Doublet Group distance statistics: 52845

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 3, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.011, 0.022, 0.032, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.003, 0.016, 0.030, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.008, 0.028, 0.048, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.028 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.008, 0.030, 0.052, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.030 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.008, 0.031, 0.053, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.031 std_dev=0.023
O4	A	0, 0.016, 0.049, 0.083, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.049 std_dev=0.033
O2	A	0, 0.020, 0.070, 0.121, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.070 std_dev=0.051
O4'	A	0, 0.016, 0.090, 0.165, 0.294 max_d=0.294 avg_d=0.090 std_dev=0.075
C2'	A	0, 0.014, 0.125, 0.236, 0.369 max_d=0.369 avg_d=0.125 std_dev=0.111
C4'	A	0, -0.007, 0.126, 0.260, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.126 std_dev=0.133
O2'	A	0, 0.043, 0.178, 0.314, 0.435 max_d=0.435 avg_d=0.178 std_dev=0.135
C3'	A	0, -0.006, 0.150, 0.305, 0.552 max_d=0.552 avg_d=0.150 std_dev=0.156
O3'	A	0, 0.017, 0.193, 0.369, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.193 std_dev=0.176
N3	B	0, 0.114, 0.303, 0.491, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.303 std_dev=0.189
C4	B	0, 0.063, 0.257, 0.450, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.257 std_dev=0.193
O3'	B	0, 0.175, 0.376, 0.577, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.376 std_dev=0.201
N4	B	0, 0.098, 0.299, 0.500, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.299 std_dev=0.201
C2	B	0, 0.122, 0.337, 0.552, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.337 std_dev=0.215
O5'	A	0, -0.009, 0.213, 0.435, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.213 std_dev=0.222
C5'	A	0, -0.012, 0.212, 0.435, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.212 std_dev=0.223
C5	B	0, 0.070, 0.294, 0.518, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.294 std_dev=0.224
C3'	B	0, 0.090, 0.324, 0.557, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.324 std_dev=0.234
N1	B	0, 0.059, 0.292, 0.526, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.292 std_dev=0.234
C2'	B	0, 0.096, 0.333, 0.569, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.333 std_dev=0.236
O2'	B	0, 0.160, 0.406, 0.652, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.406 std_dev=0.246
C6	B	0, 0.021, 0.270, 0.519, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.270 std_dev=0.249
O2	B	0, 0.199, 0.459, 0.719, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.459 std_dev=0.260
OP2	B	0, 0.042, 0.302, 0.563, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.302 std_dev=0.261
P	A	0, 0.037, 0.299, 0.561, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.299 std_dev=0.262
C1'	B	0, 0.069, 0.337, 0.605, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.337 std_dev=0.268
C4'	B	0, 0.083, 0.364, 0.645, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.364 std_dev=0.281
O5'	B	0, 0.018, 0.301, 0.584, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.301 std_dev=0.283
OP1	A	0, 0.006, 0.302, 0.597, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.302 std_dev=0.295
P	B	0, 0.025, 0.321, 0.617, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.321 std_dev=0.296
OP2	A	0, 0.078, 0.388, 0.698, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.388 std_dev=0.310
O4'	B	0, 0.060, 0.371, 0.682, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.371 std_dev=0.311
OP1	B	0, 0.096, 0.415, 0.733, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.415 std_dev=0.318
C5'	B	0, 0.038, 0.359, 0.679, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.359 std_dev=0.320

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.02	0.01	0.09	0.11	0.11	0.09
C2	0.04	0.00	0.08	0.06	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.01	0.13	0.13	0.17	0.14
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.06	0.03	0.06	0.03	0.06	0.13	0.00	0.03	0.05	0.02	0.09	0.14	0.16	0.11
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.07	0.04	0.06	0.09	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.14	0.16	0.10
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.19	0.21	0.27	0.22
C4'	0.02	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.05	0.01	0.03	0.09	0.06	0.04
C5	0.02	0.02	0.06	0.08	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.08	0.01	0.06	0.21	0.23	0.29	0.25
C5'	0.03	0.03	0.03	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.11	0.05	0.05	0.03	0.04	0.01	0.09	0.03	0.01	0.08	0.04	0.03
C6	0.03	0.02	0.06	0.07	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.07	0.02	0.06	0.19	0.20	0.24	0.21
N1	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.13	0.13	0.17	0.14
N3	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01	0.03	0.16	0.16	0.22	0.17
O2	0.07	0.01	0.13	0.09	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.14	0.06	0.02	0.03	0.10	0.09	0.14	0.11
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.04	0.07	0.04	0.08	0.02	0.04	0.14	0.00	0.05	0.04	0.03	0.07	0.13	0.15	0.08
O3'	0.04	0.04	0.03	0.00	0.06	0.02	0.08	0.01	0.07	0.03	0.05	0.06	0.05	0.00	0.07	0.02	0.07	0.14	0.14	0.09
O4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.07	0.00	0.05	0.21	0.23	0.30	0.25
O4'	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.06	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.05	0.00	0.10	0.11	0.11	0.10
O5'	0.09	0.13	0.09	0.08	0.19	0.03	0.21	0.01	0.19	0.13	0.16	0.10	0.07	0.07	0.21	0.10	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.11	0.13	0.14	0.14	0.21	0.09	0.23	0.08	0.20	0.13	0.16	0.09	0.13	0.14	0.23	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.17	0.16	0.16	0.27	0.06	0.29	0.04	0.24	0.17	0.22	0.14	0.15	0.14	0.30	0.11	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.11	0.10	0.22	0.04	0.25	0.03	0.21	0.14	0.17	0.11	0.08	0.09	0.25	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.21	0.21	0.15	0.14	0.15	0.22	0.10	0.24	0.20	0.20	0.10	0.25	0.23	0.12	0.21	0.10	0.10	0.09	0.08
C2	0.15	0.19	0.18	0.12	0.09	0.09	0.24	0.07	0.19	0.14	0.17	0.12	0.26	0.22	0.12	0.13	0.07	0.10	0.12	0.10
C2'	0.21	0.19	0.20	0.16	0.16	0.15	0.18	0.11	0.23	0.20	0.19	0.20	0.20	0.20	0.13	0.22	0.12	0.09	0.10	0.09
C3'	0.15	0.17	0.13	0.08	0.16	0.07	0.13	0.04	0.15	0.14	0.19	0.20	0.19	0.13	0.08	0.15	0.06	0.10	0.09	0.06
C4	0.14	0.21	0.19	0.12	0.09	0.10	0.22	0.09	0.17	0.09	0.18	0.14	0.34	0.24	0.13	0.11	0.10	0.12	0.15	0.14
C4'	0.17	0.19	0.17	0.11	0.14	0.10	0.16	0.08	0.18	0.16	0.19	0.14	0.23	0.16	0.10	0.16	0.08	0.14	0.10	0.09
C5	0.21	0.25	0.25	0.17	0.06	0.15	0.15	0.11	0.14	0.16	0.20	0.10	0.35	0.26	0.14	0.19	0.08	0.11	0.15	0.13
C5'	0.13	0.17	0.13	0.09	0.12	0.08	0.12	0.09	0.14	0.12	0.18	0.13	0.21	0.12	0.11	0.13	0.08	0.18	0.10	0.11
C6	0.24	0.25	0.25	0.18	0.07	0.17	0.15	0.13	0.19	0.20	0.21	0.07	0.31	0.25	0.14	0.22	0.09	0.11	0.13	0.10
N1	0.20	0.21	0.21	0.14	0.08	0.13	0.20	0.09	0.21	0.18	0.19	0.05	0.27	0.23	0.12	0.18	0.07	0.11	0.11	0.09
N3	0.13	0.18	0.17	0.11	0.11	0.09	0.25	0.08	0.19	0.10	0.16	0.16	0.29	0.22	0.12	0.11	0.09	0.10	0.13	0.12
O2	0.15	0.17	0.18	0.11	0.13	0.09	0.24	0.07	0.20	0.14	0.16	0.16	0.23	0.22	0.11	0.13	0.08	0.11	0.12	0.11
O2'	0.31	0.25	0.27	0.23	0.24	0.24	0.32	0.19	0.34	0.30	0.24	0.22	0.25	0.29	0.20	0.32	0.20	0.13	0.13	0.15
O3'	0.14	0.15	0.12	0.06	0.16	0.05	0.14	0.03	0.15	0.14	0.17	0.20	0.15	0.11	0.07	0.13	0.05	0.10	0.11	0.06
O4	0.10	0.20	0.16	0.11	0.13	0.09	0.23	0.10	0.18	0.08	0.16	0.17	0.36	0.24	0.14	0.09	0.13	0.15	0.16	0.16
O4'	0.20	0.21	0.21	0.16	0.12	0.14	0.19	0.11	0.21	0.18	0.20	0.10	0.26	0.21	0.14	0.19	0.10	0.14	0.11	0.10
O5'	0.08	0.12	0.08	0.07	0.06	0.06	0.10	0.08	0.12	0.06	0.13	0.09	0.17	0.08	0.14	0.10	0.07	0.18	0.07	0.10
OP1	0.07	0.10	0.08	0.09	0.07	0.06	0.12	0.07	0.13	0.07	0.11	0.09	0.15	0.09	0.18	0.09	0.08	0.17	0.06	0.07
OP2	0.08	0.11	0.11	0.14	0.08	0.11	0.15	0.11	0.17	0.07	0.12	0.11	0.16	0.15	0.23	0.08	0.16	0.17	0.13	0.11
P	0.05	0.11	0.08	0.09	0.06	0.07	0.11	0.07	0.12	0.04	0.12	0.09	0.17	0.10	0.18	0.08	0.09	0.17	0.05	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.07	0.08	0.09	0.07
C2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.04	0.02	0.11	0.12	0.16	0.12
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.04	0.08	0.09	0.06
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.09	0.02	0.10	0.04	0.04	0.07	0.08	0.02	0.01	0.01	0.07	0.08	0.06	0.06
C4	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.06	0.04	0.15	0.16	0.18	0.17
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.05	0.09	0.02	0.06	0.04	0.00	0.02	0.06	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.10	0.06	0.13	0.12	0.11	0.13
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.11	0.07	0.10	0.16	0.05	0.05	0.05	0.02	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.10	0.07	0.10	0.08	0.08	0.08
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.09	0.09	0.10	0.09
N3	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.04	0.03	0.14	0.16	0.19	0.16
N4	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.09	0.02	0.16	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.07	0.05	0.18	0.20	0.22	0.21
O2	0.02	0.01	0.10	0.08	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.13	0.10	0.04	0.11	0.13	0.17	0.13
O2'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.05	0.06	0.03	0.05	0.03	0.04	0.08	0.06	0.13	0.00	0.03	0.05	0.04	0.07	0.05	0.04
O3'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.06	0.04	0.10	0.05	0.10	0.03	0.04	0.07	0.10	0.03	0.00	0.03	0.13	0.12	0.11	0.12
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.02	0.07	0.02	0.03	0.05	0.04	0.05	0.03	0.00	0.10	0.09	0.10	0.08
O5'	0.07	0.11	0.04	0.07	0.15	0.02	0.13	0.01	0.10	0.09	0.14	0.18	0.11	0.04	0.13	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.08	0.12	0.08	0.08	0.16	0.06	0.12	0.06	0.08	0.09	0.16	0.20	0.13	0.07	0.12	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.09	0.16	0.09	0.06	0.18	0.04	0.11	0.02	0.08	0.10	0.19	0.22	0.17	0.05	0.11	0.10	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.12	0.06	0.06	0.17	0.03	0.13	0.02	0.08	0.09	0.16	0.21	0.13	0.04	0.12	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00