Doublet Group distance statistics: 52814

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.000, 0.036, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.036 std_dev=0.036
O2	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.043 std_dev=0.043
C1'	B	0, 0.000, 0.221, 0.443, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.221 std_dev=0.221
N1	B	0, 0.000, 0.251, 0.502, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.251 std_dev=0.251
O3'	B	0, 0.000, 0.279, 0.558, 0.558 max_d=0.558 avg_d=0.279 std_dev=0.279
C2'	B	0, 0.000, 0.289, 0.577, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.289 std_dev=0.289
C3'	B	0, 0.000, 0.307, 0.615, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.307 std_dev=0.307
C4	B	0, 0.000, 0.383, 0.766, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.383 std_dev=0.383
O4'	B	0, 0.000, 0.416, 0.831, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.416 std_dev=0.416
O4	B	0, 0.000, 0.466, 0.931, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.466 std_dev=0.466
O2'	B	0, 0.000, 0.472, 0.944, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.472 std_dev=0.472
C4'	B	0, 0.000, 0.513, 1.027, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.513 std_dev=0.513
O4'	A	0, 0.000, 0.526, 1.052, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.526 std_dev=0.526
C2'	A	0, 0.000, 0.607, 1.214, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.607 std_dev=0.607
C5'	B	0, 0.000, 0.793, 1.586, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.793 std_dev=0.793
O5'	A	0, 0.000, 0.808, 1.617, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.808 std_dev=0.808
C5	B	0, 0.000, 0.859, 1.718, 1.718 max_d=1.718 avg_d=0.859 std_dev=0.859
C6	B	0, 0.000, 0.863, 1.726, 1.726 max_d=1.726 avg_d=0.863 std_dev=0.863
P	A	0, 0.000, 0.868, 1.736, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.868 std_dev=0.868
C4'	A	0, 0.000, 0.885, 1.770, 1.770 max_d=1.770 avg_d=0.885 std_dev=0.885
O5'	B	0, 0.000, 0.891, 1.783, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.891 std_dev=0.891
O2'	A	0, 0.000, 0.907, 1.813, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.907 std_dev=0.907
C3'	A	0, 0.000, 0.958, 1.917, 1.917 max_d=1.917 avg_d=0.958 std_dev=0.958
C5'	A	0, 0.000, 0.991, 1.983, 1.983 max_d=1.983 avg_d=0.991 std_dev=0.991
C2	B	0, 0.000, 1.012, 2.024, 2.024 max_d=2.024 avg_d=1.012 std_dev=1.012
N3	B	0, 0.000, 1.030, 2.060, 2.060 max_d=2.060 avg_d=1.030 std_dev=1.030
OP1	A	0, 0.000, 1.056, 2.112, 2.112 max_d=2.112 avg_d=1.056 std_dev=1.056
OP2	B	0, 0.000, 1.114, 2.228, 2.228 max_d=2.228 avg_d=1.114 std_dev=1.114
OP2	A	0, 0.000, 1.296, 2.591, 2.591 max_d=2.591 avg_d=1.296 std_dev=1.296
P	B	0, 0.000, 1.322, 2.644, 2.644 max_d=2.644 avg_d=1.322 std_dev=1.322
O3'	A	0, 0.000, 1.452, 2.903, 2.903 max_d=2.903 avg_d=1.452 std_dev=1.452
O2	B	0, 0.000, 1.771, 3.542, 3.542 max_d=3.542 avg_d=1.771 std_dev=1.771
OP1	B	0, 0.000, 2.017, 4.035, 4.035 max_d=4.035 avg_d=2.017 std_dev=2.017

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.25	0.01	0.31	0.14	0.44	0.20
C2	0.00	0.00	0.16	0.26	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.02	0.06	0.44	0.22	0.64	0.35
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.02	0.00	0.11	0.20	0.16	0.01	0.12	0.02	0.31	0.00	0.01	0.01	0.61	0.64	0.86	0.62
C3'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.33	0.00	0.28	0.02	0.21	0.19	0.32	0.35	0.24	0.01	0.00	0.00	0.27	0.46	0.27	0.24
C4	0.00	0.01	0.02	0.33	0.00	0.10	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.26	0.16	0.02	0.55	0.33	0.75	0.48
C4'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.10	0.07	0.08	0.10	0.07	0.25	0.01	0.01	0.03	0.11	0.11	0.07
C5	0.00	0.01	0.11	0.28	0.00	0.10	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.31	0.16	0.03	0.57	0.35	0.72	0.49
C5'	0.06	0.00	0.20	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.17	0.01	0.01	0.28	0.28	0.06
C6	0.01	0.01	0.16	0.21	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.28	0.07	0.06	0.53	0.29	0.63	0.41
N1	0.00	0.00	0.01	0.19	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.04	0.00	0.45	0.21	0.58	0.32
N3	0.00	0.00	0.12	0.32	0.00	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.08	0.06	0.51	0.28	0.72	0.43
N4	0.00	0.01	0.02	0.35	0.00	0.10	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.20	0.02	0.57	0.36	0.78	0.52
O2	0.03	0.00	0.31	0.24	0.00	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.09	0.07	0.36	0.15	0.58	0.28
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.26	0.25	0.31	0.03	0.28	0.17	0.18	0.28	0.07	0.00	0.03	0.20	0.31	0.38	0.80	0.43
O3'	0.25	0.02	0.01	0.00	0.16	0.01	0.16	0.17	0.07	0.04	0.08	0.20	0.09	0.03	0.00	0.20	0.01	0.23	0.05	0.01
O4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.06	0.02	0.07	0.20	0.20	0.00	0.01	0.15	0.03	0.15
O5'	0.31	0.44	0.61	0.27	0.55	0.03	0.57	0.01	0.53	0.45	0.51	0.57	0.36	0.31	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.14	0.22	0.64	0.46	0.33	0.11	0.35	0.28	0.29	0.21	0.28	0.36	0.15	0.38	0.23	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.44	0.64	0.86	0.27	0.75	0.11	0.72	0.28	0.63	0.58	0.72	0.78	0.58	0.80	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.35	0.62	0.24	0.48	0.07	0.49	0.06	0.41	0.32	0.43	0.52	0.28	0.43	0.01	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.01	0.19	0.12	0.03	0.05	0.19	0.08	0.25	0.09	0.03	0.17	0.35	0.30	0.07	0.06	0.11	0.08	0.02	0.48	0.33
C2	0.04	0.16	0.12	0.04	0.01	0.22	0.15	0.23	0.16	0.02	0.14	0.35	0.33	0.12	0.01	0.16	0.03	0.15	0.52	0.42
C2'	0.25	0.09	0.18	0.35	0.13	0.46	0.21	0.53	0.24	0.19	0.07	0.02	0.02	0.40	0.10	0.35	0.38	0.18	0.76	0.57
C3'	0.03	0.18	0.17	0.07	0.18	0.29	0.11	0.40	0.07	0.10	0.21	0.23	0.42	0.10	0.21	0.16	0.19	0.11	0.41	0.29
C4	0.10	0.01	0.08	0.06	0.06	0.21	0.13	0.17	0.14	0.08	0.01	0.06	0.28	0.16	0.05	0.18	0.05	0.25	0.52	0.44
C4'	0.06	0.09	0.11	0.07	0.00	0.33	0.09	0.45	0.11	0.03	0.08	0.19	0.36	0.03	0.02	0.25	0.26	0.07	0.46	0.34
C5	0.07	0.04	0.11	0.04	0.01	0.18	0.02	0.13	0.04	0.04	0.02	0.05	0.30	0.16	0.00	0.14	0.08	0.15	0.49	0.38
C5'	0.16	0.08	0.02	0.16	0.07	0.42	0.10	0.51	0.12	0.12	0.06	0.05	0.25	0.12	0.06	0.33	0.32	0.09	0.48	0.35
C6	0.01	0.07	0.14	0.02	0.03	0.16	0.01	0.15	0.02	0.02	0.07	0.12	0.33	0.12	0.04	0.10	0.04	0.03	0.47	0.33
N1	0.01	0.16	0.13	0.03	0.03	0.19	0.08	0.21	0.09	0.02	0.14	0.30	0.33	0.10	0.04	0.12	0.02	0.05	0.49	0.36
N3	0.09	0.08	0.09	0.06	0.06	0.24	0.18	0.22	0.19	0.07	0.07	0.24	0.30	0.15	0.04	0.19	0.00	0.25	0.54	0.46
N4	0.14	0.12	0.05	0.08	0.13	0.22	0.16	0.16	0.16	0.14	0.12	0.10	0.23	0.18	0.11	0.21	0.07	0.34	0.54	0.48
O2	0.03	0.20	0.12	0.03	0.01	0.22	0.19	0.25	0.19	0.01	0.17	0.43	0.34	0.08	0.00	0.16	0.05	0.15	0.52	0.42
O2'	0.18	0.14	0.13	0.21	0.21	0.25	0.25	0.30	0.24	0.19	0.15	0.07	0.07	0.23	0.20	0.20	0.21	0.04	0.66	0.41
O3'	0.00	0.11	0.23	0.02	0.08	0.28	0.02	0.38	0.00	0.04	0.12	0.16	0.50	0.01	0.10	0.20	0.13	0.24	0.27	0.19
O4'	0.03	0.19	0.20	0.06	0.02	0.18	0.11	0.26	0.11	0.03	0.15	0.37	0.41	0.10	0.02	0.12	0.09	0.09	0.40	0.28
O5'	0.34	0.45	0.25	0.20	0.40	0.22	0.34	0.18	0.32	0.38	0.45	0.48	0.27	0.22	0.41	0.28	0.14	0.32	0.51	0.22
OP1	0.00	0.18	0.19	0.05	0.05	0.30	0.07	0.32	0.10	0.03	0.16	0.30	0.45	0.06	0.07	0.23	0.12	0.75	0.31	0.16
OP2	0.14	0.62	0.04	0.26	0.36	0.32	0.06	0.52	0.03	0.25	0.60	0.92	0.38	0.14	0.40	0.12	0.55	1.09	0.08	0.47
P	0.15	0.41	0.18	0.01	0.26	0.17	0.10	0.23	0.05	0.21	0.39	0.57	0.41	0.00	0.28	0.04	0.18	0.66	0.30	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.01	0.13	0.24	0.56	0.42
C2	0.02	0.00	0.18	0.09	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.28	0.13	0.00	0.15	0.14	0.48	0.76	0.54
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.03	0.01	0.17	0.01	0.21	0.01	0.11	0.33	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.13	0.60	0.38
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.14	0.01	0.06	0.18	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.16	0.43	0.19
C4	0.02	0.00	0.03	0.03	0.00	0.05	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.06	0.30	0.56	0.41	0.41
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.09	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.08	0.33	0.19
C5	0.01	0.01	0.17	0.12	0.00	0.02	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.02	0.00	0.04	0.38	0.48	0.15	0.29
C5'	0.04	0.12	0.01	0.01	0.17	0.01	0.16	0.00	0.13	0.10	0.15	0.11	0.00	0.03	0.18	0.03	0.00	0.22	0.08	0.04
C6	0.00	0.01	0.21	0.14	0.01	0.01	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.03	0.01	0.08	0.36	0.40	0.19	0.30
N1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.21	0.40	0.54	0.45
N3	0.02	0.00	0.11	0.06	0.00	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.11	0.00	0.13	0.20	0.55	0.67	0.52
O2	0.03	0.00	0.33	0.18	0.01	0.09	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00	0.55	0.20	0.01	0.23	0.06	0.44	0.92	0.59
O2'	0.03	0.28	0.01	0.02	0.02	0.01	0.22	0.00	0.26	0.02	0.19	0.55	0.00	0.02	0.01	0.01	0.08	0.10	0.64	0.37
O3'	0.05	0.13	0.01	0.00	0.05	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.11	0.20	0.02	0.00	0.05	0.03	0.03	0.27	0.41	0.15
O4	0.02	0.00	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.31	0.60	0.38	0.40
O4'	0.01	0.15	0.02	0.00	0.06	0.01	0.04	0.03	0.08	0.03	0.13	0.23	0.01	0.03	0.06	0.00	0.08	0.25	0.47	0.40
O5'	0.13	0.14	0.10	0.05	0.30	0.05	0.38	0.00	0.36	0.21	0.20	0.06	0.08	0.03	0.31	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.24	0.48	0.13	0.16	0.56	0.08	0.48	0.22	0.40	0.40	0.55	0.44	0.10	0.27	0.60	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.56	0.76	0.60	0.43	0.41	0.33	0.15	0.08	0.19	0.54	0.67	0.92	0.64	0.41	0.38	0.47	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.42	0.54	0.38	0.19	0.41	0.19	0.29	0.04	0.30	0.45	0.52	0.59	0.37	0.15	0.40	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00