Doublet Group distance statistics: 52723

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 2, 3, 8, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.009, 0.013, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.012, 0.019, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.011, 0.019, 0.027, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.010, 0.020, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.009
N6	A	0, 0.011, 0.023, 0.034, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.019, 0.031, 0.043, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.031 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.016, 0.030, 0.045, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.030 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.010, 0.025, 0.041, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C2'	A	0, 0.125, 0.277, 0.428, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.277 std_dev=0.152
C4	B	0, 0.290, 0.462, 0.633, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.462 std_dev=0.172
O2'	A	0, 0.217, 0.389, 0.561, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.389 std_dev=0.172
C5	B	0, 0.121, 0.298, 0.476, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.298 std_dev=0.177
O4'	A	0, 0.073, 0.268, 0.464, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.268 std_dev=0.196
C6	B	0, 0.133, 0.329, 0.525, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.329 std_dev=0.196
N7	B	0, 0.248, 0.459, 0.670, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.459 std_dev=0.211
N6	B	0, 0.283, 0.497, 0.711, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.497 std_dev=0.214
N9	B	0, 0.281, 0.501, 0.721, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.501 std_dev=0.220
C8	B	0, 0.252, 0.483, 0.714, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.483 std_dev=0.231
N1	B	0, 0.261, 0.508, 0.755, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.508 std_dev=0.247
C3'	A	0, 0.247, 0.515, 0.783, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.515 std_dev=0.268
N3	B	0, 0.406, 0.693, 0.980, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.693 std_dev=0.287
C4'	A	0, 0.216, 0.511, 0.806, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.511 std_dev=0.295
C2	B	0, 0.382, 0.686, 0.989, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.686 std_dev=0.303
O4'	B	0, 0.180, 0.499, 0.818, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.499 std_dev=0.319
C1'	B	0, 0.406, 0.728, 1.050, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.728 std_dev=0.322
O5'	A	0, 0.266, 0.646, 1.026, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.646 std_dev=0.380
O3'	A	0, 0.460, 0.855, 1.250, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.855 std_dev=0.395
C4'	B	0, 0.325, 0.728, 1.131, 1.917 max_d=1.917 avg_d=0.728 std_dev=0.403
P	A	0, 0.691, 1.182, 1.673, 2.186 max_d=2.186 avg_d=1.182 std_dev=0.491
C5'	A	0, 0.332, 0.823, 1.315, 1.717 max_d=1.717 avg_d=0.823 std_dev=0.491
P	B	0, 0.644, 1.145, 1.645, 2.224 max_d=2.224 avg_d=1.145 std_dev=0.500
C5'	B	0, 0.798, 1.378, 1.957, 2.267 max_d=2.267 avg_d=1.378 std_dev=0.579
O5'	B	0, 0.396, 1.030, 1.664, 2.503 max_d=2.503 avg_d=1.030 std_dev=0.634
OP2	B	0, 0.895, 1.538, 2.181, 2.343 max_d=2.343 avg_d=1.538 std_dev=0.643
C3'	B	0, 0.577, 1.225, 1.873, 2.295 max_d=2.295 avg_d=1.225 std_dev=0.648
OP1	B	0, 0.902, 1.567, 2.231, 2.850 max_d=2.850 avg_d=1.567 std_dev=0.665
C2'	B	0, 0.604, 1.298, 1.992, 2.444 max_d=2.444 avg_d=1.298 std_dev=0.694
O3'	B	0, 0.776, 1.553, 2.331, 2.776 max_d=2.776 avg_d=1.553 std_dev=0.777
O2'	B	0, 0.762, 1.617, 2.473, 2.931 max_d=2.931 avg_d=1.617 std_dev=0.856
OP1	A	0, 0.687, 1.833, 2.979, 3.990 max_d=3.990 avg_d=1.833 std_dev=1.146
OP2	A	0, 1.788, 3.111, 4.434, 4.356 max_d=4.356 avg_d=3.111 std_dev=1.323

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.28	0.52	0.25
C2	0.03	0.00	0.16	0.22	0.00	0.10	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.27	0.03	0.28	0.56	0.57	0.45
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.02	0.08	0.07	0.13	0.16	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.25	0.40	0.14
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.14	0.00	0.12	0.03	0.15	0.11	0.20	0.21	0.13	0.10	0.07	0.01	0.00	0.01	0.26	0.29	0.37	0.11
C4	0.01	0.00	0.09	0.14	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.14	0.02	0.25	0.56	0.52	0.43
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.10	0.09	0.09	0.09	0.10	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.20	0.46	0.08
C5	0.01	0.00	0.05	0.12	0.00	0.08	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.01	0.30	0.72	0.53	0.53
C5'	0.04	0.17	0.02	0.03	0.15	0.01	0.20	0.00	0.21	0.21	0.19	0.14	0.23	0.23	0.13	0.04	0.04	0.01	0.01	0.34	0.41	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.15	0.00	0.08	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.18	0.02	0.32	0.76	0.57	0.55
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.10	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.02	0.25	0.70	0.46	0.50
N1	0.02	0.00	0.13	0.20	0.00	0.09	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.24	0.02	0.31	0.67	0.59	0.51
N3	0.03	0.00	0.16	0.21	0.00	0.09	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.23	0.03	0.24	0.48	0.55	0.39
N6	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.09	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.17	0.02	0.34	0.85	0.58	0.60
N7	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.10	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.02	0.30	0.82	0.48	0.57
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.19	0.50	0.50	0.39
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.04	0.10	0.12	0.06	0.04	0.02	0.00	0.07	0.05	0.10	0.21	0.44	0.11
O3'	0.02	0.27	0.02	0.00	0.14	0.02	0.14	0.04	0.18	0.12	0.24	0.23	0.17	0.13	0.06	0.07	0.00	0.02	0.29	0.44	0.39	0.15
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.17	0.25	0.62	0.25
O5'	0.08	0.28	0.17	0.26	0.25	0.02	0.30	0.01	0.32	0.25	0.31	0.24	0.34	0.30	0.19	0.10	0.29	0.17	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.28	0.56	0.25	0.29	0.56	0.20	0.72	0.34	0.76	0.70	0.67	0.48	0.85	0.82	0.50	0.21	0.44	0.25	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.52	0.57	0.40	0.37	0.52	0.46	0.53	0.41	0.57	0.46	0.59	0.55	0.58	0.48	0.50	0.44	0.39	0.62	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.25	0.45	0.14	0.11	0.43	0.08	0.53	0.01	0.55	0.50	0.51	0.39	0.60	0.57	0.39	0.11	0.15	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.32	0.25	0.24	0.18	0.22	0.19	0.32	0.20	0.24	0.29	0.26	0.26	0.27	0.19	0.26	0.33	0.24	0.56	0.51	0.75	0.52
C2	0.31	0.36	0.41	0.31	0.23	0.29	0.14	0.33	0.17	0.22	0.27	0.36	0.18	0.18	0.24	0.42	0.43	0.30	0.52	0.41	0.69	0.43
C2'	0.23	0.36	0.33	0.28	0.22	0.22	0.23	0.29	0.25	0.26	0.32	0.30	0.30	0.28	0.22	0.32	0.38	0.23	0.55	0.48	0.70	0.48
C3'	0.17	0.34	0.23	0.18	0.18	0.23	0.19	0.29	0.21	0.25	0.30	0.26	0.23	0.28	0.18	0.26	0.26	0.26	0.59	0.47	0.65	0.48
C4	0.18	0.32	0.22	0.17	0.15	0.23	0.11	0.31	0.18	0.19	0.28	0.27	0.20	0.20	0.14	0.23	0.27	0.25	0.55	0.47	0.71	0.48
C4'	0.17	0.36	0.20	0.16	0.19	0.20	0.18	0.30	0.22	0.23	0.34	0.28	0.22	0.25	0.17	0.26	0.24	0.25	0.59	0.51	0.70	0.51
C5	0.12	0.28	0.13	0.10	0.12	0.25	0.12	0.34	0.18	0.19	0.25	0.23	0.20	0.21	0.08	0.15	0.20	0.25	0.58	0.47	0.69	0.48
C5'	0.18	0.34	0.18	0.17	0.19	0.25	0.21	0.28	0.25	0.29	0.35	0.26	0.27	0.29	0.20	0.24	0.16	0.31	0.64	0.50	0.65	0.51
C6	0.13	0.28	0.14	0.15	0.15	0.31	0.16	0.40	0.20	0.20	0.25	0.25	0.20	0.21	0.10	0.18	0.26	0.28	0.58	0.45	0.66	0.45
C8	0.15	0.25	0.18	0.15	0.13	0.22	0.16	0.33	0.17	0.27	0.24	0.19	0.21	0.29	0.16	0.21	0.19	0.25	0.60	0.52	0.71	0.53
N1	0.28	0.31	0.32	0.25	0.20	0.33	0.16	0.40	0.19	0.23	0.26	0.30	0.19	0.20	0.21	0.36	0.37	0.31	0.54	0.42	0.66	0.42
N3	0.26	0.38	0.35	0.29	0.20	0.25	0.13	0.30	0.17	0.20	0.30	0.34	0.19	0.18	0.20	0.34	0.40	0.27	0.52	0.44	0.71	0.45
N6	0.10	0.26	0.14	0.27	0.18	0.38	0.19	0.51	0.22	0.22	0.24	0.24	0.22	0.24	0.13	0.13	0.33	0.30	0.63	0.47	0.63	0.46
N7	0.14	0.24	0.18	0.16	0.13	0.24	0.15	0.34	0.18	0.25	0.23	0.19	0.21	0.26	0.14	0.17	0.19	0.25	0.61	0.51	0.68	0.52
N9	0.16	0.30	0.19	0.17	0.14	0.21	0.15	0.32	0.18	0.23	0.27	0.23	0.23	0.26	0.15	0.22	0.25	0.24	0.57	0.50	0.73	0.51
O2'	0.30	0.41	0.44	0.42	0.29	0.27	0.27	0.33	0.30	0.28	0.37	0.37	0.35	0.30	0.28	0.41	0.53	0.25	0.54	0.50	0.74	0.50
O3'	0.19	0.38	0.28	0.21	0.20	0.23	0.19	0.30	0.22	0.25	0.33	0.31	0.22	0.27	0.19	0.30	0.30	0.26	0.59	0.46	0.61	0.46
O4'	0.19	0.36	0.20	0.19	0.20	0.22	0.18	0.36	0.22	0.22	0.34	0.29	0.22	0.24	0.18	0.27	0.26	0.25	0.59	0.56	0.78	0.56
O5'	0.25	0.29	0.27	0.29	0.22	0.33	0.24	0.32	0.24	0.36	0.30	0.24	0.27	0.35	0.26	0.28	0.26	0.38	0.68	0.51	0.62	0.53
OP1	0.82	0.66	0.86	0.88	0.75	0.88	0.78	0.85	0.71	0.91	0.66	0.70	0.72	0.90	0.82	0.86	0.87	0.90	1.13	1.20	1.33	1.17
OP2	0.53	0.78	0.55	0.60	0.63	0.54	0.67	0.46	0.81	0.56	0.85	0.67	0.91	0.61	0.56	0.51	0.57	0.58	0.76	0.61	0.67	0.63
P	0.59	0.50	0.65	0.67	0.54	0.65	0.56	0.55	0.52	0.68	0.51	0.50	0.53	0.66	0.60	0.62	0.64	0.70	0.93	0.77	0.85	0.79

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.00	0.20	0.27	0.46	0.23
C2	0.02	0.00	0.27	0.37	0.00	0.10	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.42	0.08	0.29	0.33	0.67	0.34
C2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.15	0.02	0.09	0.09	0.14	0.10	0.22	0.27	0.11	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.29	0.46	0.41	0.32
C3'	0.02	0.37	0.01	0.00	0.29	0.00	0.30	0.06	0.35	0.19	0.38	0.33	0.35	0.25	0.18	0.01	0.01	0.03	0.31	0.46	0.23	0.27
C4	0.01	0.00	0.15	0.29	0.00	0.11	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.28	0.04	0.30	0.35	0.67	0.36
C4'	0.02	0.10	0.02	0.00	0.11	0.00	0.17	0.00	0.16	0.20	0.13	0.08	0.20	0.22	0.11	0.17	0.03	0.00	0.02	0.24	0.29	0.11
C5	0.01	0.00	0.09	0.30	0.00	0.17	0.00	0.41	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.29	0.02	0.36	0.45	0.78	0.46
C5'	0.06	0.21	0.09	0.06	0.27	0.00	0.41	0.00	0.41	0.47	0.31	0.15	0.49	0.52	0.27	0.10	0.10	0.02	0.01	0.23	0.36	0.01
C6	0.01	0.01	0.14	0.35	0.01	0.16	0.00	0.41	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.36	0.03	0.36	0.47	0.82	0.47
C8	0.01	0.00	0.10	0.19	0.00	0.20	0.00	0.47	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.16	0.16	0.07	0.36	0.46	0.74	0.45
N1	0.02	0.00	0.22	0.38	0.01	0.13	0.01	0.31	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.42	0.06	0.33	0.40	0.76	0.42
N3	0.02	0.00	0.27	0.33	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.37	0.08	0.26	0.30	0.61	0.30
N6	0.02	0.01	0.11	0.35	0.01	0.20	0.01	0.49	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.21	0.36	0.03	0.40	0.55	0.88	0.53
N7	0.01	0.00	0.05	0.25	0.00	0.22	0.00	0.52	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.19	0.23	0.05	0.39	0.53	0.83	0.51
N9	0.01	0.01	0.03	0.18	0.00	0.11	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.14	0.01	0.29	0.34	0.62	0.34
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.15	0.17	0.18	0.10	0.20	0.16	0.20	0.17	0.21	0.19	0.11	0.00	0.06	0.14	0.13	0.37	0.38	0.27
O3'	0.13	0.42	0.02	0.01	0.28	0.03	0.29	0.10	0.36	0.16	0.42	0.37	0.36	0.23	0.14	0.06	0.00	0.08	0.30	0.54	0.31	0.33
O4'	0.00	0.08	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.07	0.06	0.08	0.03	0.05	0.01	0.14	0.08	0.00	0.16	0.22	0.45	0.23
O5'	0.20	0.29	0.29	0.31	0.30	0.02	0.36	0.01	0.36	0.36	0.33	0.26	0.40	0.39	0.29	0.13	0.30	0.16	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.27	0.33	0.46	0.46	0.35	0.24	0.45	0.23	0.47	0.46	0.40	0.30	0.55	0.53	0.34	0.37	0.54	0.22	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.46	0.67	0.41	0.23	0.67	0.29	0.78	0.36	0.82	0.74	0.76	0.61	0.88	0.83	0.62	0.38	0.31	0.45	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.34	0.32	0.27	0.36	0.11	0.46	0.01	0.47	0.45	0.42	0.30	0.53	0.51	0.34	0.27	0.33	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00