Doublet Group distance statistics: 52830

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.007, 0.025, 0.042, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.025 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.031 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.032 std_dev=0.023
C2	A	0, 0.010, 0.033, 0.057, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.033 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.010, 0.035, 0.060, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.035 std_dev=0.025
N9	A	0, 0.011, 0.036, 0.062, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.036 std_dev=0.026
N3	A	0, 0.011, 0.039, 0.067, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.039 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.012, 0.040, 0.068, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.040 std_dev=0.028
C1'	A	0, 0.013, 0.045, 0.077, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.045 std_dev=0.032
O3'	B	0, 0.062, 0.213, 0.364, 0.330 max_d=0.330 avg_d=0.213 std_dev=0.151
O3'	A	0, 0.008, 0.172, 0.337, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.172 std_dev=0.164
C3'	B	0, 0.052, 0.268, 0.483, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.268 std_dev=0.216
P	B	0, 0.085, 0.309, 0.534, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.309 std_dev=0.224
C4'	B	0, 0.076, 0.308, 0.540, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.308 std_dev=0.232
OP2	B	0, 0.027, 0.280, 0.533, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.280 std_dev=0.253
C2'	A	0, -0.013, 0.326, 0.665, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.326 std_dev=0.339
C3'	A	0, 0.049, 0.402, 0.755, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.402 std_dev=0.353
O5'	B	0, 0.008, 0.379, 0.749, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.379 std_dev=0.371
OP2	A	0, 0.127, 0.512, 0.898, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.512 std_dev=0.386
P	A	0, 0.114, 0.554, 0.994, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.554 std_dev=0.440
C2'	B	0, 0.148, 0.594, 1.041, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.594 std_dev=0.446
C5'	B	0, -0.042, 0.434, 0.910, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.434 std_dev=0.476
O2'	A	0, 0.034, 0.510, 0.986, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.510 std_dev=0.476
O4'	B	0, 0.024, 0.533, 1.043, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.533 std_dev=0.509
OP1	B	0, 0.147, 0.657, 1.167, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.657 std_dev=0.510
O4'	A	0, 0.034, 0.551, 1.068, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.551 std_dev=0.517
C1'	B	0, 0.011, 0.588, 1.166, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.588 std_dev=0.578
C4'	A	0, 0.034, 0.635, 1.236, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.635 std_dev=0.601
C6	B	0, 0.180, 0.822, 1.463, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.822 std_dev=0.641
O2'	B	0, 0.236, 0.877, 1.519, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.877 std_dev=0.641
O5'	A	0, 0.313, 1.076, 1.839, 1.686 max_d=1.686 avg_d=1.076 std_dev=0.763
OP1	A	0, 0.350, 1.195, 2.040, 1.809 max_d=1.809 avg_d=1.195 std_dev=0.845
N1	B	0, 0.013, 0.954, 1.895, 2.234 max_d=2.234 avg_d=0.954 std_dev=0.941
C5	B	0, 0.202, 1.174, 2.145, 2.380 max_d=2.380 avg_d=1.174 std_dev=0.972
C5'	A	0, -0.073, 0.958, 1.990, 2.390 max_d=2.390 avg_d=0.958 std_dev=1.032
C2	B	0, -0.021, 1.598, 3.217, 3.817 max_d=3.817 avg_d=1.598 std_dev=1.619
C4	B	0, 0.107, 1.798, 3.489, 4.062 max_d=4.062 avg_d=1.798 std_dev=1.691
O2	B	0, -0.021, 1.854, 3.729, 4.423 max_d=4.423 avg_d=1.854 std_dev=1.875
N3	B	0, 0.037, 1.997, 3.958, 4.661 max_d=4.661 avg_d=1.997 std_dev=1.960
O4	B	0, 0.153, 2.225, 4.296, 4.987 max_d=4.987 avg_d=2.225 std_dev=2.071

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.22	0.40	0.59	0.35
C2	0.03	0.00	0.26	0.16	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.08	0.14	0.30	0.40	0.50	0.31
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.14	0.02	0.07	0.01	0.13	0.11	0.21	0.25	0.10	0.05	0.02	0.00	0.01	0.02	0.45	0.79	0.87	0.72
C3'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.08	0.07	0.13	0.15	0.06	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.45	0.60	0.62	0.57
C4	0.02	0.00	0.14	0.08	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.03	0.07	0.31	0.39	0.52	0.31
C4'	0.00	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.06	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.21	0.27	0.12
C5	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.02	0.03	0.32	0.35	0.43	0.26
C5'	0.04	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.30	0.17	0.01
C6	0.01	0.00	0.13	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.16	0.03	0.06	0.32	0.35	0.39	0.24
C8	0.01	0.00	0.11	0.07	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.06	0.11	0.32	0.34	0.47	0.27
N1	0.02	0.00	0.21	0.13	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.28	0.06	0.11	0.31	0.38	0.44	0.27
N3	0.03	0.00	0.25	0.15	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.07	0.14	0.29	0.41	0.54	0.33
N6	0.01	0.00	0.10	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.03	0.04	0.32	0.33	0.31	0.19
N7	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.05	0.07	0.32	0.32	0.36	0.22
N9	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.30	0.39	0.56	0.33
O2'	0.03	0.37	0.00	0.00	0.17	0.01	0.08	0.01	0.16	0.13	0.28	0.36	0.11	0.07	0.01	0.00	0.04	0.03	0.50	0.96	0.99	0.82
O3'	0.03	0.08	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.06	0.06	0.07	0.03	0.05	0.03	0.04	0.00	0.02	0.34	0.51	0.59	0.46
O4'	0.00	0.14	0.02	0.00	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.11	0.11	0.14	0.04	0.07	0.01	0.03	0.02	0.00	0.28	0.15	0.27	0.02
O5'	0.22	0.30	0.45	0.45	0.31	0.00	0.32	0.00	0.32	0.32	0.31	0.29	0.32	0.32	0.30	0.50	0.34	0.28	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.40	0.40	0.79	0.60	0.39	0.21	0.35	0.30	0.35	0.34	0.38	0.41	0.33	0.32	0.39	0.96	0.51	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.59	0.50	0.87	0.62	0.52	0.27	0.43	0.17	0.39	0.47	0.44	0.54	0.31	0.36	0.56	0.99	0.59	0.27	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.35	0.31	0.72	0.57	0.31	0.12	0.26	0.01	0.24	0.27	0.27	0.33	0.19	0.22	0.33	0.82	0.46	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.57	0.24	0.10	0.45	0.07	0.23	0.07	0.16	0.28	0.62	0.76	0.30	0.24	0.52	0.07	0.27	0.11	0.22	0.01
C2	0.16	0.61	0.21	0.11	0.53	0.03	0.27	0.07	0.18	0.30	0.69	0.78	0.26	0.20	0.63	0.10	0.22	0.15	0.23	0.10
C2'	0.30	0.21	0.21	0.36	0.22	0.42	0.30	0.23	0.37	0.22	0.26	0.32	0.22	0.60	0.25	0.37	0.41	0.30	0.13	0.14
C3'	0.27	0.22	0.18	0.28	0.21	0.33	0.27	0.14	0.33	0.21	0.26	0.33	0.21	0.52	0.24	0.31	0.37	0.30	0.14	0.12
C4	0.14	0.55	0.20	0.10	0.45	0.04	0.24	0.08	0.17	0.26	0.61	0.72	0.25	0.21	0.53	0.08	0.25	0.05	0.24	0.06
C4'	0.18	0.38	0.19	0.15	0.28	0.11	0.22	0.11	0.21	0.21	0.39	0.53	0.25	0.25	0.32	0.14	0.30	0.23	0.19	0.09
C5	0.13	0.48	0.19	0.12	0.40	0.02	0.25	0.08	0.20	0.23	0.53	0.62	0.24	0.17	0.47	0.10	0.23	0.08	0.24	0.08
C5'	0.33	0.25	0.29	0.21	0.33	0.15	0.40	0.04	0.41	0.33	0.27	0.20	0.40	0.35	0.33	0.24	0.32	0.31	0.16	0.13
C6	0.13	0.49	0.19	0.12	0.43	0.00	0.27	0.08	0.21	0.24	0.55	0.63	0.25	0.16	0.50	0.11	0.19	0.18	0.22	0.11
C8	0.11	0.42	0.18	0.11	0.32	0.04	0.20	0.09	0.18	0.20	0.44	0.56	0.22	0.19	0.36	0.05	0.27	0.10	0.21	0.02
N1	0.15	0.56	0.20	0.11	0.49	0.01	0.28	0.07	0.20	0.27	0.64	0.71	0.26	0.18	0.58	0.12	0.19	0.20	0.21	0.11
N3	0.15	0.62	0.21	0.10	0.52	0.04	0.26	0.07	0.17	0.29	0.69	0.80	0.26	0.22	0.61	0.09	0.24	0.08	0.24	0.08
N6	0.12	0.42	0.19	0.12	0.39	0.02	0.29	0.08	0.23	0.22	0.48	0.53	0.25	0.13	0.46	0.13	0.14	0.26	0.19	0.13
N7	0.11	0.39	0.18	0.12	0.32	0.02	0.24	0.10	0.21	0.19	0.42	0.51	0.22	0.15	0.36	0.08	0.24	0.03	0.23	0.05
N9	0.13	0.52	0.20	0.10	0.41	0.05	0.21	0.08	0.16	0.24	0.56	0.69	0.25	0.22	0.47	0.06	0.26	0.07	0.22	0.03
O2'	0.30	0.27	0.20	0.38	0.26	0.50	0.28	0.31	0.36	0.20	0.35	0.41	0.20	0.64	0.33	0.42	0.45	0.32	0.13	0.16
O3'	0.17	0.45	0.20	0.19	0.37	0.24	0.22	0.09	0.22	0.22	0.51	0.61	0.26	0.40	0.44	0.20	0.35	0.25	0.15	0.08
O4'	0.33	0.65	0.38	0.26	0.49	0.21	0.30	0.26	0.24	0.40	0.66	0.84	0.42	0.17	0.53	0.27	0.27	0.16	0.24	0.12
O5'	0.15	0.32	0.29	0.24	0.23	0.15	0.15	0.30	0.14	0.19	0.32	0.43	0.27	0.01	0.25	0.12	0.12	0.14	0.43	0.25
OP1	0.20	0.09	0.04	0.09	0.18	0.36	0.27	0.35	0.28	0.19	0.11	0.03	0.19	0.01	0.18	0.37	0.30	0.61	0.19	0.32
OP2	0.06	0.07	0.11	0.11	0.13	0.06	0.20	0.12	0.20	0.09	0.08	0.14	0.07	0.02	0.14	0.04	0.11	0.20	0.04	0.07
P	0.05	0.08	0.04	0.01	0.05	0.10	0.12	0.06	0.13	0.05	0.06	0.16	0.10	0.00	0.05	0.10	0.14	0.32	0.06	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.27	0.57	0.10	0.24
C2	0.01	0.00	0.16	0.11	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.06	0.00	0.04	0.35	0.72	0.24	0.36
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.16	0.03	0.11	0.30	0.00	0.00	0.06	0.02	0.50	0.61	0.17	0.35
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.12	0.02	0.14	0.02	0.08	0.21	0.01	0.00	0.05	0.00	0.31	0.43	0.05	0.19
C4	0.00	0.00	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.45	0.84	0.42	0.53
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.02	0.07	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.32	0.08	0.03
C5	0.01	0.00	0.14	0.12	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.07	0.00	0.06	0.50	0.88	0.52	0.61
C5'	0.03	0.06	0.01	0.02	0.07	0.00	0.18	0.00	0.19	0.04	0.04	0.14	0.02	0.02	0.08	0.01	0.00	0.31	0.09	0.01
C6	0.01	0.00	0.16	0.14	0.00	0.08	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.07	0.00	0.07	0.49	0.84	0.43	0.55
N1	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.38	0.72	0.23	0.38
N3	0.01	0.00	0.11	0.08	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.04	0.00	0.02	0.40	0.78	0.32	0.44
O2	0.02	0.00	0.30	0.21	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	0.11	0.00	0.07	0.29	0.66	0.23	0.28
O2'	0.02	0.16	0.00	0.01	0.04	0.02	0.12	0.02	0.13	0.01	0.11	0.35	0.00	0.03	0.05	0.03	0.50	0.62	0.19	0.38
O3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.03	0.02	0.07	0.02	0.07	0.03	0.04	0.11	0.03	0.00	0.03	0.01	0.16	0.34	0.04	0.10
O4	0.00	0.00	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.03	0.00	0.02	0.46	0.83	0.47	0.55
O4'	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.07	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.43	0.08	0.09
O5'	0.27	0.35	0.50	0.31	0.45	0.01	0.50	0.00	0.49	0.38	0.40	0.29	0.50	0.16	0.46	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.57	0.72	0.61	0.43	0.84	0.32	0.88	0.31	0.84	0.72	0.78	0.66	0.62	0.34	0.83	0.43	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.10	0.24	0.17	0.05	0.42	0.08	0.52	0.09	0.43	0.23	0.32	0.23	0.19	0.04	0.47	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.24	0.36	0.35	0.19	0.53	0.03	0.61	0.01	0.55	0.38	0.44	0.28	0.38	0.10	0.55	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00