Doublet Group distance statistics: 52748

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N7	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, -0.001, 0.012, 0.025, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.012 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.001, 0.015, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.014
C1'	A	0, -0.001, 0.016, 0.032, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.002, 0.019, 0.036, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.017
C2	B	0, 0.163, 0.464, 0.766, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.464 std_dev=0.301
C4	B	0, 0.136, 0.439, 0.742, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.439 std_dev=0.303
C5	B	0, 0.129, 0.436, 0.743, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.436 std_dev=0.307
N3	B	0, 0.156, 0.466, 0.775, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.466 std_dev=0.310
N7	B	0, 0.193, 0.512, 0.831, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.512 std_dev=0.319
O4'	A	0, 0.054, 0.394, 0.734, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.394 std_dev=0.340
C8	B	0, 0.212, 0.559, 0.906, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.559 std_dev=0.347
C2'	A	0, 0.047, 0.402, 0.758, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.402 std_dev=0.356
C6	B	0, 0.140, 0.508, 0.876, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.508 std_dev=0.368
N1	B	0, 0.140, 0.508, 0.877, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.508 std_dev=0.369
N9	B	0, 0.154, 0.543, 0.932, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.543 std_dev=0.389
O2'	A	0, 0.047, 0.459, 0.872, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.459 std_dev=0.413
N6	B	0, 0.260, 0.703, 1.146, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.703 std_dev=0.443
C2'	B	0, 0.180, 0.629, 1.079, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.629 std_dev=0.449
C4'	A	0, 0.080, 0.572, 1.064, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.572 std_dev=0.492
C3'	A	0, 0.078, 0.623, 1.168, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.623 std_dev=0.545
C1'	B	0, 0.191, 0.740, 1.289, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.740 std_dev=0.549
O5'	A	0, 0.198, 0.759, 1.320, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.759 std_dev=0.561
O2'	B	0, 0.220, 0.783, 1.346, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.783 std_dev=0.563
O3'	A	0, 0.103, 0.839, 1.575, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.839 std_dev=0.736
C3'	B	0, 0.247, 1.097, 1.947, 1.931 max_d=1.931 avg_d=1.097 std_dev=0.850
O4'	B	0, 0.277, 1.136, 1.996, 2.141 max_d=2.141 avg_d=1.136 std_dev=0.859
C5'	A	0, 0.146, 1.035, 1.923, 2.219 max_d=2.219 avg_d=1.035 std_dev=0.888
O3'	B	0, 0.383, 1.430, 2.477, 2.529 max_d=2.529 avg_d=1.430 std_dev=1.047
OP2	B	0, -0.080, 0.981, 2.042, 2.680 max_d=2.680 avg_d=0.981 std_dev=1.061
P	A	0, 0.297, 1.363, 2.429, 2.691 max_d=2.691 avg_d=1.363 std_dev=1.066
C4'	B	0, 0.305, 1.384, 2.463, 2.506 max_d=2.506 avg_d=1.384 std_dev=1.079
O5'	B	0, 0.109, 1.307, 2.505, 2.669 max_d=2.669 avg_d=1.307 std_dev=1.198
P	B	0, -0.085, 1.150, 2.385, 3.098 max_d=3.098 avg_d=1.150 std_dev=1.235
OP1	A	0, 0.001, 1.428, 2.855, 3.805 max_d=3.805 avg_d=1.428 std_dev=1.427
C5'	B	0, 0.284, 1.745, 3.205, 3.401 max_d=3.401 avg_d=1.745 std_dev=1.461
OP2	A	0, 0.340, 1.968, 3.597, 3.802 max_d=3.802 avg_d=1.968 std_dev=1.629
OP1	B	0, -0.411, 1.470, 3.351, 4.646 max_d=4.646 avg_d=1.470 std_dev=1.881

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.45	0.26	0.15
C2	0.03	0.00	0.16	0.22	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.26	0.05	0.20	0.19	0.73	0.20
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.05	0.10	0.11	0.17	0.03	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.42	0.34	0.07
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.11	0.00	0.06	0.01	0.11	0.10	0.18	0.20	0.08	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.32	0.27	0.40	0.12
C4	0.01	0.01	0.08	0.11	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.12	0.03	0.21	0.15	0.70	0.23
C4'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.06	0.03	0.08	0.07	0.06	0.03	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.52	0.07	0.25
C5	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.27	0.25	0.94	0.44
C5'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.11	0.05	0.12	0.10	0.11	0.07	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.12	0.13	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.11	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.12	0.02	0.27	0.26	1.01	0.47
C8	0.01	0.01	0.10	0.10	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.12	0.04	0.27	0.29	0.84	0.42
N1	0.02	0.00	0.11	0.18	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.21	0.04	0.25	0.14	0.90	0.36
N3	0.02	0.00	0.17	0.20	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.24	0.06	0.17	0.27	0.60	0.11
N6	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.02	0.30	0.42	1.15	0.60
N7	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.03	0.30	0.42	1.05	0.57
N9	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.19	0.17	0.59	0.16
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.03	0.06	0.04	0.06	0.04	0.07	0.06	0.09	0.05	0.07	0.02	0.00	0.02	0.05	0.08	0.74	0.07	0.31
O3'	0.01	0.26	0.01	0.00	0.12	0.01	0.06	0.02	0.12	0.12	0.21	0.24	0.09	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.31	0.41	0.37	0.07
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.04	0.06	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.12	0.53	0.19	0.30
O5'	0.06	0.20	0.22	0.32	0.21	0.01	0.27	0.01	0.27	0.27	0.25	0.17	0.30	0.30	0.19	0.08	0.31	0.12	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.45	0.19	0.42	0.27	0.15	0.52	0.25	0.12	0.26	0.29	0.14	0.27	0.42	0.42	0.17	0.74	0.41	0.53	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.73	0.34	0.40	0.70	0.07	0.94	0.13	1.01	0.84	0.90	0.60	1.15	1.05	0.59	0.07	0.37	0.19	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.20	0.07	0.12	0.23	0.25	0.44	0.01	0.47	0.42	0.36	0.11	0.60	0.57	0.16	0.31	0.07	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.15	0.11	0.09	0.07	0.15	0.14	0.25	0.17	0.19	0.14	0.12	0.32	0.23	0.13	0.18	0.19	0.26	0.35	0.48	0.88	0.42
C2	0.27	0.14	0.15	0.17	0.12	0.37	0.12	0.47	0.07	0.27	0.14	0.08	0.11	0.21	0.24	0.20	0.17	0.46	0.41	0.14	0.56	0.22
C2'	0.12	0.18	0.17	0.15	0.12	0.16	0.20	0.28	0.25	0.21	0.25	0.09	0.33	0.24	0.14	0.15	0.25	0.27	0.36	0.38	0.84	0.37
C3'	0.12	0.11	0.14	0.12	0.08	0.17	0.13	0.31	0.12	0.20	0.13	0.05	0.17	0.21	0.13	0.13	0.20	0.26	0.37	0.42	0.86	0.40
C4	0.15	0.19	0.11	0.06	0.05	0.22	0.08	0.34	0.10	0.18	0.20	0.11	0.16	0.18	0.13	0.16	0.11	0.30	0.35	0.26	0.75	0.30
C4'	0.17	0.22	0.12	0.07	0.12	0.17	0.11	0.27	0.07	0.19	0.16	0.19	0.13	0.20	0.15	0.19	0.17	0.26	0.37	0.54	0.91	0.46
C5	0.11	0.22	0.10	0.07	0.03	0.23	0.03	0.39	0.14	0.16	0.24	0.13	0.14	0.14	0.09	0.14	0.07	0.27	0.38	0.28	0.75	0.32
C5'	0.18	0.32	0.13	0.07	0.17	0.20	0.15	0.32	0.16	0.20	0.29	0.25	0.12	0.19	0.17	0.20	0.13	0.27	0.40	0.62	0.95	0.52
C6	0.11	0.21	0.09	0.12	0.04	0.29	0.06	0.47	0.14	0.18	0.21	0.14	0.15	0.15	0.09	0.16	0.10	0.32	0.41	0.14	0.63	0.26
C8	0.10	0.22	0.11	0.10	0.04	0.18	0.09	0.34	0.14	0.18	0.24	0.13	0.20	0.19	0.09	0.12	0.13	0.22	0.39	0.54	0.91	0.48
N1	0.20	0.17	0.11	0.18	0.07	0.37	0.09	0.53	0.07	0.27	0.16	0.10	0.08	0.22	0.19	0.16	0.15	0.44	0.46	0.20	0.53	0.26
N3	0.23	0.14	0.14	0.12	0.11	0.28	0.12	0.36	0.12	0.22	0.15	0.11	0.19	0.19	0.19	0.21	0.16	0.38	0.35	0.11	0.66	0.22
N6	0.11	0.22	0.09	0.16	0.09	0.31	0.12	0.53	0.20	0.12	0.23	0.16	0.23	0.14	0.04	0.19	0.15	0.29	0.43	0.17	0.58	0.28
N7	0.10	0.23	0.11	0.10	0.06	0.22	0.07	0.38	0.18	0.17	0.27	0.14	0.21	0.15	0.09	0.14	0.10	0.23	0.39	0.47	0.86	0.44
N9	0.13	0.19	0.10	0.07	0.05	0.17	0.10	0.30	0.13	0.18	0.19	0.11	0.23	0.20	0.11	0.14	0.14	0.25	0.36	0.44	0.85	0.40
O2'	0.15	0.20	0.16	0.17	0.14	0.15	0.24	0.25	0.33	0.22	0.33	0.09	0.45	0.27	0.15	0.13	0.29	0.29	0.35	0.38	0.84	0.36
O3'	0.13	0.12	0.17	0.14	0.11	0.18	0.16	0.31	0.15	0.20	0.15	0.07	0.20	0.21	0.15	0.16	0.23	0.27	0.37	0.38	0.84	0.38
O4'	0.21	0.31	0.17	0.09	0.17	0.17	0.12	0.25	0.08	0.18	0.22	0.27	0.16	0.20	0.17	0.27	0.18	0.27	0.35	0.57	0.91	0.46
O5'	0.22	0.32	0.22	0.14	0.22	0.19	0.15	0.26	0.16	0.15	0.27	0.29	0.07	0.12	0.19	0.30	0.18	0.25	0.29	0.52	0.80	0.39
OP1	0.18	0.20	0.26	0.27	0.19	0.18	0.23	0.11	0.24	0.25	0.23	0.18	0.29	0.27	0.20	0.22	0.34	0.19	0.04	0.26	0.39	0.07
OP2	0.89	0.70	0.81	0.83	0.83	0.95	0.83	1.03	0.75	0.90	0.68	0.77	0.73	0.88	0.88	0.82	0.79	0.99	1.00	0.95	1.15	0.99
P	0.33	0.24	0.27	0.24	0.29	0.32	0.27	0.35	0.23	0.32	0.22	0.27	0.19	0.29	0.31	0.31	0.22	0.38	0.32	0.41	0.62	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.37	0.21	0.26
C2	0.02	0.00	0.13	0.21	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.27	0.02	0.20	0.30	0.52	0.22
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.07	0.09	0.14	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.15	0.23	0.06
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.00	0.10	0.10	0.17	0.20	0.08	0.07	0.03	0.01	0.01	0.02	0.20	0.06	0.28	0.09
C4	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.14	0.01	0.18	0.25	0.46	0.19
C4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.09	0.07	0.08	0.05	0.08	0.03	0.06	0.01	0.00	0.01	0.32	0.08	0.17
C5	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.01	0.23	0.35	0.59	0.27
C5'	0.03	0.09	0.01	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.12	0.18	0.10	0.08	0.14	0.18	0.09	0.06	0.03	0.01	0.01	0.17	0.05	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.14	0.02	0.25	0.43	0.64	0.31
C8	0.01	0.00	0.07	0.10	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.02	0.21	0.21	0.46	0.19
N1	0.02	0.00	0.09	0.17	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.23	0.02	0.23	0.39	0.60	0.27
N3	0.02	0.00	0.14	0.20	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.25	0.02	0.17	0.26	0.44	0.19
N6	0.02	0.01	0.02	0.08	0.01	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.27	0.54	0.71	0.37
N7	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.06	0.02	0.25	0.38	0.62	0.30
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.14	0.21	0.36	0.16
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.06	0.04	0.06	0.05	0.04	0.05	0.06	0.05	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.39	0.10	0.22
O3'	0.01	0.27	0.01	0.01	0.14	0.01	0.09	0.03	0.14	0.09	0.23	0.25	0.11	0.06	0.03	0.04	0.00	0.01	0.21	0.17	0.32	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.12	0.54	0.26	0.40
O5'	0.05	0.20	0.15	0.20	0.18	0.01	0.23	0.01	0.25	0.21	0.23	0.17	0.27	0.25	0.14	0.06	0.21	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.37	0.30	0.15	0.06	0.25	0.32	0.35	0.17	0.43	0.21	0.39	0.26	0.54	0.38	0.21	0.39	0.17	0.54	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.52	0.23	0.28	0.46	0.08	0.59	0.05	0.64	0.46	0.60	0.44	0.71	0.62	0.36	0.10	0.32	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.26	0.22	0.06	0.09	0.19	0.17	0.27	0.01	0.31	0.19	0.27	0.19	0.37	0.30	0.16	0.22	0.16	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00