Doublet Group distance statistics: 52756

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.006, 0.021, 0.037, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.006, 0.025, 0.045, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.025 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.007, 0.028, 0.049, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.028 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.008, 0.030, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.030 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.009, 0.035, 0.061, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.035 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.010, 0.038, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.038 std_dev=0.028
N3	A	0, 0.008, 0.036, 0.065, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.036 std_dev=0.028
N6	A	0, -0.004, 0.027, 0.058, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.027 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.054, 0.237, 0.420, 0.446 max_d=0.446 avg_d=0.237 std_dev=0.183
C2'	A	0, 0.083, 0.337, 0.591, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.337 std_dev=0.254
C4'	A	0, 0.070, 0.329, 0.589, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.329 std_dev=0.259
O2'	A	0, 0.141, 0.535, 0.929, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.535 std_dev=0.394
C3'	A	0, 0.075, 0.525, 0.974, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.525 std_dev=0.450
N7	B	0, 0.213, 0.731, 1.249, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.731 std_dev=0.518
C8	B	0, 0.215, 0.736, 1.258, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.736 std_dev=0.521
N9	B	0, 0.220, 0.769, 1.318, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.769 std_dev=0.549
C5	B	0, 0.228, 0.777, 1.327, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.777 std_dev=0.550
C2'	B	0, 0.201, 0.756, 1.311, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.756 std_dev=0.555
P	B	0, 0.184, 0.745, 1.307, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.745 std_dev=0.561
O5'	B	0, 0.136, 0.702, 1.267, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.702 std_dev=0.565
N6	B	0, 0.230, 0.795, 1.361, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.795 std_dev=0.566
C6	B	0, 0.236, 0.806, 1.377, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.806 std_dev=0.570
OP1	B	0, 0.233, 0.805, 1.378, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.805 std_dev=0.573
C4	B	0, 0.230, 0.804, 1.377, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.804 std_dev=0.573
C5'	A	0, 0.141, 0.718, 1.294, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.718 std_dev=0.576
C1'	B	0, 0.214, 0.798, 1.381, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.798 std_dev=0.584
C3'	B	0, 0.160, 0.757, 1.353, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.757 std_dev=0.596
N1	B	0, 0.252, 0.865, 1.478, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.865 std_dev=0.613
N3	B	0, 0.237, 0.853, 1.470, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.853 std_dev=0.616
C2	B	0, 0.250, 0.882, 1.513, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.882 std_dev=0.631
O4'	B	0, 0.210, 0.844, 1.478, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.844 std_dev=0.634
O3'	A	0, 0.004, 0.678, 1.352, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.678 std_dev=0.674
C4'	B	0, 0.201, 0.918, 1.636, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.918 std_dev=0.717
OP2	B	0, 0.279, 0.996, 1.714, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.996 std_dev=0.718
C5'	B	0, 0.190, 0.937, 1.685, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.937 std_dev=0.747
O3'	B	0, 0.144, 0.899, 1.655, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.899 std_dev=0.756
OP1	A	0, 0.315, 1.079, 1.843, 1.658 max_d=1.658 avg_d=1.079 std_dev=0.764
O2'	B	0, 0.271, 1.050, 1.829, 1.864 max_d=1.864 avg_d=1.050 std_dev=0.779
O5'	A	0, 0.384, 1.316, 2.248, 2.044 max_d=2.044 avg_d=1.316 std_dev=0.932
P	A	0, 0.445, 1.522, 2.600, 2.337 max_d=2.337 avg_d=1.522 std_dev=1.077
OP2	A	0, 0.541, 1.850, 3.158, 2.810 max_d=2.810 avg_d=1.850 std_dev=1.308

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.01	0.22	0.26	0.11	0.25
C2	0.03	0.00	0.07	0.10	0.00	0.02	0.02	0.16	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.17	0.43	0.07	0.16	0.28	0.12	0.22
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.04	0.07	0.02	0.05	0.01	0.00	0.07	0.02	0.24	0.16	0.09	0.21
C3'	0.04	0.10	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.11	0.05	0.11	0.04	0.10	0.02	0.01	0.02	0.01	0.16	0.15	0.21	0.15
C4	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.29	0.05	0.22	0.31	0.12	0.28
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.06	0.07	0.04	0.01	0.08	0.08	0.04	0.02	0.03	0.00	0.01	0.13	0.14	0.02
C5	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.09	0.23	0.03	0.25	0.34	0.12	0.31
C5'	0.03	0.16	0.01	0.03	0.16	0.00	0.20	0.00	0.22	0.16	0.20	0.13	0.25	0.20	0.12	0.01	0.05	0.01	0.00	0.24	0.22	0.02
C6	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.22	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.13	0.28	0.04	0.23	0.33	0.10	0.29
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.03	0.34	0.37	0.20	0.40
N1	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.04	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.16	0.37	0.06	0.19	0.31	0.10	0.25
N3	0.03	0.00	0.07	0.11	0.01	0.01	0.02	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.16	0.41	0.07	0.17	0.28	0.12	0.23
N6	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.08	0.00	0.25	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.24	0.03	0.25	0.35	0.09	0.31
N7	0.00	0.02	0.05	0.10	0.02	0.08	0.00	0.20	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.02	0.31	0.37	0.17	0.38
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.19	0.01	0.27	0.32	0.14	0.32
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.11	0.02	0.09	0.01	0.13	0.04	0.16	0.16	0.11	0.06	0.05	0.00	0.06	0.02	0.21	0.09	0.13	0.19
O3'	0.21	0.43	0.07	0.02	0.29	0.03	0.23	0.05	0.28	0.08	0.37	0.41	0.24	0.12	0.19	0.06	0.00	0.13	0.22	0.30	0.33	0.24
O4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.07	0.03	0.02	0.01	0.02	0.13	0.00	0.19	0.32	0.16	0.25
O5'	0.22	0.16	0.24	0.16	0.22	0.01	0.25	0.00	0.23	0.34	0.19	0.17	0.25	0.31	0.27	0.21	0.22	0.19	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.26	0.28	0.16	0.15	0.31	0.13	0.34	0.24	0.33	0.37	0.31	0.28	0.35	0.37	0.32	0.09	0.30	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.12	0.09	0.21	0.12	0.14	0.12	0.22	0.10	0.20	0.10	0.12	0.09	0.17	0.14	0.13	0.33	0.16	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.25	0.22	0.21	0.15	0.28	0.02	0.31	0.02	0.29	0.40	0.25	0.23	0.31	0.38	0.32	0.19	0.24	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.24	0.22	0.14	0.25	0.23	0.24	0.21	0.23	0.23	0.22	0.25	0.25	0.24	0.24	0.30	0.12	0.29	0.08	0.13	0.36	0.11
C2	0.28	0.18	0.24	0.20	0.26	0.29	0.22	0.28	0.14	0.26	0.12	0.24	0.12	0.24	0.26	0.29	0.20	0.32	0.17	0.12	0.40	0.19
C2'	0.28	0.27	0.24	0.15	0.25	0.25	0.21	0.21	0.20	0.20	0.22	0.28	0.20	0.19	0.24	0.34	0.14	0.30	0.07	0.16	0.30	0.06
C3'	0.29	0.31	0.26	0.14	0.26	0.23	0.20	0.18	0.20	0.18	0.25	0.31	0.18	0.17	0.24	0.38	0.13	0.29	0.06	0.18	0.24	0.03
C4	0.22	0.17	0.19	0.14	0.20	0.23	0.19	0.23	0.14	0.21	0.12	0.19	0.15	0.21	0.21	0.24	0.13	0.27	0.10	0.13	0.37	0.12
C4'	0.14	0.15	0.10	0.03	0.13	0.08	0.14	0.04	0.14	0.14	0.13	0.15	0.19	0.17	0.13	0.20	0.05	0.16	0.10	0.20	0.22	0.06
C5	0.19	0.14	0.17	0.13	0.16	0.21	0.13	0.22	0.07	0.17	0.09	0.17	0.05	0.15	0.17	0.21	0.13	0.24	0.09	0.15	0.36	0.11
C5'	0.10	0.08	0.14	0.28	0.13	0.19	0.18	0.23	0.18	0.21	0.11	0.08	0.25	0.25	0.14	0.04	0.32	0.12	0.36	0.41	0.27	0.32
C6	0.19	0.14	0.18	0.16	0.16	0.23	0.11	0.25	0.06	0.17	0.10	0.16	0.04	0.13	0.17	0.20	0.16	0.25	0.12	0.14	0.37	0.14
C8	0.17	0.14	0.15	0.09	0.15	0.17	0.13	0.17	0.10	0.15	0.10	0.16	0.10	0.14	0.15	0.20	0.07	0.21	0.05	0.17	0.32	0.06
N1	0.25	0.14	0.22	0.20	0.20	0.28	0.14	0.29	0.05	0.23	0.09	0.18	0.04	0.19	0.23	0.24	0.21	0.30	0.17	0.13	0.40	0.19
N3	0.26	0.21	0.22	0.18	0.25	0.26	0.24	0.26	0.20	0.25	0.17	0.24	0.19	0.25	0.25	0.29	0.17	0.30	0.14	0.12	0.39	0.16
N6	0.17	0.16	0.17	0.16	0.15	0.22	0.11	0.25	0.11	0.13	0.14	0.16	0.10	0.08	0.16	0.17	0.17	0.22	0.12	0.16	0.36	0.12
N7	0.16	0.14	0.15	0.10	0.14	0.18	0.10	0.19	0.06	0.13	0.09	0.15	0.03	0.11	0.14	0.18	0.09	0.21	0.06	0.18	0.33	0.06
N9	0.21	0.17	0.18	0.11	0.19	0.20	0.18	0.20	0.16	0.20	0.14	0.19	0.17	0.20	0.19	0.24	0.10	0.25	0.07	0.14	0.35	0.09
O2'	0.43	0.39	0.40	0.32	0.38	0.43	0.32	0.40	0.29	0.32	0.32	0.41	0.26	0.29	0.38	0.50	0.32	0.47	0.22	0.19	0.40	0.21
O3'	0.65	0.67	0.64	0.52	0.60	0.60	0.49	0.54	0.47	0.46	0.57	0.68	0.34	0.40	0.58	0.77	0.52	0.64	0.39	0.35	0.43	0.35
O4'	0.14	0.10	0.09	0.06	0.14	0.11	0.17	0.08	0.17	0.18	0.11	0.11	0.23	0.21	0.14	0.16	0.05	0.17	0.03	0.13	0.30	0.03
O5'	0.23	0.11	0.14	0.08	0.17	0.17	0.17	0.11	0.11	0.25	0.07	0.15	0.13	0.24	0.21	0.23	0.06	0.28	0.07	0.05	0.33	0.08
OP1	0.38	0.27	0.31	0.25	0.34	0.32	0.35	0.26	0.31	0.41	0.26	0.30	0.32	0.40	0.37	0.37	0.20	0.42	0.19	0.13	0.49	0.22
OP2	0.19	0.29	0.22	0.25	0.21	0.19	0.20	0.25	0.25	0.12	0.29	0.25	0.27	0.13	0.18	0.22	0.32	0.16	0.31	0.34	0.03	0.26
P	0.26	0.15	0.17	0.07	0.20	0.19	0.18	0.14	0.12	0.26	0.12	0.18	0.09	0.24	0.24	0.25	0.03	0.30	0.04	0.02	0.34	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.12	0.02
C2	0.03	0.00	0.06	0.15	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.19	0.03	0.21	0.25	0.17	0.19
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.06	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.08	0.16	0.09
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.13	0.01	0.13	0.03	0.15	0.05	0.17	0.14	0.16	0.09	0.07	0.01	0.01	0.01	0.09	0.06	0.11	0.09
C4	0.01	0.00	0.04	0.13	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.14	0.02	0.20	0.26	0.15	0.17
C4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.10	0.06	0.10	0.07	0.11	0.08	0.05	0.05	0.01	0.00	0.02	0.07	0.02	0.02
C5	0.00	0.01	0.03	0.13	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.15	0.01	0.24	0.31	0.16	0.22
C5'	0.03	0.14	0.02	0.03	0.13	0.01	0.17	0.00	0.18	0.14	0.17	0.12	0.20	0.17	0.11	0.04	0.01	0.01	0.00	0.03	0.10	0.01
C6	0.00	0.01	0.04	0.15	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.19	0.01	0.25	0.32	0.16	0.24
C8	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.19	0.30	0.16	0.16
N1	0.01	0.00	0.05	0.17	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.21	0.02	0.24	0.29	0.17	0.23
N3	0.03	0.00	0.06	0.14	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.16	0.03	0.18	0.23	0.15	0.15
N6	0.02	0.01	0.04	0.16	0.02	0.11	0.03	0.20	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.02	0.03	0.20	0.03	0.27	0.34	0.15	0.26
N7	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.08	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.11	0.00	0.24	0.33	0.17	0.22
N9	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.15	0.24	0.14	0.12
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.02	0.06	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.05	0.11	0.09	0.03
O3'	0.01	0.19	0.01	0.01	0.14	0.01	0.15	0.01	0.19	0.06	0.21	0.16	0.20	0.11	0.07	0.01	0.00	0.01	0.10	0.10	0.13	0.10
O4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.17	0.11	0.06
O5'	0.06	0.21	0.08	0.09	0.20	0.02	0.24	0.00	0.25	0.19	0.24	0.18	0.27	0.24	0.15	0.05	0.10	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01
OP1	0.16	0.25	0.08	0.06	0.26	0.07	0.31	0.03	0.32	0.30	0.29	0.23	0.34	0.33	0.24	0.11	0.10	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01
OP2	0.12	0.17	0.16	0.11	0.15	0.02	0.16	0.10	0.16	0.16	0.17	0.15	0.15	0.17	0.14	0.09	0.13	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.19	0.09	0.09	0.17	0.02	0.22	0.01	0.24	0.16	0.23	0.15	0.26	0.22	0.12	0.03	0.10	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00