Doublet Group distance statistics: 52737

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.009, 0.022, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.011, 0.027, 0.043, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N1	B	0, 0.132, 0.321, 0.511, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.321 std_dev=0.190
C6	B	0, 0.124, 0.317, 0.509, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.317 std_dev=0.192
C5	B	0, 0.096, 0.337, 0.578, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.337 std_dev=0.241
N6	B	0, 0.152, 0.397, 0.642, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.397 std_dev=0.245
C2	B	0, 0.117, 0.378, 0.639, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.378 std_dev=0.261
C4	B	0, 0.077, 0.343, 0.610, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.343 std_dev=0.266
N3	B	0, 0.077, 0.384, 0.691, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.384 std_dev=0.307
N9	B	0, 0.074, 0.407, 0.741, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.407 std_dev=0.334
N7	B	0, 0.090, 0.434, 0.777, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.434 std_dev=0.343
C8	B	0, 0.081, 0.455, 0.829, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.455 std_dev=0.374
C1'	B	0, 0.083, 0.481, 0.879, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.481 std_dev=0.398
O4'	B	0, 0.099, 0.519, 0.938, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.519 std_dev=0.420
OP2	B	0, 0.318, 0.818, 1.318, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.818 std_dev=0.500
C2'	B	0, 0.076, 0.607, 1.137, 1.862 max_d=1.862 avg_d=0.607 std_dev=0.530
C4'	B	0, 0.083, 0.638, 1.192, 2.066 max_d=2.066 avg_d=0.638 std_dev=0.554
O2'	B	0, 0.141, 0.714, 1.286, 2.067 max_d=2.067 avg_d=0.714 std_dev=0.572
C3'	B	0, 0.095, 0.698, 1.302, 2.210 max_d=2.210 avg_d=0.698 std_dev=0.603
C5'	B	0, 0.095, 0.724, 1.354, 2.350 max_d=2.350 avg_d=0.724 std_dev=0.629
O5'	B	0, 0.140, 0.778, 1.416, 2.371 max_d=2.371 avg_d=0.778 std_dev=0.638
P	B	0, 0.090, 0.777, 1.464, 2.513 max_d=2.513 avg_d=0.777 std_dev=0.687
O3'	B	0, 0.129, 0.860, 1.590, 2.696 max_d=2.696 avg_d=0.860 std_dev=0.731
O4'	A	0, -0.447, 0.343, 1.134, 2.579 max_d=2.579 avg_d=0.343 std_dev=0.791
C2'	A	0, -0.490, 0.381, 1.251, 2.841 max_d=2.841 avg_d=0.381 std_dev=0.871
O2'	A	0, -0.526, 0.485, 1.496, 3.336 max_d=3.336 avg_d=0.485 std_dev=1.011
OP1	B	0, -0.198, 0.821, 1.840, 3.602 max_d=3.602 avg_d=0.821 std_dev=1.019
C4'	A	0, -0.652, 0.517, 1.685, 3.817 max_d=3.817 avg_d=0.517 std_dev=1.168
C3'	A	0, -0.769, 0.577, 1.924, 4.382 max_d=4.382 avg_d=0.577 std_dev=1.347
O3'	A	0, -1.086, 0.845, 2.777, 6.302 max_d=6.302 avg_d=0.845 std_dev=1.931
C5'	A	0, -1.155, 0.882, 2.920, 6.641 max_d=6.641 avg_d=0.882 std_dev=2.037
O5'	A	0, -1.458, 1.029, 3.515, 8.059 max_d=8.059 avg_d=1.029 std_dev=2.487
OP1	A	0, -1.475, 1.520, 4.516, 9.895 max_d=9.895 avg_d=1.520 std_dev=2.996
P	A	0, -1.692, 1.431, 4.555, 10.224 max_d=10.224 avg_d=1.431 std_dev=3.123
OP2	A	0, -1.989, 1.705, 5.399, 12.083 max_d=12.083 avg_d=1.705 std_dev=3.694

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.70	0.11	0.25
C2	0.02	0.00	0.34	0.07	0.00	0.46	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.51	0.09	0.52	0.80	2.05	1.38	1.52
C2'	0.00	0.34	0.00	0.00	0.18	0.01	0.09	0.01	0.17	0.16	0.28	0.33	0.12	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.47	0.32	0.07
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.05	0.08	0.03	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.25	0.22	0.52	0.17
C4	0.01	0.00	0.18	0.04	0.00	0.22	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.05	0.27	0.17	1.22	0.51	0.68
C4'	0.01	0.46	0.01	0.00	0.22	0.00	0.10	0.00	0.20	0.22	0.36	0.44	0.13	0.13	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.34	0.15	0.13
C5	0.01	0.00	0.09	0.02	0.00	0.10	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.06	0.12	0.17	0.87	0.19	0.34
C5'	0.02	0.89	0.01	0.01	0.41	0.00	0.22	0.00	0.42	0.34	0.72	0.81	0.31	0.18	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.22	0.01
C6	0.01	0.00	0.17	0.03	0.00	0.20	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.08	0.23	0.12	1.17	0.51	0.64
C8	0.01	0.00	0.16	0.06	0.00	0.22	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.03	0.27	0.79	0.24	0.57	0.47
N1	0.02	0.00	0.28	0.05	0.00	0.36	0.00	0.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.40	0.09	0.40	0.52	1.70	1.07	1.18
N3	0.02	0.00	0.33	0.08	0.00	0.44	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.48	0.08	0.54	0.73	1.92	1.18	1.36
N6	0.01	0.00	0.12	0.03	0.00	0.13	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.08	0.15	0.14	0.93	0.30	0.42
N7	0.00	0.00	0.07	0.05	0.00	0.13	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.04	0.14	0.67	0.31	0.44	0.35
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.26	0.67	0.07	0.17
O2'	0.01	0.51	0.00	0.02	0.24	0.04	0.12	0.05	0.24	0.21	0.40	0.48	0.17	0.11	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.53	0.26	0.16
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.08	0.03	0.09	0.08	0.08	0.04	0.02	0.03	0.00	0.01	0.20	0.18	0.72	0.30
O4'	0.00	0.52	0.00	0.01	0.27	0.00	0.12	0.01	0.23	0.27	0.40	0.54	0.15	0.14	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.69	0.19	0.35
O5'	0.10	0.80	0.17	0.25	0.17	0.01	0.17	0.01	0.12	0.79	0.52	0.73	0.14	0.67	0.26	0.04	0.20	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.70	2.05	0.47	0.22	1.22	0.34	0.87	0.04	1.17	0.24	1.70	1.92	0.93	0.31	0.67	0.53	0.18	0.69	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	1.38	0.32	0.52	0.51	0.15	0.19	0.22	0.51	0.57	1.07	1.18	0.30	0.44	0.07	0.26	0.72	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.25	1.52	0.07	0.17	0.68	0.13	0.34	0.01	0.64	0.47	1.18	1.36	0.42	0.35	0.17	0.16	0.30	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.21	0.32	0.31	0.22	0.34	0.16	0.34	0.15	0.19	0.17	0.24	0.14	0.14	0.25	0.36	0.34	0.33	0.28	0.60	0.23	0.14
C2	0.21	0.11	0.22	0.26	0.16	0.28	0.17	0.32	0.14	0.26	0.12	0.13	0.17	0.25	0.21	0.20	0.26	0.26	0.34	0.62	0.34	0.29
C2'	0.40	0.25	0.43	0.48	0.30	0.48	0.26	0.54	0.21	0.36	0.21	0.30	0.19	0.29	0.36	0.42	0.49	0.43	0.56	0.16	0.80	0.58
C3'	0.50	0.44	0.55	0.67	0.57	0.54	0.69	0.71	0.63	0.84	0.51	0.45	0.69	0.85	0.63	0.41	0.61	0.48	1.00	0.55	1.49	1.18
C4	0.22	0.17	0.22	0.23	0.17	0.25	0.12	0.27	0.12	0.18	0.14	0.18	0.12	0.13	0.19	0.22	0.24	0.24	0.27	0.53	0.33	0.17
C4'	0.26	0.31	0.26	0.17	0.33	0.30	0.54	0.16	0.59	0.50	0.45	0.26	0.75	0.69	0.27	0.47	0.26	0.28	0.29	0.11	1.01	0.59
C5	0.13	0.17	0.13	0.14	0.12	0.16	0.07	0.20	0.09	0.10	0.14	0.17	0.09	0.06	0.11	0.13	0.14	0.16	0.19	0.41	0.38	0.13
C5'	0.28	0.46	0.32	0.23	0.50	0.44	0.89	0.23	0.98	0.78	0.75	0.32	1.27	1.12	0.38	0.66	0.39	0.35	0.39	0.16	1.37	0.79
C6	0.12	0.12	0.11	0.14	0.09	0.17	0.07	0.21	0.05	0.14	0.10	0.11	0.07	0.11	0.12	0.09	0.13	0.17	0.21	0.42	0.40	0.16
C8	0.18	0.23	0.20	0.13	0.19	0.13	0.14	0.16	0.15	0.09	0.19	0.25	0.13	0.10	0.15	0.23	0.15	0.12	0.13	0.32	0.36	0.12
N1	0.16	0.10	0.15	0.19	0.13	0.21	0.14	0.26	0.11	0.21	0.10	0.10	0.14	0.20	0.17	0.13	0.18	0.20	0.28	0.52	0.38	0.22
N3	0.25	0.14	0.26	0.29	0.18	0.31	0.16	0.35	0.13	0.27	0.13	0.16	0.15	0.22	0.24	0.25	0.30	0.29	0.36	0.65	0.31	0.29
N6	0.13	0.16	0.12	0.14	0.12	0.16	0.09	0.19	0.06	0.13	0.11	0.15	0.04	0.11	0.13	0.10	0.13	0.17	0.19	0.35	0.44	0.15
N7	0.10	0.22	0.13	0.09	0.15	0.12	0.11	0.17	0.13	0.08	0.18	0.23	0.11	0.08	0.10	0.12	0.09	0.13	0.15	0.29	0.40	0.14
N9	0.25	0.20	0.25	0.23	0.20	0.25	0.14	0.25	0.14	0.14	0.17	0.23	0.13	0.11	0.21	0.28	0.25	0.24	0.21	0.48	0.31	0.11
O2'	0.31	0.19	0.33	0.36	0.19	0.40	0.15	0.43	0.17	0.15	0.17	0.22	0.22	0.15	0.21	0.39	0.40	0.34	0.35	0.21	0.45	0.32
O3'	0.73	0.53	0.87	1.07	0.70	0.93	0.79	1.18	0.70	1.01	0.58	0.57	0.74	0.97	0.81	0.70	1.06	0.75	1.48	1.17	1.93	1.77
O4'	0.58	0.22	0.64	0.64	0.22	0.78	0.23	0.69	0.31	0.14	0.25	0.29	0.46	0.27	0.30	0.79	0.74	0.70	0.37	0.63	0.34	0.09
O5'	0.66	0.17	0.72	0.57	0.12	0.78	0.50	0.47	0.62	0.40	0.34	0.33	0.99	0.77	0.16	1.15	0.75	0.72	0.19	0.11	1.26	0.66
OP1	0.45	0.51	0.71	0.72	0.50	0.86	1.04	0.62	1.25	0.76	0.97	0.24	1.67	1.22	0.31	1.21	1.06	0.56	0.29	0.12	1.01	0.56
OP2	0.54	0.31	0.65	0.57	0.30	0.80	0.84	0.55	1.07	0.59	0.76	0.16	1.54	1.06	0.13	1.15	0.83	0.64	0.16	0.13	1.21	0.59
P	0.49	0.30	0.63	0.55	0.32	0.76	0.90	0.49	1.09	0.67	0.76	0.07	1.54	1.14	0.15	1.14	0.82	0.59	0.26	0.08	1.26	0.67

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.19	0.15	0.05
C2	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.01	0.02	0.20	0.32	0.04
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.05	0.04	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.08	0.13	0.02
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.04	0.07	0.05	0.09	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.16	0.04
C4	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.03	0.19	0.31	0.04
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.10	0.08	0.02
C5	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.04	0.18	0.40	0.05
C5'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.04	0.13	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.04	0.19	0.42	0.05
C8	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.18	0.35	0.05
N1	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.01	0.03	0.19	0.38	0.05
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.02	0.20	0.28	0.04
N6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.11	0.02	0.05	0.18	0.47	0.06
N7	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.04	0.17	0.44	0.05
N9	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.19	0.27	0.05
O2'	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.12	0.11	0.03
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.01	0.08	0.03	0.10	0.05	0.09	0.06	0.11	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.13	0.28	0.07
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.23	0.12	0.09
O5'	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.03	0.02	0.05	0.04	0.03	0.02	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.19	0.20	0.08	0.05	0.19	0.10	0.18	0.04	0.19	0.18	0.19	0.20	0.18	0.17	0.19	0.12	0.13	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.32	0.13	0.16	0.31	0.08	0.40	0.13	0.42	0.35	0.38	0.28	0.47	0.44	0.27	0.11	0.28	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.04	0.02	0.04	0.04	0.02	0.05	0.01	0.05	0.05	0.05	0.04	0.06	0.05	0.05	0.03	0.07	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00