Doublet Group distance statistics: 52767

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.000, 0.040, 0.080, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.040
C8	A	0, 0.000, 0.047, 0.093, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.047 std_dev=0.047
N9	A	0, 0.000, 0.048, 0.097, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.048 std_dev=0.048
N6	A	0, 0.000, 0.054, 0.107, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.054 std_dev=0.054
O4'	A	0, 0.000, 0.263, 0.527, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.263 std_dev=0.263
C2'	A	0, 0.000, 0.264, 0.529, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.264 std_dev=0.264
O2'	A	0, 0.000, 0.284, 0.568, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.284 std_dev=0.284
C5'	A	0, 0.000, 0.328, 0.657, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.328 std_dev=0.328
P	A	0, 0.000, 0.384, 0.769, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.384 std_dev=0.384
N6	B	0, 0.000, 0.415, 0.830, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.415 std_dev=0.415
C6	B	0, 0.000, 0.423, 0.846, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.423 std_dev=0.423
N1	B	0, 0.000, 0.425, 0.850, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.425 std_dev=0.425
C4'	A	0, 0.000, 0.426, 0.852, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.426 std_dev=0.426
O5'	A	0, 0.000, 0.484, 0.967, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.484 std_dev=0.484
C5	B	0, 0.000, 0.490, 0.979, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.490 std_dev=0.490
C3'	A	0, 0.000, 0.534, 1.068, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.534 std_dev=0.534
C2	B	0, 0.000, 0.541, 1.081, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.541 std_dev=0.541
C4	B	0, 0.000, 0.554, 1.109, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.554 std_dev=0.554
N7	B	0, 0.000, 0.556, 1.111, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.556 std_dev=0.556
OP2	B	0, 0.000, 0.564, 1.129, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.564 std_dev=0.564
O5'	B	0, 0.000, 0.582, 1.165, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.582 std_dev=0.582
C8	B	0, 0.000, 0.600, 1.200, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.600 std_dev=0.600
N3	B	0, 0.000, 0.607, 1.213, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.607 std_dev=0.607
N9	B	0, 0.000, 0.610, 1.220, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.610 std_dev=0.610
P	B	0, 0.000, 0.673, 1.347, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.673 std_dev=0.673
OP2	A	0, 0.000, 0.682, 1.364, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.682 std_dev=0.682
C1'	B	0, 0.000, 0.723, 1.447, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.723 std_dev=0.723
C2'	B	0, 0.000, 0.774, 1.547, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.774 std_dev=0.774
OP1	B	0, 0.000, 0.813, 1.626, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.813 std_dev=0.813
O2'	B	0, 0.000, 0.813, 1.626, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.813 std_dev=0.813
O3'	A	0, 0.000, 0.838, 1.676, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.838 std_dev=0.838
OP1	A	0, 0.000, 0.852, 1.704, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.852 std_dev=0.852
O4'	B	0, 0.000, 0.866, 1.732, 1.732 max_d=1.732 avg_d=0.866 std_dev=0.866
C3'	B	0, 0.000, 0.955, 1.910, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.955 std_dev=0.955
O3'	B	0, 0.000, 1.013, 2.027, 2.027 max_d=2.027 avg_d=1.013 std_dev=1.013
C4'	B	0, 0.000, 1.020, 2.041, 2.041 max_d=2.041 avg_d=1.020 std_dev=1.020
C5'	B	0, 0.000, 1.222, 2.443, 2.443 max_d=2.443 avg_d=1.222 std_dev=1.222

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.11	0.01	0.31	0.21	0.34	0.01
C2	0.01	0.00	0.09	0.05	0.03	0.06	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.12	0.12	0.29	0.16	0.27	0.01
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.04	0.10	0.07	0.03	0.09	0.08	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.48	0.28	0.30	0.09
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.13	0.15	0.09	0.02	0.18	0.16	0.07	0.02	0.01	0.00	0.19	0.13	0.61	0.16
C4	0.01	0.03	0.05	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.08	0.32	0.16	0.24	0.03
C4'	0.00	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.08	0.03	0.07	0.05	0.06	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.15	0.51	0.14
C5	0.00	0.02	0.04	0.13	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.05	0.30	0.09	0.18	0.01
C5'	0.00	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.09	0.03	0.02	0.10	0.08	0.03	0.06	0.04	0.04	0.01	0.22	0.28	0.03
C6	0.00	0.00	0.07	0.13	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.28	0.07	0.18	0.00
C8	0.00	0.03	0.03	0.15	0.00	0.08	0.02	0.09	0.04	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.11	0.09	0.03	0.33	0.10	0.18	0.02
N1	0.01	0.00	0.09	0.09	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04	0.06	0.10	0.28	0.11	0.22	0.01
N3	0.00	0.01	0.08	0.02	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.15	0.12	0.31	0.19	0.28	0.03
N6	0.02	0.01	0.08	0.18	0.01	0.05	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.06	0.03	0.01	0.09	0.04	0.23	0.01	0.16	0.03
N7	0.02	0.02	0.01	0.16	0.02	0.06	0.00	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.10	0.10	0.01	0.30	0.05	0.12	0.02
N9	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.05	0.03	0.01	0.33	0.17	0.25	0.03
O2'	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.03	0.06	0.01	0.11	0.04	0.06	0.01	0.10	0.05	0.00	0.01	0.07	0.45	0.27	0.26	0.10
O3'	0.11	0.12	0.00	0.01	0.06	0.00	0.02	0.04	0.01	0.09	0.06	0.15	0.09	0.10	0.03	0.01	0.00	0.09	0.03	0.09	0.83	0.36
O4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.08	0.01	0.05	0.04	0.07	0.03	0.10	0.12	0.04	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.08	0.16	0.42	0.08
O5'	0.31	0.29	0.48	0.19	0.32	0.00	0.30	0.01	0.28	0.33	0.28	0.31	0.23	0.30	0.33	0.45	0.03	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.21	0.16	0.28	0.13	0.16	0.15	0.09	0.22	0.07	0.10	0.11	0.19	0.01	0.05	0.17	0.27	0.09	0.16	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.34	0.27	0.30	0.61	0.24	0.51	0.18	0.28	0.18	0.18	0.22	0.28	0.16	0.12	0.25	0.26	0.83	0.42	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.01	0.01	0.09	0.16	0.03	0.14	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.10	0.36	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.06	0.08	0.02	0.03	0.05	0.05	0.16	0.01	0.13	0.07	0.02	0.02	0.11	0.09	0.10	0.01	0.02	0.12	0.10	0.06	0.10
C2	0.12	0.04	0.18	0.13	0.11	0.06	0.13	0.01	0.12	0.15	0.05	0.07	0.13	0.16	0.13	0.17	0.16	0.03	0.10	0.04	0.02	0.04
C2'	0.15	0.08	0.15	0.05	0.07	0.01	0.08	0.11	0.01	0.21	0.08	0.01	0.01	0.17	0.15	0.17	0.05	0.06	0.02	0.02	0.04	0.03
C3'	0.08	0.14	0.07	0.00	0.02	0.04	0.07	0.14	0.00	0.22	0.11	0.09	0.03	0.21	0.11	0.08	0.01	0.00	0.07	0.10	0.16	0.11
C4	0.07	0.06	0.11	0.03	0.03	0.02	0.04	0.11	0.01	0.10	0.07	0.02	0.02	0.09	0.07	0.12	0.06	0.03	0.13	0.10	0.04	0.09
C4'	0.14	0.01	0.12	0.02	0.10	0.02	0.13	0.14	0.07	0.25	0.00	0.03	0.08	0.23	0.17	0.13	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.00
C5	0.01	0.15	0.05	0.01	0.04	0.08	0.04	0.17	0.08	0.02	0.15	0.09	0.08	0.00	0.01	0.07	0.03	0.10	0.18	0.15	0.07	0.14
C5'	0.06	0.11	0.04	0.07	0.03	0.10	0.02	0.22	0.07	0.09	0.11	0.08	0.07	0.05	0.05	0.07	0.06	0.04	0.07	0.08	0.01	0.07
C6	0.00	0.10	0.08	0.03	0.02	0.06	0.01	0.12	0.03	0.02	0.10	0.06	0.03	0.02	0.00	0.08	0.08	0.09	0.17	0.13	0.05	0.12
C8	0.06	0.23	0.03	0.12	0.13	0.17	0.12	0.28	0.17	0.04	0.22	0.18	0.15	0.06	0.07	0.00	0.08	0.17	0.21	0.20	0.13	0.18
N1	0.06	0.01	0.14	0.10	0.06	0.02	0.07	0.04	0.06	0.09	0.01	0.02	0.06	0.09	0.07	0.13	0.14	0.02	0.13	0.08	0.00	0.08
N3	0.13	0.03	0.17	0.11	0.11	0.05	0.14	0.02	0.10	0.17	0.03	0.07	0.11	0.17	0.14	0.17	0.13	0.04	0.09	0.04	0.01	0.04
N6	0.07	0.16	0.02	0.02	0.09	0.11	0.07	0.18	0.08	0.05	0.14	0.13	0.07	0.05	0.07	0.02	0.04	0.16	0.22	0.18	0.09	0.17
N7	0.09	0.26	0.03	0.10	0.15	0.17	0.13	0.26	0.17	0.06	0.24	0.21	0.14	0.07	0.09	0.01	0.05	0.19	0.22	0.20	0.11	0.18
N9	0.03	0.12	0.05	0.04	0.03	0.09	0.02	0.19	0.09	0.05	0.14	0.07	0.09	0.03	0.03	0.07	0.02	0.07	0.16	0.14	0.09	0.14
O2'	0.12	0.06	0.11	0.01	0.05	0.04	0.05	0.17	0.01	0.15	0.07	0.01	0.03	0.12	0.12	0.14	0.01	0.02	0.05	0.07	0.07	0.06
O3'	0.08	0.05	0.07	0.01	0.09	0.08	0.19	0.17	0.14	0.30	0.02	0.03	0.22	0.33	0.16	0.04	0.03	0.02	0.06	0.12	0.21	0.12
O4'	0.12	0.04	0.11	0.00	0.11	0.04	0.14	0.15	0.10	0.19	0.05	0.07	0.09	0.19	0.15	0.12	0.00	0.01	0.14	0.12	0.08	0.12
O5'	0.25	0.05	0.29	0.49	0.13	0.57	0.08	0.77	0.02	0.18	0.01	0.10	0.01	0.11	0.19	0.24	0.48	0.46	0.51	0.56	0.41	0.53
OP1	0.11	0.01	0.07	0.03	0.09	0.09	0.14	0.22	0.10	0.24	0.03	0.01	0.13	0.22	0.16	0.07	0.04	0.02	0.22	0.13	0.24	0.18
OP2	0.03	0.23	0.00	0.16	0.18	0.21	0.23	0.42	0.28	0.13	0.28	0.18	0.31	0.20	0.10	0.11	0.10	0.16	0.17	0.25	0.29	0.26
P	0.00	0.11	0.01	0.15	0.06	0.22	0.05	0.39	0.08	0.01	0.10	0.09	0.07	0.01	0.01	0.04	0.12	0.14	0.08	0.16	0.09	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.13	0.01
C2	0.00	0.00	0.14	0.12	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.11	0.19	0.07	0.15	0.09	0.02	0.09
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.08	0.10	0.14	0.03	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.12	0.15	0.05	0.09
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.03	0.11	0.09	0.11	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.20	0.20	0.01	0.16
C4	0.00	0.00	0.06	0.05	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.05	0.15	0.09	0.05	0.07
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.00	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.03	0.00	0.01	0.04	0.10	0.02
C5	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.19	0.12	0.01	0.10
C5'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.04	0.03	0.02	0.04	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.11	0.02
C6	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.06	0.21	0.13	0.02	0.12
C8	0.00	0.00	0.08	0.11	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.13	0.00	0.18	0.11	0.07	0.07
N1	0.00	0.00	0.10	0.09	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.14	0.07	0.18	0.11	0.01	0.11
N3	0.00	0.00	0.14	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.18	0.07	0.12	0.07	0.05	0.06
N6	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.23	0.15	0.05	0.14
N7	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.02	0.22	0.14	0.01	0.11
N9	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.08	0.09	0.04
O2'	0.00	0.11	0.00	0.02	0.05	0.03	0.02	0.02	0.04	0.06	0.08	0.11	0.02	0.04	0.01	0.00	0.09	0.02	0.03	0.09	0.09	0.03
O3'	0.03	0.19	0.03	0.01	0.07	0.03	0.01	0.02	0.05	0.13	0.14	0.18	0.02	0.10	0.01	0.09	0.00	0.03	0.22	0.31	0.09	0.24
O4'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.06	0.00	0.07	0.07	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.08	0.05	0.18	0.07
O5'	0.03	0.15	0.12	0.20	0.15	0.01	0.19	0.00	0.21	0.18	0.18	0.12	0.23	0.22	0.12	0.03	0.22	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01
OP1	0.03	0.09	0.15	0.20	0.09	0.04	0.12	0.04	0.13	0.11	0.11	0.07	0.15	0.14	0.08	0.09	0.31	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.02	0.05	0.01	0.05	0.10	0.01	0.11	0.02	0.07	0.01	0.05	0.05	0.01	0.09	0.09	0.09	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.01	0.09	0.09	0.16	0.07	0.02	0.10	0.02	0.12	0.07	0.11	0.06	0.14	0.11	0.04	0.03	0.24	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00