0.06	0.20	0.24	0.33	0.25
N9	0.00	0.01	0.01	0.13	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.15	0.17	0.01	0.13	0.14	0.23	0.19
O2'	0.02	0.30	0.00	0.02	0.19	0.21	0.24	0.11	0.28	0.26	0.29	0.26	0.30	0.28	0.15	0.00	0.06	0.14	0.32	0.29	0.53	0.35
O3'	0.27	0.36	0.06	0.01	0.24	0.03	0.17	0.18	0.21	0.09	0.30	0.37	0.18	0.11	0.17	0.06	0.00	0.19	0.20	0.48	0.29	0.27
O4'	0.00	0.18	0.01	0.02	0.09	0.01	0.06	0.01	0.09	0.11	0.15	0.17	0.08	0.06	0.01	0.14	0.19	0.00	0.06	0.08	0.14	0.09
O5'	0.13	0.14	0.36	0.16	0.14	0.02	0.18	0.01	0.18	0.17	0.17	0.13	0.21	0.20	0.13	0.32	0.20	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.11	0.12	0.30	0.25	0.13	0.08	0.19	0.13	0.20	0.21	0.16	0.10	0.24	0.24	0.14	0.29	0.48	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.25	0.44	0.16	0.24	0.15	0.30	0.22	0.31	0.28	0.29	0.22	0.35	0.33	0.23	0.53	0.29	0.14	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.16	0.37	0.11	0.18	0.04	0.21	0.03	0.21	0.24	0.18	0.15	0.23	0.25	0.19	0.35	0.27	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.19	0.36	0.29	0.25	0.26	0.22	0.20	0.17	0.29	0.13	0.24	0.20	0.26	0.29	0.41	0.31	0.27	0.18	0.30	0.56	0.30
C2	0.36	0.17	0.42	0.32	0.22	0.29	0.11	0.22	0.14	0.22	0.15	0.25	0.23	0.13	0.28	0.50	0.35	0.29	0.19	0.23	0.43	0.21
C2'	0.33	0.21	0.38	0.30	0.25	0.25	0.24	0.18	0.20	0.30	0.20	0.24	0.23	0.27	0.30	0.45	0.32	0.26	0.16	0.29	0.55	0.28
C3'	0.31	0.25	0.37	0.28	0.25	0.23	0.20	0.15	0.16	0.25	0.19	0.27	0.14	0.22	0.27	0.44	0.31	0.24	0.13	0.27	0.50	0.25
C4	0.36	0.17	0.38	0.30	0.26	0.28	0.21	0.21	0.12	0.31	0.10	0.25	0.19	0.25	0.32	0.45	0.31	0.30	0.18	0.27	0.53	0.27
C4'	0.36	0.38	0.39	0.34	0.35	0.31	0.31	0.26	0.30	0.31	0.35	0.38	0.26	0.29	0.34	0.43	0.35	0.32	0.24	0.29	0.49	0.28
C5	0.38	0.15	0.36	0.27	0.25	0.28	0.19	0.22	0.10	0.33	0.09	0.23	0.19	0.26	0.33	0.43	0.26	0.33	0.18	0.25	0.50	0.24
C5'	0.37	0.44	0.39	0.35	0.38	0.32	0.35	0.29	0.38	0.33	0.43	0.41	0.37	0.32	0.35	0.41	0.37	0.33	0.29	0.27	0.43	0.25
C6	0.38	0.13	0.36	0.27	0.22	0.29	0.11	0.25	0.10	0.29	0.10	0.21	0.22	0.17	0.32	0.44	0.26	0.34	0.21	0.21	0.42	0.18
C8	0.36	0.19	0.35	0.26	0.28	0.28	0.26	0.21	0.19	0.35	0.15	0.25	0.22	0.32	0.34	0.41	0.25	0.32	0.18	0.31	0.57	0.29
N1	0.39	0.15	0.40	0.30	0.21	0.30	0.09	0.25	0.14	0.23	0.15	0.22	0.24	0.11	0.30	0.49	0.31	0.32	0.21	0.21	0.39	0.16
N3	0.35	0.18	0.41	0.32	0.25	0.28	0.17	0.21	0.11	0.26	0.11	0.26	0.21	0.19	0.30	0.48	0.35	0.28	0.18	0.26	0.50	0.26
N6	0.38	0.12	0.33	0.26	0.19	0.30	0.10	0.28	0.13	0.28	0.12	0.18	0.23	0.14	0.29	0.42	0.25	0.35	0.27	0.19	0.37	0.15
N7	0.37	0.17	0.34	0.25	0.27	0.28	0.23	0.22	0.15	0.36	0.13	0.24	0.20	0.31	0.34	0.41	0.23	0.33	0.18	0.28	0.53	0.26
N9	0.35	0.18	0.36	0.28	0.27	0.27	0.24	0.20	0.16	0.32	0.13	0.25	0.20	0.28	0.32	0.42	0.29	0.30	0.18	0.30	0.56	0.29
O2'	0.49	0.36	0.55	0.45	0.38	0.41	0.34	0.33	0.32	0.44	0.36	0.37	0.34	0.37	0.44	0.64	0.48	0.42	0.29	0.39	0.66	0.42
O3'	0.68	0.70	0.76	0.67	0.64	0.60	0.55	0.50	0.53	0.54	0.62	0.71	0.42	0.49	0.62	0.84	0.71	0.59	0.45	0.41	0.70	0.47
O4'	0.39	0.38	0.40	0.35	0.37	0.34	0.32	0.29	0.30	0.34	0.34	0.40	0.23	0.31	0.37	0.44	0.35	0.36	0.27	0.33	0.52	0.32
O5'	0.29	0.36	0.29	0.27	0.29	0.26	0.28	0.27	0.32	0.26	0.37	0.33	0.34	0.25	0.28	0.32	0.28	0.27	0.30	0.17	0.23	0.15
OP1	0.35	0.38	0.35	0.30	0.34	0.29	0.33	0.26	0.34	0.35	0.37	0.36	0.34	0.34	0.34	0.38	0.30	0.32	0.27	0.36	0.55	0.32
OP2	0.33	0.41	0.33	0.41	0.36	0.38	0.39	0.46	0.44	0.34	0.45	0.36	0.51	0.37	0.33	0.32	0.44	0.35	0.54	0.34	0.34	0.38
P	0.34	0.39	0.32	0.28	0.33	0.27	0.32	0.26	0.35	0.31	0.40	0.36	0.36	0.30	0.32	0.36	0.29	0.31	0.28	0.21	0.37	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.20	0.28	0.22
C2	0.02	0.00	0.17	0.26	0.00	0.13	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.32	0.02	0.25	0.35	0.53	0.38
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.09	0.12	0.18	0.05	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.15	0.11
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.13	0.00	0.07	0.01	0.12	0.16	0.20	0.25	0.09	0.11	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.08	0.05
C4	0.01	0.00	0.08	0.13	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.14	0.01	0.17	0.31	0.46	0.32
C4'	0.00	0.13	0.01	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.08	0.10	0.11	0.12	0.08	0.08	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.08	0.06	0.08
C5	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.02	0.18	0.35	0.48	0.33
C5'	0.02	0.18	0.01	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.15	0.13	0.17	0.15	0.16	0.13	0.06	0.03	0.03	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.12	0.01	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.14	0.02	0.22	0.38	0.53	0.36
C8	0.01	0.01	0.09	0.16	0.00	0.10	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.17	0.03	0.17	0.27	0.34	0.22
N1	0.02	0.00	0.12	0.20	0.01	0.11	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.25	0.01	0.25	0.38	0.55	0.39
N3	0.02	0.00	0.18	0.25	0.00	0.12	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.30	0.02	0.22	0.31	0.48	0.35
N6	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.11	0.03	0.22	0.41	0.53	0.36
N7	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.18	0.33	0.42	0.27
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.10	0.25	0.36	0.26
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.06	0.03	0.04	0.03	0.07	0.05	0.10	0.13	0.06	0.04	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.10	0.11	0.11
O3'	0.01	0.32	0.01	0.01	0.14	0.01	0.08	0.03	0.14	0.17	0.25	0.30	0.11	0.13	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.21	0.18	0.10
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.21	0.25	0.22
O5'	0.05	0.25	0.03	0.04	0.17	0.01	0.18	0.01	0.22	0.17	0.25	0.22	0.22	0.18	0.10	0.02	0.07	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.20	0.35	0.07	0.09	0.31	0.08	0.35	0.08	0.38	0.27	0.38	0.31	0.41	0.33	0.25	0.10	0.21	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.53	0.15	0.08	0.46	0.06	0.48	0.07	0.53	0.34	0.55	0.48	0.53	0.42	0.36	0.11	0.18	0.25	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.38	0.11	0.05	0.32	0.08	0.33	0.01	0.36	0.22	0.39	0.35	0.36	0.27	0.26	0.11	0.10	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00