Doublet Group distance statistics: 52802

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.009, 0.029, 0.049, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.029 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.013, 0.039, 0.064, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.039 std_dev=0.026
C6	A	0, 0.013, 0.039, 0.065, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.039 std_dev=0.026
C2	A	0, 0.014, 0.041, 0.067, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.041 std_dev=0.026
C4	A	0, 0.013, 0.040, 0.068, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.040 std_dev=0.027
O2	A	0, 0.030, 0.089, 0.149, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.089 std_dev=0.059
N4	A	0, 0.042, 0.127, 0.213, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.127 std_dev=0.085
O4'	A	0, 0.029, 0.129, 0.230, 0.273 max_d=0.273 avg_d=0.129 std_dev=0.100
C2'	A	0, 0.090, 0.252, 0.413, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.252 std_dev=0.162
C4'	A	0, 0.049, 0.230, 0.411, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.230 std_dev=0.181
C3'	A	0, 0.149, 0.358, 0.567, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.358 std_dev=0.209
O2'	A	0, 0.081, 0.377, 0.673, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.377 std_dev=0.296
C5'	A	0, 0.086, 0.439, 0.793, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.439 std_dev=0.354
O3'	A	0, 0.237, 0.600, 0.964, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.600 std_dev=0.364
O2'	B	0, 0.209, 0.576, 0.943, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.576 std_dev=0.367
C2	B	0, 0.272, 0.724, 1.175, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.724 std_dev=0.452
N3	B	0, 0.265, 0.736, 1.207, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.736 std_dev=0.471
O5'	A	0, 0.262, 0.734, 1.205, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.734 std_dev=0.471
C2'	B	0, 0.220, 0.691, 1.163, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.691 std_dev=0.472
O3'	B	0, 0.166, 0.656, 1.146, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.656 std_dev=0.490
C1'	B	0, 0.295, 0.812, 1.330, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.812 std_dev=0.518
P	A	0, 0.252, 0.782, 1.312, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.782 std_dev=0.530
O5'	B	0, 0.282, 0.878, 1.474, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.878 std_dev=0.596
OP2	A	0, 0.376, 0.981, 1.585, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.981 std_dev=0.605
C3'	B	0, 0.146, 0.803, 1.460, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.803 std_dev=0.657
P	B	0, 0.273, 0.930, 1.587, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.930 std_dev=0.657
O4'	B	0, 0.309, 0.971, 1.632, 1.787 max_d=1.787 avg_d=0.971 std_dev=0.662
OP2	B	0, 0.307, 0.980, 1.653, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.980 std_dev=0.673
OP1	B	0, 0.304, 0.989, 1.674, 1.864 max_d=1.864 avg_d=0.989 std_dev=0.685
N1	B	0, 0.336, 1.029, 1.722, 1.753 max_d=1.753 avg_d=1.029 std_dev=0.693
OP1	A	0, 0.409, 1.110, 1.812, 1.942 max_d=1.942 avg_d=1.110 std_dev=0.701
C4'	B	0, 0.198, 0.972, 1.747, 1.973 max_d=1.973 avg_d=0.972 std_dev=0.774
O2	B	0, 0.362, 1.315, 2.268, 2.326 max_d=2.326 avg_d=1.315 std_dev=0.953
C4	B	0, 0.383, 1.478, 2.573, 2.577 max_d=2.577 avg_d=1.478 std_dev=1.095
C5'	B	0, 0.280, 1.466, 2.652, 2.898 max_d=2.898 avg_d=1.466 std_dev=1.186
O4	B	0, 0.403, 1.624, 2.845, 2.827 max_d=2.827 avg_d=1.624 std_dev=1.221
C6	B	0, 0.413, 1.922, 3.431, 3.495 max_d=3.495 avg_d=1.922 std_dev=1.509
C5	B	0, 0.428, 2.190, 3.951, 4.034 max_d=4.034 avg_d=2.190 std_dev=1.761

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.17	0.10	0.06
C2	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.08	0.02	0.25	0.16	0.07	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.03	0.08	0.02	0.03	0.06	0.14	0.00	0.02	0.00	0.23	0.28	0.08	0.12
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.10	0.04	0.09	0.02	0.07	0.07	0.17	0.01	0.01	0.00	0.32	0.37	0.13	0.16
C4	0.00	0.00	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.03	0.38	0.15	0.25	0.20
C4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03	0.08	0.02	0.04	0.00	0.00	0.25	0.28	0.01
C5	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.13	0.04	0.40	0.14	0.27	0.21
C5'	0.02	0.12	0.03	0.04	0.12	0.00	0.09	0.00	0.07	0.08	0.13	0.12	0.13	0.02	0.07	0.01	0.01	0.38	0.43	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.04	0.34	0.16	0.15	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.25	0.17	0.05	0.12
N3	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.32	0.16	0.16	0.17
N4	0.00	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.03	0.42	0.14	0.32	0.23
O2	0.02	0.00	0.14	0.17	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.17	0.01	0.18	0.16	0.06	0.10
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.05	0.02	0.03	0.06	0.08	0.00	0.02	0.02	0.08	0.22	0.16	0.04
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.09	0.04	0.13	0.07	0.11	0.02	0.06	0.11	0.17	0.02	0.00	0.03	0.27	0.38	0.19	0.12
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.07	0.15	0.20	0.05
O5'	0.11	0.25	0.23	0.32	0.38	0.00	0.40	0.01	0.34	0.25	0.32	0.42	0.18	0.08	0.27	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.17	0.16	0.28	0.37	0.15	0.25	0.14	0.38	0.16	0.17	0.16	0.14	0.16	0.22	0.38	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.07	0.08	0.13	0.25	0.28	0.27	0.43	0.15	0.05	0.16	0.32	0.06	0.16	0.19	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.13	0.12	0.16	0.20	0.01	0.21	0.01	0.17	0.12	0.17	0.23	0.10	0.04	0.12	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.42	0.26	0.07	0.10	0.15	0.24	0.36	0.22	0.14	0.35	0.69	0.36	0.04	0.12	0.07	0.16	0.37	0.15	0.17
C2	0.12	0.29	0.25	0.08	0.10	0.30	0.13	0.56	0.14	0.12	0.26	0.45	0.29	0.09	0.09	0.20	0.12	0.34	0.12	0.10
C2'	0.11	0.35	0.19	0.08	0.10	0.17	0.21	0.34	0.21	0.10	0.30	0.58	0.25	0.04	0.11	0.11	0.11	0.29	0.20	0.11
C3'	0.08	0.24	0.10	0.09	0.08	0.14	0.21	0.21	0.20	0.07	0.20	0.43	0.11	0.06	0.11	0.11	0.11	0.32	0.23	0.15
C4	0.16	0.24	0.28	0.12	0.28	0.35	0.31	0.61	0.30	0.22	0.27	0.25	0.22	0.10	0.25	0.25	0.15	0.32	0.15	0.09
C4'	0.11	0.33	0.13	0.07	0.09	0.03	0.29	0.10	0.27	0.08	0.25	0.59	0.21	0.04	0.12	0.05	0.21	0.44	0.21	0.26
C5	0.17	0.29	0.30	0.15	0.32	0.29	0.32	0.52	0.30	0.25	0.31	0.30	0.21	0.09	0.29	0.18	0.12	0.32	0.20	0.13
C5'	0.06	0.19	0.07	0.06	0.10	0.08	0.27	0.10	0.26	0.05	0.13	0.40	0.08	0.06	0.13	0.06	0.28	0.56	0.26	0.36
C6	0.16	0.34	0.29	0.12	0.22	0.22	0.10	0.42	0.10	0.21	0.33	0.44	0.26	0.07	0.20	0.12	0.15	0.34	0.19	0.17
N1	0.13	0.35	0.26	0.08	0.13	0.23	0.11	0.46	0.12	0.14	0.31	0.52	0.30	0.07	0.12	0.13	0.13	0.35	0.14	0.13
N3	0.14	0.24	0.26	0.09	0.17	0.35	0.15	0.62	0.17	0.16	0.24	0.32	0.25	0.10	0.14	0.25	0.15	0.33	0.14	0.11
N4	0.18	0.20	0.28	0.13	0.38	0.37	0.52	0.63	0.47	0.26	0.26	0.19	0.20	0.10	0.36	0.29	0.21	0.35	0.17	0.16
O2	0.10	0.29	0.23	0.07	0.06	0.29	0.25	0.57	0.23	0.08	0.23	0.50	0.31	0.09	0.11	0.21	0.13	0.35	0.13	0.10
O2'	0.16	0.46	0.24	0.08	0.10	0.12	0.27	0.31	0.25	0.14	0.38	0.76	0.36	0.01	0.11	0.06	0.14	0.30	0.18	0.12
O3'	0.06	0.24	0.09	0.08	0.08	0.09	0.20	0.14	0.19	0.06	0.20	0.43	0.09	0.05	0.11	0.08	0.09	0.28	0.26	0.14
O4'	0.16	0.41	0.23	0.07	0.09	0.06	0.31	0.23	0.28	0.11	0.32	0.70	0.36	0.01	0.12	0.05	0.23	0.43	0.18	0.25
O5'	0.15	0.31	0.19	0.04	0.09	0.04	0.13	0.18	0.13	0.12	0.24	0.50	0.31	0.01	0.09	0.04	0.11	0.07	0.32	0.15
OP1	0.32	0.41	0.24	0.14	0.26	0.34	0.22	0.33	0.21	0.29	0.36	0.56	0.28	0.02	0.26	0.38	0.31	0.35	0.21	0.30
OP2	0.27	0.29	0.24	0.13	0.23	0.21	0.19	0.23	0.19	0.24	0.28	0.32	0.37	0.03	0.25	0.28	0.29	0.19	0.40	0.26
P	0.07	0.13	0.09	0.01	0.08	0.06	0.13	0.11	0.13	0.07	0.10	0.23	0.15	0.00	0.09	0.05	0.11	0.21	0.20	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.20	0.20	0.18	0.19
C2	0.01	0.00	0.24	0.07	0.00	0.18	0.00	0.34	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.13	0.01	0.26	0.12	0.14	0.13	0.12
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.03	0.01	0.15	0.02	0.21	0.02	0.18	0.41	0.00	0.05	0.03	0.01	0.33	0.37	0.33	0.34
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.09	0.00	0.14	0.02	0.15	0.04	0.06	0.15	0.01	0.01	0.11	0.01	0.37	0.48	0.25	0.37
C4	0.01	0.00	0.03	0.09	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.00	0.03	0.39	0.43	0.55	0.46
C4'	0.00	0.18	0.01	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.14	0.03	0.17	0.27	0.03	0.02	0.12	0.00	0.01	0.12	0.18	0.02
C5	0.01	0.00	0.15	0.14	0.00	0.10	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.19	0.00	0.19	0.82	0.89	0.92	0.94
C5'	0.01	0.34	0.02	0.02	0.17	0.00	0.15	0.00	0.23	0.08	0.34	0.48	0.03	0.06	0.23	0.01	0.00	0.27	0.40	0.01
C6	0.01	0.01	0.21	0.15	0.00	0.14	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.19	0.00	0.27	0.87	0.88	0.84	0.92
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.33	0.33	0.36	0.34
N3	0.01	0.00	0.18	0.06	0.00	0.17	0.00	0.34	0.00	0.01	0.00	0.01	0.25	0.08	0.01	0.19	0.08	0.09	0.21	0.08
O2	0.02	0.00	0.41	0.15	0.01	0.27	0.00	0.48	0.01	0.01	0.01	0.00	0.54	0.28	0.02	0.44	0.45	0.51	0.27	0.48
O2'	0.01	0.30	0.00	0.01	0.07	0.03	0.14	0.03	0.20	0.03	0.25	0.54	0.00	0.11	0.08	0.05	0.13	0.16	0.18	0.15
O3'	0.05	0.13	0.05	0.01	0.08	0.02	0.19	0.06	0.19	0.01	0.08	0.28	0.11	0.00	0.11	0.03	0.29	0.49	0.22	0.33
O4	0.00	0.01	0.03	0.11	0.00	0.12	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.11	0.00	0.06	0.33	0.39	0.52	0.41
O4'	0.00	0.26	0.01	0.01	0.03	0.00	0.19	0.01	0.27	0.01	0.19	0.44	0.05	0.03	0.06	0.00	0.03	0.04	0.10	0.04
O5'	0.20	0.12	0.33	0.37	0.39	0.01	0.82	0.00	0.87	0.33	0.08	0.45	0.13	0.29	0.33	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.20	0.14	0.37	0.48	0.43	0.12	0.89	0.27	0.88	0.33	0.09	0.51	0.16	0.49	0.39	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.13	0.33	0.25	0.55	0.18	0.92	0.40	0.84	0.36	0.21	0.27	0.18	0.22	0.52	0.10	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.12	0.34	0.37	0.46	0.02	0.94	0.01	0.92	0.34	0.08	0.48	0.15	0.33	0.41	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00