Doublet Group distance statistics: 52739

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.024 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.014, 0.027, 0.041, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.027 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.002, 0.018, 0.034, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.018 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.015, 0.032, 0.049, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.032 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.012, 0.031, 0.050, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.031 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.010, 0.030, 0.050, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.030 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.010, 0.037, 0.064, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.037 std_dev=0.027
C2'	A	0, 0.034, 0.105, 0.176, 0.210 max_d=0.210 avg_d=0.105 std_dev=0.071
O4'	A	0, 0.034, 0.139, 0.245, 0.325 max_d=0.325 avg_d=0.139 std_dev=0.105
O2'	A	0, 0.056, 0.171, 0.286, 0.346 max_d=0.346 avg_d=0.171 std_dev=0.115
C3'	A	0, 0.118, 0.260, 0.403, 0.484 max_d=0.484 avg_d=0.260 std_dev=0.142
O3'	A	0, 0.122, 0.287, 0.452, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.287 std_dev=0.165
C4'	A	0, 0.140, 0.360, 0.580, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.360 std_dev=0.220
C1'	B	0, 0.174, 0.412, 0.651, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.412 std_dev=0.238
N9	B	0, 0.198, 0.460, 0.721, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.460 std_dev=0.262
N3	B	0, 0.201, 0.472, 0.743, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.472 std_dev=0.271
C4	B	0, 0.192, 0.466, 0.741, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.466 std_dev=0.275
C8	B	0, 0.251, 0.526, 0.801, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.526 std_dev=0.275
O4'	B	0, 0.136, 0.419, 0.702, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.419 std_dev=0.283
O2'	B	0, 0.293, 0.580, 0.867, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.580 std_dev=0.287
C2	B	0, 0.235, 0.523, 0.811, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.523 std_dev=0.288
C5	B	0, 0.210, 0.503, 0.795, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.503 std_dev=0.293
N7	B	0, 0.247, 0.544, 0.842, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.544 std_dev=0.298
N1	B	0, 0.246, 0.546, 0.846, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.546 std_dev=0.300
C2'	B	0, 0.246, 0.547, 0.848, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.547 std_dev=0.301
C6	B	0, 0.225, 0.532, 0.839, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.532 std_dev=0.307
N6	B	0, 0.237, 0.566, 0.895, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.566 std_dev=0.329
C4'	B	0, 0.213, 0.548, 0.882, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.548 std_dev=0.334
C3'	B	0, 0.257, 0.613, 0.969, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.613 std_dev=0.356
C5'	B	0, 0.277, 0.656, 1.036, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.656 std_dev=0.380
O3'	B	0, 0.305, 0.706, 1.107, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.706 std_dev=0.401
OP2	B	0, 0.386, 0.833, 1.280, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.833 std_dev=0.447
C5'	A	0, 0.239, 0.750, 1.261, 1.645 max_d=1.645 avg_d=0.750 std_dev=0.511
P	B	0, 0.311, 0.874, 1.437, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.874 std_dev=0.563
O5'	B	0, 0.184, 0.763, 1.341, 1.863 max_d=1.863 avg_d=0.763 std_dev=0.579
OP1	B	0, 0.392, 1.082, 1.771, 2.237 max_d=2.237 avg_d=1.082 std_dev=0.689
O5'	A	0, 0.309, 1.003, 1.697, 2.059 max_d=2.059 avg_d=1.003 std_dev=0.694
OP1	A	0, 0.711, 1.565, 2.420, 2.316 max_d=2.316 avg_d=1.565 std_dev=0.855
P	A	0, 0.489, 1.419, 2.349, 2.723 max_d=2.723 avg_d=1.419 std_dev=0.930
OP2	A	0, 0.846, 2.604, 4.362, 4.823 max_d=4.823 avg_d=2.604 std_dev=1.758

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.13	0.16	0.46	0.23
C2	0.02	0.00	0.05	0.09	0.01	0.02	0.01	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.08	0.05	0.25	0.48	0.79	0.45
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.05	0.04	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.03	0.02	0.26	0.14	0.53	0.26
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.04	0.12	0.09	0.11	0.08	0.14	0.11	0.07	0.01	0.01	0.02	0.43	0.29	0.59	0.35
C4	0.01	0.01	0.02	0.09	0.00	0.06	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.07	0.03	0.27	0.50	0.80	0.47
C4'	0.02	0.02	0.02	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.10	0.18	0.06	0.03	0.13	0.18	0.08	0.09	0.03	0.00	0.02	0.15	0.14	0.04
C5	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.12	0.00	0.39	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.10	0.03	0.35	0.71	0.98	0.61
C5'	0.08	0.21	0.05	0.04	0.27	0.01	0.39	0.00	0.38	0.46	0.30	0.17	0.45	0.49	0.28	0.08	0.11	0.02	0.01	0.17	0.07	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.12	0.01	0.10	0.01	0.38	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.04	0.35	0.75	1.01	0.63
C8	0.00	0.00	0.05	0.09	0.00	0.18	0.01	0.46	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.09	0.04	0.36	0.66	0.95	0.60
N1	0.02	0.00	0.04	0.11	0.01	0.06	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.04	0.30	0.64	0.92	0.55
N3	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.07	0.05	0.22	0.38	0.70	0.38
N6	0.02	0.01	0.03	0.14	0.01	0.13	0.01	0.45	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.04	0.39	0.89	1.12	0.71
N7	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.18	0.00	0.49	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.11	0.04	0.40	0.82	1.08	0.69
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.08	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.02	0.26	0.43	0.73	0.43
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.08	0.09	0.08	0.08	0.09	0.05	0.10	0.10	0.09	0.07	0.05	0.00	0.04	0.05	0.16	0.24	0.30	0.16
O3'	0.02	0.08	0.03	0.01	0.07	0.03	0.10	0.11	0.11	0.09	0.10	0.07	0.13	0.11	0.06	0.04	0.00	0.03	0.47	0.55	0.54	0.38
O4'	0.00	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.05	0.03	0.00	0.14	0.16	0.29	0.16
O5'	0.13	0.25	0.26	0.43	0.27	0.02	0.35	0.01	0.35	0.36	0.30	0.22	0.39	0.40	0.26	0.16	0.47	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.16	0.48	0.14	0.29	0.50	0.15	0.71	0.17	0.75	0.66	0.64	0.38	0.89	0.82	0.43	0.24	0.55	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.46	0.79	0.53	0.59	0.80	0.14	0.98	0.07	1.01	0.95	0.92	0.70	1.12	1.08	0.73	0.30	0.54	0.29	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.45	0.26	0.35	0.47	0.04	0.61	0.01	0.63	0.60	0.55	0.38	0.71	0.69	0.43	0.16	0.38	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.22	0.19	0.17	0.19	0.16	0.16	0.11	0.16	0.18	0.20	0.21	0.11	0.16	0.19	0.22	0.17	0.20	0.43	0.33	0.65	0.50
C2	0.15	0.14	0.18	0.16	0.13	0.12	0.15	0.08	0.13	0.17	0.08	0.14	0.17	0.19	0.14	0.20	0.16	0.11	0.42	0.28	0.48	0.44
C2'	0.20	0.18	0.19	0.17	0.16	0.18	0.13	0.16	0.12	0.18	0.15	0.17	0.09	0.16	0.18	0.22	0.17	0.20	0.45	0.38	0.67	0.55
C3'	0.22	0.20	0.21	0.19	0.19	0.18	0.18	0.15	0.17	0.20	0.19	0.19	0.17	0.19	0.20	0.23	0.19	0.21	0.49	0.42	0.73	0.59
C4	0.17	0.18	0.17	0.14	0.13	0.12	0.08	0.06	0.04	0.15	0.13	0.17	0.06	0.14	0.14	0.21	0.15	0.14	0.45	0.29	0.55	0.48
C4'	0.16	0.26	0.15	0.13	0.19	0.10	0.20	0.06	0.25	0.16	0.28	0.21	0.28	0.16	0.17	0.17	0.12	0.14	0.44	0.28	0.69	0.52
C5	0.16	0.18	0.16	0.12	0.10	0.10	0.04	0.06	0.07	0.12	0.13	0.17	0.11	0.13	0.11	0.21	0.13	0.12	0.48	0.32	0.52	0.49
C5'	0.18	0.12	0.14	0.16	0.07	0.23	0.07	0.26	0.16	0.14	0.18	0.08	0.26	0.07	0.13	0.16	0.17	0.24	0.57	0.22	0.79	0.60
C6	0.12	0.13	0.14	0.10	0.03	0.08	0.09	0.06	0.09	0.14	0.08	0.12	0.13	0.16	0.07	0.20	0.12	0.08	0.47	0.34	0.44	0.46
C8	0.21	0.21	0.18	0.15	0.17	0.16	0.12	0.12	0.14	0.14	0.18	0.20	0.13	0.11	0.17	0.23	0.15	0.20	0.48	0.35	0.62	0.54
N1	0.13	0.09	0.16	0.14	0.10	0.10	0.14	0.08	0.12	0.17	0.04	0.10	0.16	0.19	0.12	0.19	0.14	0.10	0.44	0.32	0.43	0.44
N3	0.16	0.17	0.18	0.16	0.14	0.12	0.13	0.07	0.10	0.17	0.11	0.16	0.12	0.18	0.15	0.20	0.16	0.13	0.42	0.26	0.53	0.45
N6	0.08	0.13	0.13	0.08	0.05	0.06	0.11	0.08	0.12	0.14	0.11	0.11	0.15	0.16	0.04	0.20	0.11	0.06	0.50	0.41	0.39	0.47
N7	0.20	0.20	0.18	0.14	0.15	0.14	0.11	0.10	0.13	0.11	0.17	0.20	0.14	0.11	0.15	0.23	0.15	0.17	0.51	0.36	0.56	0.54
N9	0.20	0.21	0.18	0.15	0.16	0.14	0.11	0.09	0.11	0.15	0.18	0.20	0.07	0.13	0.17	0.22	0.15	0.18	0.45	0.31	0.61	0.50
O2'	0.21	0.21	0.20	0.17	0.18	0.18	0.15	0.14	0.14	0.18	0.18	0.20	0.11	0.16	0.19	0.23	0.18	0.21	0.43	0.36	0.66	0.53
O3'	0.22	0.19	0.21	0.19	0.18	0.19	0.17	0.15	0.16	0.20	0.18	0.19	0.15	0.18	0.20	0.23	0.19	0.22	0.52	0.45	0.76	0.63
O4'	0.26	0.29	0.24	0.22	0.26	0.21	0.25	0.15	0.26	0.23	0.29	0.28	0.24	0.22	0.25	0.27	0.22	0.25	0.42	0.37	0.69	0.51
O5'	0.18	0.17	0.21	0.24	0.17	0.23	0.18	0.27	0.17	0.20	0.16	0.17	0.20	0.22	0.17	0.19	0.25	0.20	0.49	0.33	0.78	0.60
OP1	0.83	0.52	0.87	0.94	0.65	0.99	0.57	1.06	0.44	0.76	0.44	0.62	0.35	0.64	0.75	0.87	0.97	0.92	1.23	0.97	1.39	1.28
OP2	0.89	0.70	0.81	0.77	0.74	0.89	0.62	0.84	0.55	0.70	0.60	0.77	0.45	0.60	0.79	0.88	0.75	0.97	1.08	1.03	1.30	1.22
P	0.59	0.43	0.57	0.59	0.47	0.65	0.40	0.67	0.33	0.48	0.36	0.49	0.24	0.40	0.52	0.60	0.59	0.65	0.87	0.78	1.18	1.01

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.18	0.17	0.13
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.03	0.17	0.09	0.35	0.20
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.06	0.08	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.13	0.13	0.07
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.02	0.04	0.06	0.07	0.08	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.26	0.13	0.17	0.18
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.18	0.10	0.34	0.20
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.22	0.14	0.04
C5	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.20	0.12	0.43	0.24
C5'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.00	0.05	0.08	0.04	0.03	0.07	0.08	0.04	0.04	0.05	0.01	0.01	0.20	0.15	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.02	0.20	0.13	0.46	0.26
C8	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.21	0.13	0.38	0.23
N1	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.19	0.10	0.42	0.23
N3	0.02	0.00	0.08	0.08	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.02	0.16	0.11	0.30	0.18
N6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.22	0.17	0.52	0.29
N7	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.21	0.16	0.46	0.27
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.18	0.11	0.29	0.19
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.10	0.23	0.16	0.10
O3'	0.01	0.10	0.02	0.00	0.05	0.01	0.03	0.05	0.05	0.06	0.09	0.09	0.05	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.44	0.23	0.28	0.35
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.28	0.27	0.16	0.22
O5'	0.16	0.17	0.10	0.26	0.18	0.02	0.20	0.01	0.20	0.21	0.19	0.16	0.22	0.21	0.18	0.10	0.44	0.28	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.18	0.09	0.13	0.13	0.10	0.22	0.12	0.20	0.13	0.13	0.10	0.11	0.17	0.16	0.11	0.23	0.23	0.27	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.35	0.13	0.17	0.34	0.14	0.43	0.15	0.46	0.38	0.42	0.30	0.52	0.46	0.29	0.16	0.28	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.13	0.20	0.07	0.18	0.20	0.04	0.24	0.01	0.26	0.23	0.23	0.18	0.29	0.27	0.19	0.10	0.35	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00