Doublet Group distance statistics: 52725

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 3, 2, 1, 1, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.010, 0.018, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.001, 0.014, 0.026, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.006, 0.025, 0.044, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.001, 0.022, 0.042, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.022 std_dev=0.021
N1	A	0, -0.001, 0.022, 0.045, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.022 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.002, 0.030, 0.057, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.030 std_dev=0.028
N9	A	0, 0.001, 0.031, 0.060, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.031 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.013, 0.049, 0.085, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.049 std_dev=0.036
N6	A	0, 0.012, 0.052, 0.091, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.052 std_dev=0.039
C8	A	0, 0.010, 0.058, 0.106, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.058 std_dev=0.048
C2'	A	0, 0.021, 0.203, 0.385, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.203 std_dev=0.182
O4'	A	0, -0.013, 0.193, 0.399, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.193 std_dev=0.206
C1'	B	0, 0.211, 0.434, 0.657, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.434 std_dev=0.223
C2'	B	0, 0.238, 0.485, 0.732, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.485 std_dev=0.247
C4'	B	0, 0.272, 0.545, 0.817, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.545 std_dev=0.273
N9	B	0, 0.211, 0.497, 0.784, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.497 std_dev=0.286
N3	B	0, 0.219, 0.510, 0.801, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.510 std_dev=0.291
C4	B	0, 0.215, 0.529, 0.843, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.529 std_dev=0.314
O2'	A	0, -0.060, 0.294, 0.649, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.294 std_dev=0.355
O4'	B	0, 0.179, 0.539, 0.900, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.539 std_dev=0.361
C3'	B	0, 0.233, 0.597, 0.962, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.597 std_dev=0.364
C8	B	0, 0.186, 0.588, 0.990, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.588 std_dev=0.402
C2	B	0, 0.212, 0.616, 1.021, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.616 std_dev=0.405
C5	B	0, 0.194, 0.631, 1.068, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.631 std_dev=0.437
N7	B	0, 0.176, 0.659, 1.142, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.659 std_dev=0.483
O2'	B	0, 0.132, 0.622, 1.111, 1.978 max_d=1.978 avg_d=0.622 std_dev=0.490
C4'	A	0, -0.112, 0.394, 0.900, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.394 std_dev=0.506
O5'	A	0, 0.032, 0.542, 1.051, 1.928 max_d=1.928 avg_d=0.542 std_dev=0.510
N1	B	0, 0.188, 0.708, 1.229, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.708 std_dev=0.520
C6	B	0, 0.176, 0.711, 1.246, 1.874 max_d=1.874 avg_d=0.711 std_dev=0.535
C5'	A	0, -0.019, 0.519, 1.058, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.519 std_dev=0.538
C5'	B	0, 0.128, 0.720, 1.312, 2.460 max_d=2.460 avg_d=0.720 std_dev=0.592
C3'	A	0, -0.193, 0.470, 1.133, 2.300 max_d=2.300 avg_d=0.470 std_dev=0.663
N6	B	0, 0.138, 0.811, 1.484, 2.313 max_d=2.313 avg_d=0.811 std_dev=0.673
O3'	B	0, 0.071, 0.878, 1.686, 3.064 max_d=3.064 avg_d=0.878 std_dev=0.808
O5'	B	0, 0.047, 0.889, 1.732, 3.023 max_d=3.023 avg_d=0.889 std_dev=0.843
OP2	B	0, 0.147, 1.010, 1.872, 3.294 max_d=3.294 avg_d=1.010 std_dev=0.863
OP2	A	0, -0.007, 0.892, 1.791, 3.409 max_d=3.409 avg_d=0.892 std_dev=0.899
P	B	0, 0.007, 1.018, 2.028, 3.801 max_d=3.801 avg_d=1.018 std_dev=1.011
P	A	0, -0.199, 0.885, 1.969, 3.964 max_d=3.964 avg_d=0.885 std_dev=1.084
O3'	A	0, -0.380, 0.763, 1.906, 3.879 max_d=3.879 avg_d=0.763 std_dev=1.143
OP1	B	0, 0.129, 1.281, 2.433, 4.208 max_d=4.208 avg_d=1.281 std_dev=1.152
OP1	A	0, -0.473, 1.078, 2.628, 5.488 max_d=5.488 avg_d=1.078 std_dev=1.551

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.24	0.01	0.06	0.22	0.12	0.22
C2	0.02	0.00	0.15	0.16	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.25	0.06	0.10	0.16	0.22	0.26
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.10	0.01	0.10	0.13	0.14	0.05	0.15	0.13	0.15	0.08	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.35	0.09	0.21
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.22	0.00	0.35	0.01	0.35	0.38	0.27	0.12	0.43	0.43	0.23	0.01	0.01	0.02	0.03	0.38	0.08	0.18
C4	0.01	0.01	0.10	0.22	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.23	0.11	0.03	0.10	0.11	0.18	0.18
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.14	0.20	0.09	0.03	0.19	0.21	0.10	0.24	0.01	0.00	0.01	0.34	0.09	0.21
C5	0.01	0.01	0.10	0.35	0.01	0.15	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.25	0.15	0.01	0.13	0.29	0.19	0.14
C5'	0.04	0.06	0.13	0.01	0.09	0.01	0.19	0.00	0.19	0.22	0.13	0.04	0.25	0.26	0.09	0.10	0.17	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.14	0.35	0.01	0.14	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.28	0.15	0.02	0.13	0.29	0.19	0.15
C8	0.01	0.01	0.05	0.38	0.00	0.20	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.18	0.24	0.06	0.15	0.39	0.18	0.15
N1	0.02	0.00	0.15	0.27	0.01	0.09	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.14	0.04	0.11	0.15	0.21	0.20
N3	0.02	0.00	0.13	0.12	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.30	0.06	0.09	0.20	0.20	0.27
N6	0.02	0.01	0.15	0.43	0.01	0.19	0.01	0.25	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.28	0.26	0.02	0.15	0.44	0.20	0.16
N7	0.01	0.01	0.08	0.43	0.01	0.21	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.23	0.29	0.04	0.16	0.49	0.20	0.18
N9	0.00	0.01	0.04	0.23	0.00	0.10	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.16	0.04	0.01	0.10	0.11	0.15	0.14
O2'	0.02	0.25	0.01	0.01	0.23	0.24	0.25	0.10	0.28	0.18	0.28	0.22	0.28	0.23	0.16	0.00	0.07	0.16	0.25	0.19	0.30	0.10
O3'	0.24	0.25	0.03	0.01	0.11	0.01	0.15	0.17	0.15	0.24	0.14	0.30	0.26	0.29	0.04	0.07	0.00	0.15	0.16	0.39	0.09	0.13
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.04	0.06	0.02	0.04	0.01	0.16	0.15	0.00	0.07	0.16	0.13	0.21
O5'	0.06	0.10	0.07	0.03	0.10	0.01	0.13	0.01	0.13	0.15	0.11	0.09	0.15	0.16	0.10	0.25	0.16	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.22	0.16	0.35	0.38	0.11	0.34	0.29	0.07	0.29	0.39	0.15	0.20	0.44	0.49	0.11	0.19	0.39	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.22	0.09	0.08	0.18	0.09	0.19	0.01	0.19	0.18	0.21	0.20	0.20	0.20	0.15	0.30	0.09	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.26	0.21	0.18	0.18	0.21	0.14	0.01	0.15	0.15	0.20	0.27	0.16	0.18	0.14	0.10	0.13	0.21	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.22	0.15	0.15	0.17	0.16	0.17	0.19	0.21	0.11	0.23	0.20	0.23	0.14	0.13	0.24	0.33	0.20	0.48	0.36	0.63	0.33
C2	0.12	0.14	0.14	0.15	0.16	0.14	0.25	0.11	0.28	0.22	0.22	0.11	0.33	0.27	0.16	0.37	0.56	0.13	0.28	0.54	0.41	0.15
C2'	0.14	0.25	0.13	0.12	0.17	0.14	0.17	0.20	0.22	0.10	0.25	0.22	0.23	0.13	0.12	0.20	0.38	0.16	0.49	0.36	0.62	0.35
C3'	0.19	0.21	0.19	0.29	0.17	0.26	0.15	0.42	0.18	0.10	0.18	0.22	0.23	0.16	0.14	0.18	0.13	0.24	0.64	0.31	0.75	0.48
C4	0.10	0.13	0.11	0.10	0.09	0.13	0.11	0.17	0.10	0.13	0.10	0.14	0.14	0.15	0.08	0.26	0.50	0.13	0.40	0.38	0.50	0.24
C4'	0.16	0.19	0.14	0.16	0.16	0.14	0.17	0.23	0.18	0.15	0.19	0.18	0.19	0.17	0.15	0.18	0.20	0.17	0.50	0.38	0.66	0.38
C5	0.08	0.10	0.07	0.13	0.09	0.13	0.13	0.21	0.12	0.17	0.10	0.09	0.15	0.17	0.10	0.20	0.63	0.16	0.42	0.31	0.47	0.26
C5'	0.15	0.21	0.15	0.26	0.18	0.18	0.19	0.38	0.20	0.15	0.21	0.20	0.21	0.18	0.16	0.16	0.10	0.15	0.67	0.32	0.79	0.60
C6	0.11	0.17	0.10	0.20	0.13	0.15	0.18	0.18	0.20	0.17	0.20	0.11	0.23	0.19	0.13	0.26	0.72	0.19	0.33	0.36	0.41	0.20
C8	0.12	0.18	0.11	0.11	0.20	0.15	0.24	0.31	0.22	0.25	0.19	0.18	0.24	0.28	0.18	0.15	0.46	0.17	0.61	0.22	0.61	0.46
N1	0.11	0.22	0.13	0.19	0.18	0.14	0.25	0.14	0.29	0.20	0.28	0.14	0.33	0.25	0.15	0.35	0.66	0.15	0.28	0.47	0.39	0.16
N3	0.13	0.13	0.13	0.12	0.11	0.14	0.17	0.11	0.15	0.19	0.10	0.14	0.20	0.22	0.13	0.33	0.48	0.14	0.32	0.51	0.46	0.17
N6	0.16	0.24	0.14	0.28	0.16	0.18	0.19	0.22	0.23	0.19	0.25	0.18	0.25	0.19	0.16	0.24	0.85	0.26	0.33	0.33	0.38	0.21
N7	0.11	0.12	0.08	0.11	0.15	0.15	0.19	0.30	0.16	0.25	0.12	0.13	0.18	0.25	0.18	0.13	0.61	0.23	0.54	0.24	0.51	0.39
N9	0.14	0.19	0.12	0.12	0.16	0.15	0.17	0.22	0.18	0.12	0.19	0.19	0.20	0.17	0.11	0.21	0.42	0.15	0.49	0.29	0.59	0.34
O2'	0.23	0.22	0.20	0.13	0.18	0.18	0.16	0.20	0.19	0.14	0.21	0.21	0.22	0.15	0.17	0.38	0.50	0.21	0.51	0.33	0.78	0.45
O3'	0.19	0.44	0.20	0.10	0.39	0.13	0.55	0.25	0.64	0.41	0.56	0.35	0.77	0.59	0.31	0.26	0.31	0.14	0.43	0.52	0.63	0.28
O4'	0.22	0.19	0.18	0.13	0.16	0.18	0.16	0.16	0.20	0.14	0.20	0.18	0.23	0.14	0.17	0.25	0.27	0.25	0.46	0.36	0.63	0.34
O5'	0.23	0.20	0.21	0.14	0.19	0.18	0.21	0.15	0.23	0.19	0.22	0.19	0.27	0.21	0.19	0.18	0.22	0.26	0.48	0.29	0.57	0.40
OP1	0.30	0.22	0.37	0.69	0.21	0.60	0.25	0.88	0.31	0.22	0.27	0.21	0.40	0.27	0.23	0.43	0.62	0.40	1.01	0.48	1.00	0.98
OP2	0.42	0.31	0.41	0.25	0.33	0.37	0.31	0.27	0.30	0.35	0.30	0.33	0.31	0.32	0.36	0.35	0.30	0.46	0.31	0.39	0.46	0.24
P	0.30	0.34	0.27	0.18	0.34	0.16	0.37	0.20	0.38	0.36	0.36	0.33	0.40	0.39	0.33	0.22	0.19	0.26	0.43	0.29	0.53	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.00	0.12	0.39	0.29	0.13
C2	0.01	0.00	0.05	0.12	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.45	0.19	0.02	0.23	0.54	0.31	0.15
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.11	0.06	0.07	0.05	0.05	0.07	0.08	0.04	0.00	0.03	0.01	0.21	0.37	0.26	0.22
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.20	0.00	0.32	0.03	0.31	0.37	0.22	0.07	0.37	0.41	0.22	0.02	0.01	0.02	0.13	0.39	0.21	0.15
C4	0.01	0.01	0.04	0.20	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.31	0.11	0.01	0.26	0.50	0.31	0.12
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.13	0.18	0.09	0.02	0.16	0.19	0.09	0.23	0.01	0.00	0.02	0.24	0.33	0.05
C5	0.00	0.01	0.06	0.32	0.00	0.14	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.28	0.18	0.01	0.37	0.52	0.48	0.19
C5'	0.03	0.10	0.11	0.03	0.12	0.01	0.20	0.00	0.20	0.26	0.15	0.08	0.25	0.28	0.13	0.11	0.17	0.02	0.01	0.29	0.33	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.31	0.01	0.13	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.35	0.20	0.01	0.36	0.55	0.53	0.21
C8	0.00	0.01	0.07	0.37	0.01	0.18	0.01	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.10	0.21	0.01	0.44	0.42	0.44	0.20
N1	0.01	0.00	0.05	0.22	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.42	0.15	0.01	0.29	0.56	0.43	0.18
N3	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.43	0.23	0.02	0.20	0.51	0.25	0.14
N6	0.01	0.01	0.07	0.37	0.01	0.16	0.01	0.25	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.33	0.27	0.02	0.42	0.56	0.67	0.28
N7	0.01	0.01	0.08	0.41	0.01	0.19	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.17	0.28	0.01	0.48	0.48	0.59	0.27
N9	0.00	0.01	0.04	0.22	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.08	0.01	0.26	0.44	0.28	0.09
O2'	0.01	0.45	0.00	0.02	0.31	0.23	0.28	0.11	0.35	0.10	0.42	0.43	0.33	0.17	0.15	0.00	0.10	0.16	0.10	0.34	0.27	0.13
O3'	0.24	0.19	0.03	0.01	0.11	0.01	0.18	0.17	0.20	0.21	0.15	0.23	0.27	0.28	0.08	0.10	0.00	0.16	0.27	0.71	0.22	0.36
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.16	0.16	0.00	0.12	0.34	0.40	0.15
O5'	0.12	0.23	0.21	0.13	0.26	0.02	0.37	0.01	0.36	0.44	0.29	0.20	0.42	0.48	0.26	0.10	0.27	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.39	0.54	0.37	0.39	0.50	0.24	0.52	0.29	0.55	0.42	0.56	0.51	0.56	0.48	0.44	0.34	0.71	0.34	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.31	0.26	0.21	0.31	0.33	0.48	0.33	0.53	0.44	0.43	0.25	0.67	0.59	0.28	0.27	0.22	0.40	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.15	0.22	0.15	0.12	0.05	0.19	0.01	0.21	0.20	0.18	0.14	0.28	0.27	0.09	0.13	0.36	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00