Doublet Group distance statistics: 52796

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.004, 0.009, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.004 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N1	A	0, -0.001, 0.012, 0.024, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N3	A	0, -0.004, 0.012, 0.028, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.012 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.009, 0.026, 0.043, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.009, 0.034, 0.058, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.034 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.015, 0.088, 0.161, 0.199 max_d=0.199 avg_d=0.088 std_dev=0.073
C2'	A	0, 0.008, 0.095, 0.181, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.095 std_dev=0.086
C4'	A	0, 0.023, 0.124, 0.224, 0.254 max_d=0.254 avg_d=0.124 std_dev=0.101
C3'	A	0, 0.028, 0.139, 0.250, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.139 std_dev=0.111
O2'	A	0, 0.007, 0.121, 0.235, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.121 std_dev=0.114
O5'	A	0, 0.052, 0.189, 0.325, 0.387 max_d=0.387 avg_d=0.189 std_dev=0.136
OP1	A	0, 0.076, 0.223, 0.370, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.223 std_dev=0.147
O3'	A	0, 0.053, 0.201, 0.349, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.201 std_dev=0.148
P	A	0, 0.046, 0.194, 0.342, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.194 std_dev=0.148
O3'	B	0, 0.056, 0.235, 0.414, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.235 std_dev=0.179
OP2	A	0, 0.075, 0.267, 0.459, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.267 std_dev=0.192
C5'	A	0, 0.018, 0.218, 0.418, 0.518 max_d=0.518 avg_d=0.218 std_dev=0.200
O2'	B	0, 0.105, 0.371, 0.637, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.371 std_dev=0.266
C2'	B	0, 0.035, 0.443, 0.852, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.443 std_dev=0.408
C3'	B	0, -0.050, 0.463, 0.975, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.463 std_dev=0.512
C1'	B	0, -0.259, 0.739, 1.737, 2.691 max_d=2.691 avg_d=0.739 std_dev=0.998
OP1	B	0, -0.049, 0.971, 1.991, 2.657 max_d=2.657 avg_d=0.971 std_dev=1.020
C4'	B	0, -0.343, 0.764, 1.871, 2.944 max_d=2.944 avg_d=0.764 std_dev=1.107
N1	B	0, -0.376, 0.928, 2.233, 3.487 max_d=3.487 avg_d=0.928 std_dev=1.305
O4'	B	0, -0.481, 0.907, 2.296, 3.658 max_d=3.658 avg_d=0.907 std_dev=1.389
C6	B	0, -0.424, 1.062, 2.549, 3.954 max_d=3.954 avg_d=1.062 std_dev=1.487
C2	B	0, -0.512, 1.082, 2.675, 4.232 max_d=4.232 avg_d=1.082 std_dev=1.593
O5'	B	0, -0.447, 1.155, 2.756, 4.273 max_d=4.273 avg_d=1.155 std_dev=1.601
C5'	B	0, -0.549, 1.100, 2.749, 4.359 max_d=4.359 avg_d=1.100 std_dev=1.649
O2	B	0, -0.586, 1.146, 2.878, 4.581 max_d=4.581 avg_d=1.146 std_dev=1.732
C5	B	0, -0.527, 1.227, 2.981, 4.650 max_d=4.650 avg_d=1.227 std_dev=1.754
P	B	0, -0.397, 1.363, 3.123, 4.719 max_d=4.719 avg_d=1.363 std_dev=1.760
N3	B	0, -0.601, 1.254, 3.108, 4.919 max_d=4.919 avg_d=1.254 std_dev=1.855
C4	B	0, -0.600, 1.298, 3.196, 5.030 max_d=5.030 avg_d=1.298 std_dev=1.898
O4	B	0, -0.699, 1.462, 3.624, 5.718 max_d=5.718 avg_d=1.462 std_dev=2.162
OP2	B	0, -0.665, 1.816, 4.298, 6.634 max_d=6.634 avg_d=1.816 std_dev=2.481

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.07	0.12	0.10	0.11
C2	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.12	0.14	0.14	0.13
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.03	0.05	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.06	0.02
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.08	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.08	0.06
C4	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.01	0.12	0.15	0.17	0.14
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.03	0.03
C5	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.10	0.14	0.16	0.13
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.04	0.05	0.05	0.05	0.02	0.04	0.01	0.01	0.08	0.00	0.00
C6	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.09	0.12	0.13	0.12
N1	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.10	0.13	0.12	0.12
N3	0.03	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.13	0.15	0.16	0.14
N4	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.01	0.13	0.17	0.19	0.16
O2	0.03	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.03	0.13	0.14	0.13	0.13
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.05	0.05	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.06	0.02	0.04	0.04	0.09	0.03	0.00	0.01	0.11	0.08	0.14	0.11
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.10	0.16	0.13	0.14
O5'	0.07	0.12	0.02	0.05	0.12	0.01	0.10	0.01	0.09	0.10	0.13	0.13	0.13	0.02	0.11	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.12	0.14	0.03	0.02	0.15	0.07	0.14	0.08	0.12	0.13	0.15	0.17	0.14	0.04	0.08	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.14	0.06	0.08	0.17	0.03	0.16	0.00	0.13	0.12	0.16	0.19	0.13	0.05	0.14	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.13	0.02	0.06	0.14	0.03	0.13	0.00	0.12	0.12	0.14	0.16	0.13	0.02	0.11	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.70	1.02	0.18	0.08	0.90	0.40	0.71	0.22	0.65	0.79	1.03	1.20	0.09	0.15	0.93	0.75	0.41	0.31	0.21	0.32
C2	0.55	0.96	0.09	0.13	0.76	0.12	0.50	0.21	0.43	0.64	0.97	1.22	0.13	0.14	0.81	0.47	0.10	0.24	0.16	0.11
C2'	0.59	0.91	0.12	0.06	0.82	0.32	0.64	0.15	0.57	0.69	0.94	1.07	0.11	0.08	0.87	0.66	0.30	0.19	0.09	0.17
C3'	0.42	0.62	0.09	0.07	0.57	0.27	0.46	0.15	0.41	0.48	0.64	0.71	0.17	0.06	0.61	0.53	0.24	0.16	0.20	0.10
C4	0.33	0.70	0.10	0.28	0.45	0.22	0.21	0.59	0.17	0.38	0.68	0.97	0.22	0.13	0.48	0.15	0.26	0.23	0.41	0.27
C4'	0.51	0.63	0.13	0.13	0.62	0.49	0.56	0.42	0.53	0.56	0.65	0.66	0.21	0.07	0.64	0.72	0.48	0.26	0.16	0.34
C5	0.30	0.60	0.10	0.27	0.38	0.22	0.19	0.54	0.17	0.34	0.57	0.83	0.22	0.13	0.40	0.14	0.21	0.23	0.35	0.23
C5'	0.26	0.24	0.07	0.09	0.29	0.42	0.30	0.42	0.30	0.27	0.26	0.19	0.31	0.07	0.30	0.51	0.41	0.22	0.08	0.27
C6	0.44	0.72	0.09	0.16	0.54	0.09	0.35	0.26	0.31	0.48	0.70	0.92	0.15	0.13	0.55	0.34	0.10	0.24	0.17	0.13
N1	0.56	0.91	0.11	0.09	0.73	0.18	0.51	0.11	0.46	0.64	0.90	1.13	0.11	0.14	0.76	0.52	0.18	0.25	0.11	0.15
N3	0.45	0.86	0.07	0.21	0.63	0.11	0.35	0.43	0.29	0.52	0.86	1.14	0.18	0.13	0.67	0.30	0.14	0.22	0.31	0.18
N4	0.25	0.62	0.13	0.33	0.34	0.34	0.14	0.77	0.14	0.29	0.59	0.90	0.27	0.14	0.37	0.10	0.41	0.25	0.56	0.41
O2	0.62	1.08	0.11	0.09	0.90	0.20	0.62	0.11	0.54	0.74	1.10	1.33	0.11	0.14	0.96	0.58	0.18	0.25	0.10	0.13
O2'	0.73	1.09	0.20	0.11	1.05	0.49	0.86	0.36	0.77	0.87	1.15	1.22	0.11	0.10	1.12	0.86	0.48	0.27	0.15	0.34
O3'	0.37	0.55	0.09	0.08	0.54	0.29	0.45	0.20	0.40	0.44	0.58	0.60	0.21	0.09	0.58	0.51	0.24	0.14	0.28	0.08
O4'	0.70	0.88	0.21	0.17	0.79	0.53	0.69	0.41	0.66	0.75	0.87	0.98	0.13	0.18	0.81	0.83	0.55	0.37	0.36	0.45
O5'	0.14	0.18	0.01	0.01	0.18	0.13	0.15	0.07	0.14	0.15	0.18	0.19	0.09	0.01	0.18	0.21	0.15	0.17	0.28	0.09
OP1	0.20	0.30	0.03	0.17	0.19	0.05	0.11	0.20	0.10	0.20	0.27	0.38	0.03	0.02	0.19	0.17	0.15	0.19	0.34	0.12
OP2	0.16	0.07	0.08	0.21	0.13	0.48	0.21	0.65	0.22	0.15	0.08	0.06	0.17	0.01	0.13	0.36	0.40	0.30	0.82	0.49
P	0.07	0.06	0.01	0.01	0.04	0.12	0.05	0.14	0.05	0.06	0.05	0.06	0.04	0.00	0.04	0.10	0.05	0.19	0.39	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.06	0.34	0.26	0.04
C2	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.04	0.02	0.06	0.03	0.57	0.47	0.09
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.06	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.03	0.00	0.31	0.27	0.57	0.35
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.23	0.32	0.20	0.25
C4	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.06	0.50	0.76	0.11
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.18	0.22	0.12
C5	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.04	0.01	0.03	0.09	0.35	0.82	0.16
C5'	0.01	0.06	0.03	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.06	0.04	0.07	0.07	0.03	0.03	0.08	0.01	0.01	0.14	0.33	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.04	0.01	0.05	0.10	0.30	0.69	0.14
N1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.06	0.42	0.48	0.06
N3	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.04	0.01	0.05	0.04	0.59	0.61	0.09
O2	0.02	0.00	0.06	0.02	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.04	0.02	0.10	0.02	0.64	0.35	0.13
O2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.08	0.03	0.09	0.01	0.05	0.13	0.00	0.01	0.03	0.01	0.34	0.36	0.71	0.43
O3'	0.03	0.04	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.05	0.03	0.15	0.17	0.09	0.12
O4	0.03	0.02	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.05	0.00	0.04	0.06	0.52	0.82	0.12
O4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.10	0.01	0.03	0.04	0.00	0.16	0.62	0.15	0.31
O5'	0.06	0.03	0.31	0.23	0.06	0.01	0.09	0.01	0.10	0.06	0.04	0.02	0.34	0.15	0.06	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.34	0.57	0.27	0.32	0.50	0.18	0.35	0.14	0.30	0.42	0.59	0.64	0.36	0.17	0.52	0.62	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.47	0.57	0.20	0.76	0.22	0.82	0.33	0.69	0.48	0.61	0.35	0.71	0.09	0.82	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.09	0.35	0.25	0.11	0.12	0.16	0.02	0.14	0.06	0.09	0.13	0.43	0.12	0.12	0.31	0.01	0.00	0.00	0.00