Doublet Group distance statistics: 52784

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 5, 11, 6, 4, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.007, 0.009, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.010, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.005, 0.011, 0.016, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.009 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.011, 0.030, 0.048, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.030 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.027 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.052, 0.125, 0.198, 0.407 max_d=0.407 avg_d=0.125 std_dev=0.073
C2'	A	0, 0.039, 0.113, 0.187, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.113 std_dev=0.074
C2'	B	0, 0.146, 0.299, 0.453, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.299 std_dev=0.153
C4'	A	0, 0.145, 0.310, 0.475, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.310 std_dev=0.165
O2'	B	0, 0.112, 0.284, 0.457, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.284 std_dev=0.173
O2'	A	0, 0.102, 0.297, 0.492, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.297 std_dev=0.195
C3'	A	0, 0.053, 0.273, 0.492, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.273 std_dev=0.220
C3'	B	0, 0.114, 0.389, 0.664, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.389 std_dev=0.275
C1'	B	0, 0.088, 0.369, 0.651, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.369 std_dev=0.282
C5'	A	0, 0.207, 0.537, 0.867, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.537 std_dev=0.330
O3'	A	0, -0.101, 0.365, 0.831, 2.732 max_d=2.732 avg_d=0.365 std_dev=0.466
N1	B	0, -0.033, 0.453, 0.940, 2.402 max_d=2.402 avg_d=0.453 std_dev=0.486
O5'	A	0, 0.097, 0.585, 1.074, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.585 std_dev=0.488
O3'	B	0, -0.039, 0.462, 0.964, 2.703 max_d=2.703 avg_d=0.462 std_dev=0.502
C4'	B	0, -0.005, 0.502, 1.009, 2.627 max_d=2.627 avg_d=0.502 std_dev=0.507
O4'	B	0, -0.007, 0.502, 1.011, 3.058 max_d=3.058 avg_d=0.502 std_dev=0.509
P	A	0, -0.028, 0.582, 1.192, 3.329 max_d=3.329 avg_d=0.582 std_dev=0.610
C2	B	0, -0.145, 0.494, 1.134, 3.398 max_d=3.398 avg_d=0.494 std_dev=0.640
O2	B	0, -0.174, 0.483, 1.140, 3.923 max_d=3.923 avg_d=0.483 std_dev=0.657
C5'	B	0, -0.069, 0.629, 1.327, 3.498 max_d=3.498 avg_d=0.629 std_dev=0.698
O5'	B	0, -0.052, 0.666, 1.383, 3.666 max_d=3.666 avg_d=0.666 std_dev=0.718
C6	B	0, -0.180, 0.541, 1.262, 3.676 max_d=3.676 avg_d=0.541 std_dev=0.721
OP2	A	0, -0.051, 0.755, 1.561, 4.356 max_d=4.356 avg_d=0.755 std_dev=0.806
N3	B	0, -0.356, 0.589, 1.534, 4.594 max_d=4.594 avg_d=0.589 std_dev=0.945
P	B	0, -0.186, 0.802, 1.791, 5.073 max_d=5.073 avg_d=0.802 std_dev=0.989
C5	B	0, -0.406, 0.640, 1.685, 4.988 max_d=4.988 avg_d=0.640 std_dev=1.046
OP1	A	0, -0.027, 1.038, 2.102, 5.535 max_d=5.535 avg_d=1.038 std_dev=1.065
OP1	B	0, -0.233, 0.895, 2.023, 5.361 max_d=5.361 avg_d=0.895 std_dev=1.128
C4	B	0, -0.507, 0.656, 1.819, 5.097 max_d=5.097 avg_d=0.656 std_dev=1.163
OP2	B	0, -0.291, 0.885, 2.061, 5.761 max_d=5.761 avg_d=0.885 std_dev=1.176
O4	B	0, -0.671, 0.821, 2.314, 6.606 max_d=6.606 avg_d=0.821 std_dev=1.492

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.12	0.66	0.15	0.24
C2	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.11	0.03	0.20	0.67	0.25	0.26
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.02	0.06	0.03	0.10	0.00	0.02	0.01	0.23	0.58	0.23	0.26
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.15	0.00	0.16	0.01	0.15	0.09	0.12	0.16	0.09	0.02	0.01	0.03	0.20	0.49	0.07	0.16
C4	0.01	0.00	0.03	0.15	0.00	0.10	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.08	0.03	0.27	0.60	0.34	0.26
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.12	0.06	0.06	0.11	0.03	0.13	0.01	0.00	0.02	0.44	0.11	0.10
C5	0.01	0.00	0.02	0.16	0.00	0.13	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.03	0.29	0.56	0.33	0.25
C5'	0.05	0.13	0.05	0.01	0.24	0.01	0.28	0.00	0.25	0.15	0.18	0.27	0.07	0.09	0.09	0.03	0.01	0.28	0.16	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.15	0.00	0.12	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.03	0.27	0.59	0.26	0.25
N1	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.05	0.02	0.20	0.65	0.22	0.25
N3	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.06	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.09	0.03	0.24	0.65	0.30	0.26
N4	0.01	0.01	0.03	0.16	0.00	0.11	0.01	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.09	0.03	0.29	0.57	0.37	0.26
O2	0.01	0.00	0.10	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.19	0.03	0.15	0.68	0.22	0.26
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.15	0.13	0.11	0.09	0.08	0.09	0.17	0.16	0.17	0.00	0.04	0.09	0.11	0.52	0.16	0.16
O3'	0.11	0.11	0.02	0.01	0.08	0.01	0.10	0.09	0.08	0.05	0.09	0.09	0.19	0.04	0.00	0.07	0.10	0.35	0.23	0.05
O4'	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.09	0.07	0.00	0.10	0.65	0.14	0.26
O5'	0.12	0.20	0.23	0.20	0.27	0.02	0.29	0.01	0.27	0.20	0.24	0.29	0.15	0.11	0.10	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.66	0.67	0.58	0.49	0.60	0.44	0.56	0.28	0.59	0.65	0.65	0.57	0.68	0.52	0.35	0.65	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.25	0.23	0.07	0.34	0.11	0.33	0.16	0.26	0.22	0.30	0.37	0.22	0.16	0.23	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.24	0.26	0.26	0.16	0.26	0.10	0.25	0.01	0.25	0.25	0.26	0.26	0.26	0.16	0.05	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.15	0.15	0.13	0.15	0.36	0.10	0.38	0.10	0.12	0.17	0.21	0.14	0.10	0.21	0.37	0.29	0.35	0.31	0.33
C2	0.16	0.22	0.12	0.12	0.34	0.31	0.24	0.33	0.13	0.12	0.32	0.26	0.13	0.18	0.44	0.32	0.25	0.33	0.24	0.28
C2'	0.24	0.14	0.17	0.16	0.20	0.39	0.18	0.39	0.16	0.16	0.16	0.18	0.18	0.16	0.26	0.37	0.28	0.34	0.29	0.31
C3'	0.14	0.20	0.12	0.08	0.34	0.28	0.32	0.31	0.25	0.18	0.28	0.16	0.15	0.15	0.40	0.24	0.17	0.26	0.25	0.22
C4	0.11	0.29	0.10	0.15	0.49	0.28	0.38	0.29	0.23	0.17	0.45	0.28	0.14	0.26	0.61	0.25	0.21	0.29	0.17	0.21
C4'	0.20	0.09	0.11	0.10	0.15	0.38	0.19	0.40	0.19	0.14	0.10	0.12	0.14	0.18	0.18	0.36	0.28	0.36	0.34	0.34
C5	0.12	0.27	0.10	0.15	0.41	0.26	0.31	0.27	0.19	0.16	0.39	0.28	0.14	0.25	0.51	0.25	0.20	0.27	0.17	0.20
C5'	0.31	0.27	0.25	0.20	0.31	0.39	0.34	0.37	0.33	0.29	0.28	0.26	0.33	0.32	0.32	0.37	0.28	0.32	0.36	0.32
C6	0.16	0.21	0.12	0.12	0.28	0.28	0.20	0.28	0.11	0.12	0.28	0.25	0.13	0.20	0.36	0.29	0.22	0.28	0.22	0.24
N1	0.18	0.19	0.13	0.12	0.26	0.31	0.17	0.33	0.10	0.12	0.25	0.24	0.14	0.16	0.34	0.33	0.25	0.31	0.25	0.28
N3	0.13	0.26	0.11	0.14	0.44	0.29	0.33	0.31	0.19	0.15	0.41	0.27	0.13	0.23	0.57	0.28	0.23	0.31	0.19	0.24
N4	0.10	0.33	0.09	0.17	0.60	0.29	0.47	0.30	0.30	0.21	0.54	0.28	0.14	0.28	0.75	0.24	0.21	0.30	0.15	0.20
O2	0.17	0.21	0.13	0.12	0.32	0.33	0.22	0.36	0.12	0.12	0.30	0.25	0.13	0.16	0.42	0.34	0.27	0.35	0.26	0.31
O2'	0.21	0.14	0.13	0.09	0.19	0.32	0.19	0.31	0.16	0.14	0.15	0.19	0.15	0.13	0.24	0.33	0.19	0.24	0.24	0.22
O3'	0.16	0.25	0.17	0.11	0.42	0.26	0.42	0.28	0.33	0.24	0.34	0.19	0.21	0.18	0.48	0.23	0.13	0.21	0.28	0.18
O4'	0.22	0.18	0.16	0.13	0.12	0.38	0.10	0.40	0.13	0.15	0.17	0.25	0.14	0.09	0.15	0.40	0.31	0.36	0.34	0.35
O5'	0.31	0.38	0.40	0.26	0.41	0.22	0.41	0.18	0.39	0.36	0.40	0.38	0.44	0.02	0.42	0.28	0.24	0.20	0.37	0.24
OP1	0.13	0.26	0.08	0.11	0.12	0.30	0.11	0.45	0.11	0.10	0.23	0.41	0.25	0.02	0.14	0.21	0.47	0.68	0.61	0.58
OP2	0.19	0.26	0.29	0.07	0.36	0.10	0.41	0.24	0.37	0.28	0.30	0.25	0.39	0.02	0.37	0.07	0.31	0.37	0.51	0.38
P	0.08	0.14	0.13	0.02	0.11	0.09	0.16	0.14	0.16	0.09	0.12	0.23	0.20	0.01	0.11	0.05	0.23	0.30	0.38	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.14	0.01	0.00	0.04	0.05	0.06	0.03
C2	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.20	0.01	0.03	0.10	0.09	0.10	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.05	0.07	0.03	0.04	0.07	0.00	0.04	0.07	0.03	0.11	0.12	0.14	0.11
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.08	0.00	0.12	0.02	0.12	0.05	0.03	0.07	0.02	0.01	0.08	0.01	0.10	0.13	0.15	0.11
C4	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.08	0.00	0.03	0.19	0.19	0.21	0.19
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.02	0.02	0.05	0.09	0.03	0.06	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.07	0.01	0.04	0.20	0.20	0.20	0.20
C5'	0.02	0.07	0.05	0.02	0.14	0.00	0.15	0.00	0.12	0.07	0.10	0.05	0.07	0.09	0.16	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.07	0.01	0.05	0.16	0.15	0.13	0.14
N1	0.00	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.01	0.01	0.10	0.09	0.09	0.07
N3	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.16	0.01	0.03	0.15	0.14	0.16	0.13
O2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.30	0.01	0.06	0.07	0.06	0.09	0.05
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.18	0.09	0.16	0.07	0.13	0.09	0.16	0.15	0.00	0.08	0.21	0.06	0.10	0.14	0.17	0.12
O3'	0.14	0.20	0.04	0.01	0.08	0.03	0.07	0.09	0.07	0.10	0.16	0.30	0.08	0.00	0.09	0.08	0.17	0.26	0.25	0.20
O4	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.09	0.00	0.04	0.22	0.23	0.25	0.23
O4'	0.00	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.06	0.06	0.08	0.04	0.00	0.06	0.05	0.15	0.09
O5'	0.04	0.10	0.11	0.10	0.19	0.01	0.20	0.01	0.16	0.10	0.15	0.07	0.10	0.17	0.22	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.09	0.12	0.13	0.19	0.05	0.20	0.05	0.15	0.09	0.14	0.06	0.14	0.26	0.23	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.10	0.14	0.15	0.21	0.05	0.20	0.02	0.13	0.09	0.16	0.09	0.17	0.25	0.25	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.08	0.11	0.11	0.19	0.02	0.20	0.01	0.14	0.07	0.13	0.05	0.12	0.20	0.23	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00