Doublet Group distance statistics: 52745

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.025 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.009, 0.025, 0.040, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.011, 0.027, 0.042, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.027 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.013, 0.031, 0.049, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.031 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.014, 0.033, 0.052, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.033 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.013, 0.035, 0.057, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.035 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.017, 0.039, 0.062, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.039 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.018, 0.042, 0.067, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.042 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.016, 0.041, 0.066, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.041 std_dev=0.025
N7	B	0, 0.160, 0.355, 0.551, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.355 std_dev=0.196
C5	B	0, 0.163, 0.363, 0.564, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.363 std_dev=0.200
C6	B	0, 0.246, 0.529, 0.812, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.529 std_dev=0.283
N6	B	0, 0.300, 0.615, 0.930, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.615 std_dev=0.315
C8	B	0, 0.308, 0.653, 0.997, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.653 std_dev=0.345
C4	B	0, 0.347, 0.701, 1.055, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.701 std_dev=0.354
N9	B	0, 0.405, 0.822, 1.239, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.822 std_dev=0.417
N1	B	0, 0.437, 0.883, 1.328, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.883 std_dev=0.446
N3	B	0, 0.499, 1.004, 1.508, 1.354 max_d=1.354 avg_d=1.004 std_dev=0.505
C2	B	0, 0.518, 1.042, 1.566, 1.401 max_d=1.401 avg_d=1.042 std_dev=0.524
C4'	A	0, 0.564, 1.134, 1.705, 1.525 max_d=1.525 avg_d=1.134 std_dev=0.570
C1'	B	0, 0.604, 1.229, 1.854, 1.617 max_d=1.617 avg_d=1.229 std_dev=0.625
C2'	B	0, 0.611, 1.242, 1.872, 1.656 max_d=1.656 avg_d=1.242 std_dev=0.631
O4'	A	0, 0.647, 1.295, 1.944, 1.652 max_d=1.652 avg_d=1.295 std_dev=0.648
C2'	A	0, 0.658, 1.316, 1.974, 1.666 max_d=1.666 avg_d=1.316 std_dev=0.658
C3'	B	0, 0.607, 1.299, 1.992, 1.873 max_d=1.873 avg_d=1.299 std_dev=0.692
O4'	B	0, 0.701, 1.442, 2.184, 1.954 max_d=1.954 avg_d=1.442 std_dev=0.742
C4'	B	0, 0.755, 1.583, 2.412, 2.227 max_d=2.227 avg_d=1.583 std_dev=0.829
O3'	B	0, 0.710, 1.597, 2.484, 2.429 max_d=2.429 avg_d=1.597 std_dev=0.887
C5'	B	0, 0.805, 1.700, 2.596, 2.426 max_d=2.426 avg_d=1.700 std_dev=0.896
O2'	B	0, 0.877, 1.779, 2.681, 2.334 max_d=2.334 avg_d=1.779 std_dev=0.902
O2'	A	0, 1.087, 2.176, 3.266, 2.804 max_d=2.804 avg_d=2.176 std_dev=1.089
C3'	A	0, 1.091, 2.185, 3.280, 2.822 max_d=2.822 avg_d=2.185 std_dev=1.094
C5'	A	0, 1.424, 2.851, 4.278, 3.691 max_d=3.691 avg_d=2.851 std_dev=1.427
O5'	B	0, 1.426, 2.881, 4.335, 3.822 max_d=3.822 avg_d=2.881 std_dev=1.454
O3'	A	0, 1.665, 3.341, 5.017, 4.333 max_d=4.333 avg_d=3.341 std_dev=1.676
OP1	B	0, 1.798, 3.631, 5.464, 4.816 max_d=4.816 avg_d=3.631 std_dev=1.833
P	B	0, 2.039, 4.110, 6.181, 5.410 max_d=5.410 avg_d=4.110 std_dev=2.071
O5'	A	0, 2.086, 4.174, 6.262, 5.275 max_d=5.275 avg_d=4.174 std_dev=2.088
OP2	B	0, 2.641, 5.297, 7.953, 6.797 max_d=6.797 avg_d=5.297 std_dev=2.656
OP1	A	0, 2.971, 5.947, 8.922, 7.542 max_d=7.542 avg_d=5.947 std_dev=2.975
P	A	0, 3.022, 6.046, 9.069, 7.618 max_d=7.618 avg_d=6.046 std_dev=3.023
OP2	A	0, 3.398, 6.801, 10.203, 8.690 max_d=8.690 avg_d=6.801 std_dev=3.403

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.13	0.00	0.11	0.13	0.07	0.12
C2	0.03	0.00	0.07	0.04	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.22	0.08	0.05	0.34	0.53	0.30	0.46
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.07	0.04	0.08	0.02	0.06	0.02	0.00	0.01	0.02	0.17	0.12	0.18	0.20
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.12	0.19	0.06	0.04	0.15	0.20	0.10	0.01	0.00	0.00	0.06	0.15	0.11	0.06
C4	0.02	0.00	0.02	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.06	0.03	0.21	0.35	0.15	0.27
C4'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.05	0.13	0.02	0.05	0.07	0.12	0.05	0.12	0.02	0.00	0.00	0.14	0.06	0.02
C5	0.01	0.00	0.02	0.13	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.06	0.01	0.15	0.34	0.20	0.22
C5'	0.01	0.10	0.05	0.01	0.05	0.00	0.13	0.00	0.11	0.26	0.07	0.10	0.15	0.25	0.10	0.06	0.07	0.01	0.01	0.12	0.07	0.01
C6	0.02	0.00	0.01	0.12	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.06	0.02	0.21	0.44	0.21	0.30
C8	0.01	0.01	0.07	0.19	0.00	0.13	0.00	0.26	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.05	0.09	0.15	0.32	0.15
N1	0.02	0.00	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.06	0.04	0.29	0.52	0.24	0.41
N3	0.03	0.00	0.08	0.04	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.20	0.09	0.05	0.32	0.46	0.27	0.41
N6	0.02	0.01	0.02	0.15	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.08	0.02	0.18	0.44	0.26	0.28
N7	0.00	0.01	0.06	0.20	0.00	0.12	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.08	0.03	0.09	0.24	0.35	0.17
N9	0.00	0.00	0.02	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.06	0.01	0.11	0.19	0.12	0.14
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.16	0.12	0.15	0.06	0.18	0.06	0.21	0.20	0.18	0.10	0.08	0.00	0.03	0.08	0.02	0.15	0.08	0.05
O3'	0.13	0.08	0.01	0.00	0.06	0.02	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.09	0.08	0.08	0.06	0.03	0.00	0.06	0.07	0.40	0.11	0.14
O4'	0.00	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.05	0.02	0.03	0.01	0.08	0.06	0.00	0.09	0.12	0.05	0.09
O5'	0.11	0.34	0.17	0.06	0.21	0.00	0.15	0.01	0.21	0.09	0.29	0.32	0.18	0.09	0.11	0.02	0.07	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.13	0.53	0.12	0.15	0.35	0.14	0.34	0.12	0.44	0.15	0.52	0.46	0.44	0.24	0.19	0.15	0.40	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.30	0.18	0.11	0.15	0.06	0.20	0.07	0.21	0.32	0.24	0.27	0.26	0.35	0.12	0.08	0.11	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.46	0.20	0.06	0.27	0.02	0.22	0.01	0.30	0.15	0.41	0.41	0.28	0.17	0.14	0.05	0.14	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.17	0.07	0.09	0.05	0.07	0.03	0.07	0.10	0.12	0.17	0.11	0.09	0.11	0.06	0.06	0.10	0.08	0.47	0.42	0.60	0.52
C2	0.15	0.29	0.11	0.09	0.14	0.17	0.07	0.18	0.13	0.04	0.25	0.24	0.12	0.02	0.11	0.18	0.10	0.19	0.27	0.36	0.35	0.31
C2'	0.08	0.17	0.09	0.11	0.09	0.08	0.12	0.08	0.15	0.15	0.18	0.13	0.19	0.18	0.09	0.08	0.12	0.09	0.46	0.45	0.61	0.52
C3'	0.07	0.15	0.05	0.05	0.04	0.09	0.07	0.10	0.12	0.11	0.16	0.11	0.18	0.12	0.04	0.07	0.05	0.11	0.37	0.33	0.52	0.43
C4	0.09	0.23	0.06	0.05	0.11	0.12	0.07	0.14	0.14	0.05	0.22	0.18	0.11	0.05	0.07	0.10	0.06	0.14	0.33	0.35	0.38	0.35
C4'	0.09	0.16	0.10	0.11	0.08	0.11	0.07	0.12	0.12	0.12	0.17	0.12	0.13	0.09	0.08	0.09	0.11	0.11	0.30	0.18	0.43	0.34
C5	0.13	0.25	0.10	0.11	0.15	0.17	0.11	0.20	0.16	0.04	0.23	0.22	0.13	0.04	0.10	0.14	0.12	0.18	0.27	0.29	0.25	0.26
C5'	0.29	0.20	0.31	0.35	0.23	0.38	0.22	0.43	0.19	0.31	0.20	0.21	0.18	0.27	0.27	0.29	0.36	0.34	0.06	0.24	0.11	0.08
C6	0.18	0.30	0.15	0.16	0.18	0.23	0.12	0.25	0.17	0.06	0.25	0.27	0.15	0.04	0.14	0.20	0.18	0.24	0.22	0.27	0.18	0.21
C8	0.10	0.17	0.09	0.08	0.11	0.11	0.09	0.13	0.12	0.10	0.17	0.15	0.10	0.07	0.09	0.11	0.09	0.12	0.36	0.29	0.34	0.34
N1	0.19	0.32	0.15	0.14	0.17	0.22	0.10	0.23	0.15	0.06	0.25	0.27	0.14	0.03	0.13	0.22	0.16	0.24	0.22	0.31	0.24	0.24
N3	0.10	0.25	0.07	0.04	0.11	0.12	0.06	0.13	0.12	0.04	0.23	0.20	0.10	0.05	0.07	0.12	0.05	0.14	0.32	0.38	0.43	0.38
N6	0.22	0.30	0.20	0.22	0.19	0.29	0.13	0.31	0.18	0.08	0.25	0.29	0.16	0.06	0.16	0.25	0.26	0.30	0.21	0.24	0.15	0.17
N7	0.12	0.21	0.11	0.11	0.15	0.16	0.12	0.20	0.15	0.05	0.20	0.19	0.12	0.05	0.11	0.13	0.13	0.16	0.29	0.25	0.21	0.24
N9	0.07	0.18	0.06	0.06	0.08	0.08	0.06	0.10	0.12	0.09	0.18	0.14	0.09	0.08	0.06	0.08	0.06	0.10	0.39	0.36	0.45	0.41
O2'	0.26	0.32	0.30	0.33	0.29	0.24	0.33	0.22	0.35	0.32	0.34	0.29	0.40	0.36	0.28	0.27	0.35	0.22	0.65	0.67	0.83	0.74
O3'	0.24	0.27	0.29	0.34	0.27	0.24	0.34	0.24	0.34	0.36	0.31	0.24	0.41	0.40	0.28	0.24	0.37	0.20	0.70	0.68	0.87	0.78
O4'	0.10	0.19	0.12	0.13	0.13	0.12	0.16	0.14	0.20	0.15	0.22	0.15	0.23	0.17	0.12	0.10	0.14	0.11	0.28	0.17	0.39	0.31
O5'	0.23	0.11	0.28	0.38	0.16	0.38	0.19	0.48	0.16	0.31	0.14	0.10	0.20	0.29	0.23	0.24	0.41	0.29	0.17	0.41	0.20	0.22
OP1	0.20	0.16	0.22	0.34	0.04	0.36	0.05	0.48	0.12	0.24	0.18	0.10	0.19	0.19	0.15	0.22	0.39	0.27	0.30	0.57	0.39	0.39
OP2	0.65	0.26	0.72	0.85	0.45	0.88	0.42	1.01	0.28	0.66	0.21	0.37	0.23	0.56	0.59	0.69	0.91	0.75	0.73	1.06	0.79	0.83
P	0.34	0.05	0.40	0.54	0.19	0.55	0.21	0.69	0.13	0.41	0.09	0.10	0.16	0.35	0.31	0.36	0.59	0.43	0.42	0.73	0.47	0.51

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.18	0.32	0.12	0.19
C2	0.01	0.00	0.11	0.13	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.05	0.29	0.50	0.43	0.39
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.10	0.10	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.34	0.10	0.15
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.00	0.11	0.02	0.13	0.11	0.10	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.33	0.07	0.12
C4	0.01	0.00	0.07	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.03	0.30	0.47	0.40	0.38
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.19	0.12	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.03	0.36	0.50	0.54	0.46
C5'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.11	0.17	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.14	0.04	0.36	0.53	0.59	0.49
C8	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.36	0.41	0.45	0.41
N1	0.01	0.00	0.10	0.13	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.17	0.05	0.33	0.53	0.53	0.45
N3	0.01	0.00	0.10	0.11	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.13	0.05	0.26	0.47	0.35	0.34
N6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.15	0.03	0.39	0.54	0.68	0.54
N7	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.39	0.47	0.58	0.49
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.28	0.41	0.32	0.33
O2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.03	0.02	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.28	0.11	0.09
O3'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.10	0.02	0.11	0.02	0.14	0.02	0.17	0.13	0.15	0.07	0.04	0.03	0.00	0.02	0.14	0.27	0.05	0.03
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.16	0.23	0.04	0.12
O5'	0.18	0.29	0.07	0.02	0.30	0.01	0.36	0.01	0.36	0.36	0.33	0.26	0.39	0.39	0.28	0.04	0.14	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.32	0.50	0.34	0.33	0.47	0.19	0.50	0.11	0.53	0.41	0.53	0.47	0.54	0.47	0.41	0.28	0.27	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.43	0.10	0.07	0.40	0.12	0.54	0.17	0.59	0.45	0.53	0.35	0.68	0.58	0.32	0.11	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.39	0.15	0.12	0.38	0.03	0.46	0.01	0.49	0.41	0.45	0.34	0.54	0.49	0.33	0.09	0.03	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00