Doublet Group distance statistics: 52738

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N6	A	0, 0.014, 0.029, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.029 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.022, 0.040, 0.058, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.040 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.023, 0.042, 0.061, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.042 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.022, 0.042, 0.061, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.042 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.026, 0.046, 0.066, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.046 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.025, 0.047, 0.070, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.047 std_dev=0.023
C2	A	0, 0.030, 0.056, 0.082, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.056 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.029, 0.057, 0.084, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.057 std_dev=0.027
C2'	A	0, 0.149, 0.297, 0.446, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.297 std_dev=0.149
O4'	A	0, 0.091, 0.248, 0.405, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.248 std_dev=0.157
O2'	A	0, 0.177, 0.427, 0.678, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.427 std_dev=0.251
C4'	A	0, 0.151, 0.456, 0.761, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.456 std_dev=0.305
C3'	A	0, 0.152, 0.503, 0.854, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.503 std_dev=0.351
P	A	0, 0.449, 0.822, 1.195, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.822 std_dev=0.373
C5'	A	0, 0.305, 0.694, 1.083, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.694 std_dev=0.389
C2	B	0, 0.280, 0.672, 1.064, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.672 std_dev=0.392
N1	B	0, 0.259, 0.668, 1.076, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.668 std_dev=0.409
N3	B	0, 0.318, 0.750, 1.182, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.750 std_dev=0.432
OP1	A	0, 0.535, 1.002, 1.470, 1.524 max_d=1.524 avg_d=1.002 std_dev=0.468
C4	B	0, 0.338, 0.814, 1.290, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.814 std_dev=0.476
C6	B	0, 0.251, 0.743, 1.234, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.743 std_dev=0.491
C5	B	0, 0.296, 0.803, 1.310, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.803 std_dev=0.507
O3'	A	0, 0.260, 0.775, 1.290, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.775 std_dev=0.515
O5'	A	0, 0.209, 0.737, 1.265, 1.705 max_d=1.705 avg_d=0.737 std_dev=0.528
N9	B	0, 0.401, 0.936, 1.471, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.936 std_dev=0.535
N7	B	0, 0.342, 0.920, 1.498, 1.656 max_d=1.656 avg_d=0.920 std_dev=0.578
C8	B	0, 0.385, 0.965, 1.544, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.965 std_dev=0.579
N6	B	0, 0.214, 0.794, 1.375, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.794 std_dev=0.581
C1'	B	0, 0.462, 1.043, 1.624, 1.621 max_d=1.621 avg_d=1.043 std_dev=0.581
C3'	B	0, 0.526, 1.127, 1.727, 1.680 max_d=1.680 avg_d=1.127 std_dev=0.600
C2'	B	0, 0.502, 1.103, 1.705, 1.816 max_d=1.816 avg_d=1.103 std_dev=0.602
C4'	B	0, 0.534, 1.151, 1.769, 1.715 max_d=1.715 avg_d=1.151 std_dev=0.618
O4'	B	0, 0.509, 1.127, 1.746, 1.778 max_d=1.778 avg_d=1.127 std_dev=0.619
O3'	B	0, 0.564, 1.270, 1.975, 2.133 max_d=2.133 avg_d=1.270 std_dev=0.706
C5'	B	0, 0.425, 1.166, 1.908, 2.043 max_d=2.043 avg_d=1.166 std_dev=0.742
OP2	A	0, 0.194, 0.979, 1.764, 2.609 max_d=2.609 avg_d=0.979 std_dev=0.785
O2'	B	0, 0.432, 1.231, 2.030, 2.723 max_d=2.723 avg_d=1.231 std_dev=0.799
P	B	0, 0.591, 1.437, 2.284, 2.383 max_d=2.383 avg_d=1.437 std_dev=0.847
O5'	B	0, 0.415, 1.293, 2.172, 2.669 max_d=2.669 avg_d=1.293 std_dev=0.878
OP2	B	0, 0.761, 2.047, 3.332, 3.743 max_d=3.743 avg_d=2.047 std_dev=1.285
OP1	B	0, 0.354, 1.645, 2.935, 4.170 max_d=4.170 avg_d=1.645 std_dev=1.290

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.16	0.11	0.59	0.16
C2	0.03	0.00	0.13	0.21	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.24	0.04	0.39	0.17	0.25	0.15
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.07	0.03	0.06	0.02	0.07	0.08	0.10	0.14	0.07	0.07	0.04	0.00	0.05	0.02	0.26	0.35	0.68	0.28
C3'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.18	0.00	0.23	0.02	0.24	0.25	0.22	0.18	0.27	0.27	0.16	0.04	0.01	0.01	0.32	0.41	0.51	0.24
C4	0.02	0.01	0.07	0.18	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.18	0.02	0.41	0.18	0.29	0.15
C4'	0.00	0.07	0.03	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.11	0.17	0.08	0.06	0.14	0.17	0.08	0.19	0.04	0.00	0.03	0.17	0.49	0.12
C5	0.01	0.01	0.06	0.23	0.00	0.12	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.24	0.02	0.53	0.28	0.23	0.30
C5'	0.01	0.10	0.02	0.02	0.11	0.01	0.19	0.00	0.18	0.24	0.14	0.08	0.22	0.26	0.11	0.15	0.06	0.01	0.01	0.25	0.37	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.24	0.01	0.11	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.25	0.02	0.54	0.30	0.23	0.33
C8	0.01	0.02	0.08	0.25	0.01	0.17	0.01	0.24	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.26	0.04	0.52	0.27	0.31	0.25
N1	0.03	0.00	0.10	0.22	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.24	0.03	0.48	0.24	0.18	0.25
N3	0.03	0.01	0.14	0.18	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.21	0.05	0.34	0.14	0.35	0.09
N6	0.01	0.01	0.07	0.27	0.01	0.14	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.19	0.29	0.02	0.60	0.39	0.36	0.44
N7	0.01	0.01	0.07	0.27	0.01	0.17	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.10	0.29	0.03	0.59	0.36	0.33	0.39
N9	0.01	0.01	0.04	0.16	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.15	0.01	0.36	0.14	0.38	0.09
O2'	0.03	0.25	0.00	0.04	0.15	0.19	0.15	0.15	0.19	0.06	0.23	0.22	0.19	0.10	0.06	0.00	0.08	0.16	0.11	0.21	0.70	0.20
O3'	0.02	0.24	0.05	0.01	0.18	0.04	0.24	0.06	0.25	0.26	0.24	0.21	0.29	0.29	0.15	0.08	0.00	0.03	0.30	0.50	0.50	0.28
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.16	0.03	0.00	0.11	0.10	0.66	0.30
O5'	0.16	0.39	0.26	0.32	0.41	0.03	0.53	0.01	0.54	0.52	0.48	0.34	0.60	0.59	0.36	0.11	0.30	0.11	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.11	0.17	0.35	0.41	0.18	0.17	0.28	0.25	0.30	0.27	0.24	0.14	0.39	0.36	0.14	0.21	0.50	0.10	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.59	0.25	0.68	0.51	0.29	0.49	0.23	0.37	0.23	0.31	0.18	0.35	0.36	0.33	0.38	0.70	0.50	0.66	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.15	0.28	0.24	0.15	0.12	0.30	0.02	0.33	0.25	0.25	0.09	0.44	0.39	0.09	0.20	0.28	0.30	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.38	0.18	0.36	0.25	0.16	0.28	0.15	0.17	0.27	0.08	0.21	0.25	0.44	0.19	0.23	0.50	0.26	0.31	0.21	0.58	1.23	0.58
C2	0.45	0.44	0.49	0.43	0.42	0.39	0.33	0.32	0.29	0.36	0.32	0.48	0.36	0.33	0.41	0.56	0.43	0.38	0.32	0.49	1.57	0.69
C2'	0.36	0.15	0.32	0.20	0.13	0.25	0.15	0.17	0.27	0.10	0.17	0.23	0.48	0.25	0.19	0.48	0.21	0.31	0.31	0.70	1.37	0.67
C3'	0.51	0.26	0.48	0.32	0.24	0.38	0.15	0.18	0.25	0.17	0.21	0.34	0.43	0.20	0.31	0.66	0.35	0.45	0.15	0.52	1.24	0.62
C4	0.43	0.30	0.48	0.37	0.31	0.34	0.15	0.22	0.18	0.23	0.12	0.41	0.41	0.19	0.33	0.60	0.39	0.33	0.19	0.46	1.33	0.59
C4'	0.58	0.31	0.56	0.42	0.34	0.46	0.27	0.24	0.30	0.29	0.27	0.39	0.40	0.28	0.41	0.72	0.46	0.51	0.17	0.50	1.00	0.51
C5	0.42	0.31	0.52	0.41	0.29	0.34	0.16	0.21	0.21	0.20	0.14	0.42	0.41	0.19	0.31	0.66	0.45	0.29	0.15	0.41	1.22	0.53
C5'	0.78	0.45	0.82	0.68	0.49	0.69	0.37	0.46	0.37	0.42	0.37	0.56	0.42	0.35	0.57	1.01	0.75	0.70	0.34	0.44	0.67	0.38
C6	0.42	0.40	0.53	0.45	0.34	0.36	0.24	0.25	0.24	0.26	0.23	0.46	0.39	0.24	0.34	0.64	0.48	0.31	0.22	0.40	1.31	0.58
C8	0.40	0.19	0.51	0.37	0.18	0.31	0.19	0.15	0.32	0.13	0.24	0.30	0.47	0.21	0.23	0.68	0.43	0.26	0.09	0.45	0.96	0.44
N1	0.44	0.46	0.51	0.45	0.40	0.38	0.32	0.30	0.30	0.33	0.33	0.49	0.38	0.31	0.39	0.60	0.46	0.35	0.29	0.44	1.48	0.65
N3	0.45	0.37	0.46	0.40	0.38	0.37	0.26	0.29	0.18	0.32	0.21	0.44	0.34	0.28	0.39	0.55	0.39	0.38	0.28	0.50	1.52	0.67
N6	0.40	0.38	0.55	0.47	0.32	0.36	0.23	0.25	0.25	0.24	0.24	0.43	0.38	0.23	0.32	0.67	0.52	0.28	0.21	0.36	1.24	0.55
N7	0.40	0.20	0.55	0.42	0.21	0.33	0.15	0.18	0.27	0.14	0.19	0.34	0.44	0.18	0.25	0.72	0.49	0.26	0.09	0.39	1.00	0.44
N9	0.41	0.20	0.45	0.32	0.20	0.30	0.12	0.16	0.26	0.13	0.18	0.32	0.45	0.17	0.26	0.59	0.35	0.30	0.13	0.49	1.18	0.53
O2'	0.31	0.11	0.28	0.36	0.16	0.37	0.24	0.47	0.26	0.31	0.16	0.16	0.44	0.39	0.23	0.33	0.36	0.36	0.63	1.02	1.49	0.84
O3'	0.46	0.21	0.40	0.24	0.20	0.34	0.17	0.14	0.26	0.19	0.19	0.29	0.45	0.26	0.27	0.60	0.27	0.43	0.20	0.53	1.34	0.69
O4'	0.52	0.30	0.52	0.38	0.34	0.38	0.31	0.19	0.34	0.27	0.30	0.37	0.41	0.29	0.38	0.65	0.41	0.41	0.14	0.51	0.97	0.44
O5'	0.37	0.41	0.45	0.26	0.27	0.20	0.23	0.29	0.29	0.22	0.33	0.42	0.34	0.28	0.24	0.67	0.33	0.19	0.44	0.74	1.07	0.93
OP1	0.47	0.49	0.59	0.53	0.41	0.50	0.38	0.44	0.42	0.31	0.45	0.50	0.44	0.34	0.38	0.76	0.62	0.40	0.48	0.67	0.38	0.51
OP2	0.15	0.42	0.15	0.17	0.40	0.21	0.58	0.38	0.62	0.54	0.53	0.34	0.74	0.66	0.36	0.39	0.21	0.28	0.56	0.70	1.12	0.97
P	0.25	0.44	0.34	0.27	0.35	0.28	0.41	0.39	0.46	0.35	0.45	0.42	0.52	0.45	0.28	0.54	0.34	0.26	0.53	0.78	0.82	0.82

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.28	0.42	0.20
C2	0.04	0.00	0.07	0.10	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.09	0.05	0.13	0.39	0.94	0.36
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05	0.08	0.03	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.14	0.26	0.11
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.08	0.10	0.09	0.09	0.09	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.07	0.08	0.24	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.12	0.39	0.90	0.35
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.04	0.03	0.07	0.07	0.03	0.04	0.04	0.00	0.02	0.11	0.19	0.08
C5	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.15	0.46	1.15	0.42
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.11	0.09	0.05	0.13	0.12	0.06	0.04	0.09	0.03	0.01	0.12	0.36	0.03
C6	0.02	0.01	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.16	0.48	1.23	0.44
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03	0.15	0.45	1.02	0.39
N1	0.03	0.00	0.05	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.08	0.04	0.15	0.44	1.12	0.41
N3	0.04	0.00	0.08	0.09	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.08	0.05	0.11	0.35	0.80	0.31
N6	0.02	0.01	0.03	0.09	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.09	0.02	0.18	0.52	1.37	0.48
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.10	0.03	0.16	0.49	1.25	0.45
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.10	0.37	0.76	0.31
O2'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.08	0.10	0.05	0.02	0.02	0.00	0.06	0.04	0.05	0.11	0.23	0.11
O3'	0.02	0.09	0.04	0.01	0.05	0.04	0.07	0.09	0.07	0.11	0.08	0.08	0.09	0.10	0.05	0.06	0.00	0.03	0.13	0.20	0.46	0.14
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.05	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.00	0.08	0.26	0.29	0.19
O5'	0.06	0.13	0.06	0.07	0.12	0.02	0.15	0.01	0.16	0.15	0.15	0.11	0.18	0.16	0.10	0.05	0.13	0.08	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.28	0.39	0.14	0.08	0.39	0.11	0.46	0.12	0.48	0.45	0.44	0.35	0.52	0.49	0.37	0.11	0.20	0.26	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.42	0.94	0.26	0.24	0.90	0.19	1.15	0.36	1.23	1.02	1.12	0.80	1.37	1.25	0.76	0.23	0.46	0.29	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.36	0.11	0.08	0.35	0.08	0.42	0.03	0.44	0.39	0.41	0.31	0.48	0.45	0.31	0.11	0.14	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00