Doublet Group distance statistics: 52743

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.014, 0.032, 0.050, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.032 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.013, 0.031, 0.050, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.031 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.014, 0.035, 0.056, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.035 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.009, 0.032, 0.054, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.032 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.020, 0.048, 0.075, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.048 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.020, 0.049, 0.078, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.049 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.022, 0.055, 0.088, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.055 std_dev=0.033
N6	A	0, 0.025, 0.063, 0.101, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.063 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.034, 0.084, 0.134, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.084 std_dev=0.050
C4	B	0, 0.219, 0.499, 0.779, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.499 std_dev=0.280
N1	B	0, 0.279, 0.585, 0.892, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.585 std_dev=0.306
C6	B	0, 0.263, 0.574, 0.884, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.574 std_dev=0.310
C5	B	0, 0.307, 0.626, 0.944, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.626 std_dev=0.319
N3	B	0, 0.317, 0.642, 0.966, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.642 std_dev=0.324
N9	B	0, 0.324, 0.651, 0.978, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.651 std_dev=0.327
C1'	B	0, 0.327, 0.676, 1.025, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.676 std_dev=0.349
O4'	B	0, 0.350, 0.718, 1.086, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.718 std_dev=0.368
C2	B	0, 0.328, 0.697, 1.067, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.697 std_dev=0.369
C2'	B	0, 0.297, 0.669, 1.040, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.669 std_dev=0.372
O2'	B	0, 0.322, 0.700, 1.078, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.700 std_dev=0.378
C4'	B	0, 0.376, 0.766, 1.156, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.766 std_dev=0.390
C5'	B	0, 0.373, 0.771, 1.170, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.771 std_dev=0.398
O5'	B	0, 0.390, 0.791, 1.192, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.791 std_dev=0.401
C3'	B	0, 0.360, 0.767, 1.173, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.767 std_dev=0.406
P	B	0, 0.393, 0.815, 1.237, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.815 std_dev=0.422
OP2	B	0, 0.425, 0.861, 1.296, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.861 std_dev=0.435
N6	B	0, 0.330, 0.780, 1.230, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.780 std_dev=0.450
C8	B	0, 0.424, 0.915, 1.406, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.915 std_dev=0.491
O3'	B	0, 0.376, 0.869, 1.362, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.869 std_dev=0.493
N7	B	0, 0.436, 0.947, 1.458, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.947 std_dev=0.511
OP1	B	0, 0.470, 0.995, 1.521, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.995 std_dev=0.526
C2'	A	0, 0.006, 0.550, 1.093, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.550 std_dev=0.544
O4'	A	0, 0.130, 0.714, 1.298, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.714 std_dev=0.584
O2'	A	0, 0.148, 0.867, 1.586, 1.734 max_d=1.734 avg_d=0.867 std_dev=0.719
C3'	A	0, 0.231, 1.095, 1.960, 2.109 max_d=2.109 avg_d=1.095 std_dev=0.865
C4'	A	0, 0.302, 1.194, 2.086, 2.236 max_d=2.236 avg_d=1.194 std_dev=0.892
OP2	A	0, 0.416, 1.333, 2.251, 2.450 max_d=2.450 avg_d=1.333 std_dev=0.917
O5'	A	0, 0.323, 1.317, 2.312, 2.644 max_d=2.644 avg_d=1.317 std_dev=0.994
O3'	A	0, 0.446, 1.480, 2.514, 2.709 max_d=2.709 avg_d=1.480 std_dev=1.034
P	A	0, 0.417, 1.477, 2.536, 2.716 max_d=2.716 avg_d=1.477 std_dev=1.060
C5'	A	0, 0.338, 1.488, 2.638, 2.849 max_d=2.849 avg_d=1.488 std_dev=1.150
OP1	A	0, 0.388, 1.773, 3.158, 3.611 max_d=3.611 avg_d=1.773 std_dev=1.385

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.09	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.24	0.38	0.39	0.27
C2	0.03	0.00	0.34	0.39	0.00	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.35	0.19	0.16	0.23	0.23	0.17
C2'	0.01	0.34	0.00	0.00	0.20	0.04	0.12	0.15	0.19	0.11	0.28	0.34	0.14	0.04	0.04	0.00	0.06	0.01	0.36	0.64	0.66	0.51
C3'	0.04	0.39	0.00	0.00	0.35	0.00	0.41	0.02	0.45	0.29	0.44	0.33	0.47	0.38	0.25	0.02	0.01	0.02	0.15	0.34	0.19	0.13
C4	0.02	0.00	0.20	0.35	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.30	0.09	0.17	0.24	0.27	0.19
C4'	0.02	0.08	0.04	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.14	0.20	0.10	0.07	0.17	0.20	0.10	0.28	0.04	0.00	0.03	0.21	0.14	0.06
C5	0.02	0.01	0.12	0.41	0.00	0.14	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.40	0.02	0.15	0.22	0.24	0.17
C5'	0.09	0.12	0.15	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.11	0.14	0.11	0.13	0.13	0.15	0.09	0.16	0.16	0.02	0.01	0.16	0.06	0.01
C6	0.03	0.00	0.19	0.45	0.01	0.14	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.46	0.06	0.14	0.23	0.22	0.16
C8	0.01	0.01	0.11	0.29	0.01	0.20	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.29	0.15	0.17	0.24	0.31	0.19
N1	0.03	0.00	0.28	0.44	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.43	0.14	0.14	0.22	0.21	0.16
N3	0.03	0.00	0.34	0.33	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.27	0.19	0.18	0.25	0.27	0.20
N6	0.03	0.01	0.14	0.47	0.01	0.17	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.21	0.51	0.02	0.15	0.25	0.23	0.18
N7	0.01	0.01	0.04	0.38	0.01	0.20	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.27	0.39	0.10	0.17	0.23	0.25	0.17
N9	0.01	0.00	0.04	0.25	0.00	0.10	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.14	0.20	0.01	0.19	0.28	0.33	0.22
O2'	0.03	0.07	0.00	0.02	0.10	0.28	0.19	0.16	0.17	0.25	0.10	0.08	0.21	0.27	0.14	0.00	0.08	0.19	0.27	0.50	0.65	0.40
O3'	0.08	0.35	0.06	0.01	0.30	0.04	0.40	0.16	0.46	0.29	0.43	0.27	0.51	0.39	0.20	0.08	0.00	0.05	0.30	0.16	0.07	0.15
O4'	0.00	0.19	0.01	0.02	0.09	0.00	0.02	0.02	0.06	0.15	0.14	0.19	0.02	0.10	0.01	0.19	0.05	0.00	0.11	0.19	0.18	0.08
O5'	0.24	0.16	0.36	0.15	0.17	0.03	0.15	0.01	0.14	0.17	0.14	0.18	0.15	0.17	0.19	0.27	0.30	0.11	0.00	0.04	0.01	0.01
OP1	0.38	0.23	0.64	0.34	0.24	0.21	0.22	0.16	0.23	0.24	0.22	0.25	0.25	0.23	0.28	0.50	0.16	0.19	0.04	0.00	0.02	0.00
OP2	0.39	0.23	0.66	0.19	0.27	0.14	0.24	0.06	0.22	0.31	0.21	0.27	0.23	0.25	0.33	0.65	0.07	0.18	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.27	0.17	0.51	0.13	0.19	0.06	0.17	0.01	0.16	0.19	0.16	0.20	0.18	0.17	0.22	0.40	0.15	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.37	0.19	0.14	0.03	0.15	0.16	0.17	0.20	0.27	0.30	0.23	0.29	0.29	0.15	0.25	0.19	0.17	0.21	0.24	0.11	0.21
C2	0.17	0.29	0.18	0.17	0.08	0.22	0.12	0.30	0.13	0.33	0.23	0.24	0.13	0.26	0.18	0.22	0.20	0.23	0.34	0.46	0.28	0.40
C2'	0.20	0.38	0.27	0.21	0.12	0.17	0.18	0.13	0.16	0.34	0.31	0.23	0.17	0.33	0.22	0.32	0.25	0.14	0.21	0.19	0.11	0.14
C3'	0.13	0.53	0.17	0.14	0.09	0.12	0.12	0.10	0.11	0.31	0.39	0.37	0.17	0.33	0.13	0.24	0.17	0.12	0.19	0.16	0.19	0.13
C4	0.16	0.35	0.21	0.14	0.07	0.13	0.16	0.17	0.17	0.36	0.29	0.24	0.19	0.34	0.20	0.24	0.17	0.14	0.23	0.29	0.13	0.24
C4'	0.38	0.73	0.43	0.40	0.39	0.36	0.22	0.33	0.25	0.23	0.56	0.62	0.12	0.19	0.32	0.50	0.44	0.33	0.32	0.32	0.22	0.31
C5	0.24	0.31	0.27	0.20	0.18	0.15	0.25	0.13	0.20	0.47	0.27	0.23	0.22	0.45	0.29	0.28	0.20	0.17	0.23	0.23	0.12	0.19
C5'	0.45	0.86	0.51	0.49	0.51	0.43	0.38	0.40	0.45	0.31	0.76	0.72	0.29	0.27	0.41	0.56	0.52	0.39	0.40	0.39	0.32	0.39
C6	0.29	0.28	0.29	0.21	0.19	0.17	0.22	0.13	0.17	0.49	0.24	0.23	0.18	0.41	0.31	0.32	0.20	0.20	0.24	0.27	0.12	0.21
C8	0.20	0.33	0.26	0.20	0.17	0.16	0.30	0.14	0.28	0.44	0.31	0.20	0.35	0.48	0.26	0.26	0.21	0.15	0.24	0.20	0.18	0.17
N1	0.21	0.27	0.22	0.12	0.12	0.12	0.14	0.19	0.15	0.38	0.23	0.23	0.15	0.30	0.21	0.28	0.14	0.12	0.27	0.41	0.21	0.33
N3	0.20	0.34	0.20	0.19	0.07	0.22	0.10	0.28	0.13	0.31	0.26	0.26	0.13	0.25	0.19	0.24	0.22	0.24	0.31	0.40	0.23	0.35
N6	0.38	0.25	0.37	0.31	0.25	0.29	0.26	0.21	0.19	0.55	0.22	0.24	0.22	0.47	0.38	0.39	0.29	0.34	0.31	0.21	0.16	0.18
N7	0.27	0.30	0.30	0.26	0.23	0.21	0.34	0.16	0.27	0.52	0.29	0.21	0.31	0.55	0.33	0.30	0.25	0.21	0.27	0.20	0.21	0.18
N9	0.16	0.36	0.21	0.15	0.09	0.13	0.21	0.14	0.22	0.35	0.31	0.22	0.27	0.37	0.20	0.25	0.18	0.13	0.22	0.23	0.12	0.20
O2'	0.14	0.41	0.22	0.16	0.11	0.14	0.19	0.20	0.26	0.29	0.39	0.24	0.31	0.29	0.16	0.28	0.24	0.17	0.23	0.30	0.14	0.26
O3'	0.24	0.60	0.33	0.26	0.19	0.20	0.07	0.16	0.09	0.28	0.42	0.47	0.13	0.28	0.18	0.45	0.35	0.18	0.22	0.21	0.17	0.17
O4'	0.44	0.65	0.44	0.41	0.38	0.43	0.20	0.42	0.13	0.27	0.41	0.60	0.15	0.21	0.36	0.51	0.43	0.43	0.39	0.39	0.27	0.39
O5'	0.41	0.79	0.47	0.43	0.48	0.37	0.40	0.34	0.46	0.38	0.71	0.66	0.36	0.38	0.40	0.52	0.46	0.35	0.41	0.39	0.32	0.38
OP1	0.43	0.81	0.48	0.41	0.46	0.37	0.36	0.32	0.42	0.40	0.71	0.67	0.30	0.38	0.40	0.56	0.45	0.36	0.39	0.35	0.29	0.33
OP2	0.35	0.59	0.37	0.33	0.33	0.31	0.29	0.28	0.27	0.47	0.52	0.48	0.18	0.46	0.35	0.42	0.34	0.32	0.41	0.36	0.40	0.34
P	0.35	0.70	0.38	0.34	0.38	0.30	0.30	0.27	0.35	0.36	0.63	0.56	0.24	0.35	0.33	0.44	0.36	0.30	0.34	0.31	0.27	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.15	0.04	0.08
C2	0.03	0.00	0.24	0.22	0.01	0.10	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.31	0.05	0.19	0.23	0.15	0.17
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.12	0.02	0.04	0.02	0.10	0.12	0.18	0.25	0.06	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.13	0.09	0.08
C3'	0.02	0.22	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.07	0.27	0.15	0.21	0.08	0.22	0.10	0.02	0.01	0.01	0.10	0.09	0.10	0.06
C4	0.02	0.01	0.12	0.08	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.10	0.03	0.14	0.16	0.09	0.13
C4'	0.01	0.10	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.15	0.06	0.10	0.06	0.12	0.05	0.10	0.03	0.00	0.01	0.14	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.09	0.02	0.14	0.13	0.13	0.17
C5'	0.03	0.10	0.02	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.09	0.16	0.08	0.09	0.12	0.15	0.06	0.08	0.08	0.03	0.01	0.15	0.02	0.04
C6	0.01	0.00	0.10	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.10	0.03	0.16	0.15	0.16	0.19
C8	0.02	0.01	0.12	0.27	0.00	0.15	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.08	0.30	0.02	0.12	0.14	0.15	0.16
N1	0.02	0.00	0.18	0.15	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.22	0.04	0.18	0.19	0.16	0.18
N3	0.03	0.00	0.25	0.21	0.00	0.10	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.27	0.29	0.05	0.18	0.23	0.12	0.15
N6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.10	0.11	0.04	0.16	0.15	0.21	0.23
N7	0.02	0.01	0.07	0.22	0.01	0.12	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.26	0.02	0.14	0.16	0.19	0.21
N9	0.01	0.01	0.01	0.10	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.09	0.01	0.10	0.12	0.04	0.10
O2'	0.01	0.28	0.00	0.02	0.14	0.10	0.08	0.08	0.14	0.08	0.22	0.27	0.10	0.03	0.02	0.00	0.06	0.06	0.02	0.08	0.06	0.01
O3'	0.01	0.31	0.01	0.01	0.10	0.03	0.09	0.08	0.10	0.30	0.22	0.29	0.11	0.26	0.09	0.06	0.00	0.02	0.20	0.10	0.18	0.16
O4'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.13	0.17	0.08	0.09
O5'	0.10	0.19	0.09	0.10	0.14	0.01	0.14	0.01	0.16	0.12	0.18	0.18	0.16	0.14	0.10	0.02	0.20	0.13	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.15	0.23	0.13	0.09	0.16	0.14	0.13	0.15	0.15	0.14	0.19	0.23	0.15	0.16	0.12	0.08	0.10	0.17	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.15	0.09	0.10	0.09	0.02	0.13	0.02	0.16	0.15	0.16	0.12	0.21	0.19	0.04	0.06	0.18	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.17	0.08	0.06	0.13	0.02	0.17	0.04	0.19	0.16	0.18	0.15	0.23	0.21	0.10	0.01	0.16	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00