Doublet Group distance statistics: 52806

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.004, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.004 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.001, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N4	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.006, 0.022, 0.039, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.022 std_dev=0.017
C2'	A	0, 0.025, 0.109, 0.194, 0.205 max_d=0.205 avg_d=0.109 std_dev=0.084
O2'	A	0, 0.031, 0.123, 0.215, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.123 std_dev=0.092
O4'	A	0, 0.020, 0.114, 0.208, 0.229 max_d=0.229 avg_d=0.114 std_dev=0.094
C4'	A	0, 0.039, 0.170, 0.301, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.170 std_dev=0.131
C3'	A	0, 0.040, 0.183, 0.326, 0.349 max_d=0.349 avg_d=0.183 std_dev=0.143
P	B	0, 0.065, 0.273, 0.482, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.273 std_dev=0.209
O3'	A	0, 0.066, 0.281, 0.495, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.281 std_dev=0.214
C5'	A	0, 0.071, 0.288, 0.505, 0.524 max_d=0.524 avg_d=0.288 std_dev=0.217
O5'	B	0, 0.013, 0.344, 0.675, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.344 std_dev=0.331
C5'	B	0, 0.080, 0.415, 0.751, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.415 std_dev=0.335
O5'	A	0, 0.093, 0.442, 0.790, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.442 std_dev=0.349
OP1	B	0, 0.042, 0.424, 0.806, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.424 std_dev=0.382
P	A	0, 0.161, 0.551, 0.941, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.551 std_dev=0.390
C3'	B	0, 0.150, 0.548, 0.947, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.548 std_dev=0.399
C2'	B	0, 0.179, 0.622, 1.066, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.622 std_dev=0.444
O3'	B	0, 0.149, 0.617, 1.084, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.617 std_dev=0.467
C4'	B	0, 0.124, 0.623, 1.122, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.623 std_dev=0.499
O2'	B	0, -0.020, 0.488, 0.996, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.488 std_dev=0.508
OP2	B	0, 0.090, 0.690, 1.290, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.690 std_dev=0.600
OP1	A	0, 0.260, 0.892, 1.523, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.892 std_dev=0.632
O4'	B	0, 0.065, 0.814, 1.562, 1.806 max_d=1.806 avg_d=0.814 std_dev=0.748
C1'	B	0, 0.091, 0.848, 1.604, 1.837 max_d=1.837 avg_d=0.848 std_dev=0.756
OP2	A	0, 0.211, 0.975, 1.739, 1.865 max_d=1.865 avg_d=0.975 std_dev=0.764
C6	B	0, -0.104, 0.848, 1.799, 2.176 max_d=2.176 avg_d=0.848 std_dev=0.951
N1	B	0, -0.049, 1.030, 2.110, 2.521 max_d=2.521 avg_d=1.030 std_dev=1.079
C5	B	0, -0.147, 1.095, 2.337, 2.832 max_d=2.832 avg_d=1.095 std_dev=1.242
C2	B	0, -0.076, 1.454, 2.983, 3.568 max_d=3.568 avg_d=1.454 std_dev=1.530
O2	B	0, 0.022, 1.695, 3.368, 3.972 max_d=3.972 avg_d=1.695 std_dev=1.673
C4	B	0, -0.247, 1.469, 3.185, 3.876 max_d=3.876 avg_d=1.469 std_dev=1.716
N3	B	0, -0.204, 1.621, 3.446, 4.170 max_d=4.170 avg_d=1.621 std_dev=1.825
O4	B	0, -0.284, 1.670, 3.625, 4.413 max_d=4.413 avg_d=1.670 std_dev=1.955

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.17	0.35	0.17	0.07
C2	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.19	0.31	0.43	0.10
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.16	0.24	0.08
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.04	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.18	0.11
C4	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.25	0.28	0.54	0.11
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.00	0.03	0.21	0.07	0.02
C5	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.30	0.32	0.44	0.11
C5'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.06	0.03	0.05	0.07	0.00	0.07	0.05	0.01	0.01	0.16	0.22	0.01
C6	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.31	0.37	0.31	0.11
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.23	0.35	0.32	0.09
N3	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.21	0.28	0.53	0.11
N4	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.24	0.25	0.61	0.12
O2	0.03	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.15	0.30	0.41	0.09
O2'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.03	0.02	0.21	0.15	0.04
O3'	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.00	0.02	0.16	0.08	0.17	0.14
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.22	0.44	0.02	0.13
O5'	0.17	0.19	0.03	0.05	0.25	0.03	0.30	0.01	0.31	0.23	0.21	0.24	0.15	0.02	0.16	0.22	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.35	0.31	0.16	0.04	0.28	0.21	0.32	0.16	0.37	0.35	0.28	0.25	0.30	0.21	0.08	0.44	0.03	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.43	0.24	0.18	0.54	0.07	0.44	0.22	0.31	0.32	0.53	0.61	0.41	0.15	0.17	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.10	0.08	0.11	0.11	0.02	0.11	0.01	0.11	0.09	0.11	0.12	0.09	0.04	0.14	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.38	0.22	0.21	0.53	0.23	0.44	0.12	0.29	0.26	0.50	0.38	0.52	0.38	0.58	0.17	0.12	0.30	0.37	0.05
C2	0.14	0.45	0.23	0.21	0.65	0.19	0.55	0.09	0.38	0.33	0.60	0.43	0.47	0.32	0.71	0.11	0.17	0.33	0.52	0.10
C2'	0.19	0.25	0.18	0.21	0.42	0.27	0.34	0.14	0.20	0.15	0.37	0.24	0.44	0.33	0.47	0.22	0.08	0.24	0.41	0.07
C3'	0.23	0.10	0.13	0.19	0.26	0.30	0.21	0.15	0.10	0.05	0.21	0.09	0.35	0.29	0.29	0.28	0.04	0.19	0.35	0.05
C4	0.13	0.43	0.22	0.18	0.60	0.13	0.53	0.06	0.39	0.33	0.55	0.40	0.40	0.24	0.65	0.11	0.21	0.36	0.57	0.12
C4'	0.26	0.13	0.18	0.22	0.25	0.32	0.18	0.18	0.08	0.08	0.22	0.14	0.47	0.40	0.28	0.30	0.04	0.28	0.22	0.05
C5	0.13	0.37	0.23	0.18	0.50	0.13	0.44	0.07	0.33	0.29	0.46	0.35	0.40	0.25	0.52	0.11	0.19	0.36	0.43	0.07
C5'	0.35	0.07	0.18	0.26	0.06	0.38	0.05	0.24	0.10	0.15	0.02	0.09	0.43	0.43	0.08	0.40	0.14	0.32	0.13	0.16
C6	0.15	0.36	0.23	0.20	0.48	0.17	0.41	0.08	0.30	0.27	0.46	0.35	0.46	0.31	0.51	0.12	0.15	0.33	0.35	0.05
N1	0.15	0.41	0.23	0.21	0.56	0.20	0.47	0.10	0.33	0.29	0.53	0.39	0.48	0.34	0.61	0.13	0.15	0.32	0.42	0.07
N3	0.14	0.46	0.23	0.20	0.66	0.16	0.57	0.07	0.41	0.34	0.60	0.43	0.44	0.28	0.72	0.10	0.20	0.34	0.58	0.13
N4	0.13	0.43	0.21	0.15	0.61	0.09	0.55	0.04	0.41	0.34	0.55	0.39	0.35	0.20	0.66	0.14	0.24	0.34	0.65	0.17
O2	0.15	0.47	0.22	0.21	0.68	0.21	0.57	0.11	0.39	0.33	0.63	0.45	0.48	0.33	0.76	0.12	0.17	0.32	0.52	0.10
O2'	0.18	0.32	0.18	0.19	0.49	0.26	0.40	0.13	0.25	0.20	0.45	0.31	0.45	0.33	0.55	0.21	0.09	0.25	0.41	0.07
O3'	0.25	0.02	0.08	0.17	0.19	0.29	0.17	0.13	0.06	0.03	0.13	0.05	0.27	0.23	0.23	0.31	0.04	0.10	0.38	0.08
O4'	0.19	0.33	0.22	0.21	0.45	0.25	0.36	0.14	0.23	0.22	0.43	0.34	0.54	0.40	0.48	0.20	0.09	0.31	0.26	0.01
O5'	0.07	0.18	0.18	0.09	0.34	0.13	0.33	0.07	0.24	0.15	0.28	0.12	0.06	0.03	0.36	0.16	0.19	0.07	0.44	0.20
OP1	0.09	0.24	0.44	0.15	0.35	0.30	0.31	0.22	0.23	0.17	0.32	0.20	0.44	0.02	0.37	0.34	0.02	0.16	0.23	0.01
OP2	0.18	0.01	0.20	0.18	0.11	0.56	0.20	0.67	0.23	0.13	0.02	0.10	0.58	0.01	0.11	0.50	0.56	0.74	0.41	0.62
P	0.10	0.11	0.25	0.03	0.16	0.29	0.13	0.24	0.08	0.05	0.15	0.11	0.31	0.00	0.17	0.29	0.12	0.27	0.08	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.08	0.02	0.01	0.11	0.17	0.25	0.15
C2	0.02	0.00	0.07	0.14	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.05	0.00	0.05	0.11	0.14	0.24	0.13
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.09	0.03	0.17	0.08	0.18	0.04	0.01	0.19	0.00	0.03	0.10	0.01	0.25	0.39	0.47	0.36
C3'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.13	0.00	0.10	0.02	0.09	0.11	0.15	0.15	0.01	0.00	0.12	0.01	0.05	0.25	0.14	0.15
C4	0.01	0.00	0.09	0.13	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.10	0.00	0.03	0.09	0.13	0.26	0.12
C4'	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.02	0.01	0.20	0.05	0.05	0.01	0.01	0.07	0.05	0.04
C5	0.01	0.01	0.17	0.10	0.01	0.07	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.10	0.00	0.08	0.08	0.13	0.27	0.12
C5'	0.04	0.07	0.08	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.04	0.04	0.07	0.08	0.11	0.17	0.05	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01
C6	0.00	0.00	0.18	0.09	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.08	0.00	0.09	0.08	0.14	0.27	0.13
N1	0.01	0.00	0.04	0.11	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.04	0.00	0.01	0.10	0.14	0.24	0.13
N3	0.01	0.00	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.08	0.00	0.02	0.10	0.14	0.25	0.13
O2	0.03	0.00	0.19	0.15	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.03	0.00	0.10	0.11	0.14	0.22	0.13
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.23	0.20	0.27	0.11	0.23	0.11	0.14	0.11	0.00	0.10	0.26	0.14	0.13	0.28	0.48	0.28
O3'	0.08	0.05	0.03	0.00	0.10	0.05	0.10	0.17	0.08	0.04	0.08	0.03	0.10	0.00	0.10	0.03	0.14	0.04	0.09	0.08
O4	0.02	0.00	0.10	0.12	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.10	0.00	0.04	0.08	0.12	0.26	0.12
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.02	0.10	0.14	0.03	0.04	0.00	0.03	0.03	0.08	0.02
O5'	0.11	0.11	0.25	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.08	0.10	0.10	0.11	0.13	0.14	0.08	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.17	0.14	0.39	0.25	0.13	0.07	0.13	0.04	0.14	0.14	0.14	0.14	0.28	0.04	0.12	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.25	0.24	0.47	0.14	0.26	0.05	0.27	0.02	0.27	0.24	0.25	0.22	0.48	0.09	0.26	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.13	0.36	0.15	0.12	0.04	0.12	0.01	0.13	0.13	0.13	0.13	0.28	0.08	0.12	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00