Doublet Group distance statistics: 52751

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.008, 0.024, 0.040, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.004, 0.023, 0.043, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.023 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.006, 0.030, 0.053, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.030 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.022, 0.054, 0.085, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.054 std_dev=0.032
N7	A	0, 0.006, 0.044, 0.081, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.044 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.005, 0.050, 0.095, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.050 std_dev=0.045
O5'	A	0, 0.071, 0.266, 0.461, 0.483 max_d=0.483 avg_d=0.266 std_dev=0.195
O4'	A	0, 0.029, 0.316, 0.604, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.316 std_dev=0.288
N7	B	0, 0.219, 0.546, 0.874, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.546 std_dev=0.328
C8	B	0, 0.209, 0.542, 0.875, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.542 std_dev=0.333
C6	B	0, 0.195, 0.530, 0.866, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.530 std_dev=0.335
C5	B	0, 0.194, 0.534, 0.875, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.534 std_dev=0.340
C4'	A	0, 0.039, 0.383, 0.728, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.383 std_dev=0.344
N6	B	0, 0.247, 0.600, 0.952, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.600 std_dev=0.353
C3'	A	0, 0.046, 0.402, 0.758, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.402 std_dev=0.356
N1	B	0, 0.165, 0.525, 0.885, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.525 std_dev=0.360
C2'	A	0, 0.017, 0.380, 0.744, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.380 std_dev=0.363
N9	B	0, 0.212, 0.592, 0.972, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.592 std_dev=0.380
C4	B	0, 0.203, 0.585, 0.968, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.585 std_dev=0.383
C2	B	0, 0.198, 0.603, 1.009, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.603 std_dev=0.406
N3	B	0, 0.232, 0.654, 1.076, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.654 std_dev=0.422
P	A	0, 0.233, 0.695, 1.157, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.695 std_dev=0.462
O4'	B	0, 0.197, 0.660, 1.123, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.660 std_dev=0.463
C1'	B	0, 0.275, 0.739, 1.202, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.739 std_dev=0.464
OP1	B	0, 0.318, 0.797, 1.276, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.797 std_dev=0.479
O3'	A	0, -0.006, 0.548, 1.101, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.548 std_dev=0.553
C2'	B	0, 0.383, 0.945, 1.507, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.945 std_dev=0.562
C5'	A	0, 0.042, 0.620, 1.198, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.620 std_dev=0.578
O5'	B	0, 0.335, 0.939, 1.543, 1.682 max_d=1.682 avg_d=0.939 std_dev=0.604
P	B	0, 0.361, 0.975, 1.588, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.975 std_dev=0.613
O2'	B	0, 0.451, 1.069, 1.687, 1.472 max_d=1.472 avg_d=1.069 std_dev=0.618
O2'	A	0, 0.054, 0.677, 1.301, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.677 std_dev=0.624
C4'	B	0, 0.402, 1.034, 1.667, 1.651 max_d=1.651 avg_d=1.034 std_dev=0.632
C3'	B	0, 0.387, 1.028, 1.670, 1.697 max_d=1.697 avg_d=1.028 std_dev=0.642
O3'	B	0, 0.339, 1.033, 1.727, 1.872 max_d=1.872 avg_d=1.033 std_dev=0.694
C5'	B	0, 0.574, 1.389, 2.203, 1.975 max_d=1.975 avg_d=1.389 std_dev=0.814
OP2	B	0, 0.607, 1.508, 2.409, 2.381 max_d=2.381 avg_d=1.508 std_dev=0.901
OP1	A	0, 0.391, 1.314, 2.238, 2.553 max_d=2.553 avg_d=1.314 std_dev=0.924
OP2	A	0, 0.551, 1.490, 2.429, 2.578 max_d=2.578 avg_d=1.490 std_dev=0.939

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.29	0.00	0.09	0.26	0.36	0.06
C2	0.00	0.00	0.20	0.11	0.00	0.03	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.24	0.30	0.11	0.11	0.25	0.42	0.07
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.09	0.02	0.03	0.16	0.08	0.12	0.15	0.20	0.04	0.08	0.01	0.00	0.06	0.02	0.29	0.44	0.49	0.29
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.03	0.09	0.10	0.10	0.10	0.09	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.33	0.32	0.52	0.26
C4	0.00	0.00	0.09	0.07	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.24	0.07	0.11	0.25	0.37	0.07
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.06	0.06	0.02	0.09	0.08	0.03	0.11	0.03	0.01	0.01	0.18	0.45	0.07
C5	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.19	0.07	0.12	0.22	0.37	0.10
C5'	0.07	0.13	0.16	0.03	0.15	0.00	0.19	0.00	0.20	0.20	0.17	0.11	0.24	0.22	0.14	0.05	0.20	0.02	0.00	0.18	0.39	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.07	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.21	0.09	0.12	0.22	0.40	0.10
C8	0.01	0.00	0.12	0.10	0.00	0.06	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.20	0.14	0.03	0.12	0.22	0.31	0.09
N1	0.01	0.00	0.15	0.10	0.01	0.06	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.26	0.11	0.12	0.23	0.42	0.09
N3	0.01	0.00	0.20	0.10	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.23	0.31	0.10	0.10	0.26	0.40	0.06
N6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.09	0.01	0.24	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.19	0.18	0.10	0.13	0.20	0.40	0.13
N7	0.01	0.01	0.08	0.10	0.00	0.08	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.20	0.14	0.02	0.12	0.20	0.33	0.10
N9	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.11	0.21	0.02	0.11	0.25	0.35	0.07
O2'	0.01	0.24	0.00	0.02	0.14	0.11	0.16	0.05	0.18	0.20	0.21	0.23	0.19	0.20	0.11	0.00	0.07	0.05	0.28	0.46	0.45	0.24
O3'	0.29	0.30	0.06	0.01	0.24	0.03	0.19	0.20	0.21	0.14	0.26	0.31	0.18	0.14	0.21	0.07	0.00	0.22	0.24	0.30	0.50	0.19
O4'	0.00	0.11	0.02	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.09	0.03	0.11	0.10	0.10	0.02	0.02	0.05	0.22	0.00	0.27	0.25	0.35	0.14
O5'	0.09	0.11	0.29	0.33	0.11	0.01	0.12	0.00	0.12	0.12	0.12	0.10	0.13	0.12	0.11	0.28	0.24	0.27	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.26	0.25	0.44	0.32	0.25	0.18	0.22	0.18	0.22	0.22	0.23	0.26	0.20	0.20	0.25	0.46	0.30	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.36	0.42	0.49	0.52	0.37	0.45	0.37	0.39	0.40	0.31	0.42	0.40	0.40	0.33	0.35	0.45	0.50	0.35	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.07	0.29	0.26	0.07	0.07	0.10	0.01	0.10	0.09	0.09	0.06	0.13	0.10	0.07	0.24	0.19	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.12	0.06	0.07	0.04	0.13	0.09	0.28	0.15	0.11	0.15	0.07	0.22	0.12	0.06	0.07	0.07	0.07	0.22	0.14	0.12	0.07
C2	0.19	0.05	0.21	0.23	0.12	0.18	0.10	0.26	0.06	0.15	0.05	0.09	0.09	0.13	0.15	0.21	0.22	0.16	0.18	0.19	0.12	0.11
C2'	0.08	0.09	0.05	0.05	0.03	0.07	0.07	0.16	0.15	0.04	0.14	0.06	0.23	0.08	0.03	0.09	0.05	0.09	0.26	0.13	0.09	0.10
C3'	0.15	0.15	0.14	0.16	0.14	0.12	0.16	0.18	0.20	0.15	0.19	0.13	0.28	0.16	0.14	0.15	0.15	0.15	0.29	0.29	0.19	0.24
C4	0.11	0.14	0.10	0.11	0.03	0.12	0.08	0.24	0.16	0.11	0.19	0.06	0.20	0.11	0.08	0.12	0.10	0.11	0.20	0.14	0.11	0.05
C4'	0.25	0.25	0.24	0.25	0.26	0.20	0.25	0.23	0.25	0.24	0.25	0.26	0.27	0.24	0.25	0.25	0.24	0.22	0.31	0.31	0.18	0.26
C5	0.12	0.19	0.12	0.12	0.05	0.11	0.09	0.20	0.17	0.09	0.23	0.11	0.19	0.09	0.07	0.15	0.10	0.11	0.21	0.12	0.13	0.07
C5'	0.46	0.41	0.45	0.44	0.44	0.39	0.40	0.34	0.37	0.43	0.38	0.44	0.34	0.38	0.45	0.48	0.42	0.45	0.46	0.44	0.33	0.41
C6	0.18	0.13	0.21	0.20	0.05	0.15	0.04	0.20	0.10	0.11	0.16	0.06	0.12	0.08	0.11	0.22	0.18	0.15	0.20	0.16	0.15	0.10
C8	0.08	0.23	0.07	0.09	0.16	0.15	0.19	0.24	0.25	0.12	0.26	0.19	0.27	0.15	0.10	0.07	0.12	0.12	0.29	0.10	0.18	0.14
N1	0.21	0.05	0.25	0.25	0.11	0.19	0.08	0.24	0.04	0.15	0.06	0.08	0.07	0.12	0.15	0.24	0.24	0.18	0.20	0.19	0.15	0.12
N3	0.15	0.06	0.15	0.17	0.08	0.15	0.08	0.27	0.09	0.14	0.10	0.04	0.14	0.13	0.12	0.16	0.16	0.13	0.18	0.17	0.10	0.07
N6	0.19	0.15	0.25	0.23	0.06	0.17	0.05	0.18	0.10	0.11	0.16	0.09	0.11	0.07	0.11	0.27	0.20	0.16	0.22	0.16	0.18	0.13
N7	0.08	0.26	0.08	0.08	0.15	0.11	0.17	0.19	0.24	0.10	0.27	0.20	0.24	0.12	0.09	0.11	0.09	0.11	0.26	0.09	0.17	0.11
N9	0.07	0.16	0.06	0.07	0.07	0.13	0.12	0.26	0.20	0.11	0.21	0.10	0.24	0.12	0.06	0.08	0.08	0.09	0.24	0.13	0.13	0.08
O2'	0.08	0.18	0.11	0.14	0.15	0.11	0.24	0.24	0.30	0.20	0.26	0.12	0.40	0.28	0.13	0.08	0.13	0.05	0.25	0.25	0.23	0.17
O3'	0.34	0.52	0.40	0.40	0.46	0.32	0.52	0.36	0.59	0.41	0.58	0.47	0.68	0.48	0.40	0.35	0.39	0.29	0.41	0.49	0.32	0.43
O4'	0.13	0.28	0.14	0.12	0.22	0.11	0.25	0.24	0.30	0.14	0.30	0.24	0.33	0.19	0.16	0.14	0.11	0.06	0.22	0.16	0.04	0.10
O5'	0.24	0.18	0.30	0.36	0.21	0.40	0.23	0.48	0.22	0.27	0.19	0.18	0.25	0.26	0.24	0.22	0.39	0.27	0.57	0.31	0.46	0.43
OP1	0.12	0.20	0.10	0.12	0.11	0.13	0.11	0.23	0.19	0.10	0.22	0.16	0.24	0.06	0.09	0.20	0.13	0.12	0.05	0.36	0.23	0.20
OP2	0.34	0.43	0.27	0.22	0.43	0.15	0.45	0.18	0.45	0.44	0.44	0.42	0.44	0.48	0.40	0.33	0.16	0.29	0.01	0.45	0.18	0.20
P	0.09	0.11	0.03	0.03	0.08	0.07	0.08	0.16	0.09	0.11	0.10	0.10	0.13	0.09	0.09	0.12	0.06	0.08	0.17	0.22	0.11	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.15	0.10	0.13	0.06
C2	0.06	0.00	0.13	0.18	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.18	0.03	0.18	0.15	0.09	0.08
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.02	0.02	0.03	0.05	0.06	0.10	0.13	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.14	0.10
C3'	0.02	0.18	0.00	0.00	0.11	0.00	0.09	0.00	0.12	0.03	0.16	0.16	0.09	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.04	0.10	0.14	0.08
C4	0.03	0.01	0.06	0.11	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.10	0.01	0.18	0.13	0.08	0.06
C4'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.06	0.05	0.07	0.08	0.06	0.06	0.05	0.11	0.01	0.00	0.01	0.15	0.12	0.04
C5	0.01	0.00	0.02	0.09	0.00	0.05	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.20	0.11	0.07	0.06
C5'	0.06	0.17	0.03	0.00	0.17	0.00	0.19	0.00	0.19	0.19	0.18	0.15	0.21	0.20	0.15	0.08	0.06	0.04	0.00	0.21	0.18	0.02
C6	0.02	0.00	0.05	0.12	0.00	0.06	0.00	0.19	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.13	0.01	0.20	0.11	0.07	0.07
C8	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.05	0.01	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.03	0.03	0.22	0.10	0.09	0.07
N1	0.04	0.00	0.10	0.16	0.01	0.07	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.17	0.02	0.19	0.13	0.08	0.08
N3	0.05	0.01	0.13	0.16	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.15	0.03	0.17	0.15	0.09	0.07
N6	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.06	0.01	0.21	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.11	0.03	0.21	0.07	0.05	0.06
N7	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.06	0.00	0.20	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.22	0.09	0.07	0.08
N9	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.18	0.12	0.10	0.05
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.03	0.11	0.02	0.08	0.03	0.04	0.06	0.08	0.03	0.03	0.01	0.00	0.05	0.07	0.10	0.11	0.14	0.07
O3'	0.03	0.18	0.01	0.01	0.10	0.01	0.09	0.06	0.13	0.03	0.17	0.15	0.11	0.06	0.03	0.05	0.00	0.05	0.10	0.05	0.13	0.04
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.07	0.05	0.00	0.15	0.11	0.18	0.09
O5'	0.15	0.18	0.08	0.04	0.18	0.01	0.20	0.00	0.20	0.22	0.19	0.17	0.21	0.22	0.18	0.10	0.10	0.15	0.00	0.02	0.04	0.01
OP1	0.10	0.15	0.12	0.10	0.13	0.15	0.11	0.21	0.11	0.10	0.13	0.15	0.07	0.09	0.12	0.11	0.05	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.09	0.14	0.14	0.08	0.12	0.07	0.18	0.07	0.09	0.08	0.09	0.05	0.07	0.10	0.14	0.13	0.18	0.04	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.08	0.10	0.08	0.06	0.04	0.06	0.02	0.07	0.07	0.08	0.07	0.06	0.08	0.05	0.07	0.04	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00