Doublet Group distance statistics: 52760

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.017, 0.030, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.003, 0.030, 0.058, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.030 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.003, 0.036, 0.069, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.036 std_dev=0.033
N9	A	0, 0.001, 0.038, 0.075, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.038 std_dev=0.037
N7	A	0, 0.009, 0.048, 0.086, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.048 std_dev=0.039
C4	A	0, -0.004, 0.038, 0.081, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.038 std_dev=0.042
C2	A	0, -0.002, 0.042, 0.085, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.042 std_dev=0.044
C1'	A	0, 0.006, 0.050, 0.094, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.050 std_dev=0.044
N1	A	0, -0.004, 0.041, 0.086, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.041 std_dev=0.045
N3	A	0, -0.002, 0.054, 0.111, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.054 std_dev=0.057
N6	A	0, 0.000, 0.086, 0.172, 0.204 max_d=0.204 avg_d=0.086 std_dev=0.086
N1	B	0, 0.151, 0.522, 0.893, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.522 std_dev=0.371
C6	B	0, 0.109, 0.494, 0.880, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.494 std_dev=0.385
C2	B	0, 0.170, 0.595, 1.020, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.595 std_dev=0.425
N6	B	0, 0.143, 0.574, 1.004, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.574 std_dev=0.430
C4	B	0, 0.147, 0.611, 1.076, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.611 std_dev=0.464
C5	B	0, 0.047, 0.517, 0.988, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.517 std_dev=0.471
N3	B	0, 0.196, 0.671, 1.146, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.671 std_dev=0.475
N9	B	0, 0.140, 0.701, 1.262, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.701 std_dev=0.561
C8	B	0, 0.041, 0.657, 1.273, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.657 std_dev=0.616
N7	B	0, -0.074, 0.551, 1.176, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.551 std_dev=0.625
O2'	A	0, 0.079, 0.723, 1.367, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.723 std_dev=0.644
C1'	B	0, 0.202, 0.859, 1.516, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.859 std_dev=0.657
O4'	B	0, 0.198, 0.870, 1.543, 1.639 max_d=1.639 avg_d=0.870 std_dev=0.673
C2'	A	0, 0.251, 0.940, 1.629, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.940 std_dev=0.689
O4'	A	0, 0.292, 1.033, 1.773, 1.697 max_d=1.697 avg_d=1.033 std_dev=0.740
C4'	B	0, 0.153, 0.965, 1.777, 1.987 max_d=1.987 avg_d=0.965 std_dev=0.812
C2'	B	0, 0.130, 1.066, 2.002, 2.278 max_d=2.278 avg_d=1.066 std_dev=0.936
C5'	B	0, 0.104, 1.053, 2.002, 2.300 max_d=2.300 avg_d=1.053 std_dev=0.949
O2'	B	0, 0.173, 1.154, 2.134, 2.397 max_d=2.397 avg_d=1.154 std_dev=0.981
O5'	B	0, 0.080, 1.074, 2.068, 2.396 max_d=2.396 avg_d=1.074 std_dev=0.994
C3'	B	0, 0.046, 1.049, 2.052, 2.401 max_d=2.401 avg_d=1.049 std_dev=1.003
C4'	A	0, 0.479, 1.637, 2.796, 2.491 max_d=2.491 avg_d=1.637 std_dev=1.158
C3'	A	0, 0.476, 1.637, 2.799, 2.565 max_d=2.565 avg_d=1.637 std_dev=1.161
P	B	0, -0.021, 1.177, 2.375, 2.821 max_d=2.821 avg_d=1.177 std_dev=1.198
O3'	B	0, -0.106, 1.182, 2.470, 2.973 max_d=2.973 avg_d=1.182 std_dev=1.288
OP1	B	0, -0.117, 1.272, 2.660, 3.204 max_d=3.204 avg_d=1.272 std_dev=1.389
OP2	B	0, -0.095, 1.303, 2.701, 3.242 max_d=3.242 avg_d=1.303 std_dev=1.398
O3'	A	0, 0.643, 2.208, 3.774, 3.442 max_d=3.442 avg_d=2.208 std_dev=1.565
C5'	A	0, 0.789, 2.697, 4.604, 4.112 max_d=4.112 avg_d=2.697 std_dev=1.908
O5'	A	0, 1.052, 3.612, 6.172, 5.630 max_d=5.630 avg_d=3.612 std_dev=2.560
P	A	0, 1.204, 4.157, 7.110, 6.578 max_d=6.578 avg_d=4.157 std_dev=2.953
OP1	A	0, 1.468, 5.030, 8.591, 7.772 max_d=7.772 avg_d=5.030 std_dev=3.561
OP2	A	0, 1.581, 5.472, 9.363, 8.710 max_d=8.710 avg_d=5.472 std_dev=3.891

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.17	0.02	0.04	0.05	0.06	0.04	0.03	0.01	0.05	0.10	0.00	0.14	0.12	0.22	0.15
C2	0.06	0.00	0.26	0.25	0.01	0.05	0.00	0.27	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.18	0.30	0.18	0.11	0.16	0.40	0.16
C2'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.17	0.04	0.18	0.12	0.19	0.25	0.22	0.25	0.22	0.23	0.12	0.01	0.03	0.03	0.17	0.22	0.19	0.09
C3'	0.02	0.25	0.00	0.00	0.19	0.01	0.22	0.08	0.24	0.19	0.25	0.22	0.28	0.22	0.12	0.01	0.02	0.05	0.22	0.27	0.18	0.07
C4	0.01	0.01	0.17	0.19	0.00	0.07	0.01	0.35	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.23	0.10	0.19	0.11	0.49	0.24
C4'	0.01	0.05	0.04	0.01	0.07	0.00	0.12	0.03	0.09	0.18	0.03	0.05	0.16	0.18	0.10	0.14	0.06	0.00	0.13	0.28	0.17	0.10
C5	0.02	0.00	0.18	0.22	0.01	0.12	0.00	0.45	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.13	0.26	0.08	0.27	0.10	0.72	0.34
C5'	0.17	0.27	0.12	0.08	0.35	0.03	0.45	0.00	0.44	0.49	0.34	0.25	0.53	0.52	0.36	0.09	0.10	0.03	0.04	0.33	0.41	0.01
C6	0.02	0.00	0.19	0.24	0.01	0.09	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.10	0.30	0.10	0.24	0.13	0.74	0.33
C8	0.04	0.02	0.25	0.19	0.01	0.18	0.00	0.49	0.00	0.00	0.02	0.03	0.05	0.00	0.01	0.25	0.20	0.15	0.37	0.11	0.75	0.43
N1	0.05	0.01	0.22	0.25	0.03	0.03	0.01	0.34	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.11	0.32	0.16	0.17	0.16	0.58	0.24
N3	0.06	0.01	0.25	0.22	0.02	0.05	0.01	0.25	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.17	0.25	0.18	0.10	0.14	0.32	0.14
N6	0.04	0.01	0.22	0.28	0.02	0.16	0.04	0.53	0.02	0.05	0.01	0.02	0.00	0.06	0.04	0.15	0.34	0.07	0.27	0.17	0.89	0.39
N7	0.03	0.00	0.23	0.22	0.01	0.18	0.00	0.52	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.02	0.22	0.24	0.12	0.37	0.09	0.90	0.46
N9	0.01	0.03	0.12	0.12	0.01	0.10	0.01	0.36	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04	0.02	0.00	0.12	0.15	0.06	0.23	0.12	0.47	0.26
O2'	0.05	0.18	0.01	0.01	0.09	0.14	0.13	0.09	0.10	0.25	0.11	0.17	0.15	0.22	0.12	0.00	0.10	0.03	0.13	0.21	0.19	0.06
O3'	0.10	0.30	0.03	0.02	0.23	0.06	0.26	0.10	0.30	0.20	0.32	0.25	0.34	0.24	0.15	0.10	0.00	0.11	0.27	0.37	0.18	0.12
O4'	0.00	0.18	0.03	0.05	0.10	0.00	0.08	0.03	0.10	0.15	0.16	0.18	0.07	0.12	0.06	0.03	0.11	0.00	0.13	0.07	0.16	0.18
O5'	0.14	0.11	0.17	0.22	0.19	0.13	0.27	0.04	0.24	0.37	0.17	0.10	0.27	0.37	0.23	0.13	0.27	0.13	0.00	0.06	0.04	0.00
OP1	0.12	0.16	0.22	0.27	0.11	0.28	0.10	0.33	0.13	0.11	0.16	0.14	0.17	0.09	0.12	0.21	0.37	0.07	0.06	0.00	0.03	0.02
OP2	0.22	0.40	0.19	0.18	0.49	0.17	0.72	0.41	0.74	0.75	0.58	0.32	0.89	0.90	0.47	0.19	0.18	0.16	0.04	0.03	0.00	0.00
P	0.15	0.16	0.09	0.07	0.24	0.10	0.34	0.01	0.33	0.43	0.24	0.14	0.39	0.46	0.26	0.06	0.12	0.18	0.00	0.02	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.21	0.40	0.39	0.22	0.30	0.06	0.28	0.08	0.14	0.02	0.31	0.28	0.04	0.25	0.37	0.41	0.27	0.15	0.15	0.21	0.14
C2	0.51	0.16	0.61	0.55	0.30	0.46	0.19	0.42	0.11	0.35	0.16	0.26	0.14	0.24	0.41	0.60	0.56	0.42	0.31	0.26	0.40	0.30
C2'	0.14	0.08	0.24	0.19	0.05	0.08	0.22	0.06	0.33	0.17	0.18	0.16	0.58	0.30	0.03	0.26	0.25	0.04	0.16	0.18	0.19	0.22
C3'	0.09	0.22	0.13	0.12	0.17	0.08	0.32	0.12	0.42	0.26	0.32	0.20	0.66	0.38	0.13	0.12	0.14	0.09	0.21	0.22	0.23	0.25
C4	0.35	0.11	0.41	0.39	0.22	0.31	0.11	0.30	0.07	0.22	0.11	0.22	0.17	0.13	0.29	0.36	0.39	0.29	0.18	0.18	0.30	0.19
C4'	0.33	0.44	0.38	0.36	0.35	0.33	0.35	0.31	0.42	0.30	0.41	0.43	0.57	0.35	0.31	0.39	0.37	0.31	0.27	0.27	0.23	0.25
C5	0.24	0.09	0.27	0.26	0.13	0.21	0.07	0.23	0.08	0.18	0.14	0.09	0.14	0.11	0.20	0.22	0.25	0.21	0.10	0.12	0.26	0.14
C5'	0.60	0.74	0.63	0.58	0.68	0.59	0.76	0.58	0.84	0.70	0.82	0.68	0.96	0.76	0.65	0.68	0.59	0.60	0.61	0.58	0.51	0.57
C6	0.30	0.18	0.33	0.30	0.16	0.25	0.12	0.27	0.11	0.26	0.18	0.12	0.12	0.18	0.26	0.29	0.28	0.25	0.15	0.14	0.31	0.18
C8	0.14	0.06	0.14	0.15	0.09	0.13	0.06	0.15	0.12	0.07	0.08	0.12	0.25	0.08	0.11	0.10	0.15	0.15	0.08	0.10	0.15	0.10
N1	0.45	0.17	0.52	0.46	0.25	0.39	0.18	0.37	0.12	0.34	0.17	0.19	0.12	0.24	0.37	0.50	0.45	0.38	0.26	0.21	0.38	0.26
N3	0.47	0.16	0.57	0.52	0.30	0.43	0.17	0.40	0.09	0.31	0.12	0.30	0.15	0.20	0.38	0.53	0.54	0.39	0.28	0.25	0.38	0.28
N6	0.17	0.26	0.19	0.17	0.11	0.15	0.11	0.20	0.14	0.21	0.23	0.21	0.13	0.15	0.16	0.16	0.14	0.16	0.07	0.08	0.27	0.13
N7	0.09	0.07	0.07	0.09	0.05	0.11	0.06	0.15	0.11	0.07	0.12	0.04	0.17	0.06	0.08	0.04	0.08	0.13	0.10	0.11	0.17	0.11
N9	0.26	0.10	0.30	0.29	0.16	0.23	0.03	0.22	0.10	0.11	0.08	0.20	0.26	0.03	0.19	0.25	0.30	0.21	0.10	0.11	0.20	0.12
O2'	0.31	0.21	0.46	0.39	0.15	0.25	0.10	0.17	0.22	0.06	0.06	0.31	0.49	0.19	0.16	0.50	0.47	0.18	0.05	0.08	0.12	0.12
O3'	0.05	0.21	0.12	0.10	0.16	0.04	0.33	0.09	0.43	0.26	0.33	0.17	0.68	0.39	0.11	0.12	0.13	0.05	0.21	0.22	0.24	0.25
O4'	0.48	0.46	0.52	0.53	0.42	0.47	0.28	0.46	0.17	0.32	0.27	0.51	0.06	0.24	0.42	0.47	0.52	0.45	0.37	0.39	0.44	0.37
O5'	0.47	0.74	0.58	0.60	0.54	0.49	0.44	0.47	0.48	0.35	0.69	0.66	0.35	0.33	0.45	0.56	0.64	0.42	0.43	0.48	0.48	0.41
OP1	0.86	1.05	1.05	1.02	0.94	0.87	0.92	0.82	0.98	0.82	1.08	0.99	0.91	0.84	0.88	1.10	1.11	0.78	0.82	0.85	0.74	0.74
OP2	0.26	0.32	0.07	0.21	0.16	0.32	0.20	0.44	0.07	0.38	0.25	0.22	0.18	0.37	0.26	0.11	0.17	0.40	0.47	0.53	0.68	0.61
P	0.31	0.63	0.45	0.45	0.40	0.32	0.33	0.30	0.41	0.20	0.61	0.53	0.31	0.20	0.30	0.48	0.51	0.25	0.27	0.35	0.36	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.04	0.05
C2	0.01	0.00	0.09	0.16	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.16	0.18	0.02	0.07	0.10	0.24	0.11
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.06	0.03	0.06	0.01	0.05	0.07	0.07	0.09	0.03	0.07	0.04	0.01	0.02	0.02	0.06	0.15	0.02	0.07
C3'	0.00	0.16	0.01	0.00	0.12	0.00	0.12	0.03	0.15	0.05	0.16	0.14	0.16	0.09	0.07	0.01	0.01	0.02	0.04	0.14	0.03	0.05
C4	0.02	0.02	0.06	0.12	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.13	0.12	0.02	0.05	0.06	0.19	0.08
C4'	0.01	0.05	0.03	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.09	0.11	0.07	0.04	0.14	0.11	0.06	0.08	0.02	0.01	0.03	0.16	0.04	0.04
C5	0.00	0.01	0.06	0.12	0.00	0.08	0.00	0.14	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.13	0.13	0.06	0.10	0.16	0.27	0.16
C5'	0.02	0.07	0.01	0.03	0.08	0.01	0.14	0.00	0.16	0.16	0.12	0.04	0.23	0.17	0.08	0.06	0.04	0.03	0.01	0.18	0.04	0.03
C6	0.01	0.00	0.05	0.15	0.01	0.09	0.02	0.16	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.14	0.16	0.07	0.14	0.22	0.33	0.21
C8	0.02	0.01	0.07	0.05	0.01	0.11	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.07	0.04	0.11	0.07	0.09	0.19	0.11
N1	0.00	0.00	0.07	0.16	0.02	0.07	0.02	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.16	0.18	0.04	0.11	0.18	0.30	0.17
N3	0.03	0.01	0.09	0.14	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.15	0.02	0.04	0.04	0.18	0.06
N6	0.03	0.02	0.03	0.16	0.02	0.14	0.04	0.23	0.00	0.06	0.03	0.01	0.00	0.08	0.04	0.13	0.17	0.12	0.21	0.35	0.43	0.30
N7	0.00	0.02	0.07	0.09	0.01	0.11	0.01	0.17	0.04	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.10	0.09	0.09	0.12	0.19	0.28	0.18
N9	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.00	0.08	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.06	0.05	0.02	0.02	0.13	0.04
O2'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.13	0.08	0.13	0.06	0.14	0.07	0.16	0.14	0.13	0.10	0.07	0.00	0.04	0.07	0.01	0.12	0.03	0.01
O3'	0.01	0.18	0.02	0.01	0.12	0.02	0.13	0.04	0.16	0.04	0.18	0.15	0.17	0.09	0.06	0.04	0.00	0.02	0.10	0.12	0.02	0.06
O4'	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.03	0.07	0.11	0.04	0.02	0.12	0.09	0.05	0.07	0.02	0.00	0.09	0.14	0.06	0.06
O5'	0.07	0.07	0.06	0.04	0.05	0.03	0.10	0.01	0.14	0.07	0.11	0.04	0.21	0.12	0.02	0.01	0.10	0.09	0.00	0.03	0.03	0.02
OP1	0.13	0.10	0.15	0.14	0.06	0.16	0.16	0.18	0.22	0.09	0.18	0.04	0.35	0.19	0.02	0.12	0.12	0.14	0.03	0.00	0.04	0.02
OP2	0.04	0.24	0.02	0.03	0.19	0.04	0.27	0.04	0.33	0.19	0.30	0.18	0.43	0.28	0.13	0.03	0.02	0.06	0.03	0.04	0.00	0.01
P	0.05	0.11	0.07	0.05	0.08	0.04	0.16	0.03	0.21	0.11	0.17	0.06	0.30	0.18	0.04	0.01	0.06	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00