Doublet Group distance statistics: 52812

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N1	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N4	A	0, 0.000, 0.035, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C4'	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
O2	A	0, 0.000, 0.050, 0.101, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.050 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.000, 0.083, 0.167, 0.167 max_d=0.167 avg_d=0.083 std_dev=0.083
C6	B	0, 0.000, 0.088, 0.175, 0.175 max_d=0.175 avg_d=0.088 std_dev=0.088
O3'	A	0, 0.000, 0.093, 0.187, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.093 std_dev=0.093
C5	B	0, 0.000, 0.105, 0.211, 0.211 max_d=0.211 avg_d=0.105 std_dev=0.105
C5'	A	0, 0.000, 0.110, 0.220, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.110 std_dev=0.110
O5'	B	0, 0.000, 0.114, 0.228, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.114 std_dev=0.114
N1	B	0, 0.000, 0.117, 0.234, 0.234 max_d=0.234 avg_d=0.117 std_dev=0.117
C3'	A	0, 0.000, 0.120, 0.241, 0.241 max_d=0.241 avg_d=0.120 std_dev=0.120
C1'	B	0, 0.000, 0.137, 0.274, 0.274 max_d=0.274 avg_d=0.137 std_dev=0.137
C2	B	0, 0.000, 0.163, 0.326, 0.326 max_d=0.326 avg_d=0.163 std_dev=0.163
C3'	B	0, 0.000, 0.171, 0.341, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.171 std_dev=0.171
OP2	B	0, 0.000, 0.174, 0.347, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.174 std_dev=0.174
O3'	B	0, 0.000, 0.176, 0.351, 0.351 max_d=0.351 avg_d=0.176 std_dev=0.176
C2'	B	0, 0.000, 0.177, 0.353, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.177 std_dev=0.177
C4	B	0, 0.000, 0.184, 0.367, 0.367 max_d=0.367 avg_d=0.184 std_dev=0.184
N3	B	0, 0.000, 0.192, 0.383, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.192 std_dev=0.192
P	B	0, 0.000, 0.200, 0.401, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.200 std_dev=0.200
OP1	A	0, 0.000, 0.201, 0.402, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.201 std_dev=0.201
P	A	0, 0.000, 0.202, 0.404, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.202 std_dev=0.202
C4'	B	0, 0.000, 0.205, 0.411, 0.411 max_d=0.411 avg_d=0.205 std_dev=0.205
O5'	A	0, 0.000, 0.206, 0.413, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.206 std_dev=0.206
O2	B	0, 0.000, 0.221, 0.443, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.221 std_dev=0.221
C2'	A	0, 0.000, 0.234, 0.467, 0.467 max_d=0.467 avg_d=0.234 std_dev=0.234
O4	B	0, 0.000, 0.249, 0.498, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.249 std_dev=0.249
O4'	B	0, 0.000, 0.252, 0.503, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.252 std_dev=0.252
OP1	B	0, 0.000, 0.294, 0.588, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.294 std_dev=0.294
O2'	B	0, 0.000, 0.311, 0.621, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.311 std_dev=0.311
OP2	A	0, 0.000, 0.365, 0.730, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.365 std_dev=0.365
O2'	A	0, 0.000, 0.447, 0.895, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.447 std_dev=0.447
C5'	B	0, 0.000, 0.477, 0.954, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.477 std_dev=0.477

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01
C2	0.00	0.00	0.08	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.02	0.02	0.04	0.00	0.05	0.03
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.11	0.02	0.10	0.01	0.08	0.07	0.10	0.12	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02
C3'	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00
C4	0.00	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.15	0.01	0.04	0.07	0.02	0.06	0.03
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.10	0.02	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01
C5	0.01	0.02	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.09	0.00	0.05	0.07	0.03	0.05	0.03
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00
C6	0.01	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01
N1	0.00	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.08	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01
N3	0.01	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.17	0.02	0.04	0.07	0.00	0.07	0.04
N4	0.00	0.01	0.12	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.16	0.00	0.03	0.06	0.04	0.05	0.02
O2	0.03	0.01	0.07	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.15	0.10	0.09	0.10	0.05	0.08	0.17	0.16	0.23	0.00	0.05	0.07	0.12	0.20	0.20	0.15
O3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01
O5'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.05	0.03	0.07	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.20	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.03	0.05	0.07	0.05	0.06	0.05	0.05	0.06	0.03	0.04	0.07	0.05	0.03	0.20	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.03	0.03	0.01	0.03	0.05	0.10	0.03	0.22	0.02	0.02	0.06	0.02	0.08	0.02	0.07	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
C2	0.01	0.04	0.04	0.07	0.01	0.14	0.00	0.30	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.06	0.04	0.05	0.02	0.04
C2'	0.12	0.18	0.11	0.05	0.22	0.04	0.18	0.15	0.15	0.14	0.23	0.15	0.20	0.08	0.25	0.03	0.12	0.05	0.11	0.09
C3'	0.08	0.11	0.11	0.07	0.14	0.03	0.11	0.13	0.09	0.08	0.15	0.11	0.21	0.11	0.16	0.08	0.09	0.03	0.08	0.06
C4	0.01	0.06	0.07	0.09	0.02	0.14	0.01	0.33	0.01	0.04	0.05	0.09	0.04	0.04	0.01	0.01	0.06	0.10	0.05	0.07
C4'	0.04	0.07	0.06	0.03	0.08	0.05	0.05	0.12	0.04	0.04	0.09	0.08	0.14	0.07	0.10	0.12	0.03	0.03	0.02	0.00
C5	0.00	0.03	0.06	0.09	0.00	0.14	0.01	0.32	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.04	0.01	0.01	0.06	0.09	0.05	0.07
C5'	0.03	0.05	0.07	0.06	0.06	0.01	0.03	0.05	0.02	0.03	0.07	0.08	0.15	0.09	0.07	0.13	0.03	0.03	0.03	0.01
C6	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.12	0.03	0.27	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.06	0.04	0.05
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.11	0.02	0.26	0.01	0.00	0.02	0.03	0.04	0.00	0.04	0.05	0.05	0.05	0.03	0.04
N3	0.03	0.07	0.07	0.09	0.02	0.15	0.01	0.34	0.02	0.05	0.04	0.10	0.02	0.04	0.01	0.05	0.04	0.08	0.03	0.05
N4	0.01	0.06	0.06	0.08	0.04	0.12	0.00	0.32	0.01	0.03	0.07	0.09	0.05	0.04	0.04	0.03	0.09	0.14	0.07	0.11
O2	0.00	0.04	0.03	0.05	0.00	0.12	0.01	0.29	0.02	0.03	0.01	0.07	0.04	0.01	0.02	0.07	0.04	0.05	0.02	0.03
O2'	0.05	0.16	0.03	0.06	0.24	0.14	0.17	0.23	0.11	0.10	0.24	0.15	0.13	0.03	0.30	0.12	0.01	0.07	0.01	0.01
O3'	0.04	0.07	0.09	0.07	0.11	0.03	0.07	0.13	0.05	0.05	0.11	0.07	0.20	0.11	0.14	0.12	0.07	0.01	0.07	0.05
O4'	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.11	0.01	0.20	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.12	0.02	0.05	0.03	0.04
O5'	0.06	0.03	0.04	0.04	0.04	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.17	0.07	0.11	0.07	0.09
OP1	0.06	0.07	0.05	0.04	0.06	0.13	0.05	0.22	0.05	0.06	0.07	0.09	0.04	0.03	0.06	0.03	0.01	0.05	0.03	0.00
OP2	0.06	0.04	0.00	0.05	0.04	0.05	0.06	0.10	0.06	0.06	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.13	0.04	0.08	0.02	0.05
P	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.09	0.02	0.01	0.02	0.05	0.04	0.00	0.00	0.09	0.05	0.09	0.03	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.05	0.07	0.06
C2	0.03	0.00	0.04	0.02	0.01	0.05	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.04	0.01	0.02	0.10	0.08	0.09	0.09
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.05	0.05	0.00	0.02	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.09	0.05	0.07
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.08	0.03	0.01	0.03	0.03	0.13	0.17	0.09	0.14
C4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.07	0.01	0.26	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.09	0.07	0.09
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.05	0.04	0.06	0.01	0.01	0.00	0.08	0.00	0.03	0.04	0.01	0.03
C5	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.07	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.04	0.02	0.06	0.10	0.11	0.09	0.11
C5'	0.08	0.21	0.05	0.02	0.26	0.00	0.23	0.00	0.18	0.18	0.25	0.16	0.05	0.01	0.28	0.00	0.00	0.12	0.07	0.02
C6	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.04	0.02	0.06	0.11	0.11	0.10	0.12
N1	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.10	0.08	0.09	0.10
N3	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.01	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.00	0.01	0.10	0.09	0.08	0.09
O2	0.06	0.00	0.09	0.08	0.01	0.01	0.00	0.16	0.01	0.02	0.00	0.00	0.15	0.11	0.01	0.04	0.11	0.08	0.10	0.10
O2'	0.00	0.08	0.00	0.03	0.00	0.01	0.07	0.05	0.08	0.00	0.05	0.15	0.00	0.04	0.01	0.01	0.12	0.15	0.13	0.13
O3'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.11	0.04	0.00	0.01	0.10	0.12	0.18	0.10	0.13
O4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.08	0.02	0.28	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.09	0.05	0.08
O4'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.01	0.04	0.01	0.10	0.03	0.00	0.17	0.15	0.17	0.17
O5'	0.07	0.10	0.07	0.13	0.09	0.03	0.10	0.00	0.11	0.10	0.10	0.11	0.12	0.12	0.07	0.17	0.00	0.02	0.00	0.01
OP1	0.05	0.08	0.09	0.17	0.09	0.04	0.11	0.12	0.11	0.08	0.09	0.08	0.15	0.18	0.09	0.15	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.09	0.05	0.09	0.07	0.01	0.09	0.07	0.10	0.09	0.08	0.10	0.13	0.10	0.05	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.09	0.07	0.14	0.09	0.03	0.11	0.02	0.12	0.10	0.09	0.10	0.13	0.13	0.08	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00