Doublet Group distance statistics: 52765

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C5	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C6	A	0, 0.000, 0.023, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.000, 0.030, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.000, 0.035, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N6	A	0, 0.000, 0.071, 0.141, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.071 std_dev=0.071
C2'	A	0, 0.000, 0.083, 0.165, 0.165 max_d=0.165 avg_d=0.083 std_dev=0.083
O4'	A	0, 0.000, 0.120, 0.240, 0.240 max_d=0.240 avg_d=0.120 std_dev=0.120
O2'	A	0, 0.000, 0.144, 0.288, 0.288 max_d=0.288 avg_d=0.144 std_dev=0.144
C4'	A	0, 0.000, 0.240, 0.481, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.240 std_dev=0.240
C3'	A	0, 0.000, 0.252, 0.504, 0.504 max_d=0.504 avg_d=0.252 std_dev=0.252
O3'	A	0, 0.000, 0.335, 0.669, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.335 std_dev=0.335
C5'	A	0, 0.000, 0.504, 1.008, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.504 std_dev=0.504
C8	B	0, 0.000, 0.530, 1.060, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.530 std_dev=0.530
N9	B	0, 0.000, 0.532, 1.065, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.532 std_dev=0.532
N7	B	0, 0.000, 0.537, 1.074, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.537 std_dev=0.537
C1'	B	0, 0.000, 0.543, 1.087, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.543 std_dev=0.543
C4	B	0, 0.000, 0.544, 1.087, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.544 std_dev=0.544
N3	B	0, 0.000, 0.554, 1.108, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.554 std_dev=0.554
C5	B	0, 0.000, 0.555, 1.110, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.555 std_dev=0.555
C2	B	0, 0.000, 0.590, 1.180, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.590 std_dev=0.590
C6	B	0, 0.000, 0.600, 1.201, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.600 std_dev=0.600
N1	B	0, 0.000, 0.619, 1.239, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.619 std_dev=0.619
N6	B	0, 0.000, 0.636, 1.273, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.636 std_dev=0.636
C2'	B	0, 0.000, 0.637, 1.273, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.637 std_dev=0.637
O4'	B	0, 0.000, 0.668, 1.337, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.668 std_dev=0.668
O2'	B	0, 0.000, 0.669, 1.337, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.669 std_dev=0.669
C4'	B	0, 0.000, 0.772, 1.545, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.772 std_dev=0.772
C5'	B	0, 0.000, 0.801, 1.602, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.801 std_dev=0.801
O5'	B	0, 0.000, 0.842, 1.684, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.842 std_dev=0.842
C3'	B	0, 0.000, 0.843, 1.686, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.843 std_dev=0.843
O5'	A	0, 0.000, 0.979, 1.959, 1.959 max_d=1.959 avg_d=0.979 std_dev=0.979
P	B	0, 0.000, 1.061, 2.123, 2.123 max_d=2.123 avg_d=1.061 std_dev=1.061
P	A	0, 0.000, 1.251, 2.502, 2.502 max_d=2.502 avg_d=1.251 std_dev=1.251
O3'	B	0, 0.000, 1.329, 2.659, 2.659 max_d=2.659 avg_d=1.329 std_dev=1.329
OP1	B	0, 0.000, 1.357, 2.713, 2.713 max_d=2.713 avg_d=1.357 std_dev=1.357
OP2	A	0, 0.000, 1.463, 2.927, 2.927 max_d=2.927 avg_d=1.463 std_dev=1.463
OP1	A	0, 0.000, 1.622, 3.244, 3.244 max_d=3.244 avg_d=1.622 std_dev=1.622
OP2	B	0, 0.000, 1.645, 3.291, 3.291 max_d=3.291 avg_d=1.645 std_dev=1.645

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.32	0.30	0.40	0.32
C2	0.02	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.13	0.07	0.21	0.11	0.39	0.20
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.43	0.44	0.47	0.42
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.05	0.05	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.22	0.14	0.17
C4	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.16	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.07	0.09	0.04	0.29	0.25	0.47	0.31
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.08	0.03	0.01	0.09	0.09	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.05	0.00
C5	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.22	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.07	0.06	0.04	0.32	0.32	0.55	0.37
C5'	0.05	0.13	0.06	0.02	0.16	0.00	0.22	0.00	0.23	0.24	0.17	0.10	0.27	0.27	0.16	0.05	0.01	0.01	0.00	0.23	0.26	0.01
C6	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.02	0.23	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.06	0.07	0.06	0.27	0.25	0.51	0.31
C8	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.24	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.42	0.47	0.64	0.49
N1	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.09	0.11	0.06	0.24	0.16	0.45	0.25
N3	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.10	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.07	0.12	0.06	0.22	0.14	0.39	0.22
N6	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.09	0.03	0.27	0.02	0.04	0.02	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.04	0.06	0.28	0.29	0.54	0.34
N7	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.09	0.00	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02	0.38	0.44	0.64	0.46
N9	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.16	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.04	0.02	0.35	0.34	0.50	0.38
O2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.05	0.06	0.05	0.09	0.07	0.03	0.06	0.05	0.00	0.01	0.01	0.43	0.46	0.55	0.45
O3'	0.03	0.13	0.00	0.00	0.09	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.11	0.12	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.04	0.03	0.02	0.05	0.02
O4'	0.00	0.07	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.06	0.06	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.21	0.20	0.24	0.21
O5'	0.32	0.21	0.43	0.19	0.29	0.00	0.32	0.00	0.27	0.42	0.24	0.22	0.28	0.38	0.35	0.43	0.03	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.30	0.11	0.44	0.22	0.25	0.06	0.32	0.23	0.25	0.47	0.16	0.14	0.29	0.44	0.34	0.46	0.02	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.40	0.39	0.47	0.14	0.47	0.05	0.55	0.26	0.51	0.64	0.45	0.39	0.54	0.64	0.50	0.55	0.05	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.32	0.20	0.42	0.17	0.31	0.00	0.37	0.01	0.31	0.49	0.25	0.22	0.34	0.46	0.38	0.45	0.02	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.07	0.15	0.25	0.09	0.39	0.11	0.49	0.03	0.26	0.05	0.01	0.04	0.21	0.19	0.13	0.33	0.39	0.48	0.08	0.59	0.25
C2	0.03	0.31	0.13	0.09	0.13	0.11	0.07	0.29	0.18	0.08	0.30	0.23	0.12	0.07	0.03	0.10	0.12	0.12	0.29	0.22	0.84	0.34
C2'	0.22	0.06	0.19	0.30	0.10	0.44	0.11	0.53	0.04	0.25	0.04	0.01	0.04	0.20	0.19	0.17	0.42	0.41	0.54	0.08	0.56	0.27
C3'	0.23	0.06	0.21	0.37	0.10	0.49	0.13	0.58	0.06	0.28	0.03	0.00	0.08	0.23	0.20	0.15	0.51	0.44	0.61	0.08	0.51	0.28
C4	0.11	0.16	0.01	0.06	0.04	0.23	0.09	0.38	0.00	0.21	0.13	0.09	0.02	0.19	0.12	0.02	0.08	0.26	0.37	0.11	0.71	0.27
C4'	0.28	0.05	0.25	0.41	0.13	0.52	0.16	0.59	0.08	0.32	0.02	0.01	0.09	0.26	0.24	0.17	0.54	0.50	0.59	0.00	0.43	0.20
C5	0.12	0.12	0.00	0.04	0.07	0.21	0.12	0.35	0.05	0.22	0.08	0.04	0.07	0.21	0.14	0.02	0.03	0.26	0.35	0.05	0.67	0.23
C5'	0.36	0.09	0.35	0.53	0.13	0.63	0.14	0.66	0.04	0.33	0.07	0.00	0.04	0.25	0.27	0.32	0.70	0.58	0.67	0.00	0.40	0.23
C6	0.06	0.17	0.07	0.05	0.02	0.14	0.08	0.29	0.01	0.16	0.13	0.09	0.04	0.17	0.08	0.04	0.08	0.19	0.29	0.08	0.72	0.24
C8	0.23	0.00	0.12	0.18	0.17	0.32	0.19	0.42	0.11	0.28	0.02	0.07	0.11	0.26	0.23	0.14	0.23	0.36	0.41	0.04	0.55	0.17
N1	0.01	0.29	0.13	0.11	0.08	0.09	0.03	0.26	0.13	0.09	0.28	0.20	0.08	0.09	0.00	0.10	0.16	0.13	0.27	0.16	0.80	0.30
N3	0.03	0.26	0.06	0.00	0.07	0.18	0.02	0.35	0.11	0.14	0.22	0.19	0.06	0.13	0.03	0.05	0.00	0.19	0.35	0.21	0.80	0.34
N6	0.07	0.10	0.06	0.06	0.05	0.12	0.10	0.27	0.06	0.17	0.06	0.04	0.09	0.18	0.10	0.02	0.10	0.18	0.27	0.04	0.70	0.21
N7	0.19	0.01	0.07	0.11	0.15	0.26	0.18	0.37	0.12	0.26	0.02	0.06	0.12	0.25	0.21	0.10	0.13	0.31	0.37	0.03	0.59	0.17
N9	0.19	0.07	0.10	0.17	0.11	0.32	0.14	0.43	0.06	0.26	0.04	0.00	0.07	0.23	0.19	0.10	0.22	0.35	0.42	0.05	0.62	0.23
O2'	0.18	0.06	0.15	0.26	0.08	0.40	0.09	0.51	0.03	0.21	0.04	0.00	0.03	0.17	0.15	0.13	0.37	0.36	0.52	0.15	0.63	0.32
O3'	0.14	0.07	0.14	0.31	0.06	0.43	0.12	0.55	0.06	0.24	0.02	0.04	0.10	0.22	0.14	0.05	0.44	0.35	0.58	0.16	0.57	0.33
O4'	0.22	0.06	0.16	0.26	0.09	0.36	0.10	0.43	0.03	0.23	0.04	0.01	0.04	0.18	0.18	0.14	0.35	0.38	0.40	0.09	0.39	0.10
O5'	0.02	0.05	0.08	0.01	0.09	0.01	0.14	0.03	0.14	0.13	0.10	0.04	0.17	0.16	0.08	0.16	0.10	0.09	0.04	0.79	0.26	0.48
OP1	0.17	0.01	0.29	0.30	0.05	0.32	0.02	0.36	0.02	0.07	0.03	0.04	0.04	0.04	0.09	0.36	0.19	0.17	0.32	1.33	0.77	0.92
OP2	0.06	0.23	0.11	0.09	0.22	0.06	0.29	0.04	0.32	0.23	0.29	0.18	0.36	0.29	0.18	0.21	0.05	0.09	0.02	0.96	0.32	0.57
P	0.03	0.10	0.17	0.14	0.08	0.13	0.13	0.13	0.15	0.09	0.13	0.06	0.18	0.13	0.05	0.24	0.06	0.00	0.10	1.02	0.44	0.65

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.32	0.08	0.20
C2	0.01	0.00	0.10	0.15	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.00	0.01	0.21	0.29	0.09
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.02	0.07	0.00	0.08	0.09	0.05	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.35	0.02	0.21
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.12	0.00	0.12	0.01	0.14	0.06	0.15	0.13	0.13	0.09	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.17	0.06	0.09
C4	0.00	0.00	0.06	0.12	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.01	0.01	0.12	0.33	0.04
C4'	0.00	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.11	0.03	0.01	0.01	0.29	0.01	0.17
C5	0.01	0.00	0.05	0.12	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.18	0.02	0.05	0.06	0.51	0.11
C5'	0.05	0.04	0.02	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.10	0.14	0.07	0.03	0.13	0.14	0.08	0.10	0.04	0.02	0.00	0.01	0.11	0.01
C6	0.00	0.00	0.07	0.14	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.22	0.02	0.05	0.06	0.54	0.11
C8	0.02	0.00	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.09	0.02	0.06	0.12	0.49	0.14
N1	0.00	0.00	0.08	0.15	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.23	0.01	0.02	0.07	0.43	0.01
N3	0.01	0.00	0.09	0.13	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.02	0.27	0.22	0.14
N6	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.01	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.23	0.04	0.08	0.19	0.66	0.21
N7	0.01	0.00	0.02	0.09	0.00	0.03	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.15	0.03	0.07	0.21	0.61	0.21
N9	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.01	0.11	0.29	0.04
O2'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.06	0.13	0.68	0.26	0.46
O3'	0.04	0.20	0.04	0.01	0.15	0.03	0.18	0.04	0.22	0.09	0.23	0.15	0.23	0.15	0.07	0.10	0.00	0.04	0.04	0.19	0.02	0.08
O4'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.06	0.04	0.00	0.03	0.31	0.03	0.21
O5'	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.06	0.02	0.02	0.08	0.07	0.01	0.13	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.32	0.21	0.35	0.17	0.12	0.29	0.06	0.01	0.06	0.12	0.07	0.27	0.19	0.21	0.11	0.68	0.19	0.31	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.29	0.02	0.06	0.33	0.01	0.51	0.11	0.54	0.49	0.43	0.22	0.66	0.61	0.29	0.26	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.20	0.09	0.21	0.09	0.04	0.17	0.11	0.01	0.11	0.14	0.01	0.14	0.21	0.21	0.04	0.46	0.08	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00