Doublet Group distance statistics: 52724

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 7, 4, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.001, 0.015, 0.029, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.015 std_dev=0.014
C2	A	0, -0.006, 0.009, 0.023, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.009 std_dev=0.015
C1'	A	0, -0.002, 0.014, 0.029, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.014 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.002, 0.020, 0.038, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.020 std_dev=0.018
N9	A	0, -0.002, 0.018, 0.038, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.018 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.003, 0.025, 0.046, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.025 std_dev=0.021
N6	A	0, -0.009, 0.026, 0.061, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.026 std_dev=0.035
C2'	A	0, 0.063, 0.140, 0.218, 0.384 max_d=0.384 avg_d=0.140 std_dev=0.078
O4'	A	0, 0.056, 0.135, 0.214, 0.359 max_d=0.359 avg_d=0.135 std_dev=0.079
O2'	A	0, 0.067, 0.169, 0.270, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.169 std_dev=0.101
C4'	A	0, 0.081, 0.195, 0.308, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.195 std_dev=0.114
C3'	A	0, 0.087, 0.210, 0.333, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.210 std_dev=0.123
N6	B	0, 0.168, 0.328, 0.487, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.328 std_dev=0.160
C6	B	0, 0.079, 0.256, 0.433, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.256 std_dev=0.177
N1	B	0, 0.054, 0.233, 0.412, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.233 std_dev=0.179
C5'	A	0, 0.146, 0.338, 0.531, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.338 std_dev=0.192
O3'	A	0, 0.135, 0.328, 0.521, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.328 std_dev=0.193
C2	B	0, 0.052, 0.250, 0.448, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.250 std_dev=0.198
O5'	A	0, 0.095, 0.298, 0.501, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.298 std_dev=0.203
C5	B	0, 0.031, 0.254, 0.476, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.254 std_dev=0.223
N3	B	0, 0.037, 0.267, 0.498, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.267 std_dev=0.231
C4	B	0, 0.002, 0.248, 0.494, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.248 std_dev=0.246
N7	B	0, 0.067, 0.323, 0.579, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.323 std_dev=0.256
P	A	0, 0.083, 0.358, 0.633, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.358 std_dev=0.275
N9	B	0, 0.002, 0.296, 0.590, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.296 std_dev=0.294
C8	B	0, 0.032, 0.329, 0.627, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.329 std_dev=0.297
C1'	B	0, 0.030, 0.356, 0.681, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.356 std_dev=0.326
C2'	B	0, 0.021, 0.386, 0.750, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.386 std_dev=0.364
O2'	B	0, 0.049, 0.430, 0.811, 1.732 max_d=1.732 avg_d=0.430 std_dev=0.381
OP1	A	0, 0.079, 0.467, 0.856, 1.590 max_d=1.590 avg_d=0.467 std_dev=0.389
O4'	B	0, 0.027, 0.435, 0.844, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.435 std_dev=0.408
OP2	A	0, -0.030, 0.384, 0.797, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.384 std_dev=0.413
P	B	0, -0.038, 0.428, 0.894, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.428 std_dev=0.466
C4'	B	0, -0.030, 0.469, 0.968, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.469 std_dev=0.499
O5'	B	0, -0.016, 0.486, 0.989, 1.766 max_d=1.766 avg_d=0.486 std_dev=0.502
C5'	B	0, -0.036, 0.484, 1.004, 1.853 max_d=1.853 avg_d=0.484 std_dev=0.520
C3'	B	0, -0.081, 0.492, 1.065, 2.183 max_d=2.183 avg_d=0.492 std_dev=0.573
OP1	B	0, -0.070, 0.568, 1.207, 2.572 max_d=2.572 avg_d=0.568 std_dev=0.639
OP2	B	0, -0.188, 0.499, 1.185, 2.949 max_d=2.949 avg_d=0.499 std_dev=0.687
O3'	B	0, -0.198, 0.619, 1.435, 3.355 max_d=3.355 avg_d=0.619 std_dev=0.817

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.15	0.07
C2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.08	0.04	0.08	0.07	0.29	0.14
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.12	0.06
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.05	0.05	0.04	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.04	0.08	0.05
C4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.02	0.09	0.08	0.29	0.14
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01
C5	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.12	0.13	0.35	0.19
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.09	0.05	0.03	0.10	0.10	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.06	0.04	0.13	0.14	0.38	0.20
C8	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.06	0.04	0.13	0.13	0.31	0.18
N1	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.07	0.03	0.11	0.11	0.35	0.18
N3	0.03	0.00	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.07	0.07	0.04	0.06	0.05	0.25	0.11
N6	0.03	0.01	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.04	0.06	0.06	0.15	0.18	0.42	0.23
N7	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.10	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.06	0.04	0.14	0.17	0.38	0.22
N9	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.08	0.07	0.25	0.13
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.05	0.03	0.06	0.05	0.03	0.06	0.07	0.04	0.02	0.02	0.00	0.04	0.03	0.04	0.07	0.08	0.04
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.06	0.06	0.07	0.07	0.06	0.06	0.02	0.04	0.00	0.01	0.05	0.06	0.08	0.05
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.03	0.04	0.06	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.07	0.09	0.04
O5'	0.04	0.08	0.04	0.04	0.09	0.01	0.12	0.01	0.13	0.13	0.11	0.06	0.15	0.14	0.08	0.04	0.05	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.04	0.07	0.02	0.04	0.08	0.04	0.13	0.04	0.14	0.13	0.11	0.05	0.18	0.17	0.07	0.07	0.06	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.29	0.12	0.08	0.29	0.04	0.35	0.02	0.38	0.31	0.35	0.25	0.42	0.38	0.25	0.08	0.08	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.14	0.06	0.05	0.14	0.01	0.19	0.01	0.20	0.18	0.18	0.11	0.23	0.22	0.13	0.04	0.05	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.13	0.17	0.15	0.08	0.11	0.09	0.15	0.11	0.10	0.14	0.09	0.13	0.10	0.09	0.17	0.14	0.13	0.17	0.12	0.36	0.13
C2	0.10	0.11	0.14	0.11	0.11	0.16	0.18	0.22	0.18	0.18	0.14	0.08	0.20	0.21	0.12	0.22	0.25	0.17	0.21	0.22	0.30	0.18
C2'	0.09	0.15	0.15	0.10	0.07	0.13	0.09	0.18	0.12	0.09	0.16	0.10	0.13	0.10	0.07	0.16	0.21	0.15	0.17	0.12	0.34	0.12
C3'	0.10	0.13	0.16	0.11	0.07	0.12	0.08	0.17	0.10	0.10	0.14	0.09	0.12	0.10	0.08	0.16	0.18	0.14	0.18	0.11	0.39	0.14
C4	0.12	0.11	0.15	0.12	0.05	0.12	0.07	0.16	0.12	0.09	0.13	0.09	0.16	0.10	0.08	0.19	0.15	0.13	0.17	0.12	0.36	0.13
C4'	0.12	0.12	0.17	0.16	0.09	0.12	0.10	0.16	0.11	0.11	0.13	0.09	0.13	0.11	0.10	0.17	0.15	0.14	0.17	0.13	0.39	0.14
C5	0.18	0.12	0.18	0.16	0.10	0.15	0.05	0.17	0.11	0.11	0.13	0.12	0.16	0.07	0.13	0.22	0.14	0.16	0.18	0.09	0.41	0.13
C5'	0.12	0.12	0.17	0.17	0.10	0.11	0.11	0.14	0.12	0.12	0.12	0.10	0.13	0.12	0.11	0.17	0.13	0.13	0.18	0.14	0.44	0.16
C6	0.20	0.11	0.19	0.16	0.09	0.17	0.07	0.19	0.12	0.10	0.12	0.12	0.18	0.09	0.13	0.25	0.17	0.18	0.19	0.11	0.38	0.12
C8	0.16	0.13	0.17	0.17	0.11	0.14	0.08	0.15	0.09	0.13	0.13	0.12	0.11	0.11	0.14	0.19	0.11	0.16	0.19	0.08	0.44	0.15
N1	0.14	0.09	0.16	0.12	0.06	0.17	0.13	0.22	0.15	0.13	0.12	0.09	0.19	0.18	0.07	0.25	0.22	0.15	0.19	0.19	0.31	0.15
N3	0.10	0.13	0.15	0.11	0.11	0.14	0.16	0.19	0.18	0.15	0.16	0.10	0.19	0.17	0.11	0.19	0.22	0.15	0.19	0.18	0.32	0.16
N6	0.25	0.12	0.22	0.21	0.13	0.22	0.09	0.22	0.12	0.16	0.12	0.15	0.18	0.10	0.19	0.27	0.19	0.24	0.23	0.09	0.44	0.16
N7	0.20	0.14	0.19	0.19	0.14	0.17	0.11	0.18	0.11	0.16	0.14	0.14	0.14	0.12	0.17	0.22	0.14	0.19	0.20	0.08	0.46	0.16
N9	0.13	0.12	0.16	0.14	0.07	0.12	0.05	0.15	0.08	0.10	0.12	0.09	0.12	0.09	0.09	0.18	0.13	0.13	0.17	0.10	0.39	0.13
O2'	0.09	0.18	0.17	0.11	0.10	0.13	0.11	0.16	0.14	0.10	0.18	0.13	0.15	0.11	0.09	0.17	0.24	0.15	0.15	0.13	0.30	0.12
O3'	0.09	0.15	0.14	0.09	0.07	0.14	0.08	0.19	0.11	0.09	0.15	0.10	0.12	0.09	0.07	0.16	0.23	0.15	0.18	0.12	0.38	0.13
O4'	0.13	0.12	0.18	0.18	0.10	0.12	0.11	0.15	0.11	0.12	0.13	0.10	0.13	0.12	0.11	0.17	0.13	0.13	0.18	0.13	0.39	0.15
O5'	0.12	0.14	0.17	0.18	0.12	0.10	0.11	0.12	0.12	0.12	0.14	0.13	0.12	0.12	0.12	0.16	0.12	0.10	0.17	0.13	0.49	0.19
OP1	0.18	0.13	0.23	0.27	0.16	0.13	0.16	0.11	0.15	0.18	0.14	0.14	0.16	0.18	0.17	0.19	0.15	0.12	0.25	0.22	0.60	0.28
OP2	0.25	0.25	0.25	0.31	0.25	0.23	0.26	0.24	0.26	0.27	0.25	0.26	0.26	0.27	0.25	0.21	0.25	0.23	0.31	0.36	0.67	0.40
P	0.16	0.15	0.20	0.25	0.15	0.12	0.16	0.10	0.15	0.17	0.15	0.15	0.15	0.17	0.16	0.15	0.14	0.11	0.23	0.23	0.60	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.14	0.01	0.06	0.07	0.13	0.07
C2	0.03	0.00	0.15	0.17	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.08	0.06	0.10	0.10	0.22	0.08
C2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.10	0.07	0.07	0.11	0.15	0.06	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.22	0.20	0.27	0.23
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.16	0.00	0.18	0.02	0.20	0.14	0.19	0.15	0.21	0.17	0.12	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.10	0.05
C4	0.02	0.01	0.08	0.16	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.04	0.03	0.10	0.08	0.23	0.08
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.05	0.05	0.07	0.06	0.04	0.16	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.03
C5	0.02	0.01	0.04	0.18	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.08	0.03	0.14	0.10	0.31	0.11
C5'	0.05	0.07	0.10	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.08	0.10	0.07	0.06	0.09	0.11	0.06	0.06	0.11	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.20	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.10	0.03	0.15	0.12	0.33	0.12
C8	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.13	0.08	0.02	0.14	0.07	0.28	0.09
N1	0.03	0.01	0.11	0.19	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.08	0.05	0.13	0.12	0.28	0.10
N3	0.03	0.00	0.15	0.15	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.08	0.05	0.09	0.09	0.19	0.07
N6	0.02	0.01	0.06	0.21	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.16	0.13	0.03	0.18	0.16	0.40	0.16
N7	0.02	0.01	0.04	0.17	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.15	0.11	0.02	0.16	0.11	0.35	0.13
N9	0.00	0.01	0.01	0.12	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.03	0.01	0.09	0.06	0.20	0.06
O2'	0.02	0.13	0.00	0.01	0.11	0.16	0.14	0.06	0.15	0.13	0.14	0.12	0.16	0.15	0.09	0.00	0.04	0.11	0.16	0.14	0.31	0.19
O3'	0.14	0.08	0.02	0.00	0.04	0.01	0.08	0.11	0.10	0.08	0.08	0.08	0.13	0.11	0.03	0.04	0.00	0.11	0.11	0.20	0.09	0.11
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.11	0.11	0.00	0.06	0.04	0.20	0.12
O5'	0.06	0.10	0.22	0.05	0.10	0.01	0.14	0.01	0.15	0.14	0.13	0.09	0.18	0.16	0.09	0.16	0.11	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.07	0.10	0.20	0.10	0.08	0.07	0.10	0.06	0.12	0.07	0.12	0.09	0.16	0.11	0.06	0.14	0.20	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.22	0.27	0.10	0.23	0.07	0.31	0.03	0.33	0.28	0.28	0.19	0.40	0.35	0.20	0.31	0.09	0.20	0.02	0.02	0.00	0.02
P	0.07	0.08	0.23	0.05	0.08	0.03	0.11	0.01	0.12	0.09	0.10	0.07	0.16	0.13	0.06	0.19	0.11	0.12	0.00	0.01	0.02	0.00