Doublet Group distance statistics: 52763

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.000, 0.036, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.036 std_dev=0.036
N6	A	0, 0.000, 0.041, 0.082, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.041 std_dev=0.041
C8	A	0, 0.000, 0.049, 0.099, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.049 std_dev=0.049
N9	A	0, 0.000, 0.054, 0.107, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.054 std_dev=0.054
C6	B	0, 0.000, 0.177, 0.353, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.177 std_dev=0.177
N6	B	0, 0.000, 0.228, 0.456, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.228 std_dev=0.228
C3'	A	0, 0.000, 0.242, 0.485, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.242 std_dev=0.242
C5	B	0, 0.000, 0.305, 0.611, 0.611 max_d=0.611 avg_d=0.305 std_dev=0.305
O3'	A	0, 0.000, 0.339, 0.678, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.339 std_dev=0.339
C4	B	0, 0.000, 0.419, 0.838, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.419 std_dev=0.419
N1	B	0, 0.000, 0.420, 0.840, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.420 std_dev=0.420
C2'	A	0, 0.000, 0.482, 0.964, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.482 std_dev=0.482
N9	B	0, 0.000, 0.519, 1.037, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.519 std_dev=0.519
N7	B	0, 0.000, 0.539, 1.079, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.539 std_dev=0.539
O4'	A	0, 0.000, 0.545, 1.091, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.545 std_dev=0.545
C8	B	0, 0.000, 0.600, 1.200, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.600 std_dev=0.600
C4'	A	0, 0.000, 0.602, 1.203, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.602 std_dev=0.602
N3	B	0, 0.000, 0.621, 1.243, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.621 std_dev=0.621
C1'	B	0, 0.000, 0.632, 1.265, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.632 std_dev=0.632
C2	B	0, 0.000, 0.636, 1.273, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.636 std_dev=0.636
C4'	B	0, 0.000, 0.709, 1.419, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.709 std_dev=0.709
O4'	B	0, 0.000, 0.804, 1.607, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.804 std_dev=0.804
O2'	A	0, 0.000, 0.944, 1.887, 1.887 max_d=1.887 avg_d=0.944 std_dev=0.944
C5'	A	0, 0.000, 1.069, 2.139, 2.139 max_d=2.139 avg_d=1.069 std_dev=1.069
C3'	B	0, 0.000, 1.153, 2.306, 2.306 max_d=2.306 avg_d=1.153 std_dev=1.153
C2'	B	0, 0.000, 1.163, 2.327, 2.327 max_d=2.327 avg_d=1.163 std_dev=1.163
O3'	B	0, 0.000, 1.697, 3.393, 3.393 max_d=3.393 avg_d=1.697 std_dev=1.697
O2'	B	0, 0.000, 1.934, 3.868, 3.868 max_d=3.868 avg_d=1.934 std_dev=1.934
C5'	B	0, 0.000, 2.112, 4.224, 4.224 max_d=4.224 avg_d=2.112 std_dev=2.112
O5'	A	0, 0.000, 2.257, 4.514, 4.514 max_d=4.514 avg_d=2.257 std_dev=2.257
O5'	B	0, 0.000, 2.264, 4.528, 4.528 max_d=4.528 avg_d=2.264 std_dev=2.264
P	A	0, 0.000, 3.398, 6.795, 6.795 max_d=6.795 avg_d=3.398 std_dev=3.398
P	B	0, 0.000, 3.671, 7.342, 7.342 max_d=7.342 avg_d=3.671 std_dev=3.671
OP1	B	0, 0.000, 3.980, 7.960, 7.960 max_d=7.960 avg_d=3.980 std_dev=3.980
OP2	A	0, 0.000, 4.069, 8.139, 8.139 max_d=8.139 avg_d=4.069 std_dev=4.069
OP2	B	0, 0.000, 4.253, 8.507, 8.507 max_d=8.507 avg_d=4.253 std_dev=4.253
OP1	A	0, 0.000, 4.255, 8.511, 8.511 max_d=8.511 avg_d=4.255 std_dev=4.255

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.25	0.15	0.11	0.19
C2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.21	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.07	0.24	0.33	0.81	0.10	0.37
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.36	0.49	0.12	0.31
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.32	0.40	0.02
C4	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.03	0.11	0.09	0.15	0.35	0.13
C4'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.09	0.00	0.02	0.01	0.07	0.11	0.15	0.21	0.03	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.50	0.15
C5	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.29	0.11	0.77	0.43
C5'	0.03	0.32	0.05	0.03	0.14	0.01	0.04	0.00	0.11	0.16	0.24	0.31	0.05	0.11	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.29	0.36	0.01
C6	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.02	0.08	0.13	0.15	0.66	0.26
C8	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.11	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.20	0.05	0.13	0.72	0.73	1.13	0.88
N1	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.15	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.17	0.05	0.17	0.15	0.57	0.25	0.11
N3	0.02	0.00	0.03	0.04	0.00	0.21	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.07	0.25	0.28	0.67	0.15	0.32
N6	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.25	0.02	0.93	0.44
N7	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.14	0.04	0.08	0.62	0.61	1.22	0.85
N9	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.36	0.24	0.53	0.40
O2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.10	0.01	0.02	0.05	0.08	0.20	0.17	0.22	0.04	0.14	0.02	0.00	0.03	0.01	0.37	0.53	0.12	0.31
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.05	0.05	0.07	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.03	0.06	0.05	0.68	0.18
O4'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.11	0.00	0.03	0.01	0.08	0.13	0.17	0.25	0.03	0.08	0.01	0.01	0.03	0.00	0.08	0.06	0.08	0.02
O5'	0.25	0.33	0.36	0.18	0.09	0.01	0.29	0.01	0.13	0.72	0.15	0.28	0.25	0.62	0.36	0.37	0.06	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.15	0.81	0.49	0.32	0.15	0.01	0.11	0.29	0.15	0.73	0.57	0.67	0.02	0.61	0.24	0.53	0.05	0.06	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.10	0.12	0.40	0.35	0.50	0.77	0.36	0.66	1.13	0.25	0.15	0.93	1.22	0.53	0.12	0.68	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.19	0.37	0.31	0.02	0.13	0.15	0.43	0.01	0.26	0.88	0.11	0.32	0.44	0.85	0.40	0.31	0.18	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.37	0.32	0.37	0.21	0.15	0.04	0.59	0.02	0.03	0.18	0.39	0.13	0.06	0.17	0.39	0.39	0.21	0.38	0.29	0.18	0.25
C2	0.04	0.10	0.56	0.29	0.03	0.09	0.13	0.11	0.08	0.22	0.03	0.08	0.14	0.26	0.10	0.96	0.58	0.31	0.34	0.66	0.95	0.80
C2'	0.39	0.64	0.15	0.26	0.38	0.07	0.20	0.57	0.20	0.13	0.43	0.61	0.02	0.05	0.30	0.20	0.24	0.29	0.35	0.32	0.23	0.29
C3'	0.46	0.49	0.10	0.29	0.36	0.09	0.17	0.69	0.12	0.18	0.27	0.54	0.05	0.08	0.34	0.01	0.20	0.31	0.50	0.52	0.60	0.54
C4	0.12	0.30	0.40	0.27	0.12	0.03	0.02	0.24	0.00	0.08	0.17	0.28	0.14	0.15	0.05	0.65	0.42	0.22	0.01	0.18	0.52	0.31
C4'	0.66	0.37	0.16	0.05	0.44	0.06	0.22	0.59	0.07	0.36	0.11	0.56	0.10	0.21	0.50	0.34	0.08	0.44	0.46	0.53	0.60	0.55
C5	0.06	0.28	0.35	0.17	0.09	0.00	0.04	0.15	0.00	0.12	0.20	0.23	0.15	0.18	0.01	0.65	0.36	0.18	0.09	0.29	0.81	0.48
C5'	1.02	0.58	0.68	0.42	0.73	0.36	0.46	0.39	0.24	0.66	0.25	0.86	0.02	0.47	0.83	0.93	0.63	0.68	0.30	0.51	0.50	0.51
C6	0.04	0.16	0.40	0.13	0.01	0.07	0.12	0.07	0.05	0.21	0.11	0.11	0.16	0.27	0.09	0.77	0.40	0.18	0.32	0.60	1.19	0.82
C8	0.18	0.43	0.25	0.19	0.20	0.09	0.05	0.43	0.07	0.02	0.30	0.38	0.12	0.09	0.12	0.43	0.27	0.15	0.21	0.13	0.32	0.03
N1	0.09	0.08	0.49	0.18	0.07	0.12	0.17	0.21	0.09	0.28	0.04	0.04	0.14	0.33	0.15	0.91	0.50	0.25	0.46	0.81	1.28	1.00
N3	0.09	0.20	0.51	0.35	0.07	0.01	0.06	0.14	0.04	0.11	0.09	0.20	0.14	0.17	0.01	0.81	0.54	0.30	0.09	0.34	0.54	0.43
N6	0.09	0.11	0.36	0.06	0.05	0.09	0.14	0.15	0.06	0.24	0.08	0.06	0.15	0.29	0.13	0.76	0.34	0.13	0.40	0.71	1.45	0.97
N7	0.11	0.36	0.27	0.13	0.14	0.04	0.01	0.28	0.05	0.07	0.27	0.30	0.13	0.13	0.06	0.52	0.27	0.13	0.05	0.08	0.65	0.28
N9	0.21	0.42	0.31	0.26	0.21	0.08	0.05	0.43	0.05	0.00	0.25	0.39	0.12	0.08	0.14	0.47	0.34	0.20	0.21	0.09	0.21	0.02
O2'	0.13	0.60	0.45	0.54	0.23	0.27	0.08	0.69	0.18	0.10	0.45	0.49	0.03	0.12	0.08	0.60	0.59	0.11	0.43	0.33	0.25	0.30
O3'	0.12	0.22	0.54	0.74	0.07	0.41	0.06	0.94	0.06	0.09	0.07	0.23	0.17	0.15	0.03	0.48	0.69	0.06	0.74	0.67	0.89	0.74
O4'	0.55	0.30	0.02	0.10	0.37	0.04	0.16	0.52	0.01	0.29	0.05	0.48	0.15	0.14	0.42	0.09	0.04	0.39	0.37	0.37	0.30	0.34
O5'	1.55	0.60	1.34	1.13	0.97	1.02	0.55	0.27	0.14	0.94	0.10	1.12	0.19	0.60	1.20	1.62	1.37	1.22	0.29	0.04	0.11	0.07
OP1	2.44	0.65	2.36	2.19	1.41	2.08	0.94	1.24	0.35	1.63	0.17	1.35	0.03	1.14	1.87	2.91	2.58	2.17	1.11	0.76	0.61	0.71
OP2	1.48	0.13	1.45	1.31	0.58	1.14	0.03	0.36	0.50	0.59	0.50	0.73	0.98	0.11	0.92	1.94	1.68	1.19	0.19	0.16	0.07	0.12
P	1.79	0.38	1.73	1.54	0.94	1.36	0.46	0.54	0.06	1.01	0.16	1.01	0.46	0.57	1.29	2.21	1.90	1.45	0.44	0.08	0.10	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.26	0.00	0.06	0.03	0.21	0.21
C2	0.03	0.00	0.13	0.24	0.01	0.57	0.00	1.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.19	0.46	0.97	1.11	0.49	0.89
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.00	0.04	0.17	0.07	0.04	0.11	0.12	0.06	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.11	0.09	0.04	0.13
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.01	0.07	0.39	0.11	0.25	0.16	0.35	0.16	0.01	0.00	0.01	0.34	0.29	0.03	0.26
C4	0.01	0.01	0.06	0.00	0.00	0.22	0.00	0.43	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.12	0.23	0.26	0.30	0.30	0.03
C4'	0.00	0.57	0.00	0.00	0.22	0.00	0.02	0.00	0.16	0.39	0.40	0.56	0.05	0.28	0.06	0.23	0.01	0.00	0.00	0.03	0.27	0.00
C5	0.01	0.00	0.04	0.16	0.00	0.02	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.02	0.08	0.10	0.10	0.90	0.43
C5'	0.05	1.07	0.17	0.01	0.43	0.00	0.12	0.00	0.37	0.56	0.79	1.01	0.17	0.41	0.02	0.05	0.16	0.00	0.01	0.24	0.35	0.01
C6	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.16	0.01	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.25	0.04	0.18	0.17	0.21	0.67	0.12
C8	0.00	0.01	0.04	0.39	0.00	0.39	0.00	0.56	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.33	0.03	0.26	0.84	0.86	1.52	1.21
N1	0.03	0.00	0.11	0.11	0.02	0.40	0.01	0.79	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.12	0.35	0.66	0.78	0.01	0.49
N3	0.03	0.00	0.12	0.25	0.00	0.56	0.00	1.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.47	0.89	0.96	0.47	0.77
N6	0.01	0.00	0.06	0.16	0.01	0.05	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.31	0.02	0.10	0.06	0.07	1.06	0.43
N7	0.01	0.01	0.01	0.35	0.01	0.28	0.00	0.41	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.36	0.05	0.15	0.70	0.78	1.63	1.15
N9	0.01	0.01	0.00	0.16	0.00	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.10	0.00	0.21	0.18	0.67	0.45
O2'	0.02	0.04	0.00	0.01	0.13	0.23	0.26	0.05	0.25	0.33	0.15	0.01	0.31	0.36	0.17	0.00	0.00	0.17	0.23	0.24	0.05	0.22
O3'	0.26	0.19	0.02	0.00	0.12	0.01	0.02	0.16	0.04	0.03	0.12	0.22	0.02	0.05	0.10	0.00	0.00	0.18	0.39	0.35	0.02	0.29
O4'	0.00	0.46	0.01	0.01	0.23	0.00	0.08	0.00	0.18	0.26	0.35	0.47	0.10	0.15	0.00	0.17	0.18	0.00	0.09	0.07	0.01	0.08
O5'	0.06	0.97	0.11	0.34	0.26	0.00	0.10	0.01	0.17	0.84	0.66	0.89	0.06	0.70	0.21	0.23	0.39	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.03	1.11	0.09	0.29	0.30	0.03	0.10	0.24	0.21	0.86	0.78	0.96	0.07	0.78	0.18	0.24	0.35	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.21	0.49	0.04	0.03	0.30	0.27	0.90	0.35	0.67	1.52	0.01	0.47	1.06	1.63	0.67	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.21	0.89	0.13	0.26	0.03	0.00	0.43	0.01	0.12	1.21	0.49	0.77	0.43	1.15	0.45	0.22	0.29	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00