Doublet Group distance statistics: 52721

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 8, 2, 0, 4, 2, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C2	A	0, -0.001, 0.008, 0.017, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.008 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.007, 0.024, 0.042, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N6	A	0, -0.005, 0.027, 0.059, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.027 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.009, 0.178, 0.346, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.178 std_dev=0.168
C2'	A	0, 0.014, 0.213, 0.411, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.213 std_dev=0.198
N1	B	0, 0.077, 0.315, 0.554, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.315 std_dev=0.239
C6	B	0, 0.069, 0.308, 0.546, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.308 std_dev=0.239
C4	B	0, 0.066, 0.310, 0.554, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.310 std_dev=0.244
N9	B	0, 0.103, 0.347, 0.591, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.347 std_dev=0.244
C5	B	0, 0.058, 0.303, 0.548, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.303 std_dev=0.245
N6	B	0, 0.101, 0.346, 0.591, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.346 std_dev=0.245
C2	B	0, 0.069, 0.322, 0.574, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.322 std_dev=0.252
O4'	B	0, 0.171, 0.425, 0.679, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.425 std_dev=0.254
C1'	B	0, 0.139, 0.393, 0.647, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.393 std_dev=0.254
C8	B	0, 0.099, 0.359, 0.619, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.359 std_dev=0.260
N3	B	0, 0.061, 0.323, 0.585, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.323 std_dev=0.262
N7	B	0, 0.079, 0.343, 0.607, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.343 std_dev=0.264
C4'	B	0, 0.168, 0.481, 0.793, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.481 std_dev=0.313
C3'	A	0, 0.017, 0.336, 0.654, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.336 std_dev=0.318
C2'	B	0, 0.124, 0.443, 0.761, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.443 std_dev=0.319
O2'	B	0, 0.159, 0.486, 0.813, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.486 std_dev=0.327
C3'	B	0, 0.171, 0.502, 0.834, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.502 std_dev=0.331
O5'	A	0, 0.087, 0.422, 0.757, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.422 std_dev=0.335
P	A	0, 0.082, 0.436, 0.791, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.436 std_dev=0.355
C4'	A	0, 0.009, 0.378, 0.747, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.378 std_dev=0.369
O2'	A	0, 0.015, 0.390, 0.765, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.390 std_dev=0.375
OP2	A	0, 0.097, 0.476, 0.856, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.476 std_dev=0.380
O3'	B	0, 0.258, 0.640, 1.023, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.640 std_dev=0.383
O5'	B	0, 0.163, 0.577, 0.991, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.577 std_dev=0.414
P	B	0, 0.081, 0.511, 0.941, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.511 std_dev=0.430
OP1	B	0, 0.166, 0.604, 1.043, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.604 std_dev=0.438
C5'	B	0, 0.184, 0.624, 1.063, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.624 std_dev=0.439
O3'	A	0, 0.037, 0.542, 1.047, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.542 std_dev=0.505
OP1	A	0, 0.081, 0.683, 1.285, 1.964 max_d=1.964 avg_d=0.683 std_dev=0.602
OP2	B	0, 0.067, 0.691, 1.315, 2.187 max_d=2.187 avg_d=0.691 std_dev=0.624
C5'	A	0, 0.003, 0.694, 1.385, 1.768 max_d=1.768 avg_d=0.694 std_dev=0.691

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.30	0.30	0.16	0.17
C2	0.02	0.00	0.17	0.10	0.01	0.04	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.30	0.18	0.05	0.34	0.22	0.31	0.17
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.10	0.01	0.07	0.03	0.10	0.05	0.15	0.16	0.09	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.11	0.16	0.27	0.06
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.06	0.01	0.10	0.02	0.08	0.20	0.08	0.10	0.09	0.18	0.10	0.02	0.01	0.02	0.07	0.11	0.35	0.11
C4	0.01	0.01	0.10	0.06	0.00	0.09	0.01	0.31	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.07	0.03	0.33	0.21	0.29	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.13	0.23	0.08	0.03	0.16	0.23	0.12	0.04	0.01	0.00	0.01	0.24	0.26	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.15	0.00	0.43	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.14	0.08	0.03	0.32	0.21	0.35	0.19
C5'	0.09	0.26	0.03	0.02	0.31	0.01	0.43	0.00	0.42	0.47	0.35	0.22	0.47	0.51	0.30	0.04	0.07	0.02	0.01	0.40	0.31	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.08	0.01	0.13	0.01	0.42	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.08	0.04	0.32	0.21	0.37	0.20
C8	0.01	0.01	0.05	0.20	0.01	0.23	0.00	0.47	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.20	0.03	0.31	0.20	0.29	0.17
N1	0.02	0.00	0.15	0.08	0.01	0.08	0.01	0.35	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.26	0.13	0.05	0.34	0.21	0.35	0.19
N3	0.02	0.00	0.16	0.10	0.00	0.03	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.16	0.05	0.34	0.24	0.28	0.17
N6	0.02	0.02	0.09	0.09	0.01	0.16	0.02	0.47	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.18	0.08	0.03	0.31	0.22	0.37	0.21
N7	0.01	0.01	0.03	0.18	0.01	0.23	0.00	0.51	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.18	0.02	0.30	0.22	0.36	0.21
N9	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.12	0.01	0.30	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.32	0.22	0.24	0.16
O2'	0.01	0.30	0.00	0.02	0.17	0.04	0.14	0.04	0.19	0.04	0.26	0.27	0.18	0.05	0.05	0.00	0.03	0.11	0.05	0.12	0.31	0.09
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.07	0.01	0.08	0.07	0.08	0.20	0.13	0.16	0.08	0.18	0.08	0.03	0.00	0.02	0.33	0.13	0.46	0.29
O4'	0.00	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.11	0.02	0.00	0.39	0.45	0.10	0.30
O5'	0.30	0.34	0.11	0.07	0.33	0.01	0.32	0.01	0.32	0.31	0.34	0.34	0.31	0.30	0.32	0.05	0.33	0.39	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.30	0.22	0.16	0.11	0.21	0.24	0.21	0.40	0.21	0.20	0.21	0.24	0.22	0.22	0.22	0.12	0.13	0.45	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.31	0.27	0.35	0.29	0.26	0.35	0.31	0.37	0.29	0.35	0.28	0.37	0.36	0.24	0.31	0.46	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.17	0.06	0.11	0.17	0.02	0.19	0.01	0.20	0.17	0.19	0.17	0.21	0.21	0.16	0.09	0.29	0.30	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.15	0.25	0.30	0.20	0.29	0.19	0.46	0.14	0.27	0.14	0.17	0.15	0.24	0.24	0.22	0.30	0.26	0.42	0.29	0.34	0.26
C2	0.30	0.10	0.32	0.33	0.19	0.29	0.13	0.39	0.08	0.28	0.13	0.14	0.13	0.21	0.28	0.28	0.31	0.29	0.40	0.26	0.21	0.20
C2'	0.31	0.21	0.32	0.37	0.27	0.35	0.25	0.49	0.20	0.31	0.19	0.25	0.17	0.28	0.30	0.27	0.37	0.32	0.43	0.31	0.33	0.28
C3'	0.21	0.15	0.23	0.25	0.17	0.23	0.15	0.39	0.14	0.21	0.15	0.16	0.15	0.18	0.20	0.21	0.26	0.21	0.37	0.20	0.25	0.18
C4	0.25	0.10	0.25	0.30	0.16	0.29	0.14	0.44	0.11	0.27	0.13	0.12	0.18	0.22	0.24	0.23	0.28	0.27	0.41	0.26	0.28	0.23
C4'	0.25	0.17	0.24	0.25	0.21	0.26	0.21	0.40	0.19	0.27	0.18	0.19	0.20	0.25	0.24	0.25	0.26	0.27	0.43	0.26	0.30	0.24
C5	0.23	0.13	0.22	0.26	0.11	0.28	0.12	0.44	0.17	0.23	0.18	0.10	0.24	0.19	0.19	0.22	0.25	0.26	0.39	0.24	0.26	0.21
C5'	0.48	0.31	0.44	0.41	0.41	0.47	0.42	0.53	0.37	0.51	0.31	0.36	0.37	0.49	0.47	0.48	0.39	0.52	0.64	0.49	0.51	0.49
C6	0.24	0.17	0.23	0.25	0.11	0.27	0.13	0.40	0.19	0.22	0.20	0.12	0.23	0.18	0.18	0.23	0.23	0.26	0.38	0.22	0.21	0.19
C8	0.21	0.12	0.20	0.26	0.13	0.29	0.13	0.48	0.16	0.22	0.17	0.11	0.25	0.19	0.19	0.19	0.26	0.25	0.40	0.27	0.33	0.25
N1	0.28	0.16	0.28	0.29	0.11	0.28	0.10	0.37	0.15	0.24	0.19	0.12	0.19	0.17	0.23	0.27	0.27	0.29	0.39	0.24	0.19	0.19
N3	0.29	0.10	0.30	0.33	0.22	0.30	0.19	0.42	0.08	0.30	0.08	0.17	0.11	0.25	0.28	0.27	0.32	0.29	0.42	0.28	0.25	0.22
N6	0.20	0.21	0.19	0.21	0.15	0.24	0.18	0.38	0.23	0.20	0.24	0.17	0.26	0.21	0.15	0.22	0.20	0.22	0.35	0.19	0.18	0.16
N7	0.21	0.14	0.19	0.25	0.11	0.28	0.14	0.47	0.19	0.21	0.19	0.11	0.27	0.18	0.17	0.20	0.24	0.24	0.39	0.25	0.31	0.24
N9	0.23	0.12	0.23	0.29	0.16	0.29	0.15	0.46	0.13	0.26	0.14	0.13	0.19	0.22	0.22	0.22	0.28	0.26	0.41	0.28	0.32	0.25
O2'	0.44	0.39	0.46	0.51	0.41	0.47	0.37	0.59	0.32	0.41	0.35	0.42	0.24	0.36	0.43	0.40	0.51	0.43	0.50	0.42	0.40	0.37
O3'	0.24	0.24	0.28	0.30	0.22	0.26	0.19	0.39	0.17	0.22	0.21	0.24	0.15	0.19	0.23	0.25	0.31	0.23	0.37	0.20	0.25	0.17
O4'	0.24	0.21	0.23	0.25	0.21	0.26	0.21	0.43	0.21	0.25	0.22	0.20	0.22	0.23	0.23	0.25	0.26	0.25	0.42	0.29	0.35	0.25
O5'	0.31	0.32	0.35	0.41	0.32	0.38	0.33	0.53	0.34	0.33	0.34	0.31	0.38	0.34	0.32	0.31	0.43	0.31	0.39	0.39	0.49	0.39
OP1	0.12	0.25	0.18	0.19	0.18	0.16	0.22	0.36	0.28	0.15	0.30	0.19	0.34	0.19	0.14	0.16	0.22	0.11	0.25	0.14	0.32	0.17
OP2	0.28	0.32	0.26	0.16	0.28	0.24	0.29	0.36	0.32	0.26	0.33	0.30	0.36	0.27	0.27	0.32	0.16	0.28	0.31	0.19	0.33	0.22
P	0.11	0.18	0.14	0.15	0.14	0.15	0.18	0.36	0.23	0.14	0.23	0.14	0.29	0.17	0.12	0.14	0.17	0.11	0.24	0.15	0.33	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.17	0.23	0.14	0.13
C2	0.05	0.00	0.16	0.20	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.18	0.25	0.05	0.22	0.21	0.22	0.13
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.02	0.07	0.02	0.10	0.05	0.14	0.16	0.09	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.26	0.08	0.10
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.14	0.01	0.14	0.02	0.17	0.12	0.19	0.18	0.17	0.13	0.08	0.02	0.01	0.02	0.14	0.22	0.12	0.09
C4	0.03	0.01	0.09	0.14	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.03	0.21	0.19	0.23	0.13
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.13	0.08	0.08	0.12	0.13	0.06	0.07	0.02	0.01	0.01	0.23	0.08	0.10
C5	0.02	0.01	0.07	0.14	0.00	0.09	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.17	0.03	0.23	0.17	0.30	0.16
C5'	0.04	0.14	0.02	0.02	0.16	0.00	0.24	0.00	0.24	0.27	0.19	0.10	0.29	0.29	0.15	0.07	0.06	0.02	0.02	0.22	0.10	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.17	0.01	0.09	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.21	0.03	0.23	0.18	0.31	0.16
C8	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.13	0.01	0.27	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.13	0.03	0.22	0.17	0.32	0.19
N1	0.04	0.00	0.14	0.19	0.01	0.08	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.25	0.04	0.22	0.19	0.27	0.14
N3	0.05	0.01	0.16	0.18	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.22	0.05	0.20	0.22	0.20	0.14
N6	0.02	0.01	0.09	0.17	0.01	0.12	0.01	0.29	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.22	0.04	0.24	0.19	0.36	0.19
N7	0.01	0.02	0.04	0.13	0.01	0.13	0.00	0.29	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.15	0.03	0.23	0.18	0.37	0.21
N9	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.20	0.18	0.22	0.13
O2'	0.02	0.18	0.01	0.02	0.10	0.07	0.08	0.07	0.11	0.03	0.16	0.17	0.10	0.04	0.03	0.00	0.06	0.06	0.06	0.34	0.10	0.15
O3'	0.02	0.25	0.03	0.01	0.15	0.02	0.17	0.06	0.21	0.13	0.25	0.22	0.22	0.15	0.08	0.06	0.00	0.02	0.27	0.31	0.19	0.20
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.23	0.21	0.12	0.14
O5'	0.17	0.22	0.06	0.14	0.21	0.01	0.23	0.02	0.23	0.22	0.22	0.20	0.24	0.23	0.20	0.06	0.27	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.23	0.21	0.26	0.22	0.19	0.23	0.17	0.22	0.18	0.17	0.19	0.22	0.19	0.18	0.18	0.34	0.31	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.22	0.08	0.12	0.23	0.08	0.30	0.10	0.31	0.32	0.27	0.20	0.36	0.37	0.22	0.10	0.19	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.13	0.10	0.09	0.13	0.10	0.16	0.02	0.16	0.19	0.14	0.14	0.19	0.21	0.13	0.15	0.20	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00