Doublet Group distance statistics: 52722

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 6, 5, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.014, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.002, 0.014, 0.025, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.011, 0.023, 0.036, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.016, 0.031, 0.046, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.031 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.021, 0.038, 0.055, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.038 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.025, 0.045, 0.064, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.045 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.026, 0.053, 0.079, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.053 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.031, 0.061, 0.092, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.061 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.218, 0.381, 0.545, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.381 std_dev=0.164
C2'	A	0, 0.299, 0.488, 0.677, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.488 std_dev=0.189
C4'	A	0, 0.440, 0.642, 0.844, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.642 std_dev=0.202
N6	B	0, 0.384, 0.625, 0.866, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.625 std_dev=0.241
O2'	A	0, 0.520, 0.764, 1.008, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.764 std_dev=0.244
C6	B	0, 0.470, 0.716, 0.962, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.716 std_dev=0.246
C3'	A	0, 0.542, 0.797, 1.053, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.797 std_dev=0.256
N1	B	0, 0.630, 0.894, 1.157, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.894 std_dev=0.264
C5	B	0, 0.520, 0.790, 1.061, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.790 std_dev=0.271
C4	B	0, 0.619, 0.917, 1.216, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.917 std_dev=0.299
N7	B	0, 0.604, 0.904, 1.205, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.904 std_dev=0.300
C2	B	0, 0.685, 0.985, 1.286, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.985 std_dev=0.301
N3	B	0, 0.678, 0.987, 1.296, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.987 std_dev=0.309
N9	B	0, 0.767, 1.100, 1.433, 1.507 max_d=1.507 avg_d=1.100 std_dev=0.333
OP1	A	0, 0.511, 0.858, 1.206, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.858 std_dev=0.347
C8	B	0, 0.760, 1.108, 1.456, 1.521 max_d=1.521 avg_d=1.108 std_dev=0.348
C5'	A	0, 0.779, 1.159, 1.539, 1.598 max_d=1.598 avg_d=1.159 std_dev=0.380
P	A	0, 0.317, 0.697, 1.078, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.697 std_dev=0.381
C1'	B	0, 0.958, 1.345, 1.731, 1.842 max_d=1.842 avg_d=1.345 std_dev=0.387
O3'	A	0, 0.822, 1.212, 1.602, 1.666 max_d=1.666 avg_d=1.212 std_dev=0.390
O5'	A	0, 0.958, 1.417, 1.876, 1.960 max_d=1.960 avg_d=1.417 std_dev=0.459
O4'	B	0, 1.128, 1.632, 2.136, 2.262 max_d=2.262 avg_d=1.632 std_dev=0.504
OP2	A	0, 0.933, 1.463, 1.992, 2.472 max_d=2.472 avg_d=1.463 std_dev=0.530
C4'	B	0, 1.897, 2.627, 3.356, 3.726 max_d=3.726 avg_d=2.627 std_dev=0.729
C2'	B	0, 2.095, 2.833, 3.570, 3.718 max_d=3.718 avg_d=2.833 std_dev=0.737
O3'	B	0, 1.730, 2.482, 3.234, 4.353 max_d=4.353 avg_d=2.482 std_dev=0.752
C3'	B	0, 2.134, 2.914, 3.695, 4.057 max_d=4.057 avg_d=2.914 std_dev=0.781
O5'	B	0, 1.937, 2.725, 3.512, 4.165 max_d=4.165 avg_d=2.725 std_dev=0.788
O2'	B	0, 2.559, 3.449, 4.339, 4.508 max_d=4.508 avg_d=3.449 std_dev=0.890
P	B	0, 2.298, 3.206, 4.114, 4.068 max_d=4.068 avg_d=3.206 std_dev=0.908
OP2	B	0, 3.212, 4.280, 5.349, 5.167 max_d=5.167 avg_d=4.280 std_dev=1.069
C5'	B	0, 2.776, 3.913, 5.050, 4.942 max_d=4.942 avg_d=3.913 std_dev=1.137
OP1	B	0, 2.781, 4.243, 5.705, 5.367 max_d=5.367 avg_d=4.243 std_dev=1.462

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.17	0.12
C2	0.03	0.00	0.08	0.12	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.15	0.03	0.13	0.15	0.26	0.20
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.06	0.09	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.11	0.06
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.08	0.07	0.10	0.12	0.07	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.12	0.11	0.06
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.11	0.14	0.25	0.19
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.07	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.12	0.16	0.28	0.20
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.07	0.08	0.07	0.09	0.08	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.02	0.14	0.17	0.29	0.21
C8	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.03	0.13	0.13	0.27	0.16
N1	0.03	0.00	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.02	0.14	0.17	0.28	0.21
N3	0.03	0.00	0.09	0.12	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.14	0.03	0.12	0.13	0.24	0.19
N6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.08	0.03	0.15	0.19	0.30	0.22
N7	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.03	0.13	0.15	0.30	0.18
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.09	0.12	0.23	0.16
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.07	0.08	0.05	0.03	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.08	0.11	0.06
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.09	0.08	0.12	0.14	0.08	0.07	0.03	0.03	0.00	0.01	0.06	0.21	0.14	0.10
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.14	0.15	0.12
O5'	0.05	0.13	0.02	0.03	0.11	0.01	0.12	0.01	0.14	0.13	0.14	0.12	0.15	0.13	0.09	0.02	0.06	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.09	0.15	0.08	0.12	0.14	0.07	0.16	0.07	0.17	0.13	0.17	0.13	0.19	0.15	0.12	0.08	0.21	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.26	0.11	0.11	0.25	0.06	0.28	0.02	0.29	0.27	0.28	0.24	0.30	0.30	0.23	0.11	0.14	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.20	0.06	0.06	0.19	0.03	0.20	0.02	0.21	0.16	0.21	0.19	0.22	0.18	0.16	0.06	0.10	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.17	0.24	0.24	0.16	0.21	0.16	0.23	0.19	0.17	0.17	0.17	0.26	0.18	0.17	0.37	0.49	0.22	0.34	0.28	0.83	0.44
C2	0.24	0.13	0.29	0.26	0.12	0.27	0.12	0.29	0.16	0.15	0.18	0.10	0.19	0.13	0.17	0.29	0.72	0.27	0.31	0.27	0.49	0.25
C2'	0.19	0.20	0.24	0.23	0.15	0.20	0.15	0.23	0.19	0.15	0.21	0.17	0.24	0.16	0.15	0.39	0.64	0.21	0.32	0.23	0.77	0.38
C3'	0.21	0.17	0.24	0.24	0.15	0.23	0.14	0.27	0.14	0.17	0.15	0.17	0.18	0.16	0.17	0.37	0.60	0.23	0.36	0.32	0.86	0.46
C4	0.23	0.11	0.26	0.24	0.13	0.24	0.11	0.28	0.12	0.16	0.11	0.15	0.18	0.14	0.18	0.28	0.52	0.25	0.35	0.25	0.72	0.38
C4'	0.23	0.19	0.26	0.28	0.18	0.24	0.17	0.28	0.15	0.19	0.15	0.19	0.19	0.19	0.20	0.35	0.45	0.24	0.41	0.41	0.97	0.55
C5	0.23	0.11	0.24	0.27	0.13	0.26	0.08	0.32	0.08	0.17	0.10	0.14	0.15	0.13	0.19	0.22	0.44	0.26	0.38	0.31	0.75	0.43
C5'	0.26	0.23	0.28	0.34	0.22	0.28	0.20	0.33	0.19	0.23	0.20	0.23	0.20	0.22	0.23	0.33	0.40	0.27	0.47	0.53	1.06	0.64
C6	0.23	0.10	0.24	0.25	0.11	0.28	0.11	0.36	0.13	0.17	0.13	0.10	0.17	0.14	0.18	0.20	0.49	0.29	0.37	0.25	0.61	0.35
C8	0.22	0.18	0.22	0.30	0.16	0.24	0.12	0.30	0.07	0.18	0.12	0.18	0.12	0.16	0.19	0.27	0.36	0.24	0.41	0.43	0.93	0.55
N1	0.24	0.10	0.26	0.23	0.09	0.28	0.11	0.33	0.14	0.16	0.15	0.06	0.17	0.13	0.17	0.25	0.66	0.29	0.33	0.25	0.47	0.25
N3	0.24	0.13	0.28	0.26	0.14	0.25	0.13	0.27	0.17	0.15	0.18	0.14	0.21	0.14	0.18	0.32	0.66	0.26	0.31	0.23	0.60	0.29
N6	0.24	0.14	0.24	0.30	0.16	0.32	0.17	0.43	0.18	0.22	0.17	0.13	0.20	0.20	0.21	0.20	0.42	0.30	0.42	0.30	0.60	0.38
N7	0.22	0.17	0.23	0.32	0.16	0.26	0.12	0.34	0.10	0.19	0.15	0.18	0.13	0.15	0.20	0.22	0.34	0.25	0.43	0.44	0.90	0.55
N9	0.22	0.15	0.24	0.25	0.14	0.23	0.12	0.26	0.12	0.16	0.10	0.17	0.20	0.15	0.17	0.31	0.46	0.24	0.36	0.31	0.83	0.45
O2'	0.17	0.22	0.24	0.23	0.16	0.18	0.20	0.18	0.26	0.15	0.28	0.17	0.32	0.19	0.15	0.42	0.66	0.18	0.28	0.18	0.73	0.33
O3'	0.20	0.18	0.24	0.23	0.15	0.22	0.14	0.27	0.15	0.16	0.17	0.17	0.18	0.16	0.16	0.38	0.67	0.23	0.35	0.30	0.83	0.44
O4'	0.24	0.21	0.27	0.31	0.19	0.24	0.17	0.26	0.16	0.19	0.16	0.22	0.21	0.19	0.21	0.34	0.39	0.25	0.40	0.40	0.96	0.55
O5'	0.26	0.24	0.28	0.34	0.23	0.29	0.22	0.36	0.22	0.25	0.23	0.23	0.23	0.24	0.25	0.34	0.42	0.28	0.46	0.55	1.03	0.64
OP1	0.17	0.16	0.17	0.28	0.13	0.19	0.12	0.27	0.11	0.17	0.14	0.15	0.12	0.16	0.15	0.33	0.35	0.20	0.37	0.57	1.01	0.61
OP2	0.27	0.27	0.26	0.32	0.26	0.31	0.28	0.39	0.30	0.30	0.29	0.25	0.35	0.31	0.27	0.39	0.44	0.32	0.44	0.59	0.96	0.62
P	0.18	0.15	0.16	0.25	0.13	0.20	0.13	0.28	0.12	0.18	0.14	0.14	0.15	0.17	0.16	0.35	0.37	0.22	0.37	0.54	1.00	0.60

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.01	0.02	0.31	0.00	0.09	0.22	0.28	0.09
C2	0.03	0.00	0.13	0.16	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.41	0.33	0.05	0.28	0.16	0.78	0.36
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.21	0.07	0.05	0.11	0.13	0.07	0.03	0.02	0.00	0.05	0.02	0.09	0.28	0.21	0.07
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.20	0.00	0.30	0.02	0.29	0.34	0.23	0.13	0.34	0.37	0.21	0.02	0.01	0.02	0.29	0.24	0.33	0.12
C4	0.02	0.01	0.07	0.20	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.31	0.20	0.03	0.29	0.20	0.74	0.37
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.11	0.15	0.08	0.05	0.14	0.16	0.08	0.25	0.02	0.00	0.02	0.40	0.07	0.19
C5	0.02	0.01	0.05	0.30	0.01	0.12	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.34	0.13	0.02	0.38	0.42	0.97	0.57
C5'	0.07	0.07	0.21	0.02	0.08	0.01	0.14	0.00	0.13	0.17	0.10	0.07	0.17	0.19	0.08	0.06	0.18	0.02	0.01	0.10	0.06	0.02
C6	0.03	0.00	0.07	0.29	0.01	0.11	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.40	0.16	0.04	0.40	0.46	1.05	0.61
C8	0.01	0.01	0.05	0.34	0.00	0.15	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.18	0.15	0.03	0.37	0.43	0.84	0.55
N1	0.03	0.00	0.11	0.23	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.43	0.24	0.04	0.35	0.32	0.95	0.50
N3	0.03	0.00	0.13	0.13	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.36	0.36	0.05	0.23	0.10	0.64	0.27
N6	0.04	0.01	0.07	0.34	0.02	0.14	0.02	0.17	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.41	0.18	0.04	0.45	0.63	1.20	0.73
N7	0.01	0.01	0.03	0.37	0.01	0.16	0.00	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.27	0.19	0.02	0.43	0.58	1.06	0.68
N9	0.01	0.02	0.02	0.21	0.01	0.08	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.18	0.13	0.01	0.25	0.17	0.61	0.31
O2'	0.02	0.41	0.00	0.02	0.31	0.25	0.34	0.06	0.40	0.18	0.43	0.36	0.41	0.27	0.18	0.00	0.06	0.19	0.19	0.18	0.28	0.14
O3'	0.31	0.33	0.05	0.01	0.20	0.02	0.13	0.18	0.16	0.15	0.24	0.36	0.18	0.19	0.13	0.06	0.00	0.22	0.32	0.30	0.32	0.13
O4'	0.00	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.19	0.22	0.00	0.07	0.30	0.11	0.16
O5'	0.09	0.28	0.09	0.29	0.29	0.02	0.38	0.01	0.40	0.37	0.35	0.23	0.45	0.43	0.25	0.19	0.32	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.22	0.16	0.28	0.24	0.20	0.40	0.42	0.10	0.46	0.43	0.32	0.10	0.63	0.58	0.17	0.18	0.30	0.30	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.78	0.21	0.33	0.74	0.07	0.97	0.06	1.05	0.84	0.95	0.64	1.20	1.06	0.61	0.28	0.32	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.36	0.07	0.12	0.37	0.19	0.57	0.02	0.61	0.55	0.50	0.27	0.73	0.68	0.31	0.14	0.13	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00