Doublet Group distance statistics: 52764

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N7	B	0, 0.000, 0.133, 0.265, 0.265 max_d=0.265 avg_d=0.133 std_dev=0.133
C5	B	0, 0.000, 0.213, 0.426, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.213 std_dev=0.213
C8	B	0, 0.000, 0.273, 0.546, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.273 std_dev=0.273
C4	B	0, 0.000, 0.348, 0.695, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.348 std_dev=0.348
C6	B	0, 0.000, 0.379, 0.758, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.379 std_dev=0.379
N9	B	0, 0.000, 0.385, 0.770, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.385 std_dev=0.385
C2'	B	0, 0.000, 0.430, 0.859, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.430 std_dev=0.430
N6	B	0, 0.000, 0.498, 0.996, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.498 std_dev=0.498
N1	B	0, 0.000, 0.518, 1.036, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.518 std_dev=0.518
N3	B	0, 0.000, 0.520, 1.041, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.520 std_dev=0.520
C2	B	0, 0.000, 0.557, 1.114, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.557 std_dev=0.557
C1'	B	0, 0.000, 0.655, 1.310, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.655 std_dev=0.655
C3'	B	0, 0.000, 0.694, 1.388, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.694 std_dev=0.694
O3'	B	0, 0.000, 0.918, 1.836, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.918 std_dev=0.918
O4'	A	0, 0.000, 0.938, 1.875, 1.875 max_d=1.875 avg_d=0.938 std_dev=0.938
O3'	A	0, 0.000, 1.034, 2.068, 2.068 max_d=2.068 avg_d=1.034 std_dev=1.034
C2'	A	0, 0.000, 1.038, 2.075, 2.075 max_d=2.075 avg_d=1.038 std_dev=1.038
C4'	B	0, 0.000, 1.078, 2.156, 2.156 max_d=2.156 avg_d=1.078 std_dev=1.078
O2'	B	0, 0.000, 1.109, 2.218, 2.218 max_d=2.218 avg_d=1.109 std_dev=1.109
C3'	A	0, 0.000, 1.140, 2.280, 2.280 max_d=2.280 avg_d=1.140 std_dev=1.140
C4'	A	0, 0.000, 1.165, 2.329, 2.329 max_d=2.329 avg_d=1.165 std_dev=1.165
O4'	B	0, 0.000, 1.300, 2.599, 2.599 max_d=2.599 avg_d=1.300 std_dev=1.300
O2'	A	0, 0.000, 1.553, 3.106, 3.106 max_d=3.106 avg_d=1.553 std_dev=1.553
OP2	B	0, 0.000, 1.796, 3.592, 3.592 max_d=3.592 avg_d=1.796 std_dev=1.796
C5'	A	0, 0.000, 1.932, 3.865, 3.865 max_d=3.865 avg_d=1.932 std_dev=1.932
C5'	B	0, 0.000, 1.968, 3.935, 3.935 max_d=3.935 avg_d=1.968 std_dev=1.968
O5'	B	0, 0.000, 2.309, 4.618, 4.618 max_d=4.618 avg_d=2.309 std_dev=2.309
P	B	0, 0.000, 2.321, 4.642, 4.642 max_d=4.642 avg_d=2.321 std_dev=2.321
OP1	B	0, 0.000, 2.355, 4.709, 4.709 max_d=4.709 avg_d=2.355 std_dev=2.355
O5'	A	0, 0.000, 3.118, 6.236, 6.236 max_d=6.236 avg_d=3.118 std_dev=3.118
OP2	A	0, 0.000, 3.168, 6.336, 6.336 max_d=6.336 avg_d=3.168 std_dev=3.168
P	A	0, 0.000, 3.932, 7.865, 7.865 max_d=7.865 avg_d=3.932 std_dev=3.932
OP1	A	0, 0.000, 4.697, 9.394, 9.394 max_d=9.394 avg_d=4.697 std_dev=4.697

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.19	0.00	0.02	0.19	0.49	0.20
C2	0.00	0.00	0.43	0.34	0.00	0.02	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.31	0.13	0.22	0.08	0.46	0.36	0.12
C2'	0.00	0.43	0.00	0.00	0.21	0.00	0.08	0.17	0.18	0.25	0.33	0.44	0.11	0.14	0.02	0.00	0.01	0.02	0.09	0.07	0.20	0.12
C3'	0.00	0.34	0.00	0.00	0.24	0.00	0.22	0.01	0.29	0.05	0.34	0.31	0.27	0.13	0.12	0.03	0.01	0.04	0.33	0.03	0.28	0.23
C4	0.01	0.00	0.21	0.24	0.00	0.01	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.10	0.02	0.60	0.50	0.28
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.07	0.01	0.02	0.04	0.06	0.03	0.20	0.02	0.01	0.02	0.30	0.24	0.02
C5	0.01	0.00	0.08	0.22	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.04	0.03	0.09	0.91	0.61	0.45
C5'	0.06	0.12	0.17	0.01	0.09	0.00	0.08	0.00	0.09	0.04	0.10	0.11	0.08	0.05	0.07	0.05	0.19	0.01	0.00	0.30	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.18	0.29	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.07	0.06	0.93	0.55	0.40
C8	0.02	0.00	0.25	0.05	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.39	0.08	0.17	0.21	0.96	0.78	0.61
N1	0.01	0.01	0.33	0.34	0.00	0.01	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.14	0.16	0.02	0.71	0.44	0.25
N3	0.00	0.00	0.44	0.31	0.00	0.02	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.33	0.08	0.22	0.08	0.35	0.37	0.11
N6	0.01	0.01	0.11	0.27	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.11	0.04	0.10	1.11	0.60	0.50
N7	0.02	0.00	0.14	0.13	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.34	0.01	0.11	0.19	1.13	0.75	0.63
N9	0.01	0.01	0.02	0.12	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.14	0.07	0.02	0.08	0.58	0.59	0.36
O2'	0.00	0.31	0.00	0.03	0.04	0.20	0.13	0.05	0.03	0.39	0.16	0.33	0.13	0.34	0.14	0.00	0.04	0.11	0.21	0.05	0.34	0.20
O3'	0.19	0.13	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.19	0.10	0.08	0.14	0.08	0.11	0.01	0.07	0.04	0.00	0.11	0.42	0.08	0.32	0.26
O4'	0.00	0.22	0.02	0.04	0.10	0.01	0.03	0.01	0.07	0.17	0.16	0.22	0.04	0.11	0.02	0.11	0.11	0.00	0.06	0.05	0.52	0.13
O5'	0.02	0.08	0.09	0.33	0.02	0.02	0.09	0.00	0.06	0.21	0.02	0.08	0.10	0.19	0.08	0.21	0.42	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.19	0.46	0.07	0.03	0.60	0.30	0.91	0.30	0.93	0.96	0.71	0.35	1.11	1.13	0.58	0.05	0.08	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00
OP2	0.49	0.36	0.20	0.28	0.50	0.24	0.61	0.10	0.55	0.78	0.44	0.37	0.60	0.75	0.59	0.34	0.32	0.52	0.00	0.03	0.00	0.00
P	0.20	0.12	0.12	0.23	0.28	0.02	0.45	0.01	0.40	0.61	0.25	0.11	0.50	0.63	0.36	0.20	0.26	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.23	0.23	0.25	0.03	0.69	0.01	1.11	0.10	0.15	0.19	0.16	0.09	0.08	0.09	0.59	0.08	0.82	1.23	0.68	0.75	1.02
C2	0.07	0.02	0.02	0.31	0.02	0.32	0.08	0.66	0.11	0.03	0.07	0.00	0.15	0.08	0.01	0.27	0.27	0.20	0.91	0.12	0.90	0.72
C2'	0.25	0.13	0.47	0.03	0.23	0.34	0.25	0.75	0.22	0.29	0.16	0.16	0.23	0.29	0.26	0.80	0.14	0.39	0.83	0.28	0.17	0.57
C3'	0.28	0.02	0.06	0.53	0.08	0.95	0.01	1.34	0.07	0.12	0.09	0.07	0.12	0.03	0.16	0.28	0.43	0.95	1.33	0.87	0.54	1.07
C4	0.08	0.02	0.11	0.26	0.07	0.51	0.07	0.87	0.02	0.12	0.02	0.03	0.01	0.10	0.10	0.38	0.14	0.54	1.06	0.32	0.85	0.85
C4'	0.73	0.16	0.38	0.79	0.42	1.25	0.36	1.51	0.22	0.57	0.13	0.33	0.18	0.45	0.58	0.03	0.62	1.36	1.51	1.15	0.80	1.27
C5	0.13	0.12	0.10	0.21	0.14	0.47	0.11	0.79	0.08	0.11	0.09	0.15	0.03	0.09	0.13	0.32	0.10	0.52	0.96	0.17	0.84	0.75
C5'	1.02	0.54	0.66	0.95	0.75	1.37	0.64	1.56	0.50	0.81	0.44	0.72	0.43	0.69	0.87	0.39	0.78	1.51	1.55	1.23	0.85	1.31
C6	0.07	0.19	0.06	0.21	0.14	0.37	0.13	0.66	0.16	0.06	0.20	0.16	0.13	0.07	0.09	0.26	0.13	0.36	0.84	0.01	0.84	0.64
C8	0.23	0.01	0.17	0.18	0.13	0.60	0.07	0.93	0.02	0.16	0.06	0.12	0.07	0.09	0.18	0.42	0.01	0.75	1.05	0.38	0.79	0.86
N1	0.02	0.12	0.02	0.26	0.08	0.30	0.12	0.60	0.17	0.02	0.17	0.09	0.20	0.07	0.03	0.23	0.21	0.21	0.80	0.04	0.86	0.61
N3	0.04	0.06	0.07	0.32	0.00	0.43	0.05	0.82	0.03	0.08	0.02	0.06	0.06	0.10	0.02	0.36	0.24	0.36	1.08	0.33	0.89	0.87
N6	0.10	0.27	0.04	0.19	0.17	0.35	0.14	0.62	0.20	0.06	0.28	0.22	0.15	0.06	0.11	0.21	0.10	0.36	0.76	0.11	0.82	0.57
N7	0.21	0.14	0.13	0.17	0.17	0.53	0.10	0.84	0.04	0.14	0.05	0.20	0.03	0.09	0.18	0.34	0.02	0.65	0.97	0.22	0.81	0.77
N9	0.16	0.09	0.17	0.23	0.07	0.61	0.05	0.98	0.04	0.15	0.10	0.00	0.05	0.10	0.14	0.46	0.08	0.73	1.13	0.47	0.80	0.92
O2'	0.88	0.38	1.09	0.62	0.59	0.30	0.50	0.24	0.38	0.67	0.32	0.53	0.32	0.56	0.73	1.49	0.74	0.26	0.42	0.02	0.16	0.25
O3'	0.32	0.04	0.17	0.71	0.17	1.09	0.14	1.58	0.06	0.27	0.02	0.12	0.05	0.20	0.26	0.24	0.63	1.00	1.59	1.23	0.72	1.36
O4'	0.84	0.11	0.39	0.79	0.52	1.26	0.46	1.54	0.26	0.73	0.11	0.34	0.23	0.59	0.73	0.00	0.57	1.48	1.61	1.16	1.06	1.38
O5'	1.54	0.86	1.30	1.51	1.14	1.79	0.96	1.87	0.75	1.18	0.69	1.14	0.63	1.01	1.30	1.14	1.39	1.88	1.84	1.49	1.11	1.56
OP1	1.63	0.27	1.64	1.95	0.79	2.25	0.51	2.33	0.13	1.03	0.00	0.71	0.08	0.67	1.16	1.76	2.08	2.05	2.10	1.80	1.32	1.84
OP2	1.03	0.25	0.77	0.94	0.56	1.30	0.38	1.39	0.15	0.68	0.07	0.53	0.03	0.47	0.76	0.78	0.88	1.37	1.30	1.02	0.71	1.09
P	1.60	0.62	1.47	1.65	1.02	1.93	0.81	1.98	0.53	1.17	0.43	0.97	0.38	0.92	1.27	1.47	1.64	1.91	1.88	1.60	1.18	1.63

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.15	0.29	0.12
C2	0.01	0.00	0.41	0.34	0.00	0.01	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.41	0.48	0.20	0.15	0.36	0.19	0.03
C2'	0.00	0.41	0.00	0.01	0.20	0.01	0.07	0.03	0.16	0.24	0.30	0.41	0.10	0.14	0.02	0.00	0.00	0.00	0.08	0.28	0.03	0.12
C3'	0.00	0.34	0.01	0.00	0.15	0.01	0.04	0.04	0.13	0.24	0.26	0.33	0.07	0.15	0.03	0.01	0.00	0.01	0.09	0.53	0.08	0.24
C4	0.00	0.00	0.20	0.15	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.20	0.09	0.13	0.36	0.12	0.02
C4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.40	0.04
C5	0.00	0.01	0.07	0.04	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.07	0.01	0.13	0.47	0.28	0.01
C5'	0.02	0.10	0.03	0.04	0.08	0.00	0.09	0.00	0.10	0.05	0.11	0.09	0.10	0.06	0.06	0.00	0.03	0.01	0.00	0.28	0.36	0.00
C6	0.00	0.01	0.16	0.13	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.19	0.06	0.15	0.50	0.37	0.03
C8	0.01	0.00	0.24	0.24	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.28	0.17	0.08	0.45	0.09	0.10
N1	0.01	0.01	0.30	0.26	0.01	0.00	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.30	0.37	0.15	0.16	0.44	0.32	0.05
N3	0.01	0.00	0.41	0.33	0.00	0.01	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.40	0.44	0.20	0.14	0.30	0.08	0.01
N6	0.00	0.01	0.10	0.07	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.11	0.03	0.16	0.56	0.48	0.04
N7	0.01	0.01	0.14	0.15	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.18	0.11	0.10	0.54	0.29	0.05
N9	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.10	0.31	0.02	0.07
O2'	0.02	0.41	0.00	0.01	0.19	0.01	0.08	0.00	0.16	0.17	0.30	0.40	0.11	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.34	0.24	0.06
O3'	0.00	0.48	0.00	0.00	0.20	0.01	0.07	0.03	0.19	0.28	0.37	0.44	0.11	0.18	0.03	0.02	0.00	0.00	0.08	0.85	0.11	0.35
O4'	0.00	0.20	0.00	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.06	0.17	0.15	0.20	0.03	0.11	0.03	0.01	0.00	0.00	0.06	0.30	0.57	0.29
O5'	0.04	0.15	0.08	0.09	0.13	0.00	0.13	0.00	0.15	0.08	0.16	0.14	0.16	0.10	0.10	0.04	0.08	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.15	0.36	0.28	0.53	0.36	0.20	0.47	0.28	0.50	0.45	0.44	0.30	0.56	0.54	0.31	0.34	0.85	0.30	0.00	0.00	0.03	0.00
OP2	0.29	0.19	0.03	0.08	0.12	0.40	0.28	0.36	0.37	0.09	0.32	0.08	0.48	0.29	0.02	0.24	0.11	0.57	0.01	0.03	0.00	0.00
P	0.12	0.03	0.12	0.24	0.02	0.04	0.01	0.00	0.03	0.10	0.05	0.01	0.04	0.05	0.07	0.06	0.35	0.29	0.01	0.00	0.00	0.00